Aquí presentamos un protocolo para el procedimiento optimizado de empaquetado de columna capilar FlashPack. La aplicación de un protocolo optimizado a una configuración común de bomba de presión de 100 bar permite un embalaje y una fabricación 10 veces más rápidos de columnas capilares largas y de ultra alto rendimiento.
La cromatografía líquida capilar de ultra alto rendimiento (UHPLC) es actualmente un método de elección para el paso de separación de muestras en proteómica basada en LC-MS. Sin embargo, las columnas capilares son mucho menos robustas en comparación con sus contratipos de flujo más alto. Debido a la fácil contaminación y bloqueo, a menudo necesitan reemplazo. Eso los convierte en una parte marcadamente costosa del costo total del análisis LC-MS. El embalaje interno de columnas capilares UHPLC ahorra mucho dinero y permite la personalización. Sin embargo, el procedimiento de embalaje estándar en la bomba de presión de 100 bar funciona bien solo para columnas de HPLC, pero es demasiado lento para los sorbentes UHPLC. Aquí proporcionamos una descripción de un protocolo FlashPack optimizado aplicado a la misma configuración de bomba de presión de 100 bares. El método se basa en el envasado de purín de concentración de sorbente ultra alta y está desarrollado para la fabricación interna de columnas capilares UHPLC de longitud ilimitada en un tiempo razonable.
La proteómica moderna se basa en la espectrometría de masas acoplada a cromatografía líquida con la cromatografía de nano flujo de ultra alto rendimiento (diámetro interno de la columna (ID)) de 50-150 μm que proporciona la mejor velocidad de análisis y sensibilidad1. Si bien hay numerosas columnas capilares UHPLC comerciales disponibles, su precio constituye una parte importante del costo de los consumibles, especialmente cuando se ejecutan múltiples proyectos diversos en el laboratorio y la contaminación de la columna específica del proyecto es un problema frecuente. Además, el empaquetado interno de columnas permite el uso de sorbentes personalizados específicos del experimento (como, por ejemplo, el sorbente polyCAT-A2)y las características de la columna que no están disponibles para comprar como una columna ya hecha.
Para hacer frente a eso, muchos laboratorios empacan columnas capilares internamente. Sin embargo, el procedimiento de empaquetado común con una bomba de presión de 100 bar (celda de inyección de presión)3 no es adecuado para el empaquetamiento de columna UHPLC debido a la alta contrapresión de sorbentes UHPLC de menos de 2 μm, lo que resulta en una reducción dramática de la tasa de empaquetamiento en comparación con los sorbentes HPLC de mayor tamaño. Mientras que las columnas UHPLC cortas todavía se pueden empaquetar muy lentamente, la fabricación de columnas UHPLC largas es físicamente imposible4.
El embalaje estándar de la columna capilar se realiza a presiones relativamente bajas, de hasta 100 bares, y con una concentración de lodo de sorbente muy baja. Por lo tanto, hay dos posibles direcciones para acelerar el proceso. Es posible aumentar la presión de embalaje5. Sin embargo, esto requiere un equipo especial y, prácticamente, la instalación de un nuevo método en el laboratorio. Otra forma es aumentar la concentración de purines sorbentes6. El embalaje de alta concentración de purines de sorbente se describe en combinación con una presión de embalaje ultra alta en una publicación anterior7. Sin embargo, a una presión de 100 bar, que se utiliza en la mayoría de las bombas de embalaje existentes, una mayor concentración de sorbente da como resultado una ralentización de la velocidad de envasado o un cese total del embalaje. Recientemente se demostró que el efecto se debía a la agrupación de sorbentes en la entrada de la columna, y se sugirió un truco simple de desestabilización de la cúpula sorbente martillando la entrada de la columna con una barra magnética dentro de un vial de sorbente4. El método resultante, denominado FlashPack, utiliza la misma configuración de empaquetado de bombas de presión de 100 bares. Al mismo tiempo, los cambios menores pero críticos en el procedimiento de embalaje permiten el envasado a partir de una concentración de purín de sorbente muy alta y la producción de columnas UHPLC muy largas (50 a 70 cm, y más) en menos de una hora, mientras que una columna corta se puede producir en minutos con la calidad de separación igual a las columnas comerciales de los mismos parámetros4. El enfoque FlashPack ya se utilizó con éxito en múltiples proyectos de proteómica para la preparación de columnas capilares de fase inversa (RP)8,9,10,11, 12,13,14 e interacción hidrófila (HILIC)2.
Aquí describimos en detalle, las modificaciones necesarias para la adaptación del enfoque FlashPack al procedimiento estándar de empaquetado de bombas a presión de 100 bar.
El embalaje interno de columnas capilares es muy popular en grandes laboratorios que trabajan en múltiples proyectos independientes. Sin embargo, un método de empaquetamiento común a partir de una suspensión sorbente de baja concentración tiene limitaciones importantes en la velocidad y es incapaz de producir columnas UHPLC largas.
FlashPack es una modificación del procedimiento de embalaje estándar que hace posible el envasado a partir de una concentración de sorbente muy alta. La base teórica del método radica en la desestabilización continua de la cúpula sorbente en la entrada de la columna durante toda la duración del embalaje. Esto último se logra técnicamente mediante la entrada de la columna que se golpea continuamente con una barra magnética. El método de desestabilización de la cúpula se desarrolla intencionalmente para tener la configuración de empaque completamente similar al proceso de empaque común, pero el truco de FlashPack radica en los detalles de la preparación de la suspensión de sorbente, el posicionamiento capilar y el uso de la barra magnética durante el proceso de empaque.
La suspensión de sorbente se prepara como una capa de sorbente de sedimentos en un gran volumen de disolvente. Es interesante que el embalaje a base de bombas de presión no requiere las mismas condiciones de embalaje para columna a columna. En FlashPack, nunca sabemos la concentración exacta de lodo de sorbente alrededor de la entrada de la columna. Es imposible medir y controlar con exactitud, ya que también cambia durante el proceso de embalaje. Sin embargo, las columnas finales siguen siendo muy reproducibles4 independientemente de cómo se logró el embalaje.
La base para el embalaje rápido radica en la eficiente desestabilización de la cúpula sorbente. Por esta razón, es importante controlar el sorbente que ingresa al capilar y mantener las condiciones óptimas de desestabilización de la cúpula durante toda la duración del embalaje. Hay varios problemas posibles que podrían impedir la entrega eficiente de sorbentes. Algunos ejemplos de estos son la resuspensión de la capa de sorbente por rotación rápida de la barra magnética, la desestabilización ineficiente de la cúpula debido a la posición capilar relativa incorrecta a la barra magnética o la rotación demasiado lenta de la barra magnética. Las cuestiones en sí mismas y la forma en que deben abordarse se examinan en detalle en la sección de protocolo.
Después de empaquetar la columna, el parámetro de columna principal para verificar es la contrapresión de columna. Los valores de presión enumerados en la Tabla 5 proporcionan un punto de referencia a lo que se espera para uno de los populares sorbentes de tamaño de perla sub 2 μm:ReproSil PUR C18 AQ (1,9 μm). Al mismo tiempo, la fritura o un emisor demasiado estrecho pueden agregar contrapresión adicional y uno debe monitorear constantemente para eso. Si el embalaje se realiza en un emisor tirado, aún sugerimos medir la contrapresión de columna esperada para el sorbente particular en uso empaquetando primero los capilares fritados, y luego para ver si la fritada autoensamblada agrega demasiado. Para cualquier problema de alta presión, utilice las directrices proporcionadas en la Tabla 1 para identificar el problema.
En nuestra experiencia, una columna empaquetada sin decoloraciones, huecos y con la contrapresión adecuada funciona en el 100% de los casos y da una calidad de separación cercana a lo que se puede esperar de la longitud de la columna y las características del sorbente. No se garantiza que una columna con decoloraciones funcione correctamente, pero aún puede dar resultados satisfactorios.
La mayoría de las veces, si hay algún problema con la calidad de la separación, no provienen de la columna en sí, sino de otras partes del sistema de separación, a saber, bombas, disolventes o conexiones. Especialmente potencialmente dañina es cualquier conexión posterior a la columna. La mala conexión con un volumen muerto entre el emisor y la columna fritada conduce a un gran ensanchamiento y cola de picos debido a los caudales muy bajos en la cromatografía capilar.
Un problema más importante específico del enfoque FlashPack es que utiliza muchos sorbentes caros en un vial de lodo de sorbente que funciona. Recuerde que la suspensión de sorbente en FlashPack está diseñada para uso múltiple. Cuida el sorbente. Evite la agitación innecesaria de la barra magnética para reducir la molienda del sorbente: recuerde detener la rotación tan pronto como termine el embalaje. Y no deje el vial de sorbente abierto en la bomba de presión para evitar el secado del sorbente. Aunque el sorbente todavía se puede usar después de eso, lleva tiempo rehacer la suspensión del sorbente.
El método funciona igualmente bien tanto para los capilares fritados como para los capilares emisores tirados. El principio FlashPack aumenta la velocidad de empaquetamiento para los ID capilares de 20 a 250 μm (no se probaron los más pequeños y los más grandes). También es aplicable a todos los sorbentes, tanto total como superficialmente porosos, que podríamos probar (lo que refleja que la formación de cúpula sorbente en alta concentración de purines de sorbente no se limita específicamente a los sorbentes RP). Además, los parámetros del disolvente afectan claramente al embalaje según sus características físicas y químicas. Por ejemplo, una acetona menos viscosa da una tasa de empaquetamiento aún mayor que el metanol a la misma presión de empaque. Sin embargo, también es menos polar que el metanol y reduce las partículas sorbentes que se adhieren entre sí. El efecto por sí solo evita la formación de cúpula sorbente al comienzo del empaque cuando el caudal aún es alto. Sin embargo, la reducción en la interacción de partículas sorbentes también conduce a una formación de fritas autoensambladas menos confiable y un bloqueo más frecuente del extremo tirado durante el embalaje. Por lo tanto, mientras que la acetona es mejor para el empaquetamiento de capilares fritados, es menos adecuada para capilares emisores tirados, con el metanol como disolvente de lodo siendo más lento pero adecuado para ambos tipos de terminación. El empaquetamiento de hexano o diclorometano (DCM) son casos extremos de cambio a acetona de metanol: son aún menos polares, por lo que evitan la formación de cúpula sorbente por completo, sin embargo, no son aptos para el empaque del emisor tirado en absoluto. Además, se observó que la polaridad DCM extremadamente baja conduce a partículas sorbentes que se adhieren a la pared capilar interna y hacen una capa gruesa sobre ella. El espesor de la capa crece gradualmente y se forman bloques locales aleatorios, lo que resulta en la columna empaquetada en varias partes separadas por regiones sin sorbente. Tal efecto se observó para el sorbente Aeris del péptido C18.
Otro problema observado fue que el sorbente YMC Triart C18 no se suspendió en metanol correctamente, sino que formó algún tipo de escamas. Sin embargo, eso no impide que se empaquete con el FlashPack y dé una eficiencia de separación muy decente (datos no publicados). Por lo tanto, aunque no era óptimo para algunos casos, el metanol era el disolvente más universal para trabajar para todos los sorbentes y columnas probados. Es necesario mencionar que aún no analizamos cómo los diferentes solventes de lodo afectan la eficiencia de separación de columnas. Al mismo tiempo, la eficiencia de las columnas empaquetadas a partir de metanol ya es completamente igual a las columnas comerciales para los mismos sorbentes4.
FlashPack no es el único enfoque existente para mejorar la tasa de empaquetado de las columnas UHPLC. El envasado rápido a partir de una alta concentración de purines de sorbente también es posible con el uso de envases de presión ultra alta7. La ventaja de FlashPack es que es mucho más simple, ya que no requiere bombas especiales de presión ultra alta y bombas de presión para la entrega de sorbentes y conexiones capilares. Al mismo tiempo, se demostró que las columnas empaquetadas a presiones extremas pueden tener una eficiencia de separación superior a las columnas empaquetadas a menor presión17. Y aunque FlashPack produce columnas idénticas a las comerciales utilizadas en la comparación4,para las cuales no conocemos el método de empaquetado, aún no se ha probado cómo las columnas FlashPack se comparan con las columnas empaquetadas a ultra alta presión.
En resumen, el método FlashPack descrito se puede adaptar fácilmente al protocolo de embalaje existente en el laboratorio con algunos ajustes realizados en el protocolo, mientras que la configuración permanece completamente igual. Acelera el embalaje de la columna capilar HPLC a minutos de tiempo y permite la producción de columnas capilares UHP largas, lo que es claramente imposible con el procedimiento de embalaje estándar. La economía general en tiempo y dinero para el laboratorio mediante la aplicación del enfoque FlashPack se puede contar en decenas de miles de euros por año. Además, la capacidad de producir columnas capilares UHP localmente abre las posibilidades de personalización de experimentos imposibles con los productos comerciales disponibles.
The authors have nothing to disclose.
El trabajo fue apoyado por la subvención de RSF 20-14-00121. Los autores agradecen a P. V. Shliaha (Memorial Sloan Kettering Cancer Center) por sus fructíferas discusiones.
Acetonitrile with 0.1% (v/v) Formic acid | Merck | 1.59002 | |
centrifuge tube 1.5 mL | Eppendorf | ||
Ceramic Scoring Wafer | Restek | 20116 | any ceramic wafer is suitable for capillary polishing |
Diamond-chip bladed scribe | NewObjective | Diamond-chip bladed scribe | recommended for capillary cutting |
fused silica capillary 100 mm ID 375 mm OD | CM Scientific | TSP100375 | |
GELoader tips | Eppendorf | 30001222 | |
HPLC system | ThermoScientific | Ultimate3000 RSLCnano | |
laser puller | Sutter | P2000/F | |
magnet bar 2×5 mm | Merck | Z283819 | |
MeOH | Merck | 1.06018 | |
microspatula | Merck | Z193216 | |
PEEK ferrule 360 mm | VICI | JR-C360NFPK | use to connect the column to UPLC union |
pipette tip, 1000 uL | Merck | Z740095 | |
pipette, 1000 uL | Gilson | Pipetman L P1000L | |
pressure bomb | NextAdvance | PC-77 MAG | |
regulator | GCE | Jetcontrol 600 200/103 | |
Reprosil Pur C18 AQ 120 1.9 mm | Dr. Maisch | r13.aq.0001 | |
Screw cap tubes without caps, conical bottom, self-standing, 0.5 mL | Merck | AXYST050SS | |
Screw cap tubes without caps, conical bottom, self-standing, 1.5 mL | Merck | AXYST150SS | |
Screw caps with O-rings | Merck | AXYSCOC | |
sonication bath | Elma | Elmasonic S30 H | |
union HPLC | VICI | JR-C360RU1PK6 | HPLC connection from 1/16 OD HPLC capillary to 360 um capillary column |
union UPLC | VICI | JR-C360RU1FS6 | UPLC connection from 1/16 OD HPLC capillary to 360 um capillary column |
vortex | BioSan | V-1plus | |
Water with 0.1% (v/v) Formic acid | Merck | 1.59013 |