Kulometrik respirometri, küçük organizmaların metabolik hızını ölçmek için idealdir. Bu çalışmada Drosophila melanogaster için uyarlandığında, ölçülenO2 tüketimi, önceki çalışmalarda vahşi tip D. melanogaster için bildirilen aralık içindeydi. Daha küçük ve daha az aktif olan CASK mutantları tarafından sinek başınaO2 tüketimi, vahşi tipten önemli ölçüde daha düşüktü.
Kulometrik mikrorespirometri, istikrarlı bir ortamı korurken küçük organizmalarınO2 tüketimini ölçmek için basit ve ucuz bir yöntemdir. Bir kulometrik mikrorespirometre,O2’nin tüketildiği ve organizma tarafından üretilen CO2’nin emici bir ortam tarafından uzaklaştırıldığı hava geçirmez bir odadan oluşur. Ortaya çıkan basınç düşüşü elektrolitik O2 üretimini tetikler ve üretilenO2 miktarı, onu üretmek için kullanılan yük miktarı kaydedilerek ölçülür. Bu çalışmada yöntem, aparatın hassasiyeti ve yüksek stabilite için optimize edilmiş çevresel koşullar ile küçük gruplar halinde test edilen Drosophila melanogaster’e uyarlanmıştır. Bu aparattaki yabani tip sinekler tarafından tüketilen O2 miktarı, önceki çalışmalarla ölçülenle tutarlıdır. Daha küçük ve daha az aktif olduğu bilinen CASK mutantları tarafından kütleye özgüO2 tüketimi, konjenik kontrollerden farklı değildi. Bununla birlikte, CASK mutantlarının küçük boyutu, uçuş başınaO2 tüketiminde önemli bir azalmaya neden oldu. Bu nedenle, mikrorespirometre D. melanogaster’de O2 tüketimini ölçebilir, genotipler arasındaki mütevazı farklılıkları ayırt edebilir ve metabolik hızları ölçmek için çok yönlü bir araç ekler.
Metabolik hızı ölçme yeteneği, bir organizmanın çevresel bağlamında tam olarak anlaşılması için çok önemlidir. Örneğin, yaşam süresi1’deki rolünü, diyetin metabolizmadakirolünü 2 veya hipoksik stres eşiğini3 anlamak için metabolik hızı ölçmek gerekir.
Metabolizma hızını ölçmek için iki genel yaklaşım vardır4. Doğrudan kalorimetri, ısı üretimini ölçerek doğrudan enerji harcamasını ölçer. Dolaylı kalorimetri, enerji üretimini başka yollarla, genellikle O 2 tüketiminin (VO2), CO2 üretiminin veya her ikisinin respirometrik ölçümü yoluyla ölçer. Drosophila melanogaster5 dahil olmak üzere küçük ektotermlere doğrudan kalorimetri uygulanmış olsa da, respirometri teknik olarak daha basittir ve daha yaygın olarak kullanılır.
Yabani tip ve mutant D. melanogaster’de metabolik hızı ölçmek için çeşitli respirometri formları başarıyla kullanılmış ve sıcaklık6, sosyal çevre 3, diyet 3,7 ve nörogelişimsel bozuklukların8 metabolik etkileri hakkında fikir vermiştir. Bunlar, maliyet ve karmaşıklık açısından önemli ölçüde farklılık gösteren iki sınıfa ayrılır. Manometri, sineklerin bir CO2 emici içeren ve ince bir kılcal damar yoluyla bir sıvı rezervuarına bağlanan kapalı bir odaya yerleştirildiği en basit ve en ucuz 9,10’dur. O 2 tüketildikçe ve CO2 emildikçe, odadaki basınç azalır ve sıvı kılcal damara çekilir. Kılcal damarın sıvı dolu hacmi bu nedenle VO2 ile orantılıdır. Kılcal damardaki sıvının uyguladığı kuvveti telafi eden daha ayrıntılı versiyonlar da D. melanogaster 1’de kullanılmıştır. Manometri, basit ve ucuz olma avantajlarına sahiptir, ancak basınca duyarlı olduğu için sabit çevre koşulları gerektirir. Ayrıca, tüketilen O2 yerine konmadığı için, O2’nin (PO2) kısmi basıncı odaların içinde kademeli olarak azalır.
Gaz analizi kullanan respirometri de D. melanogaster için düzenli olarak kullanılmaktadır. Bu durumda, gazlar sinek içeren kapalı odalardan düzenli aralıklarla örneklenir ve bir kızılötesi analizöregönderilir 2,6,11. Bu tip aparatlar, ticari olarak temin edilebilmesi, çevresel koşullara daha az duyarlı olması ve numune alma sırasında gazların yenilenmesi ve böylece PO2’nin stabil kalması gibi avantajlara sahiptir. Bununla birlikte, ekipmanın çalıştırılması pahalı ve karmaşık olabilir.
Yakın zamanda geliştirilen bir kulometrik mikrorespirometre12, mevcut sistemlere ucuz, hassas ve istikrarlı bir alternatif sunar. Uygulamada, bir organizmaO2 tükettiği hava geçirmez bir odaya yerleştirilir ve solunan CO2 emici bir malzeme tarafından uzaklaştırılır, bu da oda basıncında net bir azalmaya neden olur. İç basınç önceden ayarlanmış bir eşiğe (AÇIK eşik) düştüğünde, akım bir elektrolitikO2 jeneratöründen geçirilir ve basıncı elektrolizi durduran ikinci bir eşiğe (OFF-eşik) döndürür. O2 jeneratörü boyunca yük transferi, odayı yeniden basınçlandırmak için gereken O2 miktarı ile doğru orantılıdır ve bu nedenle organizma4 tarafından tüketilenO2’yi ölçmek için kullanılabilir. Yöntem oldukça hassastır, V O2’yi hassas bir şekilde ölçer ve O2’nin düzenli olarak değiştirilmesi, PO2’yi saatler veya günler boyunca neredeyse sabit bir seviyede tutabilir.
Bu çalışmada kullanılan kulometrik mikrorespirometre, çok modlu (basınç, sıcaklık ve nem) bir elektronik sensör kullanır. Sensör, basınçtaki küçük değişiklikleri algılayan ve düşük basınç eşiğine12 ulaşıldığındaO2 üretimini etkinleştiren bir mikrodenetleyici tarafından çalıştırılır. Bu aparat raf parçalarından monte edilir, çok çeşitli odalar ve deney ortamları ile kullanılabilir ve vücut kütlesi ve sıcaklığının Tenebrio molitor böceği üzerindeki etkilerini incelemek için başarıyla kullanılmıştır. Bu çalışmada, mikrorespirometre, T. molitor kütlesinin yaklaşık% 1’ine sahip olan D. melanogaster’de O2 tüketimini ölçmek için uyarlanmıştır. O2 üretimini aktive etme eşiği düşürülerek aparatın hassasiyeti arttırılmıştır ve sıcaklık kontrollü bir su banyosunda deneyler yapılarak ve odaların içindeki nem% 100 veya buna yakın tutularak çevresel stabilite arttırılmıştır.
Membranla ilişkili guanilat kinazlar (MAGUK) ailesinin bir parçası olan CASK (Calmodulin’e bağımlı Serin Protein Kinaz) proteini, farklı çoklu protein komplekslerinde moleküler bir iskeledir ve CASK’deki mutasyonlar, insanlarda ve D. melanogaster’de nörogelişimsel bozukluklarla ilişkilidir 13,14. Canlı bir D. melanogaster mutantı, CASKΔ18, dopaminerjik nöronların 15 aktivitesini bozar ve konjenik kontrollere kıyasla aktivite seviyelerini %50’den fazla azaltır14,16. CASK mutantlarının azalmış aktivite seviyeleri ve katekolaminlerin metabolizmayı düzenlemedeki rolü17 nedeniyle, standart metabolik hızlarının ve dolayısıylaO2 tüketiminin kontrollere kıyasla önemli ölçüde azalacağını varsaydık.
O2 tüketimi CASKΔ18 ve bunların vahşi tip türdeşleri w(ex33) cinsinden ölçülmüştür. Sinek grupları respirometri odalarına yerleştirildi, O 2 tüketimi ölçüldü, O2 tüketimi hesaplandı ve hem kütleye özgü hem de sinek başına ifade edildi. Cihaz, önceki çalışmalarla tutarlı olan vahşi tip sineklerde V O2 kaydetti ve vahşi tip ve CASK mutant sineklerinin sinek başınaO2 tüketimini ayırt edebildi.
Yukarıdaki prosedür, elektronik bir kulometrik mikrorespirometre kullanılarak D. Melanogaster’de O2 tüketiminin ölçümünü göstermektedir. Yabani tip D. melanogaster’de O2 tüketimi için elde edilen veriler, diğerleri tarafından bildirilenden biraz daha düşük olmasına rağmen, çeşitli yöntemler kullanılarak önceki yayınların çoğunda açıklanan aralıklar içindeydi (Tablo 1) 3,6.</p…
The authors have nothing to disclose.
Arizona Üniversitesi’nden Dr. Linda Restifo’ya CASK mutantlarınınO2 tüketimini test etmeyi önerdiği ve CASK mutantlarını ve onların konjenik kontrollerini gönderdiği için teşekkür ederiz. Yayın ücretleri, College Park Üniversitesi Biyoloji Bölümü’nden Bölüm Yeniden Yatırım Fonu tarafından sağlandı. Uzay ve bazı ekipmanlar Shady Grove’daki Üniversiteler tarafından sağlandı.
19/22 Thermometer Adapter | Wilmad-Labglass | ML-280-702 | Sensor Plug |
2 ml Screwcap Tubes | Fisher | 3464 | O2 generator |
2-Pin Connector | Zyamy | 40PIN-RFB10 | O2 generator: cut to 2-pin |
4-Pin Female Connector | TE Connectivity | 215299-4 | Sensor Plug |
5 ml Polypropylene Tube | Falcon | 352063 | Cut to 5.5 cm and perforated |
50 ml Schlenk Tube 19/22 Joint | Laboy | HMF050804 | Chamber |
6-Conductor Cable | Zenith | 6-Conductor 26 ga | Cable |
6-Pin Female Bulkhead Connector | Switchcraft | 17982-6SG-300 | Controller |
6-Pin Female Connector | Switchcraft | 18982-6SG-522 | Sensor plug |
6-Pin Male Connector | Switchcraft | 16982-6PG-522 | Cable |
800 ul centrifuge tube | Fisher | 05-408-120 | Soda Lime Cartridge |
ABS Plastic Enclosure | Bud Industries | PS-11533-G | Controller |
Arduino Nano Every | Arduino LLC | ABX00028 | Controller |
BME 280 Sensor | DIYMall | FZ1639-BME280 | Sensor Plug |
Circuit Board | Lheng | 5 X 7 cm | Controller |
Copper Sulfate | BioPharm | BC2045 | O2 Generator |
Computer | Azulle | Byte4 | Data Acquisition |
Cotton Rolls | Kajukajudo | #2 | Cut in half to plug fly tubes Cut in quarters for humidity |
Environmental Chamber | Percival | I30 VLC8 | Fly Care |
Epoxy | JB Weld | Plastic Bonder | Secure Electrodes in O2 Generator |
Fly Food | Lab Express | Type R | Fly Care |
Keck Clamps | uxcell | a20092300ux0418 | Secures glass joint of chamber to plug |
Low-Viscosity Epoxy | Loctite | E-30CL | Sensor Plug |
OLED Display | IZOKEE | IZKE31-IIC-WH-3 | Controller |
Platinum Wire 24 ga | uGems | 14349 | O2 generator |
Silicone grease | Dow-Corning | High Vacuum Grease | Seals chamber-plug connection |
Soda Lime | Jorvet | JO553 | CO2 absorption |
Toggle Switch | E-Switch | 100SP1T1B1M1QEH | Controller |
USB Cable | Sabrent | CB-UM63 | Controller |
USB Hub | Atolla | Hub 3.0 | Connect controllers to computer |
Water bath | Amersham | 56-1165-33 | Temperature Control |
Water Bath Tank | Glass Cages | 15-liter rimless acrylic | Bath for Respirometers |