Summary

Kulometrik Mikrorespirometri Kullanılarak Drosophila melanogaster'de O2 Tüketiminin Ölçülmesi

Published: July 07, 2023
doi:

Summary

Kulometrik respirometri, küçük organizmaların metabolik hızını ölçmek için idealdir. Bu çalışmada Drosophila melanogaster için uyarlandığında, ölçülenO2 tüketimi, önceki çalışmalarda vahşi tip D. melanogaster için bildirilen aralık içindeydi. Daha küçük ve daha az aktif olan CASK mutantları tarafından sinek başınaO2 tüketimi, vahşi tipten önemli ölçüde daha düşüktü.

Abstract

Kulometrik mikrorespirometri, istikrarlı bir ortamı korurken küçük organizmalarınO2 tüketimini ölçmek için basit ve ucuz bir yöntemdir. Bir kulometrik mikrorespirometre,O2’nin tüketildiği ve organizma tarafından üretilen CO2’nin emici bir ortam tarafından uzaklaştırıldığı hava geçirmez bir odadan oluşur. Ortaya çıkan basınç düşüşü elektrolitik O2 üretimini tetikler ve üretilenO2 miktarı, onu üretmek için kullanılan yük miktarı kaydedilerek ölçülür. Bu çalışmada yöntem, aparatın hassasiyeti ve yüksek stabilite için optimize edilmiş çevresel koşullar ile küçük gruplar halinde test edilen Drosophila melanogaster’e uyarlanmıştır. Bu aparattaki yabani tip sinekler tarafından tüketilen O2 miktarı, önceki çalışmalarla ölçülenle tutarlıdır. Daha küçük ve daha az aktif olduğu bilinen CASK mutantları tarafından kütleye özgüO2 tüketimi, konjenik kontrollerden farklı değildi. Bununla birlikte, CASK mutantlarının küçük boyutu, uçuş başınaO2 tüketiminde önemli bir azalmaya neden oldu. Bu nedenle, mikrorespirometre D. melanogaster’de O2 tüketimini ölçebilir, genotipler arasındaki mütevazı farklılıkları ayırt edebilir ve metabolik hızları ölçmek için çok yönlü bir araç ekler.

Introduction

Metabolik hızı ölçme yeteneği, bir organizmanın çevresel bağlamında tam olarak anlaşılması için çok önemlidir. Örneğin, yaşam süresi1’deki rolünü, diyetin metabolizmadakirolünü 2 veya hipoksik stres eşiğini3 anlamak için metabolik hızı ölçmek gerekir.

Metabolizma hızını ölçmek için iki genel yaklaşım vardır4. Doğrudan kalorimetri, ısı üretimini ölçerek doğrudan enerji harcamasını ölçer. Dolaylı kalorimetri, enerji üretimini başka yollarla, genellikle O 2 tüketiminin (VO2), CO2 üretiminin veya her ikisinin respirometrik ölçümü yoluyla ölçer. Drosophila melanogaster5 dahil olmak üzere küçük ektotermlere doğrudan kalorimetri uygulanmış olsa da, respirometri teknik olarak daha basittir ve daha yaygın olarak kullanılır.

Yabani tip ve mutant D. melanogaster’de metabolik hızı ölçmek için çeşitli respirometri formları başarıyla kullanılmış ve sıcaklık6, sosyal çevre 3, diyet 3,7 ve nörogelişimsel bozuklukların8 metabolik etkileri hakkında fikir vermiştir. Bunlar, maliyet ve karmaşıklık açısından önemli ölçüde farklılık gösteren iki sınıfa ayrılır. Manometri, sineklerin bir CO2 emici içeren ve ince bir kılcal damar yoluyla bir sıvı rezervuarına bağlanan kapalı bir odaya yerleştirildiği en basit ve en ucuz 9,10’dur. O 2 tüketildikçe ve CO2 emildikçe, odadaki basınç azalır ve sıvı kılcal damara çekilir. Kılcal damarın sıvı dolu hacmi bu nedenle VO2 ile orantılıdır. Kılcal damardaki sıvının uyguladığı kuvveti telafi eden daha ayrıntılı versiyonlar da D. melanogaster 1’de kullanılmıştır. Manometri, basit ve ucuz olma avantajlarına sahiptir, ancak basınca duyarlı olduğu için sabit çevre koşulları gerektirir. Ayrıca, tüketilen O2 yerine konmadığı için, O2’nin (PO2) kısmi basıncı odaların içinde kademeli olarak azalır.

Gaz analizi kullanan respirometri de D. melanogaster için düzenli olarak kullanılmaktadır. Bu durumda, gazlar sinek içeren kapalı odalardan düzenli aralıklarla örneklenir ve bir kızılötesi analizöregönderilir 2,6,11. Bu tip aparatlar, ticari olarak temin edilebilmesi, çevresel koşullara daha az duyarlı olması ve numune alma sırasında gazların yenilenmesi ve böylece PO2’nin stabil kalması gibi avantajlara sahiptir. Bununla birlikte, ekipmanın çalıştırılması pahalı ve karmaşık olabilir.

Yakın zamanda geliştirilen bir kulometrik mikrorespirometre12, mevcut sistemlere ucuz, hassas ve istikrarlı bir alternatif sunar. Uygulamada, bir organizmaO2 tükettiği hava geçirmez bir odaya yerleştirilir ve solunan CO2 emici bir malzeme tarafından uzaklaştırılır, bu da oda basıncında net bir azalmaya neden olur. İç basınç önceden ayarlanmış bir eşiğe (AÇIK eşik) düştüğünde, akım bir elektrolitikO2 jeneratöründen geçirilir ve basıncı elektrolizi durduran ikinci bir eşiğe (OFF-eşik) döndürür. O2 jeneratörü boyunca yük transferi, odayı yeniden basınçlandırmak için gereken O2 miktarı ile doğru orantılıdır ve bu nedenle organizma4 tarafından tüketilenO2’yi ölçmek için kullanılabilir. Yöntem oldukça hassastır, V O2’yi hassas bir şekilde ölçer ve O2’nin düzenli olarak değiştirilmesi, PO2’yi saatler veya günler boyunca neredeyse sabit bir seviyede tutabilir.

Bu çalışmada kullanılan kulometrik mikrorespirometre, çok modlu (basınç, sıcaklık ve nem) bir elektronik sensör kullanır. Sensör, basınçtaki küçük değişiklikleri algılayan ve düşük basınç eşiğine12 ulaşıldığındaO2 üretimini etkinleştiren bir mikrodenetleyici tarafından çalıştırılır. Bu aparat raf parçalarından monte edilir, çok çeşitli odalar ve deney ortamları ile kullanılabilir ve vücut kütlesi ve sıcaklığının Tenebrio molitor böceği üzerindeki etkilerini incelemek için başarıyla kullanılmıştır. Bu çalışmada, mikrorespirometre, T. molitor kütlesinin yaklaşık% 1’ine sahip olan D. melanogaster’de O2 tüketimini ölçmek için uyarlanmıştır. O2 üretimini aktive etme eşiği düşürülerek aparatın hassasiyeti arttırılmıştır ve sıcaklık kontrollü bir su banyosunda deneyler yapılarak ve odaların içindeki nem% 100 veya buna yakın tutularak çevresel stabilite arttırılmıştır.

Membranla ilişkili guanilat kinazlar (MAGUK) ailesinin bir parçası olan CASK (Calmodulin’e bağımlı Serin Protein Kinaz) proteini, farklı çoklu protein komplekslerinde moleküler bir iskeledir ve CASK’deki mutasyonlar, insanlarda ve D. melanogaster’de nörogelişimsel bozukluklarla ilişkilidir 13,14. Canlı bir D. melanogaster mutantı, CASKΔ18, dopaminerjik nöronların 15 aktivitesini bozar ve konjenik kontrollere kıyasla aktivite seviyelerini %50’den fazla azaltır14,16. CASK mutantlarının azalmış aktivite seviyeleri ve katekolaminlerin metabolizmayı düzenlemedeki rolü17 nedeniyle, standart metabolik hızlarının ve dolayısıylaO2 tüketiminin kontrollere kıyasla önemli ölçüde azalacağını varsaydık.

O2 tüketimi CASKΔ18 ve bunların vahşi tip türdeşleri w(ex33) cinsinden ölçülmüştür. Sinek grupları respirometri odalarına yerleştirildi, O 2 tüketimi ölçüldü, O2 tüketimi hesaplandı ve hem kütleye özgü hem de sinek başına ifade edildi. Cihaz, önceki çalışmalarla tutarlı olan vahşi tip sineklerde V O2 kaydetti ve vahşi tip ve CASK mutant sineklerinin sinek başınaO2 tüketimini ayırt edebildi.

Protocol

1. Sinek yetiştirme ve toplama Sinekleri 25 °C’de standart Drosophila gıdası içeren dar şişelerde muhafaza edin.NOT: Her genotip için numune büyüklüğü, her biri aşağıda açıklandığı gibi kurulmuş 15-25 sinek içeren tek bir respirometre odasından oluşan en az dokuz kopyadan oluşmalıdır. Sinekleri 2-3 günde bir aktarın. CO2 ile sinekleri uyuşturun, her genotipten 15-25 erkekten oluşan grupları toplayın ve her grubu taze,…

Representative Results

Respirometre kontrolörünün basınç ve akım çıkışları, Şekil 3A’da bir deneyde bir oda için gösterilmiştir. İlk, uzun akım darbesi, odayı ortam basıncından (yaklaşık 992 hPa) önceden ayarlanmış 1017 hPa’lık KAPALI eşiğine kadar basınçlandırdı. Sinekler O 2 ve CO 2 tükettikçe, basınç 1016 hPa’lık AÇIK eşiğine ulaşana kadar yavaşça azaldı ve bu da O2 jeneratörü aracılığıyla akımı etkinleştirdi. Gösterilen örn…

Discussion

Yukarıdaki prosedür, elektronik bir kulometrik mikrorespirometre kullanılarak D. Melanogaster’de O2 tüketiminin ölçümünü göstermektedir. Yabani tip D. melanogaster’de O2 tüketimi için elde edilen veriler, diğerleri tarafından bildirilenden biraz daha düşük olmasına rağmen, çeşitli yöntemler kullanılarak önceki yayınların çoğunda açıklanan aralıklar içindeydi (Tablo 1) 3,6.</p…

Disclosures

The authors have nothing to disclose.

Acknowledgements

Arizona Üniversitesi’nden Dr. Linda Restifo’ya CASK mutantlarınınO2 tüketimini test etmeyi önerdiği ve CASK mutantlarını ve onların konjenik kontrollerini gönderdiği için teşekkür ederiz. Yayın ücretleri, College Park Üniversitesi Biyoloji Bölümü’nden Bölüm Yeniden Yatırım Fonu tarafından sağlandı. Uzay ve bazı ekipmanlar Shady Grove’daki Üniversiteler tarafından sağlandı.

Materials

19/22 Thermometer Adapter Wilmad-Labglass ML-280-702 Sensor Plug
2 ml Screwcap Tubes Fisher 3464 O2 generator
2-Pin Connector Zyamy 40PIN-RFB10 O2 generator: cut to 2-pin
4-Pin Female Connector TE Connectivity 215299-4 Sensor Plug
5 ml Polypropylene Tube Falcon 352063 Cut to 5.5 cm and perforated 
50 ml Schlenk Tube 19/22 Joint Laboy HMF050804 Chamber
6-Conductor Cable Zenith 6-Conductor 26 ga Cable
6-Pin Female Bulkhead Connector Switchcraft 17982-6SG-300 Controller
6-Pin Female Connector Switchcraft 18982-6SG-522 Sensor plug
6-Pin Male Connector Switchcraft 16982-6PG-522 Cable
800 ul centrifuge tube Fisher 05-408-120 Soda Lime Cartridge
ABS Plastic Enclosure Bud Industries PS-11533-G Controller
Arduino Nano Every Arduino LLC ABX00028 Controller
BME 280 Sensor DIYMall FZ1639-BME280 Sensor Plug
Circuit Board Lheng 5 X 7 cm Controller
Copper Sulfate BioPharm BC2045 O2 Generator
Computer Azulle Byte4 Data Acquisition
Cotton Rolls Kajukajudo #2 Cut in half to plug fly tubes
Cut in quarters for humidity
Environmental Chamber Percival I30 VLC8 Fly Care
Epoxy JB Weld Plastic Bonder Secure Electrodes in O2 Generator
Fly Food Lab Express Type R Fly Care
Keck Clamps uxcell a20092300ux0418 Secures glass joint of chamber to plug
Low-Viscosity Epoxy Loctite E-30CL Sensor Plug
OLED Display IZOKEE IZKE31-IIC-WH-3 Controller
Platinum Wire 24 ga uGems 14349 O2 generator
Silicone grease Dow-Corning High Vacuum Grease Seals chamber-plug connection
Soda Lime Jorvet JO553 CO2 absorption
Toggle Switch E-Switch 100SP1T1B1M1QEH Controller
USB Cable Sabrent CB-UM63 Controller
USB Hub Atolla Hub 3.0 Connect controllers to computer
Water bath Amersham 56-1165-33 Temperature Control
Water Bath Tank Glass Cages 15-liter rimless acrylic Bath for Respirometers

References

  1. Arking, R., Buck, S., Wells, R. A., Pretzlaff, R. Metabolic rates in genetically based long lived strains of Drosophila. Experimental Gerontology. 23 (1), 59-76 (1988).
  2. Henry, Y., Overgaard, J., Colinet, H. Dietary nutrient balance shapes phenotypic traits of Drosophila melanogaster in interaction with gut microbiota. Comparative Biochemistry and Physiology Part A: Molecular & Integrative Physiology. 241, 110626 (2020).
  3. Burggren, W., Souder, B. M., Ho, D. H. Metabolic rate and hypoxia tolerance are affected by group interactions and sex in the fruit fly (Drosophila melanogaster): new data and a literature survey. Biology Open. 6, 471-480 (2017).
  4. Lighton, J. R. B. . Measuring Metabolic Rates. , (2019).
  5. Fiorino, A., et al. Parallelized, real-time, metabolic-rate measurements from individual Drosophila. Scientific Reports. 8 (1), 14452 (2018).
  6. Berrigan, D., Partridge, L. Influence of temperature and activity on the rate of adult Drosophila melanogaster. Comparative Biochemistry and Physiology. 118 (4), 1301-1307 (1997).
  7. Hulbert, A. J., et al. Metabolic rate is not reduced by dietary-restriction or by lowered insulin/IGF-1 signalling and is not correlated with individual lifespan in Drosophila melanogaster. Experimental Gerontology. 39 (8), 1137-1143 (2004).
  8. Botero, V., et al. Neurofibromin regulates metabolic rate via neuronal mechanisms in Drosophila. Nature Communications. 12 (1), 4285 (2021).
  9. Yatsenko, A. S., Marrone, A. K., Kucherenko, M. M., Shcherbata, H. R. Measurement of Metabolic Rate in Drosophila using Respirometry. Journal of Visualized Experiments. (88), 51681 (2014).
  10. Ross, R. E. Age-specific decrease in aerobic efficiency associated with increase in oxygen free radical production in Drosophila melanogaster. Journal of Insect Physiology. 46 (11), 1477-1480 (2000).
  11. Brown, E. B., Klok, J., Keene, A. C. Measuring metabolic rate in single flies during sleep and waking states via indirect calorimetry. Journal of Neuroscience Methods. 376, 109606 (2022).
  12. Sandstrom, D. J., Offord, B. W. Measurement of oxygen consumption in Tenebrio molitor using a sensitive, inexpensive, sensor-based coulometric microrespirometer. Journal of Experimental Biology. 225 (9), jeb243966 (2022).
  13. Becker, M., et al. Presynaptic dysfunction in CASK-related neurodevelopmental disorders. Translational Psychiatry. 10 (1), 312 (2020).
  14. Slawson, J. B., et al. Central Regulation of Locomotor Behavior of Drosophila melanogaster Depends on a CASK Isoform Containing CaMK-Like and L27 Domains. 유전학. 187 (1), 171-184 (2011).
  15. Slawson, J. B., et al. Regulation of dopamine release by CASK-Î2 modulates locomotor initiation in Drosophila melanogaster. Frontiers in Behavioral Neuroscience. 8, (2014).
  16. Andrew, D. R., et al. Spontaneous motor-behavior abnormalities in two Drosophila models of neurodevelopmental disorders. Journal of Neurogenetics. 35 (1), 1-22 (2021).
  17. Ueno, T., Tomita, J., Kume, S., Kume, K. Dopamine Modulates Metabolic Rate and Temperature Sensitivity in Drosophila melanogaster. PLoS ONE. 7 (2), e31513 (2012).
  18. Van Voorhies, W. A., Khazaeli, A. A., Curtsinger, J. W. Lack of correlation between body mass and metabolic rate in Drosophila melanogaster. Journal of Insect Physiology. 50 (5), 445-453 (2004).
  19. Norton, F. J. Permeation of gases through solids. Journal of Applied Physics. 28 (1), 34-39 (1957).
  20. Hoegh-Guldberg, O., Manahan, D. T. Coulometric measurement of oxygen-consumption during development of marine invertebrate embryos and larvae. Journal of Experimental Biology. 198 (1), 19-30 (1995).
  21. Sohal, R. S., Agarwal, A., Agarwal, S., Orr, W. C. Simultaneous overexpression of copper- and zinc-containing superoxide dismutase and catalase retards age-related oxidative damage and increases metabolic potential in Drosophila melanogaster. Journal of Biological Chemistry. 270 (26), 15671-15674 (1995).
  22. Van Voorhies, W. A., Melvin, R. G., Ballard, J. W. O., Williams, J. B. Validation of manometric microrespirometers for measuring oxygen consumption in small arthropods. Journal of Insect Physiology. 54 (7), 1132-1137 (2008).
  23. Herreid, C. F., Full, R. J. Cockroaches on a treadmill: Aerobic running. Journal of Insect Physiology. 30 (5), 395-403 (1984).

Play Video

Cite This Article
Ford, S. R., Flores, J. I., Sandstrom, D. J. Measuring O2 Consumption in Drosophila melanogaster Using Coulometric Microrespirometry. J. Vis. Exp. (197), e65379, doi:10.3791/65379 (2023).

View Video