אנטרואידים מתגלים כמודל חדשני לחקר פיזיולוגיה ופתופיזיולוגיה של רקמות, פיתוח תרופות ורפואה רגנרטיבית. כאן, אנו מתארים מערכת תרבית דו-ממדית ממקור אנטרואידים של תאים ראשוניים בקר, המאפשרת תרבית משותפת עם סוגי תאי רקמה רלוונטיים. מודל זה מציע יתרון תרגומי למודלים של מחקר במערכת העיכול.
מערכות תרבית תאים אורגנואידים יכולות לשחזר את המורכבות שנצפתה ברקמות, מה שהופך אותן לשימושיות בחקר אינטראקציות בין פונדקאי לפתוגן, הערכת יעילות ורעילות של תרופות וביו-הנדסה של רקמות. עם זאת, יישום מודלים אלה מהסיבות המתוארות עשוי להיות מוגבל בגלל האופי התלת-ממדי (3D) של מודלים אלה. לדוגמה, שימוש במערכות תרבית אנטרואידים תלת-ממדיות לחקר מחלות עיכול הוא מאתגר בשל חוסר הנגישות של לומן המעי והחומרים המופרשים שלו. ואכן, גירוי של אורגנואידים תלת-ממדיים עם פתוגנים דורש מיקרו-הזרקה לומינלית, הפרעה מכנית של המבנה התלת-ממדי, או יצירת אנטרואידים אפיקליים. יתר על כן, אורגנואידים אלה אינם ניתנים לתרבית משותפת עם תאי מערכת החיסון ותאי סטרומה, מה שמגביל ניתוח מכניסטי מעמיק לדינמיקה פתופיזיולוגית. כדי לעקוף זאת, ביצענו אופטימיזציה של מערכת תרבית חד-שכבתית דו-ממדית (2D) של תא ראשוני בקר, המאפשרת תרבית משותפת עם סוגי תאים רלוונטיים אחרים. קריפטים איליאליים שבודדו מבקר בוגר בריא תורבתו כדי ליצור אורגנואידים תלת-ממדיים שנשמרו בהקפאה לשימוש עתידי. חד-שכבה דו-ממדית נוצרה באמצעות אנטרואידים תלת-ממדיים שקמו לתחייה ועברו ושיבשו כדי להניב תאים בודדים, שנזרעו על תוספות תרבית תאי טרנסוול מצופות קרום מרתף, ובכך חשפו את פני השטח האפי שלהם. הקוטביות החד-שכבתית של המעי, התמיינות התא ותפקוד המחסום אופיינו באמצעות מיקרוסקופ אימונופלואורסצנטי ומדידת התנגדות חשמלית טרנסאפיתליאלית. גירוי של פני השטח האפיקליים של המונושכבה חשף את הפונקציונליות הצפויה של החד-שכבתי, כפי שהודגם על ידי הפרשת ציטוקינים הן מהתאים האפיקליים והן ממדורי הבסיס. המודל החד-שכבתי הדו-ממדי שמקורו באנטרואידים טומן בחובו הבטחה גדולה בחקירת אינטראקציות פונדקאי-פתוגן ופיזיולוגיה של המעי, פיתוח תרופות ורפואה רגנרטיבית.
מודלים של בעלי חיים במחקר ממלאים תפקיד מכריע בשיפור ההבנה שלנו של פתופיזיולוגיה של מחלות והדינמיקה של התגובה החיסונית של המאכסן במהלך זיהום ותומכים בפיתוח אסטרטגיות מניעה וטיפול חדשניות 1,2,3,4. מודלים אלה תומכים בגילוי וקידום מחקרים בבעלי חיים והם המפתח להתקדמות המחקר בתחום בריאות האדם. במשך עשרות שנים, מודלים של מכרסמים עמדו בבסיס התקדמות במנגנוני החיסון ומחקר ביולוגי בסיסי למחלות אנושיות 3,5,6,7. בעוד מודלים של מכרסמים הם קריטיים בסינון ובמחקר התפתחות מוקדמת, מודלים של בעלי חיים גדולים מציעים השוואה רלוונטית יותר בחקר מחלות אנושיות הן בגילוי מוקדם והן במחקרי התפתחות מאוחרים יותר, כולל יעילות טיפולית ובדיקות בטיחות 1,3,4,5. משק החי מציע יתרונות ברורים בהשוואה למודלים של מכרסמים לתרגום יעיל יותר עבור יישומים אנושיים עבור מחלות מסוימות, כולל קריפטוספורידיוזיס, סלמונלוזיס, שחפת, וירוס סינסיטיאלי נשימתי וברוצלוזיס 1,7,8. ואכן, מחלות אלה ואחרות מתפתחות באופן ספונטני בבקר, החולק מספר פתוגנזה של מחלות ותהליכים חיסוניים מקבילים לבני אדם, וכאוכלוסייה מוחצנת, הבקר מחקה את ההטרוגניות הגנטית והסביבתית המשפיעה על תגובות החיסון האנושיות 5,8,9,10 . ניתן למקסם את היתרונות של מודלים של בקר לחקר מחלות זיהומיות על ידי שימוש תחילה במערכת תרביות מתוחכמת ולאחר מכן יישום מחקרי in vivo בהדרגה. השימוש הראשוני במערכת מורכבת ביותר של תרביות בקר יכול להפחית באופן משמעותי את מספר המחקרים בבעלי חיים תוך שיפור הסיכויים למחקר תרגומי ויישומי מוצלח. מודלים של תרבית צריכים לשחזר את תהליכי המחלה ברמת האיבר לקבלת תוקף ניבוי אופטימלי, תוך שמירה על מיקרו-סביבה טבעית של הרקמה מבחינה מרחבית ותפקודית.
התגובה החיסונית הרירית היא מערכת רבת פנים המורכבת ממחסום יעיל ביותר שנוצר על ידי אנטרוציטים במערכת העיכול ואוכלוסיות מגוונות של תאי חיסון הממוקמים מתחת לפני השטח של הרירית11. מערכת מורכבת זו היא קריטית במהלך זיהום בשמירה על הומאוסטזיס במערכת העיכול והפעלת הגנה חיסונית נגד פתוגנים אנטריים11. תקשורת בין אנטרוציטים לבין תאי מערכת החיסון המולדת הבסיסית יוזמת התפתחות של תגובות חיסוניות מגינות מפני מיקרואורגניזמים פתוגניים. לפיכך, מערכות תרבית שהן השוואתיות ברמת המורכבות שלהן נחוצות לחקירה אופטימלית של אינטראקציות פתוגן מארח-אנטרי והן יעילות ביותר בהבנת הפיזיולוגיה האנטרית וגילוי ופיתוח תרופות12,13. אורגנואידים הם מערכת תרבית חזקה הדומה לארכיטקטורה ולתפקוד של רקמת המקור14,15. הרב-תאיות של מודלים אלה מאפשרת לחקור את תפקידן של אוכלוסיות תאים מגוונות ואת האינטראקציות התאיות המעורבות בבריאות אנטרית ובמחלות12,14. עם זאת, מודלים אורגנואידים שמקורם בבני אדם במחקר מוגבלים כיום על ידי הקושי להשיג כמות מספקת ואיכות עקבית של תאי אפיתל מעיים אנושיים ויכולת קיום מוגבלת של תאים בתרבית. קווי תאים אימורטליים יכולים לשמש להשגת תפוקות גבוהות של תרביות הומולוגיות במודלים אלה באופן עקבי; עם זאת, תאים מותמרים מטבעם חסרים את המגוון ואת המורכבות התפקודית של תאי אפיתל שאינם מותמרים 16,17. היתרונות של שימוש בתרביות שמקורן ברקמת בקר כמודל לחקר מחלות ופיזיולוגיה של מערכת העיכול כוללים את הקלות שבה ניתן לקבל דגימות רקמה באופן עקבי מתורמים בריאים, שיפור יכולת הקיום של התא ומגוון תאי גדול יותר שניתן להשיג רק עם רקמה שאינה בת אלמוות. שעתוק רקמות השוואתי ואפיון אורגנואידים במעי חושפים דמיון בגנים אורתולוגיים שמורים ובפוטנציאלים תאיים בין בני אדם לבקר18. לכן, מערכת תרבית שמקורה באורגנואידים של בקר עשויה להיות מועילה בחקירת מחלות מעיים אנושיות, עם ממצאים הניתנים לתרגום בקלות לרפואה אנושית.
הפרוטוקול המתואר כאן מפרט פלטפורמה יעילה להערכת תגובות המארח לפתוגנים או תרכובות אנטריות ולפיזיולוגיה של המעי באמצעות מערכת תרבית תאים ראשונית דו-ממדית שמקורה באנטרואיד בקר. שלא כמו אורגנואידים תלת-ממדיים, מערכות תרבית דו-ממדיות הנוצרות על תוספות טרנסוול מאפשרות תרבית כפולה של תאי מעיים עם תאי חיסון או סטרומה, ומאפשרות לחקור את הדינמיקה ברמת הרקמה. עם יישומים במחקר ביו-רפואי, פיתוח תרופות ובדיקות יעילות, מודל פיזיולוגי רלוונטי זה יכול להועיל לבריאות ולקידום של בקר ובני אדם כאחד.
הפרוטוקול המוצג כאן מתאר מודל פיזיולוגי רלוונטי לחקירת פיזיולוגיה של המעי והפרעות אנטריות. מספר קבוצות מחקר תיארו את הדור של תרביות אנטרואידים של בקר, כולל חד-שכבות דו-ממדיות 16,19,20,21,22,23,24. בעוד שיצירת חד-שכבות אינה מאתגרת מבחינה טכנית באופן גלוי, כמה צעדים זעירים הם קריטיים בפיתוח תרבויות מוצלחות באופן עקבי. ככזה, יכולת השחזור של חד-שכבות דו-ממדיות באמצעות השיטות המתוארות בקצרה בספרות שפורסמה יכולה להיות מאתגרת עבור חוקר טירון בתחום האורגנואידים. הפרוטוקול המתואר כאן מותאם מפרוטוקולים אלה ומאלו שפורסמו במינים אחרים, ומספק מדריך שלב אחר שלב ליצירת חד-שכבות על תוספות טרנסוול הניתנות לשחזור ברמה גבוהה.
ניתן לשנות בקלות את הפרוטוקול המתואר כאן כך שיתאים למטרות הספציפיות של תכנון הניסוי או לזמינותם של ריאגנטים. ואכן, בעקבות פרוטוקול זה, תרביות מוצלחות יכולות להיות מושגות על ידי זריעת חד-שכבות בצפיפות תאים נמוכה יותר (למשל, 2.5 x 104) או בהיעדר FBS, כפי שמתואר בפרסומים אחרים24. עם זאת, שינוי פרמטרים אלה עשוי לדרוש תרבות מוגברת כדי ליצור monolayer confluent. לפיכך, אם גורמים אחרים המהווים חלק בלתי נפרד מתכנון המחקר, כולל תרבית משותפת עם תאי מערכת החיסון, מכתיבים מסלול זמן מסוים לניסוי, ניתן לשנות את צפיפות הזריעה לפי הצורך. בעוד שפורמולציות אחרות של קרום מרתף יכולות להיות מוחלפות במקום זו המשמשת בפרוטוקול זה ליצירת אנטרואידים תלת-ממדיים וחד-שכבות דו-ממדיות, אלה ידרשו אופטימיזציה מסוימת כדי לקבוע את היחס האופטימלי בין קרום המרתף למדיה.
ליישום של תוספות טרנסוול במתודולוגיה המתוארת יש יתרונות רבים על פני גידול monolayer על כלי פלסטיק קונבנציונאלי תרביות אנטרואידים 3D. בהשוואה ללוחות תרבית רקמה סטנדרטיים, שימוש בטרנסוולים לתרביות חד-שכבתיות מקדם התמיינות וארגון תאים באופן השומר על מראית עין של קריפטים במעיים14,25. מחסום אפיתל המעי חיוני במניעת טרנסלוקציה של רעלים ומיקרואורגניזמים לגוף ובו זמנית להקל על ספיגת חומרים מזינים. לכן, חשוב להבין כיצד שלמות המחסום של המעי מתפקדת במצב בריא ומשתנה במהלך הפרעות מעיים או בתגובה לתרכובות. שלא כמו תרביות אנטרואידים תלת-ממדיות, הערכה אובייקטיבית של שלמות מחסום המעי אפשרית כאשר משלבים חד-שכבות על טרנסוולים ומודדים TEER, כפי שמוצג כאן14,25. יצירת חד-שכבות דו-ממדיות על טרנסוולים מאפשרת גם תרבית כפולה עם סוגי תאים רלוונטיים כגון תאי חיסון או סטרומה. זה מאפשר לאפיין יחסי גומלין בעלי חשיבות קריטית בין תאי המעי לבין תאי המיקרו-סביבה של הרקמה, דבר שלא ניתן להשיג באמצעות תרביות תלת-ממדיות. חשיפת פני השטח האפיקליים של החד-שכבה לא רק מאפשרת חשיפה ניסיונית לפתוגנים ולתרכובות ואיסוף תוצרים לומינליים, אלא גם מאפשרת מחקרים על היבטים אחרים של פיזיולוגיה ומחלות של המעי, כולל חקירת מיקרוביוטה של המעי ופיזיולוגיה מולקולרית של ספיגה או הובלה13. שליטה עצמאית על משטחי המעי האפי והבסיסי היא יתרון מובהק על פני מודלים אנטרואידים תלת ממדיים.
באמצעות מספר ניסויים, זיהינו שלבים מרכזיים שתרמו להצלחת הפרוטוקול. בעוד דגימות רקמת מעי שלמות ניתן לשמור בקירור במשך הלילה ולעבד למחרת, דיסוציאציה רקמות ובידוד של שלבי מקטע קריפטה חייב להתבצע מיד כדי למנוע את ההתפוררות של שברי הקריפטה המבודדים. לאחר השלמת שטיפות PBS, צנטריפוגה של הקריפטות ב-Wash Media יכולה לסייע במניעת התמוטטות הקריפטה, כמפורט בשלב 2.3.10. כאשר עוברים את האנטרואידים או קוצרים אותם להיווצרות monolayer, חיוני להפריד את enteroids מן הכיפות BME. מדיית הכביסה חייבת להיות קרה כקרח כדי לסייע בהמסת ה-BME. לעומת זאת, שימוש ב-TrypLE שחומם מראש וסינון תרחיף התא פעמיים יכולים לעזור ליצור את התאים הבודדים הדרושים ליצירת חד-שכבתיות. לבסוף, תמרון ידני של הצלחת בצורת הספרה 8 יכול לעזור לפזר באופן שווה את התאים הבודדים על פני החדרת הטרנסוול.
מגבלה חשובה של פרוטוקול זה היא שהחד-שכבות הדו-ממדיות הופקו ממלאי אנטרואידים שנוצרו מהגה הולשטיין בוגר (>2 שנים). הבשלת מערכת העיכול בשוקיים עשויה לדרוש שינויים קלים בפרוטוקול המתואר כדי להניב תוצאות מיטביות. הבדלים ספציפיים לגזע בפיזיולוגיה של המעי של גזעי בקר תוארו בספרות26. אמנם לא ידוע אם הבדלים אלה יכולים להשפיע על אנטרואידים ועל יצירת מונושכבות לאחר מכן, אך אנו חושדים שכל הבדל יגרום לשינויים קלים בלבד בפרוטוקול שלנו. בנוסף, למודל התרבות הדו-ממדית יש כמה חסרונות מובנים. בהשוואה למודלים אנטרואידים תלת-ממדיים, תרביות דו-ממדיות עשויות להיות חסרות היבטים מסוימים של ארכיטקטורת רקמת המעי והמגוון התאי וליצור מגבלות ואתגרים הקשורים להתפשטות תרבית דו-ממדית13. עם זאת, מחקרים מראים כי חלק מהחד-שכבות יכולות לחקות את ארגון הקריפטההצפוי 27, ועל חלק מהמגבלות הללו ניתן אפילו להתגבר על ידי הקמת תרבויות דו-ממדיות עם ממשק אוויר-נוזל. עם זאת, יש לשקול במלואן את מגבלותיו של מודל זה כדי לקבוע אם יישומו מתאים לשאלה הניסויית הנשאלת.
פרוטוקול זה מתאר מערכת תרבית אופטימלית המדמה את מערכת העיכול של בקר באמצעות אנטרואידים שמקורם באילאום הבקר ליצירת מונושכבות על תוספות טרנסוול. עם מגוון רחב של יישומים, החל ממחקר מחלות זיהומיות ועד גילוי תרופות ורפואה רגנרטיבית, מערכת תרביות בעלת תפוקה גבוהה זו יכולה להוביל לפיתוח חסר תקדים של אסטרטגיות מניעה וטיפול שיכולות להועיל הדדית לבריאות בעלי חיים ובני אדם.
The authors have nothing to disclose.
אנו מכירים בשימוש במתקן הליבה התאית והמולקולרית באוניברסיטת מידווסטרן.
0.2 mL pipette tip | MidSci | PR-200RK-S | |
1 µm PET 24-well cell culture inserts | Corning | 353104 | |
1000 mL pipette tip | MidSci | PR-1250RK-S | |
22 G needle | Becton, Dickinson and Company | 305156 | |
24-well culture vessel | Corning | 353504 | |
40 μm cell strainer | Corning | 431750 | |
50 mL centrifuge tube | Fisher scientific | 14-955-240 | |
5-mL pipet tip | Fisher scientific | 30075307 | |
5 mL syringe | Becton, Dickinson and Company | 309647 | |
5 mL tube | Eppendorf | 30119401 | |
Anti-Cytokeratin -18 (C-04) | Abcam | AB668-1001 | |
B-27 supplement without vitamin A | Gibco | 12-587-010 | |
Belysa software | Luminex | 40-122 | Immunoassay curve fitting software |
Bovine serum albumin (BSA) | Fisher bioreagents | BP9704-100 | |
Caspofungin acetate | Selleckchem | S3073 | |
Cell lifter | Fisher Scientific | 08-100-241 | |
Chromogranin-A (E-5) | Santa Cruz Biotechnology | SC-271738 | |
Coverslips | Fisher scientific | 12-540-C | |
Cryovials | Neptune scientific | 3471.X | |
Cultrex Ultimatrix RGF BME | R&D Systems | BME001-05 | |
DAPI | MilliporeSigma | D9542-5MG | |
Dissecting scissors | VWR | 82027-588 | |
Dithiothreitol (DTT) solution | Thermo Scientific | FERR0861 | |
DMEM/ F-12 1.1 medium (with L-glutamine, without HEPES) | Cytiva | SH30271.01 | |
E-cadherin | Cell Signaling Technology | #3195 | |
Ethylenediaminetetraacetic acid | Fisher Scientific | BP2482500 | |
FBS | Corning | MT35070CV | |
Gentamicin | Gibco | 15710064 | |
Glass microscope slide | Fisher scientific | 12-550-07 | |
Goat anti-mouse Alexa Fluor 488 | Invitrogen | A11001 | |
Goat anti-mouse Alexa Fluor 647 | Invitrogen | A21235 | |
Goat anti-rabbit Alexa Fluor 555 | Invitrogen | A21428 | |
Hemacytometer | Bio-Rad | 1450015 | |
IntestiCult organoid Differentiation medium (Human) | StemCell Technologies | 100-0214 | |
IntestiCult organoid growth medium (Human) | StemCell Technologies | 0-6010 | |
Keyence BZ-X700 | Keyence | BZ-X700 | |
LY2157299 (Galunisertib) | Selleckchem | S2230 | |
MAGPIX system | Luminex | Magpix system | Compact multiplexing unit |
Microscope | Keyence | BZ-X700 | |
MILLIPLEX Bovine Cytokine/Chemokine Magnetic Bead Panel | MilliporeSigma | BCYT1-33K | Bead-based multiplex assay |
Mr. Frosty container | Nalgene | 5100-0001 | |
Non-Enzymatic Cell Dissociation Solution | ATCC | 30-2103 | |
NutriFreeze D10 Cryopreservation Media | Biological Industries | 05-713-1B | |
Orbital shaking platform | Thermo Fisher | 88880021 | |
Pam3Csk4 | invivogen | tlrl-pms | |
Parafilm sealing film | dot scientific inc. | #HS234526C | |
Paraformaldehyde 16% solution | Electron Microscopy Sciences | 15710 | |
Phalloidin-FITC | R&D Systems | 5782/12U | |
Phosphate buffered saline | Fisher Scientific | BP399-20 | |
Prolong Glass Antifade | Invitrogen | P36982 | |
Rabbit anti-human Lyzozyme (EC3.2.1.17) | Agilent technologies | A009902-2 | |
SB202190 (FHPI) | Selleckchem | S1077 | |
Shaking water bath | Thermo Fisher | MaxQ 7000 | |
Sodium Azide | VWR | BDH7465-2 | |
Streptomycin | Teknova | S6525 | |
Trypan Blue dye | Gibco | 15250-061 | |
TrypLE express enzyme | Life technologies | 12604013 | |
Tween 20 | Fisher Scientific | BP337 | |
Voltohmmeter | MilliporeSigma | Millicell ERS-2 | |
Y-27632 | Selleckchem | S1049 |