Aqui, apresentamos um protocolo para edição de genes em células T humanas primárias usando a tecnologia CRISPR Cas para modificar células CAR-T.
Terapias celulares adotivas usando células T do receptor de antígeno quimérico (células CAR-T) demonstraram notável eficácia clínica em pacientes com malignidades hematológicas e estão atualmente sendo investigadas para vários tumores sólidos. As células CAR-T são geradas removendo células T do sangue de um paciente e projetando-as para expressar um receptor imunológico sintético que redireciona as células T para reconhecer e eliminar células tumorais alvo. A edição de genes das células CAR-T tem o potencial de melhorar a segurança das terapias atuais de células CAR-T e aumentar ainda mais a eficácia das células CAR-T. Aqui, descrevemos métodos para ativação, expansão e caracterização de células CAR-T direcionadas por CRISPR. Isso compreende a transdução do vetor lentiviral CAR e o uso de RNA guia único (sgRNA) e Cas9 endonuclease para atingir genes de interesse em células T. Os métodos descritos neste protocolo podem ser universalmente aplicados a outras construções car e genes-alvo além dos utilizados neste estudo. Além disso, este protocolo discute estratégias para o design de gRNA, seleção de gRNA de chumbo e validação de genes-alvo para alcançar de forma reproduibivelmente alta eficiência, engenharia multiplex CRISPR-Cas9 de células T humanas de grau clínico.
A terapia celular quimérico de antígeno (CAR)-T revolucionou o campo das terapias celulares adotivas e da imunoterapia contra o câncer. As células CAR-T são células T projetadas expressando um receptor imunológico sintético que combina um fragmento de anticorpo de cadeia única específico de antígeno com domínios de sinalização derivados da cadeia TCRzeta e domínios costimulatórios necessários e suficientes para ativação e co-estimulação de células T1,2,3,4 . A fabricação de células CAR-T começa extraindo as próprias células T do paciente, seguida pela transdução viral ex vivo do módulo CAR e expansão do produto celular CAR-T com contas magnéticas que funcionam como antígenos artificiais apresentando células5. As células CAR-T expandidas são reinfundidas no paciente onde podem engrafar, eliminar células tumorais alvo e até persistir por vários anos após a infusão6,7,8. Embora a terapia celular CAR-T tenha resultado em taxas notáveis de resposta em malignidades de células B, o sucesso clínico para tumores sólidos tem sido desafiado por múltiplos fatores, incluindo a má infiltração de células T9,um microambiente tumoral imunossupressor10,cobertura e especificidade de antígenos, e disfunção celular CAR-T11,12 . Outra limitação da terapia celular CAR-T atual inclui o uso de células T autólogas. Após várias rodadas de quimioterapia e alta carga tumoral, as células CAR-T podem ser de má qualidade em comparação com produtos CAR-T aogeneicos de doadores saudáveis, além do tempo e despesas associados à fabricação de células CAR-T autólogas. A edição de genes do produto car-t por CRISPR/Cas9 representa uma nova estratégia para superar as limitações atuais das células CAR-T13,14,15,16,17.
CRISPR/Cas9 é um sistema de dois componentes que pode ser usado para edição de genomas direcionados em células de mamíferos18,19. O Endonuclease Cas9 associado ao CRISPR pode induzir quebras de dois fios específicas do local guiadas por pequenos RNAs através do emparelhamento de base com a sequência de DNAalvo 20. Na ausência de um modelo de reparo, as quebras de dois fios são reparadas pela via de junção final nonhomologous propensa a erros (NHEJ), resultando em mutações de mudança de quadro ou codons de parada prematura através de mutações de inserção e exclusão (INDELs)19,20,21. Eficiência, facilidade de uso, custo-efetividade e a capacidade de edição de genoma multiplex fazem do CRISPR/Cas9 uma ferramenta poderosa para aumentar a eficácia e a segurança das células CAR-T autólogas e aogenéticas. Essa abordagem também pode ser usada para editar células T direcionadas tcr substituindo a construção do CAR por um TCR. Além disso, células CAR-T aogenéticas que têm potencial limitado para causar enxerto versus doença hospedeira também podem ser geradas pela edição de genes do lócus TCR, b2m e HLA.
Neste protocolo, mostramos como a engenharia CRISPR de células T pode ser combinada com a entrega mediada por vetores virais do CAR-Transgene para gerar produtos celulares CAR-T editados por genoma com maior eficácia e segurança. Um diagrama esquemático de todo o processo é mostrado na Figura 1. Usando essa abordagem, demonstramos um nocaute genético de alta eficiência nas células CAR-T humanas primárias. A Figura 2A descreve em detalhes a linha do tempo de cada etapa para edição e fabricação de células T. Estratégias para o design de RNA guia e validação de nocaute também são discutidas para aplicar essa abordagem a vários genes-alvo.
Aqui descrevemos abordagens para editar células CAR-T de genes usando a tecnologia CRISPR Cas9 e fabricar produtos para testar melhor a função e eficácia. O protocolo acima foi otimizado para a realização da edição de genes CRIPSR em células T humanas primárias combinadas com células T de engenharia com receptores de antígeno quimérico. Este protocolo permite alta eficiência de nocaute com variabilidade mínima de doador para doador. A modificação usando CRISPR pode melhorar tanto a eficácia quanto a seg…
The authors have nothing to disclose.
Reconhecemos o Núcleo de Imunologia Humana por fornecer células T doadoras normais e o Núcleo de Citometria de Fluxo da Universidade da Pensilvânia.
4D-Nucleofactor Core Unit | Lonza | AAF-1002B | |
4D-Nucleofactor X-Unit | Lonza | AAF-1002X | |
Accuprime Pfx Supermix | ThermoFisher | 12344040 | |
Beckman Optima XPN ultracentrifuge | Beckman Coulter | ||
Brilliant Violet 605 anti-human CD3 Antibody | Biolegend | 317322 | Clone OKT3 |
BV711 Anti-human PD1 | Biolegend | Clone EH12.2H7 | |
Cas9-Electroporation enhancers | IDT | 1075915 | |
CD3/CD28 Dynabeads | ThermoFisher | 40203D | |
CD4+ T cell isolation Kit | StemCell technologies | 15062 | |
CD8+ T cell isolation Kit | StemCell technologies | 15063 | |
Corning 0.45 micron vacuum filter/bottle | Corning | 430768 | |
Corning T150 cell culture flask | Millipore Sigma | CLS430825 | |
DMSO | Millipore Sigma | D2650 | |
DNAeasy Blood and Tissue Kit | Qiagen | 69504 | |
DynaMag Magnet | ThermoFisher | 12321D | |
Glutamax supplement | ThermoFisher | 35050061 | |
HEK293T cells | ATCC | CRL-3216 | |
HEPES (1 M) | ThermoFisher | 15630080 | |
huIL-15 | PeproTech | 200-15 | |
huIL-7 | PeproTech | 200-07 | |
Lipofectamine 2000 | ThermoFisher | 11668019 | |
Nucleospin Gel and PCR cleanup | Takara | 740609.25 | |
Opti-MEM | ThermoFisher | 31985062 | |
P3 Primary cell 4D-nucleofactor X Kit L | Lonza | V4XP-3024 | |
Penicilin-Streptomycin-Glutamine | ThermoFisher | 10378016 | |
pTRPE expression Plasmid | in house | ||
Rabbit Anti-Mouse FMC63 scFv Monoclonal Antibody, (R19M), PE | CytoArt | 200105 | |
RPMI1640 | ThermoFisher | 12633012 | |
sgRNA | IDT | ||
Spy Fi Cas9 | Aldevron | 9214 | |
Ultracentrifuge tubes | Beckman Coulter | 326823 | |
Viral packaging mix | in house | ||
X-Vivo-15 Media | Lonza | BE02-060F |