La litografia near-UV e la microscopia a forza di trazione sono combinate per misurare le forze cellulari su idrogel micropatterati. Il rilascio mirato indotto dalla luce di singole cellule consente un numero elevato di misurazioni sullo stesso campione.
La microscopia a forza di trazione (TFM) è il metodo principale utilizzato in meccanobiologia per misurare le forze cellulari. Comunemente questo viene utilizzato per le cellule che aderiscono a substrati morbidi piatti che si deformano sotto trazione cellulare (2D-TFM). TFM si basa sull’uso di materiali elastici lineari, come il polidimetilsilossano (PDMS) o la poliacrilammide (PA). Per 2D-TFM su PA, la difficoltà nel raggiungere un’elevata produttività deriva principalmente dalla grande variabilità delle forme e delle trazioni delle celle, che richiedono la standardizzazione. Presentiamo un protocollo per fabbricare in modo rapido ed efficiente idrogel PA micropatterned per studi 2D-TFM. I micropattern vengono prima creati dalla fotolitografia senza maschera utilizzando la luce quasi UV in cui le proteine della matrice extracellulare si legano solo alle regioni micropatternate, mentre il resto della superficie rimane non adesivo per le cellule. La micropatterazione delle proteine della matrice extracellulare è dovuta alla presenza di gruppi aldeidici attivi, con conseguente regioni adesive di diverse forme per ospitare singole cellule o gruppi di cellule. Per le misurazioni TFM, utilizziamo idrogel PA di diversa elasticità variando le quantità di acrilammide e bis-acrilammide e monitorando lo spostamento delle perle fluorescenti incorporate per ricostruire i campi di trazione cellulare con la citometria di trazione a trasformata di Fourier regolarizzata (FTTC).
Per ottenere ulteriormente una registrazione precisa delle forze cellulari, descriviamo l’uso di una dose controllata di luce modellata per rilasciare trazioni cellulari in regioni definite per singole cellule o gruppi di cellule. Chiamiamo questo metodo microscopia a forza di trazione con illuminazione UV locale (LUVI-TFM). Con il trattamento enzimatico, tutte le cellule vengono staccate dal campione contemporaneamente, mentre con LUVI-TFM le forze di trazione delle cellule in diverse regioni del campione possono essere registrate in sequenza. Dimostriamo l’applicabilità di questo protocollo (i) per studiare le forze di trazione cellulare in funzione dell’adesione controllata al substrato e (ii) per ottenere un numero maggiore di osservazioni sperimentali dallo stesso campione.
Quando interagiscono con il loro ambiente extracellulare, le cellule aderenti esercitano forze che sono principalmente mediate da aderenze focali a base di integrina che collegano la matrice extracellulare (ECM) al citoscheletro dell’actina. Le aderenze focali sono assemblaggi multiproteici incentrati sul legame delle integrine alle proteine ECM come la fibronectina e il collagene. Il clustering delle integrine e la crescita delle aderenze focali è cruciale non solo per la creazione di una connessione meccanicamente stabile, ma anche per il reclutamento di altre proteine di adesione focale, comprese quelle che attivano la via RhoA per la regolazione della contrattilità cellulare1. La contrattilità RhoA-dipendente del citoscheletro dell’actina consente alle cellule di diffondersi e migrare sull’ECM sottostante e anche di rilevarne la rigidità2. La distribuzione delle forze di trazione dipende fortemente dall’area di diffusione e dalla forma delle cellule, entrambe le quali si basano sulle proprietà della matrice e quindi influenzano l’organizzazione citoscheletrica, formando infine un circuito di feedback chiuso tra la meccanica della matrice e l’organizzazione citoscheletrica3,4.
Le tecniche di micropatterning superficiale consentono un controllo definito della forma cellulare creando regioni di dimensioni micron che presentano proteine adesive ECM; in base alle dimensioni di queste regioni, singole cellule o gruppi di cellule che aderiscono al micropattern5. Le proteine ECM possono essere modellate su substrati di vetro con approcci diversi come la stampa a microcontatto, il foto-patterning o il laser-patterning6. L’uso della luce UV (λ = 185 o 375 nm) combinato con strategie antivegetative superficiali offre la flessibilità per la progettazione di diverse forme e dimensioni e l’immobilizzazione di più tipi di proteine con un’elevata precisione vicino ai bordi superficiali7,8. Le regioni rivestite con sostanze chimiche repellenti alle proteine come il polietilenglicole (PEG) sono protette con una fotomaschera al cromo o un sistema di litografia senza maschera basato su dispositivo a specchio digitale (DMD). I modelli nelle maschere consentono l’esposizione alla luce UV di regioni che saranno poi modellate con proteine ECM. Il pattern delle superfici dell’idrogel con proteine ECM richiede una fase di trasferimento per rimuovere le proteine dalla superficie del vetro e collegarle ai modelli. In alternativa, è possibile ottenere motivi su materiali morbidi rivestendo prima la fotomaschera con una proteina repellente, quindi bruciando le regioni smascherate utilizzando un’illuminazione UV profonda. Poiché i raggi UV profondi generano ozono e rendono la superficie reattiva per il legame proteico, le regioni non mascherate sono rivestite con proteine ECM e infine il gel viene polimerizzato direttamente sopra le regioni non mascherate9,10.
Gli idrogel modellati possono essere utilizzati per eseguire TFM, una tecnica che misura le forze cellulari all’interfaccia cellula-materiale11. In 2D-TFM, si utilizza la superficie piana di un film polimerico spesso, in cui sono state incorporate perle marcatori per tracciare le deformazioni12,13,14,15. Per estrarre i vettori di spostamento, è essenziale combinare due immagini, una dello stato deformato e un’immagine di riferimento senza deformazioni. Le due immagini vengono quindi mappate l’una sull’altra con l’elaborazione delle immagini. Ad alta densità di marcatori, questo viene solitamente fatto con particle image velocimetry (PIV), che è un metodo ben consolidato per ricostruire il flusso idrodinamico. A bassa densità di marcatori e in 3D-TFM, questo viene solitamente fatto con Particle Tracking Velocimetry (PTV), che include caratteristiche specifiche del set di dati sperimentali. Un esempio di alternativa computazionalmente più economica è il flusso ottico, come l’algoritmo Kanade-Lucas-Tomasi (KLT)16. Nel caso dei substrati di idrogel, le perle fluorescenti sono solitamente incorporate ad alta densità durante la polimerizzazione del materiale e le immagini vengono registrate prima e dopo il rilascio cellulare dopo il distacco enzimatico. Il distacco enzimatico delle cellule aderenti, ad esempio per tripsinizzazione, porta al rilascio simultaneo di trazioni cellulari da tutte le cellule sugli idrogel, rendendo difficile ottenere un’analisi dettagliata da un numero elevato di cellule.
Qui presentiamo un protocollo per preparare idrogel micropatterned per controllare la forma e la localizzazione delle cellule e un metodo per misurare in modo efficiente le forze di trazione in sequenza utilizzando UV per staccare le singole cellule dal substrato. Per le misurazioni della forza di trazione, presentiamo una tecnica per produrre idrogel PA a doppio strato, in cui le perle fluorescenti sono incorporate solo nello strato superiore, il che aumenta la loro densità e riduce la loro diffusione verticale. La combinazione del rilascio mediato dai raggi UV delle forze di trazione cellulare con il micropatterning consente di ottenere un controllo spaziale sul distacco cellulare (ad esempio, di singole cellule senza influenzare l’adesione di altre cellule nella regione di interesse), a condizione che vi sia una distanza sufficiente tra le cellule modellate. La trazione cellulare viene quindi ricostruita utilizzando il metodo più efficiente e affidabile per il 2D-TFM, vale a dire, la citometria di trazione a trasformata di Fourier (FTTC) con regolarizzazione17,18.
In questo protocollo, descriviamo la preparazione di idrogel PA micropatterned contenenti perline fluorescenti, che vengono utilizzati come marcatori fiduciali per gli studi TFM. Il nostro approccio si basa su tre fasi: 1) preparazione di idrogel PA a doppio strato; 2) micropatterning delle proteine ECM e loro trasferimento sulla superficie dell’idrogel; 3) uso di luce quasi UV modellata per TFM. La configurazione sperimentale per analizzare le trazioni cellulari al substrato richiede l’uso di materiali elastici lineari con valori di rigidità noti per calcolare le forze relative allo spostamento delle perle fluorescenti26. Gli idrogel PA sono facili da preparare, la rigidità può essere facilmente regolata e sono comunemente usati per il rilevamento della rigidità e TFM18,28. Tuttavia, per ottenere tempi di polimerizzazione riproducibili e polimerizzazione omogenea dell’intero idrogel, si dovrebbe prestare attenzione alle condizioni di conservazione e al tempo per i reagenti, ad esempio, l’APS deve essere tenuto in un essiccatore per evitare di perdere la sua attività; TEMED deve essere protetto dalla luce diretta. L’uso di HEA ossidato consente il legame covalente delle proteine della matrice sulla superficie dell’idrogel, che potrebbe essere vantaggioso per ottenere la formazione di uno strato proteico completo e stabile. La soluzione HEA ossidata deve essere preparata fresca ogni volta che vengono fabbricati idrogel di PA. L’idrogel PA a doppio strato offre tre vantaggi principali: 1) fornisce un modo alternativo per ottenere in modo riproducibile una distribuzione omogenea di perline fiduciali vicino alla superficie dell’idrogel, senza la necessità di rendere il gel estremamente sottile (cioè <20 μm). Il controllo dello spessore dell'idrogel è fondamentale per ottenere misurazioni accurate con TFM. Quando il substrato elastico è troppo sottile, le cellule aderenti forti come i fibroblasti possono percepire e rispondere meccanicamente al substrato di vetro rigido sottostante29,30. Idrogel spessi rendono più impegnativa l’acquisizione dell’immagine per la ricostruzione della forza. Inoltre, molti microscopi non avranno spazio sufficiente per ospitarli, considerando lo spessore aggiuntivo del substrato di vetro utilizzato per attaccare l’idrogel, a meno che non vengano utilizzati vetrini di microscopia ultrasottile. 2) Nell’idrogel PA a doppio strato, la distribuzione omogenea delle perle fiduciali vicino alla superficie dell’idrogel PA si ottiene senza utilizzare una centrifuga, ma piuttosto con una semplice incubazione di quantità precise di soluzioni idrogel e perline fluorescenti. L’elevata densità del tallone è di notevole vantaggio quando si esegue l’analisi PIV perché aumenta la risoluzione delle forze di trazione e il rapporto segnale-rumore senza la necessità di microscopia confocale. 3) Confinare le perline in uno strato sottile vicino all’interfaccia cellula-materiale consente l’imaging delle forze di trazione con microscopi a epifluorescenza e microscopi confocali. Quando si prepara l’idrogel, l’utente deve assicurarsi che aderisca saldamente al vetro inferiore prima di procedere con i passaggi successivi del protocollo. Si consiglia di seguire il tempo di incubazione indicato per la polimerizzazione degli strati di idrogel, in quanto potrebbe essere difficile rimuovere il vetro sulla parte superiore della superficie senza danneggiare la superficie dell’idrogel.
Le tecniche più conosciute per misurare le proprietà elastiche sono AFM, nanoindentazione, prove di trazione e reometria. Tuttavia, la nanoindentazione induce tensioni molto elevate sui materiali che possono influenzare la determinazione delle proprietà elastiche. Le prove di trazione e la reometria invece sono tecniche di misura macroscopica, mentre le cellule interagiscono su scala microscopica31,32. AFM consente misurazioni su microscala con ceppi ridotti in condizioni fisiologiche. L’affidabilità delle misurazioni AFM può essere compromessa se mancano dettagli sperimentali (ad esempio, forza di indentazione e velocità) o se vengono registrati dati insufficienti27. Huth et al. descrive un algoritmo per estrarre i moduli di Young dai dati AFM, che enfatizza il mantenimento costante dei dettagli di misurazione27. Questo algoritmo offre una determinazione precisa e affidabile dei moduli di Young ed è stato utilizzato per i nostri esperimenti. Inoltre, abbiamo misurato molte curve su campioni fabbricati in giorni diversi e ottenuto risultati molto simili (variazione dei valori medi di circa 1-2 kPa). Ciò dimostra che la rigidità dei nostri gel può essere prevista in modo affidabile.
In questo protocollo, utilizziamo un modulo di fotopatterning per creare regioni micropatterned su vetro, che vengono poi trasferite sulle superfici dell’idrogel. Il micropatterning mostrato in questo protocollo si basa sulla litografia near-UV maskless basata su DMD (dispositivo micro-specchio digitale) (λ = 375 nm)7. Una DMD è costituita da un gran numero di microspecchi su un chip. Un singolo pixel corrisponde a un singolo micro-specchio. Il file di immagine del modello pixelato da un computer viene proiettato attraverso DMD e focalizzato sulla superficie utilizzando un obiettivo. Per la micropatterning delle proteine, la luce laser focalizzata viene utilizzata per scindere spazzole polimeriche repellenti con l’aiuto di un fotoiniziatore. Successivamente, le regioni esposte sono riempite con proteine ECM. Questo metodo di ablazione senza maschera offre una grande flessibilità nella progettazione di nuovi modelli, in quanto non si basa sull’uso di una fotomaschera. Progettare e applicare un modello è molto semplice in quanto richiede solo diversi minuti utilizzando un freeware come Inkscape. Tuttavia, il numero di modelli e campioni prodotti in un breve lasso di tempo è un grosso inconveniente, in quanto questo metodo può essere utilizzato solo per modellare un singolo substrato ogni volta. Il modulo di fotopatterning utilizza una sorgente laser a stato solido vicino ai raggi UV che emette diversi milliwatt. Il raggio laser non schermato è pericoloso per gli occhi e la pelle. Anche la luce riflessa e diffusa e le radiazioni possono essere pericolose. La manipolazione deve essere accompagnata da un’istruzione di sicurezza da parte degli ufficiali laser. Il passaggio più critico del protocollo quando si utilizza un modulo di fotopatterning è quello di garantire che durante la micropatterning e l’ablazione il laser sia correttamente focalizzato sulla superficie. Una dose di illuminazione costante (intensità moltiplicata per il tempo) di luce UV durante la modellazione dipende da come il laser è focalizzato sulla superficie. Una debole intensità sulla superficie a causa della scarsa messa a fuoco può causare il fallimento del trasferimento di ECM sulla superficie dell’idrogel con conseguente assenza di cellule che si attaccano all’idrogel.
Negli esperimenti TFM, dopo l’imaging iniziale delle cellule aderenti e dei marcatori fiduciali, le cellule vengono rilasciate dall’idrogel PA mediante trattamento con tripsina per registrare il loro stato rilassato. Uno svantaggio nell’esecuzione di questo passaggio è la gestione del campione nella fase di microscopia. Senza una camera di perfusione, l’apertura del coperchio del piatto, l’aspirazione del mezzo, il risciacquo e il pipettaggio della soluzione di tripsina rappresentano una sfida per i principianti e gli utenti esperti. In effetti, queste procedure sono una delle principali fonti della deriva negli assi xyz , con conseguente perdita di posizione e messa a fuoco. Il nostro protocollo di illuminazione UV locale rende TFM una tecnica più accessibile per i principianti. Va notato che abbiamo utilizzato un modulo di fotopattering senza maschera basato su microscopia disponibile in commercio, ma in linea di principio potrebbe essere utilizzato qualsiasi sistema di illuminazione UV-A, eventualmente in combinazione con una maschera per proteggere le regioni dei substrati, dove le forze di trazione cellulare non dovrebbero essere registrate. Esporre le cellule con una dose significativa di luce visibile a bassa lunghezza d’onda (ad esempio, la luce viola che eccita l’emissione daPI) porterà ad un aumento dello stress ossidativo, che può causare fototossicità e morte cellulare. Pertanto, questa tecnica può essere applicata anche in un microscopio a epifluorescenza senza un modulo laser UV. Tuttavia, poiché l’intensità è molto più debole, sarà molto più facile realizzare TFM con il trattamento enzimatico in questo caso.
Con LUVI-TFM è possibile utilizzare lo stesso campione per diverse misurazioni a causa del distacco locale di singole cellule o piccoli gruppi di cellule. Tuttavia, si dovrebbe prestare attenzione alla selezione delle cellule da staccare, per evitare di registrare le forze dalle cellule vicine. Pertanto, per le misurazioni a cella singola in assenza di micropattern, le regioni affollate dovrebbero essere evitate; per le misurazioni su singole celle micropatternate, i modelli devono essere progettati in modo tale che la distanza tra le singole strutture sia almeno il doppio del diametro dell’area modellata. Raccomandiamo inoltre di non utilizzare cellule da modelli adiacenti in sequenza, ma piuttosto di campionarle da regioni distanti sul substrato. La nostra misurazione è ben condotta su un microscopio a epifluorescenza dotato di una funzione di controllo della messa a fuoco e di una lente 40 x aria NA = 0,9, dove la distanza di lavoro della lente è sufficientemente lunga e il rapido movimento da un pozzo all’altro è altamente sintonizzabile. Il distacco mirato di cellule per applicazioni TFM è efficace per misurare la forza cellulare di una singola cellula o di un intero cluster di piccole cellule (ad esempio, fino a 300 μm di diametro). Usando la nostra configurazione, abbiamo osservato l’arrotondamento e il distacco delle cellule per il trattamento UV di singole cellule (Figura 3A), mentre il distacco si è verificato raramente per i piccoli cluster cellulari. Ciò potrebbe portare a una sottostima delle forze di trazione cellulare. Per i cluster cellulari più grandi, si raccomanda il distacco enzimatico, poiché gli utenti dovrebbero utilizzare un obiettivo aereo 20x per visualizzare l’intero cluster ed è necessaria una funzione di controllo della messa a fuoco. Poiché la profondità di messa a fuoco dell’obiettivo pneumatico 20x è molto più lunga, la gestione non sarà critica come l’obiettivo di ingrandimento più elevato. L’utente deve assicurarsi che la messa a fuoco sia impostata correttamente per l’ablazione delle cellule, poiché la dose di illuminazione dipende dalla messa a fuoco laser sulla superficie. Mentre siamo consapevoli delle possibili limitazioni nell’uso di LUVI-TFM nei collettivi cellulari a causa di possibili interazioni meccaniche con cellule vicine non trattate, questo aspetto potrebbe effettivamente rivelarsi utile per studi sulla meccanica dell’estrusione cellulare mirata, ad esempio da monostrati epiteliali.
In conclusione, con il nostro approccio TFM combinato con il rilascio indotto dalla luce di cellule micropatternate, forniamo un protocollo robusto e ad alto rendimento per misurare le forze di adesione cellulare. La versatilità di questo metodo potrebbe essere ulteriormente sfruttata utilizzando la microscopia e la configurazione dell’imaging volte a migliorare la risoluzione e la sensibilità.
The authors have nothing to disclose.
Ringraziamo la signora Rebecca Alvarado per il supporto nella produzione video del protocollo e il signor Stephen Casale per le critiche costruttive sul manoscritto. Ringraziamo i colleghi del Dipartimento di Biofisica Cellulare, Max Planck Institute for Medical Research per le utili discussioni. Il sostegno finanziario della Max-Planck-Gesellschaft a E.A.C.-A. e la Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG SFB1129, Projektnummer 240245660, P15 a E.A.C.-A. e P4 a U.S.S.; DFG EXC 2082/1-390761711 a U.S.S.) è anche molto riconosciuto. J.B. ringrazia la Fondazione Carl Zeiss per il sostegno finanziario. E.A.C.-A., C.S. e U.S.S. riconoscono il finanziamento attraverso il Max Planck School Matter to Life sostenuto dal Ministero Federale Tedesco dell’Istruzione e della Ricerca (BMBF). C.S. è sostenuto dal Consiglio Europeo della Ricerca (Consolidator Grant PHOTOMECH, no.101001797).
3-(Trimethoxysilyl)propyl methacrylate | #440159 | Sigma Aldrich | |
Acetic acid | #33209 | Honeywell | |
Acrylamide 40 % | #1610140 | Bio-Rad | CAUTION : toxic, work under a fume hood |
AFM cantilever | #CP-CONT-BSG-A-G | NanoAndMore | 5 μm spherical tip |
AFM system | #NanoWizard3 | JPK | Coupled to optical microscope equipped with 40x air objective and GFP filter |
Ammonium persulfate | #A3678 | Sigma | |
Bis-acrylamide 2 % | #1610142 | Bio-Rad | CAUTION : toxic, work under a fume hood |
Camera sCMOS | #C11440-42U30 | Hamamatsu | |
Camera sCMOS | #ANDORZYLA4.2 | Oxford Instrument | |
CellRox | #C10422 | Thermo Fisher | |
Custom incubator chamber | EMBLEM | ||
Dental glue | #1300 100 | Picodent | |
DMEM | #41965 | Thermo Fisher | |
Epifluorescence microscope | #Eclipse Ti2E | Nikon | |
Epifluorescence microscope | #Axiovert200 | Zeiss | |
Ethanol | #9065.3 | Carl Roth | |
FBS South America | #S181T | Thermo Fisher | |
Fibrinogen | #F13191 | Invitrogen | Alexa488 conjugate |
Fibronectin | #F1141 | Sigma | |
Fluorescent beads 200 nm | #F8805 | Invitrogen | Carboxylated (365/415) |
Fluorescent beads 200 nm | #F8848 | Invitrogen | Carboxylated (505/515) |
Fluorescent beads 200 nm | #F8810 | Invitrogen | Carboxylated (580/605) |
Fluorescent beads 200 nm | #F8807 | Invitrogen | Carboxylated (660/680) |
Glass coverslip 15 mm round | #41001115 | Assistent | |
Glass coverslip 24 mm round | #41001124 | Assistent | |
Microscope Objective | #MRH08230 | Nikon | 20x air NA 0.45 |
Mouse Embryonic Fibroblasts | #CRL-2991 | ATCC | |
mPEG-SVA | #MPEG-SVA-5000 | Laysan Bio | |
N-Hydroxyethyl acrylamide | #697931 | Aldrich | |
Plasma cleaner | #100-E | TePla | |
PLPP gel | #PLPPgel | Alveole | |
Poly-L-lysine | #P4823 | Sigma Aldrich | |
Poly(L-lysine)-graft-poly(ethylene glycol) | #PLL(20-g[3.5]-PEG(2) | SuSoS | |
Sodium(meta) periodate | #S1878 | Sigma Aldrich | |
TEMED | #17919 | Thermo Scientific | |
UV Pattening module | #PRIMO | Alveole | |
UVO cleaner | #342-220 | Jelight |