В этом исследовании мы предоставляем подробную технику для простой, но надежной кортикальной органоидной системы культивирования с использованием стандартных культур hPSC без фидера. Это быстрый, эффективный и воспроизводимый протокол для генерации органоидов, которые моделируют аспекты старения мозга in vitro.
Органоиды мозга представляют собой трехмерные модели развивающегося человеческого мозга и обеспечивают убедительную, передовую платформу для моделирования заболеваний и крупномасштабного геномного и лекарственного скрининга. Из-за самоорганизующейся природы клеток в органоидах головного мозга и растущего диапазона доступных протоколов для их генерации были выявлены проблемы с гетерогенностью и изменчивостью между органоидами. В этой протокольной статье мы описываем надежный и воспроизводимый протокол, который в значительной степени преодолевает эти проблемы и генерирует кортикальные органоиды из нейроэктодермальных предшественников в течение 1 месяца, и который может поддерживаться более 1 года. Этот высоковоспроизводимый протокол может быть легко выполнен в стандартной комнате для культивирования тканей и приводит к органоидам с богатым разнообразием типов клеток, обычно встречающихся в развивающейся коре головного мозга человека. Несмотря на их ранний состав развития, нейроны и другие типы клеток головного мозга человека начнут проявлять типичные признаки старения в нейронных клетках после длительной культуры in vitro , что делает их ценной и полезной платформой для изучения нейронных процессов, связанных со старением. Этот протокол также описывает метод обнаружения таких стареющих клеток в корковых органоидах головного мозга с использованием окрашивания бета-галактозидазы, связанного со старением.
Наши текущие знания о человеческом мозге в значительной степени основаны на животных моделях и посмертных образцах мозга. Биология стволовых клеток является быстро развивающейся областью, которая дает новое понимание базовой биологии развития человеческого мозга и патологических факторов расстройств головного мозга человека. Человеческие плюрипотентные стволовые клетки (hPSCs) являются бесценным инструментом для моделирования человеческого мозга посредством генерации органоидов, органоподобной трехмерной (3D) ткани, которая обычно повторяет траектории развития, клеточный состав и архитектуру развивающегося человеческого мозга. Органоиды мозга самособираются и состоят из нервных стволовых клеток, определенных нейронных предшественников, зрелых нейронов и типов глиальных клеток. Органоиды, таким образом, предоставляют уникальную возможность для изучения раннего человеческого мозга, который часто недоступен для прямых экспериментов, но также имеет внутренние ограничения, такие как отсутствие сосудистой системы и иммунной системы.
Методологии генерации органоидов мозга использовались двумя различными способами: неуправляемая и управляемая дифференциация. Неуправляемые органоидные методы мозга основаны на спонтанных внутренних дифференцировальных способностях стволовых клеток, которые управляют тканевым морфогенезом 1,2 и позволяют возникать различные идентичности клеточных линий, начиная от переднего мозга, среднего мозга и заднего мозга до сосудистого сплетения, сетчатки и мезодермы. Напротив, управляемые органоидные методы мозга требуют существенного использования внешних факторов для стимулирования HPSC к желаемому паттерну нейронных линий, представляющих один тип области мозга, таких как медиальная ганглионная возвышение3,передний мозг 4, средний мозг5, гипоталамус6, мозжечок7 и сосудистое сплетение8. Эта способность генерировать различные области мозга с различными клеточными линиями и возможность их слияния по желанию делает органоиды мозга отличной моделью для исследования развития человеческого мозга и расшифровки основных механизмов заболеваний, связанных с мозгом. Хотя эти методы генерации органоидов мозга предлагают прорыв в моделировании областей человеческого мозга, изменчивость и неоднородность между органоидами остаются значительным ограничением для систематических и количественных исследований, таких как скрининг лекарств.
Текущий протокол основан на методе, разработанном в нашей недавней статье9 , и включает селективную дифференциацию колоний hPSC в сторону идентичности нейроэктодермы (NEct) с двойными ингибиторами SMAD (SB-431542 и LDN 193189), которые затем обладают способностью самоорганизовываться в течение 4 дней в 3D-сфероиды нейроэпителия под влиянием сигнализации FGF2. Эти сфероиды нейроэпителия надежно генерируют однородные кортикальные органоиды с клеточным составом in vivo в течение 4 недель после дифференцировки. Протокол, описанный здесь, построен на наших предыдущих выводах, показывающих, что ингибирование двойной передачи сигналов SMAD (Suppressor of Mothers Against Decapentaplegic) способствует дифференцировке hPSCs в сторону ростральных нервных стволовых клеток, полученных из нейроэктодермальных предшественников10 , путем, среди прочего, ингибирования эндодермальной, мезодермальной и трофэктодермальной судьбы клеток выбора11 . Кроме того, встраивание сфероидов нейроэпителия в матрицу базальной мембраны, сертифицированную hESC, вызывает значительное почкование нейроэпителии, образуя желудочки с апикобазальной полярностью. Крупномасштабная культура показала воспроизводимость и однородность корковых органоидов независимо от клеточных линий, клонов или партий и, таким образом, представляет собой надежную и стабильную систему стволовых клеток, имитирующую раннее развитие коры головного мозга человека в области здоровья и заболеваний in vitro. Далее мы описываем протокол обнаружения маркеров стареющих нейрональных клеток в органоидах коры головного мозга, полученных из hPSCs, которые культивировались в течение длительных периодов времени.
После покрытия hPSCs при плотности посева 20%-30% клетки обрабатывают двойными ингибиторами SMAD в течение 3 дней для дифференцировки колоний hPSC в сторону нейроэктодермальных колоний. Эти колонии затем осторожно поднимаются с помощью диспазы и высеваются в сверхнизкие прикрепленные 6-луночные пластины, дополненные FGF2. Плавающие 2D-колонии самоорганизуются в 3D-нейроэктодермальные сфероиды в течение ночи и выдерживаются в течение 4 дней в среде N2, ежедневно дополняемой FGF2. После того, как сфероиды установили нейроэпителиальный слой, они могут быть встроены в матрицу базальной мембраны. Регулярно добавляя свежую терминальную дифференцирующую среду, исследователи будут наблюдать прогрессирующее расширение и бутонизацию нейроэпителии в корковых органоидах. Исследователи могут пожелать диссоциировать эти органоиды для проведения транскрипционного и протеомного профилирования. Кроме того, визуализация Brightfield рекомендуется для мониторинга качества корковых органоидов. Анализ может быть выполнен путем фиксации, криосекции и иммуноокрашивания. Описания и методы для этих методов были ранее описаны12. В конечном счете, этот протокол позволяет исследователям быстро и надежно генерировать однородные органоиды кортикального мозга для моделирования развивающегося кортикального мозга человека с недорогим и ограниченным оборудованием, а также для изучения аспектов старения клеточных нейронов, как описано в этой статье.
Чтобы обеспечить возможность использования органоидов головного мозга, полученных из hPSC, в скрининге лекарств и моделировании заболеваний, крайне важно создавать органоиды в соответствии с воспроизводимым и надежным протоколом15. Органоиды головного мозга обычно генерируются из эмбриональных тел, полученных из hPSCs, которые затем встраиваются во внеклеточный матрикс, который способствует расширению тканей и нейронной дифференцировке. По сравнению с такими протоколами, как Lancaster’s 1,16,17 и Velasco 18, которые начинаются с эмбриоидных тел и позволяют развивающимся органоидам следовать пути дифференцировки по умолчанию, мы обнаружили, что начало создания органоидов кортикального мозга с клетками NEct человека, а не с эмбриональными телами, улучшает консистенцию кортикального органоидного образования головного мозга. Это, следовательно, также позволяет масштабироваться, необходимый для лекарственного и фенотипического скрининга. Поскольку клетки NEct человека могут быть не только расширены до значительных количеств, но также могут быть легко криоконсервированы, этот подход также улучшает воспроизводимость между экспериментами. Следует также отметить, что по сравнению с другими протоколами, которые приняли использование биореакторов и аналогичных технологий, для этого протокола не требуется специализированное оборудование, что делает его пригодным для любой лаборатории6. Наконец, время, необходимое для генерации зрелых органоидов, которые являются положительными для маркеров коркового слоя, таких как SATB2, сокращается по сравнению с протоколами Ланкастера1 и биореактора 6,19, что делает его более подходящим для изучения траектории развития коры головного мозга человека в области здоровья и заболеваний 1,6,16.
Кроме того, учитывая постоянно растущее глобальное воздействие на здравоохранение связанных со старением заболеваний, таких как деменция, которые связаны с увеличением типов стареющих клеток в мозге, что способствует патогенезу, способность идентифицировать и тестировать соединения, которые могут улучшить старение мозга, представляет огромный интерес. Несмотря на то, что hPSCs, как известно, эпигенетически омолаживаются во время процесса перепрограммирования20, мы находим устойчивое увеличение стареющих клеток в органоидах кортикального мозга, культивируемых в течение длительных периодов времени. Это многообещающая разработка, которая теперь позволяет проводить скрининг препаратов, которые устраняют такие стареющие клетки из мозга (сенолитики) или замедляют этот процесс (сеностатики)21. Поскольку корковые органоиды головного мозга, полученные из NEct человека, имеют человеческое происхождение, этот подход, вероятно, сократит традиционный путь к продаже таких новых терапевтических средств.
В этом протоколе есть два важных шага. Во-первых, это правильный уровень слияния колоний hPSC в момент дифференциации. Колонии hPSC должны быть не более 30% сливающимися, чтобы гарантировать, что генерируемые колонии NEct не сливаются с соседними колониями и что отдельные органоиды управляются клонально. Второй критический шаг включает в себя правильное использование диспаза для подъема колоний NEct и производства нейронных сфероидов. Время инкубации с диспазой имеет решающее значение для конечного качества генерируемых нейронных сфероидов. Это связано с тем, что чрезмерное воздействие колоний с диспазой токсично для клеток22 и в конечном итоге влияет на качество генерируемых органоидов. Ограничение этого протокола заключается в том, что трудно контролировать размер нейронных сфероидов, потому что он зависит от размера начальных колоний, которые поднимаются с диспазой. Однако эту проблему можно преодолеть, выбрав нейронные сфероиды, которые имеют одинаковый размер при переходе к этапу встраивания.
Наконец, будущие приложения могут распространяться на использование этих воспроизводимых кортикальных органоидов в роботизированном анализе и биофармацевтических подходах к скринингу, обычно используемых в этой отрасли. Это подтверждается предварительными данными нашей лаборатории, указывающими на то, что генерация органоидов коркового мозга из клеток NEct человека может быть легко автоматизирована, что делает ее совместимой с этими подходами.
The authors have nothing to disclose.
Эта работа поддерживается Фондом ускоренных исследований будущего медицинских исследований, флагманской миссией Лейкодистрофии Massimo (EPCD000034), Фондом медицинских исследований будущего – Миссией стволовых клеток (APP2007653). Авторы хотели бы поблагодарить д-ра Чжу Хён Ли (Корейский университет) за создание данных в дополнительном видео 1.
16% Formaldehyde (W/V) Methanol-free | Thermo Fisher Scientific | 28908 | 4% of PFA are diluted in 1x PBS |
2-Mercaptoethanol 50 mL(1000x) | Life Technologies Australia (TFS) | 21985023 | Used in NM and DM media |
B 27 Supplement 10 mL | Life Technologies Australia (TFS) | 17504044 | Used in NM and DM media |
CKX53 microscope with SC50 camera | Olympus | ||
Corning Costar 6 well cell culture plates | Sigma Aldrich Pty Ltd | CLS3516-50EA | |
Dispase II powder | Thermo Fisher Scientific | 17105041 | Powder is dissolve in HBSS, filtered through 0.22 µm filter, aliquote at 10 mL and store at -20 °C |
DMEM Nutrient Mix F12 10x 500 mL (DMEM/F-12) | Thermofisher | 11320082 | Used in NM and DM media |
DMSO Dimethyl Sulfoxide | Sigma Aldrich Pty Ltd | D2650-100ML | |
Dulbecco's Phosphate Buffered Saline | Sigma Aldrich Pty Ltd | D1408-500ML | |
Falcon Matrigel hESC-qualified Matrix | In Vitro Technologies Pty Ltd | FAL354277 | Make aliquotes of 100 µL and stored at -20 °C |
GlutaMAX Supplement 100x | Thermo Fisher Scientific | 35050061 | Used in NM and DM media |
Hanks Balanced Salt Solution | Sigma Aldrich Pty Ltd | H8264 | |
Human induced pluripotent stem cells (EU79) | In-house reporogrammed from skin fibroblast | ||
Human induced pluripotent stem cells (G22) | Genea Biocells | Obtained from Genea Biocells (San Diego, United States) | |
Human induced pluripotent stem cells (WTC) | Gift from Professor Bruce Conklin | ||
InSolution TGF-Β RI Kinase Inhibitor VI, SB431542 | Merck | US1616464-5MG | |
Insulin Solution Human Recombinant | Sigma Aldrich Pty Ltd | I9278 | Used in NM and DM media |
LDN193189 Dihydrochloride | Sigma Aldrich Pty Ltd | SML0559-5MG | Used during differentiation |
MEM Non-Essential Amino Acids Solution (100x) | Thermo Fisher Scientific | 11140050 | Used in NM and DM media |
mTeSR Plus | STEMCELL TECHNOLOGIES | 100-0276 | Used to maintain hiPSC colonies prior to differentiation with NM media |
N2 Supplement 5 mL (100x) | Life Technologies Australia Pty Ltd | 17502048 | Used in NM and DM media |
Neurobasal Medium | Thermo Fisher Scientific | 21103049 | Used in DM media |
OCT Embedding Compound Sakura Clear (118 mL/Bottle) | Tissue Tek | 4583 | |
Parafilm M Roll Size 4 in. x 125 Ft | Sigma Aldrich Pty Ltd | P7793 | |
Penicillin-Streptomycin (10,000 U/mL) | Thermo Fisher Scientific | 15140122 | Used in NM and DM media |
Potassium Hexacyanoferrate (II) Trihydrate | Sigma Aldrich Pty Ltd | CP1087 | |
Potassium hexacyanoferrate(III) | Sigma Aldrich Pty Ltd | 455946 | |
Prolong Glass Antifade Mountant | Life Technologies Australia (TFS) | P36980 | |
Recombinant Human FGF basic | R&D Systems | 233-FB-01M | Aliquotes are made at 20 µg/mL and stored at -20 °C |
SB431542 | Tocris | 1614 | Used during differentiation |
Sucrose | Sigma Aldrich Pty Ltd | PHR1001-1G | 30% of sucrose are diluted in 1x PBS |
Ultra-Low attachment multiwell plates , 24 well plate, polystyrene | Sigma Aldrich Pty Ltd | CLS3473-24EA | |
X-GAL EA | Life Technologies Australia (TFS) | R0404 | Make aliquotes of 20 mg/mL and storde at -80 °C |