1Bioinformatics and Medicinal Chemistry Laboratory (LABIOQUIM),Oswaldo Cruz Rondônia Foundation, 2National Institute of Epidemiology in the Western Amazon – EPIAMO, 3Postgraduate Program in Experimental Biology,Federal University of Rondônia (UNIR), 4Doctoral Program in Sciences – IOC/Fiocruz Rondônia Cooperation: Computational Biology and Systems (BCS)
Summary
O Visual Dynamics é uma ferramenta de código aberto que acelera implementações e aprendizado em simulação de dinâmica molecular usando Gromacs. O protocolo apresentado irá guiá-lo através das etapas para realizar uma simulação proteína-ligante preparada no ACPYPE com facilidade e etapas gerais para outros modelos de simulação.
