Клетки иногда заражаются более чем одним вирусом одновременно. Когда два вируса разбирают, чтобы изучить их геномы для репликации в одной клетке, аналогичные области их геномов могут спариться и обмениваться последовательностями в процессе, называемом рекомбинацией. Кроме того, вирусы с сегментированными геномами могут менять сегменты в процессе, называемом пересортировка.
Некоторые заболевания могут инфицировать несколько видов. Например, свиньи могут быть инфицированы некоторыми вирусами человека и птиц, в дополнение к вирусам, которые обычно инфицируют свиней. Поскольку вирусы могут рекомбинироваться, когда они совместно инфицируют ту же клетку, свиньи могут действовать как “сосуды для смешивания”, которые рекомбинируют вирусы других видов для создания новых вирусов, которые иногда могут инфицировать людей. Это тревожное явление представляет собой путь, по которому инфекционный материал других видов может проникать в популяцию человека. Болезни, которые переходят от животных к человеку, известны как зоонозы. Люди могут быть очень восприимчивы к таким вирусам, потому что у нас нет истории воздействия, которые бы вызвали иммунитет.
Грипп А является ярким примером теории вирусного заболевания в «сосуде для смешивания». Исследования показали, что вирусы гриппа свиней, птиц и гриппа человека А мутировали внутри свиней. Эти события дали “двойной ресортировку” вирусам, которые содержали гены вирусов, приобретённы от человека и птиц и вирусы”тройной-ресортировки”, которые содержали гены от человека, птиц и свиней вирусов. В Нидерландах вирус-реассортант, состоящий из генов гриппа человека и птицы, передавался от свиней человеку.
