Этот протокол описывает эффективный и недорогой метод, который использует жидкие среды для оценки воздействия химических токсикантов на жизнеспособность взрослой Drosophila melanogaster.
Человеческая промышленность производит сотни тысяч химических веществ, многие из которых не были должным образом изучены на предмет экологической безопасности или воздействия на здоровье человека. Этот дефицит информации о химической безопасности усугубляется современными методами тестирования на млекопитающих, которые являются дорогостоящими, трудоемкими и трудоемкими. В последнее время ученые и регулирующие органы работают над разработкой новых методологий подхода (NAM) для испытаний на химическую безопасность, которые являются более дешевыми, быстрыми и уменьшают страдания животных. Одним из ключевых направлений движения неприсоединения является использование беспозвоночных организмов в качестве замены моделей млекопитающих для выяснения консервативных химических способов действия отдаленно родственных видов, включая человека. Чтобы продвинуть эти усилия, здесь мы описываем метод, который использует плодовую муху Drosophila melanogaster для оценки химической безопасности. Протокол описывает простую, быструю и недорогую процедуру измерения жизнеспособности и пищевого поведения взрослых мух, подвергшихся воздействию. Кроме того, протокол может быть легко адаптирован для создания образцов для геномных и метаболомных подходов. В целом, протокол представляет собой важный шаг вперед в установлении дрозофилы в качестве стандартной модели для использования в точной токсикологии.
Люди постоянно подвергаются воздействию химических веществ из различных источников, включая воздух1, продукты питания2, воду3,4, лекарства5, чистящие средства6, средства личной гигиены 7, промышленные химикаты 7 и строительные материалы 7. Кроме того, каждый годвводятся тысячи новых химических веществ, многие из которых не проходят надлежащую проверку на безопасность здоровья и окружающей среды. Это отсутствие адекватных испытаний на химическую безопасность отчасти связано с чрезмерной зависимостью от моделей млекопитающих, таких как мыши и крысы. Несмотря на то, что такие модели грызунов информативны, испытания на химическую безопасность в этих системах являются дорогостоящими, трудоемкими и часто причиняют недопустимые страдания испытуемому животному9.
Финансовое и этическое бремя, связанное с тестированием химической безопасности млекопитающих, а также трудоемкий характер исследований млекопитающих, являются основными факторами, способствующими нехватке данных о новых химических веществах. Для решения этой проблемы Агентство по охране окружающей среды США (EPA), Европейское химическое агентство (ECHA), Министерство здравоохранения Канады и другие агентства реализуют меры, которые включают новые методологии подхода (NAM) в нормативно-правовую базу10, тем самым приводя политику Северной Америки и Европы в соответствие с международными целями по замене, сокращению и совершенствованию использования животных (принцип 3R)11, 12,13,14. NAM охватывают различные анализы, основанные главным образом на моделях in vitro и in silico, которые обеспечивают механистическое понимание химической токсичности вместо наблюдения за неблагоприятными условиями, причиняемыми подопытным видам млекопитающих, тем самым увеличивая скорость получения данных для оценки химического риска, при этом получая результаты с высокой точностью15. Однако еще не доказано, что эти методы защищают от системной токсичности, включая нарушение жизненно важных биологических процессов, связанных с межорганной связью и эндокринной сигнализацией. Кроме того, они не могут объяснить биоаккумуляцию химических веществ в определенных тканях, способность отдельных соединений поглощаться и секретироваться, а также взаимодействие между поведением и химическим воздействием.
Из-за ограничений in vitro и вычислительных моделей успешное использование NAM для уменьшения или замены моделей млекопитающих должно также включать модели беспозвоночных in vivo, таких как плодовая муха Drosophila melanogaster. Предыдущие исследования на мухе показали, что этот организм хорошо подходит для изучения консервативных генетических путей, которые защищают клетки животных от токсичных молекул 16,17,18,19,20,21,22. Более того, муха демонстрирует замечательное генетическое сходство с людьми, включая функциональные гомологи более чем 65% заболеваний человека 23,24,25 и еще большую сохранность важных функциональных путей 26. Эти особенности в сочетании с их относительно коротким жизненным циклом, низкими затратами на техническое обслуживание и легко наблюдаемыми поведенческими реакциями делают дрозофилу хорошо подходящей для использования в качестве токсикологической модели27,28,29,30. Кроме того, мухи имеют гораздо более высокую пропускную способность, чем модели грызунов, и улавливают эффекты на метаболизм, физиологию и передачу сигналов гормонов, которые не могут быть легко обнаружены другими неорганизменными NAM9.
Описанный здесь протокол представляет собой основу для тестирования воздействия химического вещества на взрослых дрозофил. Метод разработан, чтобы быть эффективным, недорогим и воспроизводимым, а также сводить к минимуму время, необходимое исследователям для контакта с тестируемым химическим веществом, и приспосабливаться к сбору образцов для метаболомики и других омиксных подходов. Протокол оптимизирован для тестирования одного химического вещества в эксперименте, но может легко учитывать другие экспериментальные параметры, такие как различные растворители или комбинации химических веществ.
Плодовая муха Drosophila melanogaster становится мощной системой для NAMs 16,18,19,21. Используя беспрецедентные генетические ресурсы, доступные сообществу мух, в сочетании с последними достижениями в области геномики и метаболомики, исследования химической безопасности с использованием дрозофилы способны быстро идентифицировать молекулярные механизмы, с помощью которых отдельные соединения влияют на метаболизм, физиологию и клеточную сигнализацию (например, см.39). Этот недорогой протокол предназначен для быстрого определения кривых доза-реакция и последующего создания образцов для анализа РНК-секвенирования и метаболомики. Более того, этот гибкий протокол может быть адаптирован для использования с любым генотипом и может вместить многие классы химических веществ.
Примечательным аспектом этого протокола является выбор жидкой пищи, используемой при химическом воздействии, который основан на предыдущем исследовании, но отличается от твердых сред, используемых в большинстве токсикологических исследований дрозофилы18,22. Эта конкретная жидкая среда была выбрана таким образом, чтобы отразить питательную ценность стандартной, твердой среды BDSC, которой мухи также кормят в этом протоколе, чтобы гарантировать, что мухи получают постоянное питание. Простота жидких питательных сред имеет много преимуществ. С жидкими средами легче обращаться, чем с твердой пищей, которую необходимо либо расплавить и затвердеть, либо восстановить из порошка. Жидкие среды также увеличивают пропускную способность системы, обеспечивают равномерное распределение химикатов по питательной среде и сокращают время, затрачиваемое на работу с опасными соединениями. Кроме того, среда не требует нагрева растворов, что облегчает тестирование летучих исследуемых соединений. Наконец, из-за относительно небольшого количества компонентов, включенных в пищевой раствор, нежелательные побочные реакции сводятся к минимуму между исследуемым химическим веществом и другими диетическими компонентами. Дрожжи, используемые в пище, также неактивны, что еще больше ограничивает реакционную способность питательной среды. Однако обратите внимание, что этот метод не подходит для тестирования токсичности для развития или личинок.
Некоторые из материалов, используемых в протоколе, могут быть заменены, например, использование стеклянных флаконов вместо полипропилена. Однако используемые материалы были выбраны как инертные, так и одноразовые, чтобы избежать нежелательных химических реакций между реагентами и химическими воздействиями, которые могут возникнуть в результате очистки стеклянной посуды.
Использование жидкой пищи требует транспортного средства для доставки еды. Фильтровальная бумага из ацетата целлюлозы была выбрана для этой цели из-за ее гибкости и инертности28. Другие исследователи использовали аналогичные протоколы, но с другими транспортными средствами, такими как деликатные рабочие салфетки или фильтр из стекловолокна29,30. Фильтровальная бумага из ацетата целлюлозы соответствовала этим потребностям, потому что это инертное транспортное средство, которое можно разрезать до идеальной формы, чтобы поместить его в дно флаконов с мухами без больших зазоров между бумагой и стенкой флакона, предотвращая гибель из-за застревания мух в среде или самом транспортном средстве.
Важным ограничением этой системы является то, что максимальная проверяемая концентрация химического вещества связана с растворимостью химического вещества. Нерастворимые в воде соединения требуют дополнительного растворителя, что может привести к дополнительным или синергетическим эффектам с интересующим химическим веществом. Это также может создавать ситуации, в которых невозможно приготовить исходные растворы, которые достаточно сконцентрированы для достижения желаемой конечной точки во всех организмах, что ограничивает анализ полученных данных31. Чтобы решить эту проблему, химические вещества с низкой растворимостью в воде можно протестировать, добавив до 0,5% диметилсульфоксида в пищевой раствор. Можно использовать и другие растворители, но для каждого интересующего растворителя необходимы дополнительные исследования, чтобы определить максимально приемлемую концентрацию растворителя в растворе, чтобы максимизировать растворимость при минимизации воздействия растворителя на организм.
Обширная характеристика реакции обоняния у дрозофилы описала, как мухи избегают потребления токсичных соединений40,41, что приводит к уменьшению питания обработанными средами. Анализ синего красителя устраняет это явление, позволяя исследователям эффективно проверять пищевое поведение мух, получавших каждую концентрацию экспериментального химического вещества42,43,44. Наличие или отсутствие синего цвета в желудочно-кишечном тракте мухи указывает на то, питалась ли муха средой, содержащей токсиканты. Несмотря на то, что существуют более сложные методы оценки поведения мух при кормлении, такие как счетчик45 взаимодействия жидкости мухи с пищей, этот качественный метод лучше подходит для скрининга с более высокой пропускной способностью.
Примечательным аспектом этого протокола является то, что он был оптимизирован для 48-часового периода воздействия без необходимости переноса мух или добавления дополнительной жидкости во флакон для воздействия. Использование камеры влажности и помещение камер в инкубатор с высокой влажностью предотвратило высыхание фильтровальной бумаги, содержащей питательную среду, в течение этого периода времени. Протокол может быть адаптирован для более длительной экспозиции, но метод должен быть скорректирован таким образом, чтобы фильтровальная бумага не высохла и не вызвала значительных изменений концентрации раствора или летальности из-за высыхания.
Наконец, важной характеристикой этого протокола является то, что он может легко приспосабливаться к генетическим вариантам, что позволяет исследователям использовать широкий спектр генетических инструментов для дрозофилы , чтобы расширить эти предварительные исследования организмов дикого типа, чтобы лучше понять механизмы химического действия in vivo. В связи с этим протокол, изложенный выше, может быть легко изменен, чтобы дополнить ранее описанный протокол JoVE Петерсоном и Лонгом, который позволяет проводить токсикологический анализ пойманных в дикой природе мух18.
Из-за большого разнообразия предыдущих исследований токсичности арсенита натрия у дрозофилы 32,33,34,35,36 мух Oregon-R обрабатывали этим соединением, чтобы продемонстрировать эффективность нашей системы. Самцы мух показали LD 50 0,65 мМ, а самки показали LD50 0,90 мМ. Это согласуется с предыдущими исследованиями взрослой дрозофилы, обработанной арсенитом натрия. Например, Гольдштейн и Бабич37 обнаружили, что 50% мух (смешанного пола) погибли после 7 дней воздействия 0,5 мМ NaAsO2. Хотя это несколько меньшая доза, чем наблюдалось в настоящее время, различия между их методами и этим методом (включая использование твердых сред воздействия, более длительную временную шкалу и смешанный пол), вероятно, объясняют эту разницу. Важно отметить, что оба метода привели к общим одинаковым значениям LD50.
Наблюдения экспериментов с использованием этого протокола могут быть использованы для поиска генетических и молекулярных мишеней для последующих поведенческих или механистических исследований. Метод воздействия также может быть использован для лечения дрозофилы для отбора проб для метаболомики и протеомики, что делает этот протокол хорошо подходящим для растущей области прецизионной токсикологии (смоделированной из области прецизионной медицины46). В связи с этим подвергшиеся воздействию мухи могут быть собраны после шага 8 для последующего геномного и метаболомного анализа. Образцы, собранные на шаге 8, затем могут быть обработаны, как описано Ли и Теннессеном47, начиная с шага 3.
В конечном счете, данные, полученные в результате описанных выше экспериментов, а также любые последующие данные метаболомики и протеомики, в идеале должны использоваться в межвидовых сравнениях. Как отмечалось ранее26, такие межвидовые исследования являются мощными и способны определить, как отдельные химические вещества влияют на консервативные биологические пути. Таким образом, протокол, описанный выше, может быть использован для поиска эволюционных общих черт в ответ на отдельные токсиканты по всему типу и помочь в определении правил химической безопасности.
The authors have nothing to disclose.
Мы благодарим наших сотрудников за помощь в тестировании и оптимизации этого протокола: Амейю Беламкар, Мэрилин Кларк, Александра Фитта, Эмму Роуз Галлант, Итана Голдича, Мэтью Лоу, Моргана Марша, Кайла МакКланга, Энди Пуга, Дарси Роуза, Кэмерона Стокбриджа и Ноэль Золман. Мы также благодарим наших коллег из Группы прецизионной токсикологии, особенно наших коллег из Группы воздействия, за помощь в определении целей протокола.
Этот проект получил финансирование от программы исследований и инноваций Европейского Союза «Горизонт 2020» в рамках грантового соглашения No 965406. Работа, представленная в данной публикации, выполнена в рамках кластера ASPIS. Этот вывод отражает только точку зрения авторов, и Европейский Союз не может нести ответственность за любое использование содержащейся в нем информации. Эта публикация также стала возможной при поддержке Института клинических и трансляционных наук штата Индиана, который частично финансируется за счет премии No UL1TR002529 от Национальных институтов здравоохранения, Национального центра развития трансляционных наук, премии в области клинических и трансляционных наук. Содержание является исключительной ответственностью авторов и не обязательно отражает официальную точку зрения Национальных институтов здравоохранения. Часть этого проекта была поддержана за счет средств Университета Индианы, выделенных JRS и консорциуму PhyloTox. JMH и EMP были поддержаны NIH P40OD018537 награды Фондовому центру дрозофилы в Блумингтоне.
1.5 inch flower lever action craft punch | Bira Craft | HCP-115-024 | |
15 mL Centrifuge Tubes | VWR | 89039-666 | High-Performance Centrifuge Tubes with Flat or Plug Caps, Polypropylene, 15 mL |
2 ml Tubes | VWR | 16466-044 | Micro Centrifuge Tube with Flat Screw-Cap, conical bottom |
5 ml Tubes | VWR | 60818-576 | Culture Tubes, Plastic, with Dual-Position Caps |
50 mL Centrifuge Tubes | Corning | 430290 | 50 mL polypropylene centrifuge tubes, conical bottom with plug seal cap |
Benchmark Dose Software version 3.2 | U.S. Environmental Protection Agency | ||
Cardboard trays | Genesee Scientific flystuff | 32-122 | trays and dividers for narrow vials |
CO2 gas pads | Genesee Scientific flystuff | 59-114 | FlyStuff flypad, CO2 anesthetizing apparatus |
Combitips advanced, 50 mL | Eppendorf | 0030089693 | Combitips advanced, Biopur, 50 mL, light gray, colorless tips |
Cotton balls | Genesee Scientific flystuff | 51-101 | Cotton balls, large, fits narrow vials |
Delicate task wipes | Kimtech | 34155 | Kimtech Science Kimwipes Delicate Task Wipes, 1 Ply / 8.2" x 4.39" |
Drosophila Vial Plugs, Cellulose Acetate (aka, Flugs) | VWR | 89168-888 | Wide |
FD&C Blue No. 1 | Spectrum Chemical | FD110 | CAS number 3844-45-9 |
Flies | BDSC | Stock #2057 | OregonR wildtype |
Gloves (nitrile) | Kimtech | 55082/55081/55083 | Kimtech purple nitrile exam gloves, 5.9 mil, ambidextrous 9.5" |
Grade 1 CHR cellulose chromatography paper | Cytvia | 3001-917 | Sheet, 46 x 57 cm |
Mesh for humidity chamber | |||
Multipette / Repeater (X) stream | Eppendorf | 022460811 | Repeater Xstream |
Plastic grate | Plaskolite | 18469 (from lowes) | Plaskolite 24 in x 48 in 7.85 sq ft louvered ceiling light panels, cut down to fit in rubbermaid tubs |
Plastic trays for glass vials | Genesee Scientific flystuff | 59-207 | Narrow fly vial reload tray |
Polypropylene Drosophila Vial | VWR | 75813-156 | Wide (28.5 mm) |
Rubbermaid tubs | Rubbermaid | 3769017 (from Lowes) | Rubbermaid Roughneck Tote 10 gallon 18" L x 12" W x 8 1/2" H |
Sucrose ultra pure | MP Biomedicals, Inc. | 821721 | |
Tube racks for wide-mouthed tubes | Thermo scientific | 5970-0230 | Nalgene Unwire Test tube racks, for 30 mm tubes |
Water Purification System | Millipore Milli-Q | ZMQ560F01 | Millipore Milli-Q Biocel Water Purifier |
Yeast extract | Acros Organics | 451120050 | CAS number 84604-16-0 |