Visual Dynamics — это инструмент с открытым исходным кодом, который ускоряет реализацию и обучение в области моделирования молекулярной динамики с помощью Gromacs. Представленный протокол с легкостью проведет вас через этапы выполнения моделирования белка-лиганда, подготовленного в ACPYPE, и общие шаги к другим имитационным моделям.