화학 물질의 구성과 분자 구조는 3차원 분자 모형을 사용하여 효과적으로 시각화되고 더 잘 이해될 수 있습니다. 공-막대모형과 공간 충전 모형은 화합물에서 원자의 기하학적 배열을 보여주는 두 가지 표준 형태의 분자 모형입니다. 이 모형들은 플라스틱이나 나무로 만들어진 물체나 가상 컴퓨터 시뮬레이션으로 만들어집니다.공-막대 모형은 구체나 공으로 원자를 묘사합니다. 구를 연결하는 막대는 화학적 결합을 나타내며, 막대 사이의 각도는 실제 화합물에서 결합 각도와 일치합니다. 두 개 또는 세 개의 막대는 각각 이중 결합과 삼중 결합을 나타냅니다.각 공의 중심 사이의 거리는 해당 원자핵 사이의 정확한 거리와 비례합니다. 이 공들은 다른 색깔을 사용하여 서로 다른 원소의 원자를 구별합니다. 색깔은 화학자들인 로버트 코리, 리너스 폴링, 월터 콜툰이 도입한 CPK 컬러링 규약에 맞게 지정됩니다.실례로 흰색, 검은색, 빨간색 공은 각각 수소, 탄소, 산소 원자를 나타냅니다. 공간 충전 모형은 보다 현실적이며 실물 크기로 된 구로 원자를 나타냅니다. 그러나 구들은 원자들 사이에 존재하는 화학적 결합과 결합 각도를 보여주지 않습니다.구들은 원자의 상대적 크기에 비례하여 만들어지며, 가시적 크기로 조정할 경우 각 원자의 실제 모양과 차지하는 공간에 대한 명확한 이해를 제공합니다. 이 공간 충전 모형에서 사용되는 색깔도 CPK 색상 규약을 따릅니다.