Dieses Protokoll beschreibt eine effiziente und kostengünstige Methode, bei der flüssige Medien verwendet werden, um die Auswirkungen chemischer Giftstoffe auf die Lebensfähigkeit von adulten Drosophila melanogaster zu bewerten.
Die menschliche Industrie erzeugt Hunderttausende von Chemikalien, von denen viele nicht ausreichend auf Umweltverträglichkeit oder Auswirkungen auf die menschliche Gesundheit untersucht wurden. Dieses Defizit an Informationen zur Chemikaliensicherheit wird durch die derzeitigen Testmethoden bei Säugetieren noch verschärft, die teuer, arbeitsintensiv und zeitaufwändig sind. In jüngster Zeit haben Wissenschaftler und Aufsichtsbehörden daran gearbeitet, neue Ansatzmethoden (NAMs) für Chemikaliensicherheitstests zu entwickeln, die billiger und schneller sind und das Leiden der Tiere verringern. Eines der wichtigsten NAMs, das sich herauskristallisieren wird, ist die Verwendung von wirbellosen Organismen als Ersatz für Säugetiermodelle, um konservierte chemische Wirkmechanismen bei entfernt verwandten Arten, einschließlich des Menschen, aufzuklären. Um diese Bemühungen voranzutreiben, beschreiben wir hier eine Methode, die die Fruchtfliege Drosophila melanogaster verwendet, um die Chemikaliensicherheit zu bewerten. Das Protokoll beschreibt ein einfaches, schnelles und kostengünstiges Verfahren zur Messung der Lebensfähigkeit und des Fressverhaltens exponierter erwachsener Fliegen. Darüber hinaus kann das Protokoll leicht angepasst werden, um Proben für genomische und metabolomische Ansätze zu generieren. Insgesamt stellt das Protokoll einen wichtigen Schritt vorwärts dar, um Drosophila als Standardmodell für den Einsatz in der Präzisionstoxikologie zu etablieren.
Der Mensch ist ständig Chemikalien aus einer Vielzahl von Quellen ausgesetzt, darunter Luft1, Lebensmittel2, Wasser3,4, Medikamente5, Reinigungsmittel6, Körperpflegeprodukte 7, Industriechemikalien 7 und Baumaterialien 7. Darüber hinaus werden jedes Jahr Tausende neuer Chemikalien eingeführt8, von denen viele nicht ordnungsgemäß auf Gesundheits- und Umweltsicherheit geprüft werden. Dieser Mangel an angemessenen Tests zur chemischen Sicherheit ist zum Teil darauf zurückzuführen, dass man sich zu sehr auf Säugetiermodelle wie Mäuse und Ratten verlässt. Solche Nagetiermodelle sind zwar aufschlussreich, aber die Prüfung der chemischen Sicherheit in diesen Systemen ist teuer, zeitaufwändig und verursacht oft ein inakzeptables Maß an Leid für das Versuchstier9.
Die finanziellen und ethischen Belastungen, die mit der chemischen Sicherheitsprüfung von Säugetieren verbunden sind, sowie der zeitaufwändige Charakter von Säugetierstudien sind wichtige Faktoren, die zum Mangel an Daten über neue Chemikalien beitragen. Um dieses Problem anzugehen, setzen die U.S. Environmental Protection Agency (EPA), die Europäische Chemikalienagentur (ECHA), Health Canada und andere Behörden Maßnahmen um, die neue Ansatzmethoden (NAMs) in den regulatorischen Rahmen einbeziehen10 und damit die nordamerikanische und europäische Politik mit den internationalen Zielen in Einklang bringen, die Verwendung von Tieren zu ersetzen, zu reduzieren und zu verfeinern (das 3R-Prinzip)11. 12,13,14. NAMs umfassen eine Vielzahl von Assays, die in erster Linie auf In-vitro- und In-silico-Modellen basieren, die ein mechanistisches Verständnis der chemischen Toxizität vermitteln, anstatt die Widrigkeiten zu beobachten, die Säugetiertestarten zugefügt werden, wodurch die Geschwindigkeit der Datengenerierung für die chemische Risikobewertung erhöht wird, während gleichzeitig hochgenaue Ergebnisse erzieltwerden 15 . Es ist jedoch noch nicht erwiesen, dass diese Methoden vor systemischer Toxizität schützen, einschließlich der Störung lebenswichtiger biologischer Prozesse, die die Kommunikation zwischen den Organen und die endokrine Signalübertragung betreffen. Darüber hinaus können sie die Bioakkumulation von Chemikalien in bestimmten Geweben, die Fähigkeit einzelner Verbindungen, absorbiert und abgesondert zu werden, und das Zusammenspiel zwischen Verhalten und chemischer Exposition nicht berücksichtigen.
Aufgrund der Einschränkungen von In-vitro– und Computermodellen sollte der erfolgreiche Einsatz von NAMs zur Reduzierung oder zum Ersatz von Säugetiermodellen auch wirbellose In-vivo-Modelle wie die Fruchtfliege Drosophila melanogaster umfassen. Frühere Studien an der Fliege haben gezeigt, dass dieser Organismus gut geeignet ist, um die konservierten genetischen Signalwege zu untersuchen, die tierische Zellen vor toxischen Molekülenschützen 16,17,18,19,20,21,22. Darüber hinaus weist die Fliege eine bemerkenswerte genetische Ähnlichkeit mit dem Menschen auf, einschließlich funktioneller Homologe zu über 65 % der menschlichen Krankheiten 23,24,25 und einer noch stärkeren Erhaltung wichtiger funktioneller Signalwege 26. Diese Merkmale, kombiniert mit ihrem relativ kurzen Lebenszyklus, den geringen Wartungskosten und den leicht beobachtbaren Verhaltensreaktionen, machen Drosophila gut geeignet für die Verwendung als toxikologisches Modell27,28,29,30. Darüber hinaus haben Fliegen einen viel höheren Durchsatz als Nagetiermodelle und erfassen Auswirkungen auf den Stoffwechsel, die Physiologie und die Hormonsignalisierung, die von anderen nicht-organismischen NAMs nicht ohne weiteres nachgewiesen werdenkönnen 9.
Das hier beschriebene Protokoll stellt einen Rahmen dar, um die Auswirkungen der Chemikalienexposition auf erwachsene Drosophila zu testen. Die Methode ist so konzipiert, dass sie effizient, kostengünstig und reproduzierbar ist und gleichzeitig die Zeit minimiert, die die Forscher mit der Testchemikalie in Kontakt bringen müssen, und die Probenentnahme für die Metabolomik und andere Omics-Ansätze ermöglicht. Das Protokoll ist für das Testen einer einzelnen Chemikalie pro Experiment optimiert, kann aber problemlos andere experimentelle Parameter berücksichtigen, wie z. B. verschiedene Lösungsmittel oder Kombinationen von Chemikalien.
Die Fruchtfliege Drosophila melanogaster entwickelt sich zu einem leistungsfähigen System für die NAMs16,18,19,21. Durch die Nutzung der beispiellosen genetischen Ressourcen, die der Fliegengemeinschaft zur Verfügung stehen, in Kombination mit den jüngsten Fortschritten in der Genomik und Metabolomik sind chemische Sicherheitsstudien mit Drosophila in der Lage, die molekularen Mechanismen, durch die einzelne Verbindungen in den Stoffwechsel, die Physiologie und die Zellsignalübertragung eingreifen, schnell zu identifizieren (z. B.39). Dieses kostengünstige Protokoll wurde entwickelt, um schnell Dosis-Wirkungs-Kurven zu definieren und anschließend Proben für die RNA-Seq- und Metabolomics-Analyse zu generieren. Darüber hinaus kann dieses flexible Protokoll für die Verwendung mit jedem Genotyp angepasst werden und kann viele Klassen von Chemikalien aufnehmen.
Ein bemerkenswerter Aspekt dieses Protokolls ist die Wahl der flüssigen Nahrung, die bei der chemischen Exposition verwendet wird, die auf einer früheren Studie basiert, sich jedoch von den festen Medien unterscheidet, die in den meisten toxikologischen Studien zu Drosophila verwendet werden 18,22. Dieses spezielle flüssige Medium wurde ausgewählt, um den Nährstoffgehalt des standardmäßigen, festen BDSC-Mediums widerzuspiegeln, mit dem die Fliegen auch in diesem Protokoll gefüttert werden, um sicherzustellen, dass die Fliegen eine konsistente Ernährung erhalten. Die Einfachheit von flüssigen Nährmedien hat viele Vorteile. Flüssige Medien sind einfacher zu handhaben als feste Lebensmittel, die entweder geschmolzen und wieder verfestigt oder aus Pulver rekonstituiert werden müssen. Flüssige Medien erhöhen auch den Durchsatz des Systems, sorgen für eine gleichmäßige Chemikalienverteilung in den Zuführmedien und verringern den Zeitaufwand für die Arbeit mit gefährlichen Verbindungen. Darüber hinaus müssen die Medien nicht erhitzt werden, was die Prüfung flüchtiger Testverbindungen erleichtert. Schließlich werden aufgrund der relativ wenigen Komponenten, die in der Lebensmittellösung enthalten sind, unerwünschte Nebenreaktionen zwischen der Prüfchemikalie und anderen Nahrungsbestandteilen minimiert. Die im Futter verwendete Hefe ist ebenfalls inaktiv, was die Reaktivität des Nährmediums weiter einschränkt. Bitte beachten Sie jedoch, dass die Methode nicht geeignet ist, um die Entwicklungs- oder Larvatoxizität zu testen.
Einige der im Protokoll verwendeten Materialien können ersetzt werden, z. B. die Verwendung von Fliegenfläschchen aus Glas anstelle von Polypropylen. Die verwendeten Materialien wurden jedoch so ausgewählt, dass sie sowohl inert als auch wegwerfbar sind, um unerwünschte chemische Reaktionen zwischen Reagenzien und chemische Expositionen zu vermeiden, die sich aus der Reinigung von Glaswaren ergeben könnten.
Die Verwendung von flüssigen Lebensmitteln erfordert ein Fahrzeug für die Lieferung von Lebensmitteln. Filterpapier aus Celluloseacetat wurde aufgrund seiner Flexibilität und Inertheit für diesen Zweck ausgewählt28. Andere Forscher verwendeten ähnliche Protokolle, jedoch mit anderen Fahrzeugen, wie z. B. empfindlichen Tüchern oder Glasfaserfiltern29,30. Das Filterpapier aus Zelluloseacetat erfüllte diese Anforderungen, da es sich um ein inertes Vehikel handelt, das in die ideale Form geschnitten werden kann, um es ohne große Lücken zwischen dem Papier und der Fläschchenwand in den Boden der Fliegenfläschchen zu passen, wodurch der Tod durch Fliegen, die im Medium oder im Vehikel selbst stecken bleiben, verhindert wird.
Eine wichtige Einschränkung dieses Systems besteht darin, dass die maximal testbare Konzentration einer Chemikalie an die Löslichkeit der Chemikalie gebunden ist. Nicht wasserlösliche Verbindungen erfordern ein zusätzliches Lösungsmittel, was zu zusätzlichen oder synergistischen Effekten mit der zu untersuchenden Chemikalie führen kann. Dies kann auch zu Situationen führen, in denen es nicht möglich ist, Stammlösungen herzustellen, die konzentriert genug sind, um den gewünschten Endpunkt in allen Organismen zu erreichen, was die Analyse der resultierenden Daten einschränkt31. Um dieses Problem zu lösen, können Chemikalien mit geringer Wasserlöslichkeit getestet werden, indem der Lebensmittellösung bis zu 0,5 % Dimethylsulfoxid zugesetzt werden. Andere Lösungsmittel könnten ebenfalls verwendet werden, aber für jedes Lösungsmittel von Interesse sind weitere Untersuchungen erforderlich, um die maximal akzeptable Lösungsmittelkonzentration in der Lösung zu bestimmen, um die Löslichkeit zu maximieren und gleichzeitig die Auswirkungen des Lösungsmittels auf den Organismus zu minimieren.
Eine umfassende Charakterisierung der Geruchsreaktion in Drosophila hat beschrieben, wie Fliegen den Verzehr toxischer Verbindungen vermeiden40,41, was zu einer reduzierten Fütterung mit behandelten Medien führt. Der blaue Farbstoff-Assay adressiert dieses Phänomen, indem er es den Forschern ermöglicht, das Fressverhalten der Fliegen, die mit jeder Konzentration der experimentellen Chemikalie gefüttert wurden, effizient zu untersuchen42,43,44. Das Vorhandensein oder Fehlen von Blau im Magen-Darm-Trakt der Fliege zeigt an, ob die Fliege das giftige Medium gefressen hat. Obwohl es ausgefeiltere Methoden zur Beurteilung des Fressverhaltens von Fliegen gibt, wie z. B. den Fly Liquid-Food Interaction Counter45, ist diese qualitative Methode besser für das Screening mit höherem Durchsatz geeignet.
Ein bemerkenswerter Aspekt dieses Protokolls ist, dass es für eine Expositionsdauer von 48 Stunden optimiert wurde, ohne dass Fliegen übertragen oder zusätzliche Flüssigkeit in das Expositionsfläschchen gegeben werden müssen. Die Verwendung einer Feuchtekammer und die Unterbringung der Kammern in einem Inkubator bei hoher Luftfeuchtigkeit verhinderten, dass das Filterpapier mit den Zuführmedien während dieser Zeit austrocknete. Das Protokoll kann für längere Expositionsdauern angepasst werden, aber die Methode muss angepasst werden, um sicherzustellen, dass das Filterpapier nicht austrocknet und aufgrund der Austrocknung erhebliche Änderungen der Lösungskonzentration oder Letalität verursacht.
Schließlich ist ein wichtiges Merkmal dieses Protokolls, dass es problemlos genetische Varianten aufnehmen kann, was es den Forschern ermöglicht, die breite Palette genetischer Werkzeuge für Drosophila zu nutzen, um diese Vorstudien an Wildtyp-Organismen zu erweitern, um die Mechanismen der chemischen Wirkung in vivo besser zu verstehen. In dieser Hinsicht könnte das oben skizzierte Protokoll leicht modifiziert werden, um ein zuvor beschriebenes JoVE-Protokoll von Peterson und Long zu ergänzen, das eine toxikologische Analyse von wild gefangenen Fliegen ermöglicht18.
Aufgrund der Vielzahl früherer Studien zur Toxizität von Natriumarsenit in Drosophila 32,33,34,35,36 wurden Oregon-R-Fliegen mit dieser Verbindung behandelt, um die Wirksamkeit unseres Systems zu demonstrieren. Männliche Fliegen wiesen eine LD 50 von 0,65 mM und Weibchen eine LD50 von 0,90 mM auf. Dies deckt sich mit früheren Studien an mit Natriumarsenit behandelten adulten Drosophila. Goldstein und Babich37 fanden beispielsweise heraus, dass 50 % der Fliegen (gemischten Geschlechts) nach 7 Tagen Exposition gegenüber 0,5 mM NaAsO2 starben. Obwohl dies eine etwas niedrigere Dosis ist, als derzeit beobachtet wurde, sind die Unterschiede zwischen ihren Methoden und dieser Methode (einschließlich der Verwendung fester Expositionsmedien, einer längeren Zeitskala und gemischter Geschlechter) wahrscheinlich für diesen Unterschied verantwortlich. Wichtig ist, dass beide Methoden zu insgesamt ähnlichen LD50-Werten führten.
Beobachtungen aus Experimenten, die dieses Protokoll verwenden, können verwendet werden, um genetische und molekulare Ziele für nachfolgende Verhaltens- oder mechanistische Studien zu finden. Die Expositionsmethode kann auch zur Behandlung von Drosophila für die Probenahme für die Metabolomik und Proteomik verwendet werden, wodurch sich dieses Protokoll gut für das wachsende Gebiet der Präzisionstoxikologie eignet (modelliert aus dem Bereich der Präzisionsmedizin46). In diesem Zusammenhang können exponierte Fliegen nach Schritt 8 für die anschließende genomische und metabolomische Analyse gesammelt werden. Die in Schritt 8 entnommenen Proben können dann verarbeitet werden, wie von Li und Tennessen47 beschrieben, beginnend mit Schritt 3.
Letztendlich würden die aus den oben beschriebenen Experimenten gewonnenen Daten sowie alle nachfolgenden Metabolomik- und Proteomik-Daten idealerweise für artübergreifende Vergleiche verwendet werden. Wie bereits erwähnt26, sind solche speziesübergreifenden Studien aussagekräftig und in der Lage, zu bestimmen, wie einzelne Chemikalien in konservierte biologische Pfade eingreifen. Daher kann das oben beschriebene Protokoll verwendet werden, um evolutionäre Gemeinsamkeiten als Reaktion auf einzelne Giftstoffe in verschiedenen Stämmen zu finden und die Chemikaliensicherheitsvorschriften zu informieren.
The authors have nothing to disclose.
Wir danken unseren Mitarbeitern für die Hilfe beim Testen und Optimieren dieses Protokolls: Ameya Belamkar, Marilyn Clark, Alexander Fitt, Emma Rose Gallant, Ethan Golditch, Matthew Lowe, Morgan Marsh, Kyle McClung, Andy Puga, Darcy Rose, Cameron Stockbridge und Noelle Zolman. Wir danken auch unseren Kollegen von der Precision Toxicology Group, insbesondere unseren Kollegen in der Exposure Group, für ihre Hilfe bei der Identifizierung der Ziele des Protokolls.
Dieses Projekt wurde durch das Forschungs- und Innovationsprogramm Horizon 2020 der Europäischen Union im Rahmen der Finanzhilfevereinbarung Nr. 965406 gefördert. Die in dieser Publikation vorgestellten Arbeiten wurden im Rahmen des ASPIS-Clusters durchgeführt. Diese Ausgabe spiegelt nur die Ansichten der Autoren wider, und die Europäische Union kann nicht für die Verwendung der darin enthaltenen Informationen verantwortlich gemacht werden. Diese Publikation wurde auch durch die Unterstützung des Indiana Clinical and Translational Sciences Institute ermöglicht, das zum Teil durch den Preis Nummer UL1TR002529 der National Institutes of Health, National Center for Advancing Translational Sciences, Clinical and Translational Sciences Award finanziert wird. Der Inhalt liegt in der alleinigen Verantwortung der Autoren und spiegelt nicht unbedingt die offiziellen Ansichten der National Institutes of Health wider. Teile dieses Projekts wurden durch Mittel der Indiana University unterstützt, die JRS und dem PhyloTox-Konsortium zur Verfügung gestellt wurden. JMH und EMP wurden durch die NIH-Auszeichnung P40OD018537 an das Bloomington Drosophila Stock Center unterstützt.
1.5 inch flower lever action craft punch | Bira Craft | HCP-115-024 | |
15 mL Centrifuge Tubes | VWR | 89039-666 | High-Performance Centrifuge Tubes with Flat or Plug Caps, Polypropylene, 15 mL |
2 ml Tubes | VWR | 16466-044 | Micro Centrifuge Tube with Flat Screw-Cap, conical bottom |
5 ml Tubes | VWR | 60818-576 | Culture Tubes, Plastic, with Dual-Position Caps |
50 mL Centrifuge Tubes | Corning | 430290 | 50 mL polypropylene centrifuge tubes, conical bottom with plug seal cap |
Benchmark Dose Software version 3.2 | U.S. Environmental Protection Agency | ||
Cardboard trays | Genesee Scientific flystuff | 32-122 | trays and dividers for narrow vials |
CO2 gas pads | Genesee Scientific flystuff | 59-114 | FlyStuff flypad, CO2 anesthetizing apparatus |
Combitips advanced, 50 mL | Eppendorf | 0030089693 | Combitips advanced, Biopur, 50 mL, light gray, colorless tips |
Cotton balls | Genesee Scientific flystuff | 51-101 | Cotton balls, large, fits narrow vials |
Delicate task wipes | Kimtech | 34155 | Kimtech Science Kimwipes Delicate Task Wipes, 1 Ply / 8.2" x 4.39" |
Drosophila Vial Plugs, Cellulose Acetate (aka, Flugs) | VWR | 89168-888 | Wide |
FD&C Blue No. 1 | Spectrum Chemical | FD110 | CAS number 3844-45-9 |
Flies | BDSC | Stock #2057 | OregonR wildtype |
Gloves (nitrile) | Kimtech | 55082/55081/55083 | Kimtech purple nitrile exam gloves, 5.9 mil, ambidextrous 9.5" |
Grade 1 CHR cellulose chromatography paper | Cytvia | 3001-917 | Sheet, 46 x 57 cm |
Mesh for humidity chamber | |||
Multipette / Repeater (X) stream | Eppendorf | 022460811 | Repeater Xstream |
Plastic grate | Plaskolite | 18469 (from lowes) | Plaskolite 24 in x 48 in 7.85 sq ft louvered ceiling light panels, cut down to fit in rubbermaid tubs |
Plastic trays for glass vials | Genesee Scientific flystuff | 59-207 | Narrow fly vial reload tray |
Polypropylene Drosophila Vial | VWR | 75813-156 | Wide (28.5 mm) |
Rubbermaid tubs | Rubbermaid | 3769017 (from Lowes) | Rubbermaid Roughneck Tote 10 gallon 18" L x 12" W x 8 1/2" H |
Sucrose ultra pure | MP Biomedicals, Inc. | 821721 | |
Tube racks for wide-mouthed tubes | Thermo scientific | 5970-0230 | Nalgene Unwire Test tube racks, for 30 mm tubes |
Water Purification System | Millipore Milli-Q | ZMQ560F01 | Millipore Milli-Q Biocel Water Purifier |
Yeast extract | Acros Organics | 451120050 | CAS number 84604-16-0 |