Ici, nous démontrons l’utilisation de l’impédance électrique cellulaire (CEI) comme méthode très simple et directe pour étudier l’infection par le virus Zika et sa réplication dans les cellules humaines en temps réel. En outre, le test CEI est utile pour l’évaluation des composés antiviraux.
La technologie d’impédance électrique à base de cellules (CEI) mesure les changements d’impédance causés par une monocouche de cellules adhérentes en croissance ou manipulée sur des puits de plaques de culture intégrés à des électrodes. La technologie peut être utilisée pour surveiller les conséquences de l’infection par le virus Zika (ZIKV) et de la réplication des cellules adhérentes en temps réel, car ce virus est hautement cytopathogène. Il s’agit d’un test simple qui ne nécessite pas l’utilisation d’étiquettes ou de méthodes invasives et qui a l’avantage de fournir des données en temps réel. La cinétique de l’infection par le ZIKV dépend fortement de la lignée cellulaire utilisée, de la souche virale et de la multiplicité de l’infection (MOI), ce qui ne peut pas être facilement étudié avec les tests conventionnels. En outre, le test CEI peut également être utilisé pour l’évaluation et la caractérisation de composés antiviraux, qui peuvent également avoir des propriétés inhibitrices dynamiques au cours de l’infection. Cet article sur les méthodes donne une explication détaillée de l’exécution pratique du test CEI et de ses applications potentielles dans la recherche ZIKV et la recherche antivirale en général.
Les flambées épidémiques du virus Zika (ZIKV) sont associées à de graves complications de la maladie, telles que la microcéphalie et le syndromede Guillain-Barré 1,2,3. Bien que les épidémies futures soient plausibles en raison de divers facteurs de risque tels que la propagation de la distribution de moustiques vecteurs et l’urbanisation croissante, à ce jour, aucun vaccin ou médicament antiviral n’a encore été mis sur le marché 3,4. Par conséquent, les méthodes traditionnelles de recherche sur le ZIKV devraient être complétées par de nouveaux outils pour étudier ce virus et ses composés antiviraux potentiels. La recherche antivirale est souvent basée sur des tests phénotypiques, où le critère d’évaluation est la présence d’un paramètre spécifique, tel que l’apparition d’un effet cytopathique induit par le virus (EPC) ou la production d’une protéine particulière induite par le virus au moyen d’un gène rapporteur 5,6,7. Cependant, ces méthodes ont des lectures de point de terminaison, nécessitent beaucoup de main-d’œuvre et peuvent nécessiter une analyse complexe. Par conséquent, les méthodes basées sur l’impédance offrent une alternative attrayante.
L’impédance électrique cellulaire (IEC) est définie comme la résistance au flux de courant d’une électrode à une autre, causée par une couche cellulaire adhérente ensemencée sur des puits contenant des électrodes. La technologie CEI utilisée dans cette méthodologie est ECIS (Electric Cell-substrate Impedance Sensing), développée à l’origine par Giaever et Keese 8,9. Ceci est utilisé dans un large domaine de recherche biologique, tels que les métastases cancéreuses, la toxicologie et la cicatrisation des plaies10,11,12. Son principe repose sur un champ électrique qui est généré par un balayage continu des tensions de courant alternatif (AC) sur une gamme de fréquences13. Les cellules sont exposées à ces champs électriques non invasifs et, à des intervalles prédéterminés, les changements d’impédance causés par la croissance cellulaire ou les changements d’adhérence ou de morphologie cellulaires sont mesurés14. En outre, la viabilité cellulaire altérée entraîne également des changements d’impédance, ce qui fait de la technologie un outil utile pour surveiller l’infection par des virus cytopathogènes15,16,17. Comme les changements morphologiques de la couche cellulaire seront détectés à l’échelle nanométrique, la technologie offre un outil de détection très sensible. Le test CEI décrit dans cet article est une méthode simple, non invasive, en temps réel et sans marquage pour mesurer les changements d’impédance de la couche cellulaire au fil du temps.
Bien que l’ICE n’ait pas été utilisée pour évaluer l’évolution de l’infection par le ZIKV ou ses antiviraux potentiels, son utilisation comme outil de diagnostic a été étudiée avant18 ans. Dans une étude récente, l’utilisation du test CEI pour déterminer l’activité antivirale de plusieurs inhibiteurs du ZIKV dans les cellules A549 a été validée pour la première fois19. Cet article sur les méthodes décrit ce test CEI plus en détail et l’étend à diverses lignées cellulaires adhérentes, ainsi qu’à une variété de souches ZIKV à différentes multiplicités d’infection (MOI). Ainsi, l’utilisation polyvalente de cette méthode dans la recherche antivirale sur les flavivirus est démontrée. La méthode présente l’avantage crucial de la surveillance cellulaire en temps réel, qui permet la détection de points temporels d’infection importants et l’activité inhibitrice dynamique par des composés antiviraux potentiels. Ensemble, la technologie CEI offre un outil puissant et précieux pour compléter la gamme actuelle de méthodologies antivirales.
Cet article décrit l’utilisation du test CEI dans la recherche antivirale ZIKV. Le test présente l’avantage d’une surveillance en temps réel et peut donc être utilisé pour évaluer la cinétique de l’infection par le ZIKV et l’inhibition antivirale avec des composés sélectifs. Les données obtenues avec cette méthode permettent une observation objective et visuelle de l’EPC induite par le virus et de la puissance d’un composé antiviral potentiel.
Étant donné que l’IEC est une méthode très sensible, il faut faire très attention lors de la réalisation de ce test cellulaire. Il est crucial qu’un pipetage précis soit effectué pour éviter autant que possible les variations de pipetage. De plus, d’autres facteurs susceptibles d’influencer les résultats expérimentaux, tels que le nombre de cellules et le stock viral utilisé, doivent être maintenus constants entre les répétitions d’expériences. Ce sont des facteurs qui influencent fortement la cinétique de la croissance cellulaire et de l’infection et pourraient donc entraîner une variation des valeurs calculées du CIT50 et/ou d’autres paramètres.
Lors de la réalisation du test CEI en présence de composés antiviraux (potentiels), il est important de déterminer s’ils influencent l’impédance des cellules en l’absence de virus. La technique est si sensible que les changements d’impédance pourraient être mesurés bien en dessous des concentrations cytotoxiquesdu composé 19.
Bien que seules les données du ZIKV soient présentées dans cet article, le test peut être facilement appliqué à d’autres virus cytopathogènes (flavi), avec seulement un effort minimal d’optimisation, comme la détermination optimale de la fréquence de surveillance CEI. Des adaptations du test CEI ont été utilisées avec divers virus humains et animaux, tels que le chikungunya, la grippe A et les herpèsvirus humains et équins25,26,27,28. Ici, il est également utilisé comme méthode simple pour la quantification des titres viraux ou pour l’identification des composés antiviraux. Ces études ont utilisé l’analyse cellulaire en temps réel, une méthode alternative d’IEC.
L’utilisation de la technologie CEI est limitée aux types de cellules adhérentes, car le principe du test repose sur les propriétés des cellules adhérentes à se propager dans les puits intégrés à l’électrode. Les revêtements de surface de puits tels que la fibronectine peuvent être utilisés pour améliorer la fixation des cellules29. La méthodologie présente d’autres inconvénients, le premier étant lié à son coût. Outre l’investissement dans le dispositif de surveillance CEI et le matériel et les logiciels qui l’accompagnent, les consommables sont également quelque peu chers. De plus, comme le protocole exige une surveillance de l’infection virale pendant plusieurs jours, une plaque de 96 puits par semaine peut être évaluée. Avec le coût élevé, cela limite l’utilisation aux paramètres de débit faible à moyen.
En raison de ces problèmes de débit, la technologie ne convient pas aux paramètres de dépistage antiviral. Cependant, il est très attrayant dans les phases expérimentales initiales, par exemple, lors de l’évaluation de la susceptibilité cellulaire pour l’étude de l’infection par le ZIKV dans un certain contexte lié à la maladie. La technologie est également utile avec les lignées cellulaires transfectées ou knockout pour observer facilement les changements dans la cinétique d’infection, par exemple, en présence ou en l’absence de certains récepteurs d’entrée. Ceci est intéressant lors de l’étude de l’implication des facteurs cellulaires dans l’infection par le ZIKV. En outre, dans les phases précliniques ultérieures, lorsqu’un certain candidat principal a été sélectionné, le test CEI peut être utilisé pour une caractérisation plus approfondie d’un composé sélectionné. Les biocapteurs CEI peuvent également être modifiés en immobilisant certains éléments de bioreconnaissance, tels que les anticorps spécifiques aux virus, pour la détection des virus18. Dans l’ensemble, cela met en évidence l’utilisation polyvalente de l’IEC dans un contexte de virologie.
The authors have nothing to disclose.
Les auteurs remercient Clément Heymann et Gorrit Lootsma pour la relecture du manuscrit. L’étude a été financée par des subventions internes du Laboratoire de virologie et de chimiothérapie (Institut Rega, KU Leuven).
A549 cells | American Type Culture Collection (ATCC) | CCL-185 | These cells are cultured in MEM Rega-3 supplemented with 10% FBS, 2 mM L-glutamine, 0.075% sodium bicarbonate. |
Acridine Orange/Propidium Iodide Stain | Logos Biosystems | F23001 | Live/dead stain |
Cellstar polypropylene tubes, 15 mL | Greiner bio-one | 1,88,271 | |
Cellstar polypropylene tubes, 50 mL | Greiner bio-one | 2,27,261 | |
Dulbecco's Modified Essential Medium (DMEM) | Gibco, Thermo Fisher Scientific | 41965-039 | Cell culture medium for U87 and HEL 299 cells |
Dulbecco's Phosphate Buffered Saline (DPBS) | Gibco, Thermo Fisher Scientific | 14190-094 | |
ECIS cultureware 96W20idf | Applied BioPhysics | 96W20idf PET | Assay plate for CEI device |
Electric cell-substrate impedance sensing (ECIS) Z array station | Applied BioPhysics | CEI device, including 96 well station, external control module and laptop with control, acquisition and display software. The necessary software is installed before shipment. NOTE: this device is currently out of production and has been replaced by the more advanced ECIS Z-Theta device | |
Falcon polystyrene tubes, 5 mL | Corning | 352054 | |
Fetal Bovine Serum (FBS) | Cytiva | SV30160.03 | Cell culture medium additive for all used cells |
HEL 299 cells | ATCC | CCL-137 | These cells are cultured in DMEM supplemented with 10% FBS and 0.01 M HEPES. |
HEPES buffer, 1 M | Gibco, Thermo Fisher Scientific | 15630-056 | Cell culture medium additive for U87 cells |
Labyrinthopeptin A1 | Kind gift from Prof. Dr. Roderich Süssmuth, Technische Universität Berlin, Germany | Antiviral compound used as an example in this protocol. It is dissolved in DMSO. | |
L-Glutamine, 200 mM | Gibco, Thermo Fisher Scientific | 25030-024 | Cell culture medium additive for A549 cells |
Luna cell counting slides | Logos Biosystems | L12001 | |
Luna-FL dual fluoresence cell counter | Logos Biosystems | L20001 | Cell viability counter |
Minimum Essential Medium Rega-3 (MEM Rega-3) | Gibco, Thermo Fisher Scientific | 19993013 | Cell culture medium for A549 cells |
Sodium Bicarbonate, 7.5% | Gibco, Thermo Fisher Scientific | 25080-060 | Cell culture medium additive for A549 cells |
Tissue culture flask T75 | TPP | Y9076 | |
Trypsin-EDTA, 0.25% | Gibco, Thermo Fisher Scientific | 25200-056 | Dissociation reagent |
U87 cells | ATCC | HTB-14 | These cells are cultured in DMEM supplemented with 10% FBS and 0.01 M HEPES. |
Virkon Rely+On tablets | Lanxess | 115-0020 | Disinfectant sollution |
Zika virus (ZIKV) MR766 | ATCC | VR-84 | ZIKV prototype strain, isolated from sentinel Rhesus monkey in Uganda in 1968 |
ZIKV PRVABC59 | ATCC | VR-1843 | ZIKV strain isolated from patient in Puerto Rico in 2015 |