Предлагаемый протокол включает в себя рекомендации о том, как избежать контаминации эндотоксином при выделении внеклеточных везикул из надосадочных продуктов клеточных культур и как правильно их оценивать.
Внеклеточные везикулы (ВВ) представляют собой гетерогенную популяцию мембранных везикул, высвобождаемых клетками in vitro и in vivo. Их вездесущность и значительная роль в качестве носителей биологической информации делают их интригующими объектами исследования, требующими надежных и повторяющихся протоколов для их выделения. Однако реализовать весь их потенциал сложно, поскольку все еще существует множество технических препятствий, связанных с их исследованиями (например, правильное приобретение). В данном исследовании представлен протокол выделения малых ЭВ (по номенклатуре MISEV 2018) из супернатанта культуры линий опухолевых клеток на основе дифференциального центрифугирования. Протокол включает в себя рекомендации о том, как избежать загрязнения эндотоксинами во время выделения электромобилей и как правильно их оценивать. Загрязнение электромобилей эндотоксинами может значительно затруднить последующие эксперименты или даже замаскировать их истинные биологические эффекты. С другой стороны, упущенное из виду присутствие эндотоксинов может привести к неправильным выводам. Это имеет особое значение, когда речь идет о клетках иммунной системы, включая моноциты, потому что моноциты составляют популяцию, которая особенно чувствительна к остаткам эндотоксина. Поэтому настоятельно рекомендуется проводить скрининг EV на загрязнение эндотоксинами, особенно при работе с чувствительными к эндотоксину клетками, такими как моноциты, макрофаги, клетки-супрессоры миелоидного происхождения или дендритные клетки.
Внеклеточные везикулы (ВВ), согласно номенклатуре MISEV 2018, являются собирательным термином, описывающим различные подтипы секретируемых клетками мембранных везикул, которые играют решающую роль в многочисленных физиологических и патологических процессах 1,2. Кроме того, электромобили обещают стать новыми биомаркерами различных заболеваний, а также терапевтическими агентами и средствами доставки лекарств. Однако реализовать весь их потенциал сложно, так как все еще существует множество технических препятствий, связанных с их приобретением3. Одной из таких проблем является выделение электромобилей, не содержащих эндотоксинов, которым во многих случаях пренебрегают. Одним из наиболее распространенных эндотоксинов является липополисахарид (ЛПС), который является основным компонентом грамотрицательных бактериальных клеточных стенок и может вызывать острую воспалительную реакцию из-за высвобождения различными клетками большого количества воспалительных цитокинов 4,5. ЛПС индуцирует реакцию путем связывания с ЛПС-связывающим белком с последующим взаимодействием с комплексом CD14/TLR4/MD2 на миелоидных клетках. Это взаимодействие приводит к активации MyD88- и TRIF-зависимых сигнальных путей, что, в свою очередь, запускает ядерный фактор каппа В (NFkB). Транслокация NFkB в ядро инициирует продукцию цитокинов6. Моноциты и макрофаги очень чувствительны к ЛПС, и их воздействие на ЛПС приводит к высвобождению воспалительных цитокинов и хемокинов (например, IL-6, IL-12, CXCL8 и TNF-α)7,8. Структура CD14 позволяет связывать различные виды ЛПС с одинаковым сродством и служит корецептором для других толл-подобных рецепторов (TLR) (TLR1, 2, 3, 4, 6, 7 и 9)6. Количество исследований, проводимых о влиянии ЭВ на моноциты/макрофаги, все еще увеличивается 9,10,11. Особенно с точки зрения изучения функций моноцитов, их субпопуляций и других иммунных клеток большое значение имеет наличие эндотоксина и даже их замаскированное присутствие в ВВ12. Упущенное из виду загрязнение электромобилей эндотоксинами может привести к вводящим в заблуждение выводам и скрыть их истинную биологическую активность. Другими словами, работа с моноцитарными клетками требует уверенности в отсутствии загрязнения эндотоксинами13. Потенциальными источниками эндотоксинов могут быть вода, коммерчески получаемые среды и сыворотки, компоненты и добавки сред, лабораторная стеклянная посуда и пластмассовая посуда 5,14,15.
Таким образом, это исследование было направлено на разработку протокола выделения ВВ с низким содержанием эндотоксина. Протокол содержит простые подсказки о том, как избежать загрязнения эндотоксинами во время изоляции электромобилей вместо удаления эндотоксинов из электромобилей. Ранее было представлено множество протоколов о том, как удалять эндотоксины, например, из инженерных наночастиц, используемых в наномедицине; однако ни один из них не полезен для биологических структур, таких как электромобили. Эффективное депирогенирование наночастиц может быть осуществлено промывкой этанолом или уксусной кислотой, нагреванием при 175 °C в течение 3 ч, облучением γ или обработкой тритоном X-100; однако эти процедуры приводят к разрушению ЭВ16,17.
Представленный протокол является новаторским исследованием, направленным на предотвращение примесей эндотоксина в EV, в отличие от предыдущих исследований о влиянии EV на моноциты9. Применение предложенных принципов в лабораторной практике может помочь получить надежные результаты исследований, что может иметь решающее значение при рассмотрении потенциального использования ЭВ в качестве терапевтических агентов в клинике12.
В последние несколько лет все большее значение приобретают методы надлежащей изоляции электромобилей, позволяющие проводить их дальнейший надежный анализ, например, в контексте получения надежных омиксных и функциональных данных24. Основываясь на предыдущем опыте иссле?…
The authors have nothing to disclose.
Эта работа была поддержана Национальным научным центром, Польша, грант No 2019/33/B/NZ5/00647. Мы хотели бы поблагодарить профессора Томаша Госевского и Агнешку Кравчик с кафедры молекулярной медицинской микробиологии Медицинского колледжа Ягеллонского университета за их неоценимую помощь в обнаружении бактериальной ДНК в EV.
Alix (3A9) Mouse mAb | Cell Signaling Technology | 2171 | |
1250ul Filter Universal Pipette Tips, Clear, Polypropylene, Non-Pyrogenic | GoogLab Scientific | GBFT1250-R-NS | |
BD FACSCanto II Flow Cytometr | BD Biosciences | ||
CBA Human Th1/Th2 Cytokine Kit II | BD Biosciences | 551809 | |
CD9 (D8O1A) Rabbit mAb | Cell Signaling Technology | 13174 | |
ChemiDoc Imaging System | Bio-Rad Laboratories, Inc. | 17001401 | |
DMEM (Dulbecco’s Modified Eagle’s Medium) | Corning | 10-013-CV | |
ELX800NB, Universal Microplate Reader | BIO-TEK INSTRUMENTS, INC | ||
Fetal Bovine Serum | Gibco | 16000044 | |
Fetal Bovine Serum South America Ultra Low Endotoxin | Biowest | S1860-500 | |
Gentamicin, 50 mg/mL | PAN – Biotech | P06-13100 | |
Goat anti-Mouse IgG- HRP | Santa Cruz Biotechnology | sc-2004 | |
Goat anti-Rabbit IgG- HRP | Santa Cruz Biotechnology | sc-2005 | |
Immun-Blot PVDF Membrane | Bio-Rad Laboratories, Inc. | 1620177 | |
LPS from Salmonella abortus equi S-form (TLRGRADE) | Enzo Life Sciences, Inc. | ALX-581-009-L002 | |
Mini Trans-Blot Electrophoretic Transfer Cell | Bio-Rad Laboratories, Inc. | 1703930 | |
Nanoparticle Tracking Analysis | Malvern Instruments Ltd | ||
NuPAGE LDS Sample Buffer (4X) | Invitrogen | NP0007 | |
NuPAGE Sample Reducing Agent (10x) | Invitrogen | NP0004 | |
Parafilm | Sigma Aldrich | P7793 | transparent film |
Perfect 100-1000 bp DNA Ladder | EURx | E3141-01 | |
PierceTM Chromogenic Endotoxin Quant Kit | Thermo Scientific | A39552 | |
PP Oak Ridge Tube with sealing caps | Thermo Scientific | 3929, 03613 | |
RPMI 1640 | RPMI-1640 (Gibco) | 11875093 | |
SimpliAmp Thermal Cycler | Applied Biosystem | A24811 | |
Sorvall wX+ ULTRA SERIES Centrifuge with T-1270 rotor | Thermo Scientific | 75000100 | |
Sub-Cell GT Horizontal Electrophoresis System | Bio-Rad Laboratories, Inc. | 1704401 | |
SuperSignal West Pico PLUS Chemiluminescent Substrate | Thermo Scientific | 34577 | |
SW480 cell line | American Type Culture Collection(ATCC) | ||
SW480 cell line | American Type Culture Collection (ATCC) | ||
Syringe filter 0.22 um | TPP | 99722 | |
Trans-Blot SD Semi-Dry Transfer Cell | Bio-Rad Laboratories, Inc. | 1703940 | Transfer machine |
Transfer pipette, 3.5 mL | SARSTEDT | 86.1171.001 |