Le protocole présente un modèle murin de colonisation vaginale avec des bactéries vaginales humaines en culture anaérobie. Nous nous concentrons sur Gardnerella vaginalis, tout en incluant des suggestions pour Prevotella bivia et Fusobacterium nucleatum. Ce protocole peut également être utilisé comme guide pour les inoculations vaginales et la récupération viable d’autres bactéries cultivées en anaérobiose.
Le vagin des mammifères peut être colonisé par de nombreux taxons bactériens. Le microbiome vaginal humain est souvent dominé par les espèces de Lactobacillus , mais une femme sur quatre souffre de vaginose bactérienne, dans laquelle un faible niveau de lactobacilles s’accompagne d’une prolifération de diverses bactéries anaérobies. Cette condition a été associée à de nombreuses complications de santé, y compris des risques pour la santé reproductive et sexuelle. Bien qu’il y ait de plus en plus de preuves montrant la nature complexe des interactions microbiennes dans la santé vaginale humaine, les rôles individuels de ces différentes bactéries anaérobies ne sont pas entièrement compris. Ceci est compliqué par le manque de modèles adéquats pour étudier les bactéries vaginales cultivées en anaérobiose. Les modèles murins nous permettent d’étudier la biologie et la virulence de ces organismes in vivo. D’autres modèles murins d’inoculation bactérienne vaginale ont déjà été décrits. Ici, nous décrivons les méthodes d’inoculation de bactéries cultivées en anaérobiose et leur récupération viable chez des souris C57Bl/6 d’élévation conventionnelle. Une nouvelle méthode procédurale moins stressante pour l’inoculation et le lavage vaginaux est également décrite. L’inoculation et la récupération viable de Gardnerella sont décrites en détail, et des stratégies pour d’autres anaérobies tels que Prevotella bivia et Fusobacterium nucleatum sont discutées.
Chez les mammifères, le vagin abrite un consortium d’espèces bactériennes. Le microbiome vaginal humain est unique parmi les mammifères par son abondance de membres du genre Lactobacillus et le faible pH vaginal correspondant (3,8-4,5)1,2,3,4. La perturbation de cette dominance de Lactobacillus est associée à une variété de résultats négatifs pour la santé.
Dans la vaginose bactérienne (VB), il y a moins de lactobacilles et une abondance accrue de diverses bactéries anaérobies, telles que Gardnerella vaginalis et Prevotella bivia 5,6. Les femmes atteintes de VB courent un risque accru d’infections sexuellement transmissibles 7,8,9, d’infertilité 10, de pertes de grossesse 11, de naissances prématurées 12,13,14, d’infections intra-utérines 15, d’infections cervicales 16 et de cancer16,17,18 . La VB est également associée à une probabilité plus élevée de colonisation vaginale par des bactéries potentiellement pathogènes, telles que Fusobacterium nucleatum 1,19,20, un isolat commun des infections du liquide amniotique 21.
En raison de l’importance des bactéries anaérobies dans la santé vaginale humaine, il existe un besoin de modèles animaux qui peuvent être utilisés pour étudier la biologie et la pathogenèse de ces organismes. Ici, nous décrivons des méthodes d’inoculation vaginale et de récupération viable de Gardnerella vaginalis chez des souris œstrogéniques et suggérons des stratégies supplémentaires pour Prevotella bivia et Fusobacterium nucleatum. D’autres modèles de colonisation vaginale murine ont déjà été décrits, mais ils se sont concentrés sur l’inoculation et la récupération de bactéries anaérobies facultatives telles que Streptococcus22 du groupe B et Neisseria gonorrhoeae23 qui ont été cultivées en aérobiose. L’inoculation et la récupération des anaérobies obligatoires peuvent être accomplies avec succès avec des stratégies expérimentales appropriées. Nous discutons des approches pour le rétablissement viable de plusieurs taxons bactériens et suggérons une évaluation empirique des conditions de viabilité d’autres espèces / souches d’intérêt.
La méthode classique d’estimation de la colonisation par des bactéries vivantes est la récupération des unités formant colonie (UFC). Chez les souris élevées de manière conventionnelle avec leur propre microbiote endogène, cela nécessite une récupération sur gélose qui sélectionne les membres du microbiote vaginal endogène tout en permettant à la souche inoculée de bactéries de se développer. Ici, nous utilisons un isolat résistant à la streptomycine de G. vaginalis24 qui peut être récupéré sélectivement sur un milieu gélosé contenant de la streptomycine. Pour s’assurer que le milieu est suffisamment sélectif et, inversement, que les bactéries résistantes à la streptomycine ne sont pas présentes dans le microbiome endogène, les lavages vaginaux prélevés juste avant l’inoculation doivent être plaqués sur gélose sélective (contenant de la streptomycine).
La meilleure méthode de préparation de l’inoculum peut varier selon les espèces et les souches de bactéries. Avant le début des expériences sur la souris, des travaux préliminaires doivent être effectués pour déterminer les conditions préférables pour le milieu de culture, le critère de croissance et la préparation de l’inoculum, ainsi que la sensibilité à l’oxygène et la viabilité dans le PBS. Dans le cas de bactéries plus sensibles à l’oxygène, d’autres préparations de l’inoculum peuvent être envisagées (p. ex. dans un milieu de culture anaérobie avec un groupe témoin approprié du véhicule)25,26.
La façon la plus importante dont le modèle décrit ici diffère des modèles d’inoculation vaginale publiés précédemment est l’utilisation de bactéries en culture anaérobie, qui nécessitent des considérations spéciales pour la préparation d’inoculum viable et la récupération des bactéries chez les souris. Les étapes spécifiques du protocole ci-dessus peuvent varier légèrement selon l’espèce ou la souche de bactéries utilisée, comme suggéré dans le dossier supplémentaire 1. De plus, ce manuscrit décrit une nouvelle méthode procédurale pour l’administration de bactéries et de lavages vaginaux qui nécessite moins d’expérience de la part de l’investigateur et moins de retenue pour les souris. Si l’expérimentateur n’est pas à l’aise avec la forme de contention décrite à l’étape 3.2. et l’étape 3.3., les souris peuvent plutôt être éraflées comme décrit précédemment34 avec ou sans anesthésie selon la conception expérimentale et les directives institutionnelles de l’IACUC.
Une mise en garde importante à l’utilisation de bactéries cultivées en anaérobiose dans les modèles murins est que certaines étapes (telles que celles impliquant des animaux vivants) doivent être effectuées à l’extérieur de la chambre anaérobie. Par conséquent, les étapes les plus critiques de ce protocole sont celles dans lesquelles les bactéries d’intérêt seront exposées à un environnement aérobie, comme lors de l’inoculation des souris. L’utilisation de tout nouvel anaérobie dans ce modèle nécessitera une étude préliminaire de sa capacité à maintenir sa viabilité en cas d’exposition à l’oxygène (comme la comparaison des UFC avant et après l’inoculation, comme décrit aux étapes 2.5 et 3.4). Selon le degré d’oxygène et la sensibilité au PBS de l’organisme, différentes méthodes de préparation de l’inoculum doivent être envisagées (dossier supplémentaire 1, étape 2.4.5.). Pour les inoculations utilisant G. vaginalis JCP8151B, nous avons constaté qu’un seul tube d’inoculum peut être préparé dans du PBS et utilisé pour infecter toutes les souris. Si une bactérie anaérobie différente est utilisée et plus sensible à l’oxygène, l’inoculum peut plutôt être préparé dans des tubes séparés pour chaque souris afin qu’il ne soit pas nécessaire d’ouvrir / fermer le tube de manière répétée. De même, si l’espèce bactérienne d’intérêt est plus exigeante / moins capable de survivre dans le PBS que G. vaginalis, l’inoculation peut plutôt être préparée dans des milieux de culture. Si le milieu utilisé contient des agents réducteurs, tels que le milieu anaérobie CDC utilisé pour la culture de Prevotella bivia (dossier supplémentaire 1, étape 2.1. et étape 2.2.), la bactérie aura également une protection accrue contre l’exposition à l’oxygène.
D’autres méthodes d’homogénéisation peuvent également être envisagées, telles que le battement du cordon22,35, qui se fait avec le bouchon du tube fermé et peut donc introduire moins d’oxygène que l’homogénéisateur portatif. De plus, les organismes plus sensibles à l’oxygène peuvent nécessiter un temps d’équilibre plus long pour les milieux. Un indicateur d’oxygène tel que la résazurine peut être utilisé pour vérifier que les conditions anaérobies ont été atteintes (étape 2.1.). D’autres méthodes telles que les pots anaérobies peuvent affecter les résultats et doivent être vérifiées pour la viabilité bactérienne avant utilisation.
La sensibilité à l’oxygène et la minutie de l’organisme expérimental peuvent également jouer un rôle dans la récupération réussie des bactéries viables de la souris pendant le lavage/homogénéisation (dossier supplémentaire 1, étape 3.2. et étape 5.1.). Pour les organismes très sensibles, le temps écoulé entre le lavage pris et le plaquage peut entraîner une perte de viabilité et provoquer une estimation artificiellement basse de la colonisation vaginale bactérienne. Pour atténuer cet effet, les lavages collectés peuvent être immédiatement dilués dans des milieux de culture anaérobies frais (avec agent réducteur). De même, l’homogénéisation des organes peut être effectuée dans des milieux de culture frais plutôt que dans du PBS pour augmenter la viabilité bactérienne et peut également être effectuée dans la chambre anaérobie elle-même pour minimiser l’exposition à l’oxygène.
Selon le but d’une expérience donnée, l’expérimentateur doit prêter attention aux groupes témoins. Pour tester les hypothèses, les mesures de base de souris témoins non infectées qui sont simulées traitées avec le véhicule seul aideront à établir s’il y a induction de chimiokines / cytokines ou d’autres résultats spécifiques de l’infection. Le véhicule témoin utilisé doit être le même que celui utilisé pour l’inoculation, donc si les bactéries sont inoculées dans des milieux de culture, les milieux de culture non inoculés doivent être utilisés comme témoin (dossier supplémentaire 1, étape 2.4.5.).
Les méthodes décrites dans ce protocole pourraient également être appliquées à des bactéries facultatives capables de se développer en anaérobiose, mais qui sont traditionnellement étudiées en utilisant des conditions de culture aérobie (comme Escherichia coli ou Streptocoque du groupe B). Cela pourrait être particulièrement pertinent pour les infections par ces organismes dans les sites du corps qui sont censés contenir de faibles niveaux d’oxygène, comme le col de l’utérus. Il se peut qu’un organisme facultatif infecte plus efficacement les sites avec moins d’oxygène lorsque l’inoculum est préparé en anaérobiose que par voie aérobie. Dans une telle expérience, la récupération de bactéries viables pour le dénombrement de l’UFC peut ne pas nécessiter de conditions anaérobies.
The authors have nothing to disclose.
Nous remercions Lynne Foster pour son assistance technique lors de l’élaboration de ces modèles. Nous apprécions les fonds de démarrage du Département de microbiologie moléculaire et du Center for Women’s Infectious Disease Research (à AL), ainsi que la March of Dimes (prix Basil O’Connor à AL) qui ont aidé à soutenir les expériences à un stade précoce. L’Institut national des allergies et des maladies infectieuses (R01 AI114635) a également soutenu le développement de ces modèles.
β-estradiol 17-valerate | Sigma | E1631 | estrogenization of mice |
0.22 µm, 50 mL Steriflip vacuum filter | Fisher | SCGP00525 | sterile filtering sesame oil |
14 mL tube | Falcon | 352059 | estrogenization of mice |
190-proof ethanol | Koptec | V1105M | dissection, tissue homogenization, CDC and Columbia media |
1x PBS | Fisher | MT21040CM | vaginal lavage, G. vaginlalis inoculum prep, tissue collection and homogenization |
25 G × 5/8 -in needle | BD | 305122 | estrogenization of mice |
5 mL tube | Falcon | 352063 | Tissue collection and homogenization |
Anaerobic chamber | Coy | 7200000 | Growth of anaerobic bacteria |
Bacto agar | Fisher | DF0140074 | G. vaginalis, F. nucleatum, and P. bivia agar plates |
Bacto peptone | Fisher | DF0118170 | CDC anaerobic media for P. bivia growth |
Columbia broth | Fisher | DF0944170 | Columbia media for F. nucleatum growth |
Defibrinated sheep blood | Hemostat | DSB500 | CDC anaerobic media for P. bivia growth |
Forceps | Fine Science Tools | 11008-13 | mouse/tissue dissection |
Glucose | Sigma | G7528 | NYCIII media for G. vaginalis growth |
Handheld homogenizer | ISC Bio | 3305500 | Tissue homogenization |
Hemin | Sigma | 51280 | CDC anaerobic media for P. bivia growth, Columbia media for F. nucleatum growth |
HEPES | Cellgro | 25-060-Cl | NYCIII media for G. vaginalis growth |
Horse serum | Hemostat | SHS500 | NYCIII media for G. vaginalis growth |
Hydrogen gas mix (5% hydrogen, 10% CO2, 85% nitrogen) | Matheson | Gas for anaerobic chamber | |
Isofluorane | VetOne | 502017 | mouse anaethesia at sacrifice |
L-cysteine | Sigma | C1276 | CDC anaerobic media for P. bivia growth |
L-glutamate | Sigma | G1626 | CDC anaerobic media for P. bivia growth |
Milli-Q Water Purifier | Millipore | IQ-7000 | for making media and homogenization |
NaCl | Sigma | S3014 | NYCIII media for G. vaginalis growth |
NaOH tablets | Sigma | S5881 | CDC anaerobic media for P. bivia growth |
Nitrogen gas | Airgas | Gas for anaerobic chamber | |
p-200 filter tips | ISC Bio | P-1237-200 | vaginal lavages and bacterial inoculations |
pancreatic digest of casein | Sigma | 70169 | CDC anaerobic media for P. bivia growth |
Proteose peptone #3 | Fisher | DF-122-17-4 | NYCIII media for G. vaginalis growth |
Scissors | Fine Science Tools | 14084-08 | mouse/tissue dissection |
Sesame oil | Fisher | ICN15662191 | estrogenization of mice |
Single edge surgical carbon steel razor blades | VWR | 55411-050 | tissue dissection |
Sodium chloride | Sigma | S3014 | CDC anaerobic media for P. bivia growth |
Spectrophotometer | BioChrom | 80-3000-45 | measuring bacterial OD600 |
Streptomycin | Gibco | 11860038 | add to agar media to make selective plates |
Tuberculin slip tip 1ml syringe | BD | 309659 | estrogenization of mice |
Vitaim K3 | Sigma | M5625 | Columbia media for F. nucleatum growth |
Vitamin K1 | Sigma | 95271 | CDC anaerobic media for P. bivia growth |
Yeast extract | Fisher | DF0127-17-9 | NYCIII media for G. vaginalis growth |