1Bioinformatics and Medicinal Chemistry Laboratory (LABIOQUIM),Oswaldo Cruz Rondônia Foundation, 2National Institute of Epidemiology in the Western Amazon – EPIAMO, 3Postgraduate Program in Experimental Biology,Federal University of Rondônia (UNIR), 4Doctoral Program in Sciences – IOC/Fiocruz Rondônia Cooperation: Computational Biology and Systems (BCS)
Summary
Visual Dynamics è uno strumento open source che accelera le implementazioni e l’apprendimento nella simulazione della dinamica molecolare utilizzando Gromacs. Il protocollo presentato vi guiderà attraverso i passaggi per eseguire una simulazione proteina-ligando preparata in ACPYPE con facilità e i passaggi generali verso altri modelli di simulazione.
