Un ensayo de citometría de flujo basado en ADN/Ki67 para el análisis del ciclo celular de células T CD8 específicas de antígeno en ratones vacunados

Los ratones fueron alojados en Plaisant Animal Facility, y el trabajo se realizó bajo la autorización del Ministerio de Salud italiano número 1065/2015-PR. El protocolo siguió las directrices de cuidado de los animales de acuerdo con las leyes y políticas nacionales e internacionales (Directiva ue 2010/63/UE; Decreto Legislativo italiano 26/2014). 1. Preparación del medio y solución de tinción Prepare el medio completo: medio del Roswell Park Memorial Institute (RPMI) con 2 mM de glutamina, 100 U/mL de penicilina/estreptomicina, 50 μM de beta-mercaptoetanol y 10% de volumen/volumen (v/v) de suero fetal bovino (FBS) Prepare el tampón de tinción: Solución salina tamponada con fosfato sin Ca2+/ Mg2 + (PBS) con 1% de peso / volumen (p / v) albúmina sérica bovina (BSA) y 2 mM de sal disódica de ácido etilendiaminotetraacético (EDTA) 2. Tratamiento con ratones Ratones Balb/c hembra de 7-8 semanas de edad mediante inyección intramuscular (i.m.) en los cuádriceps del virus de la inmunodeficiencia humana (VIH)-1-gag-expressing-chimpanzee adenoviral vector (ChAd3-gag) con una dosis de 107 partículas virales. A los 1-4 meses después del cebado, aumente una vez a los ratones mediante i.m. inyección del virus de Ankara modificado que expresa la vaccinia que expresa la mordaza del VIH-1 (MVA-gag) con una dosis de 106 unidades formadoras de placa. En el día 3 después del impulso, sacrifique a los ratones estimulados por dislocación cervical y analícelos en paralelo con los ratones no tratados. Cosecha los LNs drenando los cuádriceps (ilíaco, poplíteo e inguinal) y los bazos de ratones potenciados y no tratados. Además, recoja el BM de las dos patas traseras de ratones no tratados y use este BM para la configuración del citómetro de flujo y como control positivo para el análisis del ciclo celular(Figura 2).NOTA: Genere vectores ChAd3-gag y MVA-gag como se describió anteriormente12,15,16,17. 3. Aislamiento de células LN, bazo y BM drenantes Aislamiento del bazo y las células LN Coloque 5 ml de medio completo en cada uno de los dos tubos de 15 ml y manténgalos en hielo, listos para que se recolecten los órganos. Sacrificar un ratón adulto por luxación cervical. Coloque el ratón sobre su espalda y esterilice la superficie de la piel con etanol al 70% v/v. Para recolectar LN inguinales, haga una incisión longitudinal de ~ 1 cm en el abdomen con tijeras y estire la incisión con las pinzas. Visualice las LN inguinales en la superficie interna de la piel y recójalas con las pinzas. Coloque las LN inguinales en uno de los dos tubos de 15 ml preparados en el paso 3.1.1. Para recoger el bazo, haga una incisión peritoneal con tijeras y retire el bazo. Después de cortar el tejido conectivo circundante, coloque el bazo en el segundo tubo de 15 ml preparado en el paso 3.1.1. Para recolectar LN ilíacas, mueva los intestinos a un lado y visualice las LN ilíacas cerca de la vena cava inferior, y luego recójalas usando los fórceps. Coloque las LN ilíacas en el mismo tubo que contiene las LN inguinales.NOTA: Para obtener suficientes células LN para la tinción (ver sección 4), a menudo es necesario agrupar LN poplíteas, inguinales e ilíacas de un ratón. Todos estos LN están drenando los cuádriceps (el sitio de la vacunación i.m. Este protocolo utiliza solo un tubo de 15 ml de LN agrupados. Para recolectar LN poplíteas, agarre la piel de las patas traseras y tire suavemente de ella hacia abajo para descubrir los músculos. Luego, inserte los fórceps entre los músculos debajo de la articulación de la rodilla y recoja los LN poplíteos. Coloque los LN poplíteos en el mismo tubo que contiene LN inguinales e ilíacos.NOTA: Véase la nota posterior al punto 3.1.7. Coloque el bazo en un colador de células de 70 μm dentro de un plato de cultivo de 60 mm lleno de 5 ml de medio completo. Usando un émbolo de jeringa de 5 ml, triture suavemente el órgano hasta su desagregación completa. Retire el colador y transfiera la suspensión celular a un tubo limpio de 15 ml. Agregue 5 ml de medio completo al plato de cultivo y lave cuidadosamente el plato y el colador para asegurarse de que se hayan recuperado todas las células. Piscina con el resto de la suspensión de células del bazo en el tubo de 15 ml. Para las LN inguinales, ilíacas y poplíteas agrupadas, prepare una suspensión de una sola célula siguiendo un procedimiento similar al utilizado en los pasos 3.1.9 a 3.1.11 para el bazo. Células centrífugas a 400 × g durante 10 min a 4 °C. Deseche el sobrenadante y vuelva a suspender los gránulos celulares en PBS. Cuente las células con una cámara de Neubauer utilizando un tampón de lisis de glóbulos rojos y 0.04% v / v de azul de tripano en PBS. Aislamiento de células BM Coloque 5 ml de medio completo en un tubo de 15 ml y manténgalo en hielo, listo para la recolección de patas traseras. Sacrificar un ratón adulto por luxación cervical. Esterilizar la superficie de la piel con etanol al 70% v/v. Haga una incisión transversal de ~ 1 cm en la piel ventral con tijeras, agarre firmemente la piel a ambos lados del corte y tire suavemente hacia abajo para descubrir los músculos de las patas traseras. Para eliminar la piel de la parte posterior de las patas traseras, manteniendo al ratón en posición supina, coloque la abrazadera debajo de la rodilla y tire hacia arriba para exponer los músculos. Corte los huesos en las dos extremidades de una pierna trasera: la articulación pélvica/ cadera y el tobillo. Transfiera ambas patas traseras al tubo de 15 ml preparado en el paso 3.2.1. Mantenga el tubo sobre hielo. Tome las patas traseras del tubo de 15 ml y transfiéralas al papel de seda. Corte las patas traseras justo debajo de la articulación de la rodilla para eliminar la tibia. Diseccionar el fémur y la tibia de los músculos circundantes, eliminar el exceso de tejido con tijeras y mojar el papel de seda. Corte los extremos óseos con tijeras para exponer el eje interior de la médula. Inserte la tibia y el fémur en el tubo de extracción BM (ver preparación en 3.2.9.1-3.2.9.218), con el extremo más ancho en la parte inferior. Corte una punta de pipeta de 200 μL en la línea justo encima del final de la punta y en la línea de 100 μL. Coloque la parte media en la sección superior más grande de la punta y colóquela en un tubo de microfuge de 1,5 ml. Gire el tubo de extracción BM a 800 × g durante 1 min. Deseche el hueso y resuspenda vigorosamente el pellet en 1 ml de medio completo para eliminar cualquier racimo. Filtre la suspensión celular a través de un filtro de 70 μm colocado en la parte superior de un tubo de 15 ml. Lave el tubo de extracción BM dos veces con 1 ml de medio completo cada vez. Filtrar a través de un filtro de 70 μm, y agrupar el volumen con el resto de la suspensión celular obtenida en el paso 3.2.11.NOTA: Un solo tubo de 15 ml contendrá células de ambas patas traseras de un ratón. Células centrífugas a 400 × g durante 10 min a 4 °C. Deseche el sobrenadante y vuelva a suspender el pellet celular en PBS. Cuente las células con una cámara de Neubauer utilizando un tampón de lisis de glóbulos rojos y 0.04% v / v de azul de tripano en PBS. 4. Tinción de células del bazo, LN y BM Divida las muestras de células que se teñirán en 3 subgrupos: muestras de células para compensación,incluidas las células BM de ratones no tratados que se tiñen solo con Hoechst 33342 (en adelante, Hoechst) y células de bazo de ratones no tratados que se utilizarán para preparar una mezcla de células muertas / vivas para la compensación de colorantes de células muertas; control positivo para el análisis del ciclo celular,que consiste en una muestra de BM de ratones no tratados; y muestras experimentales que contienen muestras de bazo y LN de ratones no tratados y vacunados.NOTA: Asegúrese de que haya suficientes células del bazo y LN para el análisis de un número suficiente de células T CD8 específicas de gag. A menudo es necesario utilizar células del bazo agrupadas y células LN agrupadas de 3 ratones vacunados y teñir dos o más muestras idénticas de células agrupadas, cada una de las cuales contiene 3 × 106 células. Combine muestras idénticas en el paso de tinción de Hoechst. Del mismo modo, tiñe las células del bazo agrupadas y las células LN de 3 ratones no tratados, y fusiona muestras idénticas al final. Apartar una muestra no teñida de células del bazo de un ratón no tratado para utilizarla para la configuración del instrumento y la compensación. Prepare la mezcla de células muertas / vivas para la compensación de colorantes de células muertas (esta mezcla de células se teñirá solo con el tinte de células muertas). Calentar un baño de agua a 65 °C. Tome una alícuota de células del bazo (~ 3 × 106). Transfiera la suspensión celular a un tubo de microfuge, colóquela en el baño de agua a 65 ° C durante 5 minutos y luego colóquela inmediatamente en hielo durante 10 minutos. Mezcle las células muertas por calor con células vivas del bazo (~ 3 × 106) en una proporción de 1: 1, y transfiera la mitad de la mezcla a una placa inferior de 96 bien redonda (~ 3 × 106 células / pozo para el control de tinción de células muertas). Tinción de células muertas de muestras experimentales, control positivo para el análisis del ciclo celular y mezcla de células muertas / vivas Transfiera el bazo, LN, células BM (3 × 106 células/pozo) y la mezcla de células muertas/vivas (sección 4.2) a una placa de fondo redondo de 96 pocillos, de acuerdo con el esquema de tinción (paso 4.1), y centrífuga a 400 × g durante 3 min a 4 °C. Resuspenda cada gránulo celular en 50 μL de colorante de células muertas diluido en PBS, y resuspenda mediante pipeteo hacia arriba y hacia abajo 3 veces inmediatamente. Incubar durante 30 min a 4 °C, protegido de la luz. Lave las células 2 veces con tampón de tinción; la primera vez con 200 μL y la segunda vez con 250 μL. Para cada centrifugadora de lavado, la placa a 400 × g durante 3 min a 4 °C. Deseche el sobrenadante y vuelva a suspender el gránulo celular en 20 μL de PBS. Tinción celular de membrana con complejos principales de histocompatibilidad (MHC)-péptidos multímeros y mAbs. Teniendo en cuenta los volúmenes necesarios de acuerdo con el esquema de tinción (Configuración del citómetro de flujo, Tabla 1),prepare los siguientes reactivos: Diluir mAb 2.4G2 en el tampón de tinción de acuerdo con la dilución apropiada (ver Tabla de Materiales); para cada muestra a teñir, utilizar 10 μL de esta dilución.NOTA: 2.4G2 mAb bloquea la unión no específica de antígenos de las inmunoglobulinas a los receptores FcγIII y FcγII. Diluir el tetrámero marcado con aloficocianina (TEtr-gag) de Aloficocianina (APC) H-2k(d) en el tampón de tinción para obtener la dilución adecuada (ver Tabla de Materiales); para cada muestra a teñir, utilizar 20 μL de esta dilución. Preparar la mezcla de anticuerpos diluyendo mAbs en el tampón de tinción de acuerdo con la dilución apropiada (ver Tabla de Materiales)que se haya determinado previamente en experimentos de titulación; para cada muestra que se va a teñir, utilice 20 μL de esta mezcla de anticuerpos.NOTA: Aquí, se utilizaron proteína de clorofila de peridinina anti-CD3e (PerCP-Cy5.5) (clon 145-2C11), ultravioleta brillante anti-CD8a (BUV805) (clon 53-6.7) y cianina de ficoeritrina anti-CD62L (PECy7) (clon MEL-14). Añadir 10 μL de los 2,4G2 mAb previamente diluidos (paso 4.4.1.1) e incubar durante 10 min a 4 °C, protegidos de la luz. Añadir 20 μL del APC tetr-gag previamente diluido (paso 4.4.1.2) y 10 μL de pentamero de ficoeritrina (PE) AMQMLKETI H-2k(d) (pent-gag). Incubar durante 15 min a 4 °C, protegido de la luz. Añadir 20 μL de la mezcla de anticuerpos preparada previamente (paso 4.4.1.3) e incubar 15 min a 4 °C, protegido de la luz.NOTA: Por lo tanto, el volumen final es de 80 μL por pozo (paso 4.3.5, pasos 4.4.2 a 4.4.4). Lavar las células con 200 μL de tampón de tinción. Centrifugar a 400 × g durante 5 min a 4 °C. Resuspenda el pellet celular en 250 μL de tampón de tinción y transfiera la suspensión celular a tubos de 5 ml. Añadir 1 ml de tampón de tinción al tubo y centrifugar a 400 × g durante 5 min a 4 °C. Tomar la alícuota de células BM (3 × 106 células) (ver lista de muestras celulares, sección 4.1) que se utilizará para compensar el canal de Hoechst (Hoechst 33342 se excita con un láser ultravioleta (ajustes del citómetro de flujo (Tabla 2)), y transferir la suspensión celular a un tubo de 5 ml. Añadir 1 ml de tampón de tinción al tubo y centrifugar 400 × g durante 5 min a 4 °C. 5. Fijación/permeabilización Prepare un tampón de fijación / permeabilización fresco diluyendo 1 parte del concentrado de fijación / permeabilización con 3 partes de diluyente de fijación / permeabilización, de acuerdo con las instrucciones del fabricante. Deseche el sobrenadante y el vórtice de pulso de las muestras para desagregar completamente el pellet. Añadir 1 ml del tampón de fijación/permeabilización recién preparado a cada tubo, incluido un tubo con células del bazo no teñidas (3 x 106, ver lista de muestras celulares, sección 4.1) y vórtice. Incubar durante 16 h a 4 °C.NOTA: El protocolo se puede pausar aquí. 6. Tinción intracelular Tinción ki67 Prepare el tampón de permeabilización fresco 1x diluyendo el tampón de permeabilización 10x con agua destilada, de acuerdo con las instrucciones del fabricante. Antes de su uso, el tampón de permeabilización 1x debe filtrarse a través de un filtro de 0,45 μm para eliminar los agregados. Diluir mAb Ki67 isotiocianato de fluoresceína (FITC) (clon SolA15) en tampón de permeabilización 1x (ver Tabla de Materiales),según lo determinado previamente en experimentos de titulación (volumen final de 100 μL por muestra). Agregue 3 ml de tampón de permeabilización 1x a cada tubo y centrífuga a 400 × g durante 5 minutos a temperatura ambiente (RT). Deseche el sobrenadante y repita el paso 6.1.3. Deseche el sobrenadante y vuelva a suspender el pellet celular en 100 μL de mAb Ki67 FITC previamente diluido (paso 6.1.2). Incubar durante 30 min en RT, protegido de la luz. Lavar las células 2 veces con 4 ml de tampón de permeabilización 1x. Para cada centrífuga de lavado a 400 × g durante 5 min en RT. Resuspendir el pellet celular en PBS considerando los siguientes volúmenes: 350 μL de PBS para que las muestras se adquieran directamente en el citómetro de flujo; 250 μL de PBS para las muestras que se incubarán con Hoechst poco antes de la citometría de flujo (sección 6.2). Tinción de ADN Añadir 250 μL de 4 μg/mL hoechst en PBS a cada muestra (la concentración final de Hoechst es de 2 μg/mL).NOTA: En caso de que se prepararan dos o más muestras idénticas de 250 μL en PBS, combínelas en este paso y agregue un volumen igual de 4 μg/ml de solución de Hoechst en PBS (la concentración final de Hoechst es de 2 μg/mL). El número de células influye en gran medida en el paso de tinción del ADN. Utilice el mismo número de celda en cada muestra. Tenga en cuenta que incluso un número de células ligeramente reducido (por ejemplo, debido a la pérdida de células en los pasos de lavado anteriores) da como resultado una mayor unión de Hoechst al ADN y una mayor intensidad de Hoechst. Incubar durante 15 min en RT, protegido de la luz. Centrifugar las muestras a 400 × g durante 5 min a RT. Resuspend el pellet celular en 350 μL de PBS. 7. Preparación de muestras de cuentas de compensación Preparar 5 μL del anticuerpo diluyendo mAb en el tampón de tinción adecuadamente.NOTA: Para cada mAb conjugado con fluorocromo utilizado en el experimento, prepare su correspondiente muestra de perla de compensación. Vortex Negative Control y Anti-Rat/Hamster Ig,κ Comp Beads antes de su uso. Para cada muestra, introduzca una gota (~20 μL) de CompBeads de Control Negativo y una gota de Anti-Rat/Hamster Ig,k CompBeads. Añadir 5 μL del anticuerpo prediluido (paso 7.1) al tubo y canalizar hacia arriba y hacia abajo. Incubar durante 15 min a 4 °C, protegido de la luz. Lavar las muestras con 2 ml de tampón de tinción. Centrifugar a 400 × g durante 5 min a 4 °C. Deseche el sobrenadante y vuelva a suspender el pellet agregando 500 μL de PBS a cada tubo y vórtice. 8. Configuración del instrumento y la compensación y adquisición experimental de muestras en el citómetro de flujo NOTA: Consulte la configuración del citómetro de flujo (Tabla 2) para la configuración del citómetro. Instrumento general y configuración de compensación Abra el software para la adquisición de muestras (consulte Tabla de materiales)y cree un nuevo experimento haciendo clic en Nuevo experimento en la sección de la cinta de opciones del espacio de trabajo y seleccionando Nuevo experimento en blanco. Haga doble clic en el experimento creado para abrirlo. En la ventana Configuración del citómetro, haga clic en Parámetros y seleccione todos los canales (por ejemplo, PE, APC, etc.) utilizados en el panel de tinción, incluidos los parámetros de dispersión directa (FSC) y dispersión lateral (SSC). Seleccione la escala lineal como parámetro hoechst desmarcando la escala logarítmica y compruebe el ancho (W) del pulso de voltaje para FCS, SSC y Hoechst.NOTA: Todos los parámetros se muestran de forma predeterminada en escala logarítmica (log), excepto FSC y SSC que están en escala lineal. Todos los parámetros son analizados por el Área (A) y la Altura (H) del pulso de voltaje. En la hoja de cálculo global,cree un diagrama de puntos con FSC-A en el eje x y SSC-A en el eje y. Ejecute el ejemplo de bazo sin manchas haciendo clic en Adquirir datos en el Panel de adquisición. Establezca la configuración FSC y SSC adecuada para visualizar las celdas modificando los valores de voltaje en la sección Parámetros, y cree una puerta para seleccionar todas las celdas que se muestran en el diagrama de puntos FSC-A/SSC-A haciendo clic en Puerta poligonal en la barra de herramientas del espacio de trabajo de la Hoja de cálculoglobal . Muestre las celdas cerradas en histogramas con cada parámetro de fluorescencia en el eje x. Ejecute muestras de bazo sin teñir y completamente teñidas para ajustar el detector de fluorescencia (PMT) para tener una separación clara entre las señales negativas y positivas de las células teñidas para cada parámetro de fluorescencia. Para realizar la configuración de compensación, haga clic en Experimentar en la cinta del espacio de trabajo y, en la sección Configuración de compensación, seleccione Crear controles de compensación. Desmarque Incluir tubo/pozo de control sin manchar y haga clic en Aceptar.NOTA: Esta operación dará como resultado la creación de un espécimen denominado Controles de compensación y una hoja de cálculo normal que contiene varias hojas correspondientes a cada parámetro seleccionado. Ejecutar una muestra de cuentas de compensación (ver sección 7); establezca la configuración FSC y SSC adecuada para visualizar las perlas modificando los valores de voltaje y el umbral de adquisición de 5.000 en los parámetros FSC en la ventana Citómetro. Ajuste la puerta P1 en la población de cuentas y verifique que los picos positivos y negativos sean visibles en el eje x. Repita esta operación para cada muestra de cuentas de compensación y, finalmente, registre cada archivo de muestra haciendo clic en Registrar datos en el Panel de adquisición (registre al menos 5.000 eventos para cada muestra). Para cada muestra de cuentas registrada, establezca las puertas P2 y P3 en los picos positivo y negativo, respectivamente. Ejecute las muestras de células para la compensación (consulte los pasos 4.2 y 4.4.7, y las secciones 5 y 6). Modifique los voltajes FSC y SSC y el valor umbral para visualizar las celdas, ajustar la puerta P1 y, finalmente, registrar cada archivo de muestra (registrar al menos 10,000 eventos). Establezca las puertas P2 y P3 en los picos positivo y negativo, respectivamente.NOTA: Para la compensación del canal de Hoechst, utilice el G0/ G1 como pico negativo (P3) y el G2/ M como positivo (P2). Haga clic en Experimentar en la sección de la cinta del espacio de trabajo y, en la sección Configuración de compensación, seleccione Calcular compensación. Asigne un nombre a la configuración de compensación creada, vincule y guárdela en el experimento actual. Adquisición experimental de muestras Abra un espécimen haciendo clic en Nuevo espécimen en la barra de herramientas del explorador y cree la estrategia de cierre en la hoja de cálculo global.NOTA: La estrategia de cierre de la adquisición de muestras es similar a la del análisis de muestras, descrita en la Figura 3 y la sección 9. Mostrar toda la población de eventos en un histograma con CD3-A en el eje x. Cree una puerta de intervalo para seleccionar solo las celdas CD3 +. En el Panel de adquisición, seleccione puerta de almacenamiento como Todos los eventos para muestras LN y Todos los eventos o celdas CD3+ para muestras de bazo. Ejecute las muestras experimentales a baja velocidad y, finalmente, grabe todos los archivos asegurándose de recolectar al menos 100-200 células T CD8 específicas de antígeno para cada muestra de los ratones vacunados.NOTA: El tamaño del archivo de las muestras experimentales suele ser grande (30-120 MB), especialmente cuando la frecuencia de las células T CD8 específicas del antígeno es baja. Por lo tanto, se debe recolectar un gran número de eventos (> 1 ×10 6) para registrar al menos 100-200 células T CD8 específicas de antígenos. Los archivos grandes pueden ralentizar el proceso de análisis de datos posterior. La adquisición de solo células CD3+ en muestras de bazo (consulte el paso 8.2.2 anterior) es útil para mantener el tamaño del archivo más pequeño. Ejecute y registre el control positivo para el análisis del ciclo celular, es decir, la muestra de BM de ratones no tratados. 9. Análisis de datos Abra el software (consulte Tabla de materiales)y cree diferentes grupos correspondientes a los diferentes órganos que se analizarán haciendo clic en Crear grupo en la sección de la cinta del espacio de trabajo (es decir, crear grupo “a-LNs”; “bazo b”; “c-BM”).NOTA: Los grupos recién creados aparecerán en la lista de grupos, mientras que el grupo “Compensación” es generado automáticamente por el software. Abra la ventana Modificar grupo haciendo doble clic en el nombre del grupo y compruebe que los grupos recién creados estén sincronizados. De lo contrario, inserte una marca de verificación en la función Sincronizado. Arrastre cada archivo .fcs en su grupo correspondiente. Cree la estrategia de cierre comenzando con el grupo “a-LNs”. Haga doble clic en la muestra completamente teñida en el grupo para abrir la ventana del gráfico; Los ejes x e y están etiquetados como en los archivos fcs (consulte la configuración del citómetro de flujo, Tabla 2). Muestre el total de eventos adquiridos para esta muestra en un diagrama de puntos con ADN-A en el eje x y ADN-W en el eje y. Seleccione solo la población de una sola celda haciendo clic en Rectángulo en la sección de la herramienta de cierre de la ventana del gráfico.NOTA: Las células individuales tienen valores de ADN-A de la siguiente manera: 2N (bajo): entre 2N y 4N (intermedio), o igual a 4N (alto), mientras que los valores de ADN-W son idénticos para todas ellas (paso 1 de la Figura 3). Haga doble clic en el centro de la puerta rectangular para mostrar celdas individuales en un diagrama de puntos con el parámetro FSC-A en el eje X y el tinte de celda muerta en el eje y. Seleccione solo la población de células vivas haciendo clic en Polígono en la sección de herramientas de cierre de la ventana del gráfico. Las células vivas son negativas para el colorante de células muertas (paso 2 de la Figura 3). Haga doble clic en el centro de la puerta poligonal para mostrar las celdas en un diagrama de puntos con el parámetro FSC-A en el eje X y el parámetro SSC-A en el eje y. Haga clic en Rectánguloy cree una puerta “relajada” para incluir todas las celdas vivas individuales en ese gráfico12 (paso 3 de la Figura 3). Haga doble clic en el centro de la puerta “relajada” para mostrar las celdas en un diagrama de puntos con CD3 en el eje X y CD8 en el eje Y. Seleccione las celdas CD3+CD8+ haciendo clic en Polígono (paso 4 de la Figura 3). Haga doble clic en el centro de la puerta CD3+CD8+ para mostrar las celdas en un diagrama de puntos con Tetr-gag en el eje x y Pent-gag en el eje y. Seleccione las células T CD8 específicas del antígeno (positivas tanto para Tetr-gag como para Pent-gag) haciendo clic en Polígono (paso 5 de la Figura 3). Haga doble clic en el centro de la puerta específica de gag para mostrar las células en un diagrama de puntos con ADN-A en el eje x y Ki67 en el eje y(Figura 4). Seleccione las celdas en las diferentes fases del ciclo celular haciendo clic en Quad en la sección de la herramienta de cierre de la ventana del gráfico.NOTA: Las células en fase G0 son células bajas Ki67neg-DNA (cuadrante inferior izquierdo); las células en G1 son Ki67pos-DNA bajas (cuadrante superior izquierdo); las células en S-G2/M son Ki67pos-DNA intermedio/alto (cuadrante superior derecho) (Figura 4). Copie la estrategia de cierre creada en una muestra al grupo correspondiente para aplicar las puertas a todas las muestras del grupo. Repita los pasos 9.5 a 9.18 para el “grupo a-LN”. Verifique que todas las puertas sean apropiadas para cada muestra del grupo “bazo b”. Para analizar el ciclo celular entre las células BM (control positivo), haga clic en el centro de la puerta “relajada” para mostrar las células en un diagrama de puntos con ADN-A en el eje X y Ki67 en el eje y. Verifique que todas las puertas sean apropiadas para cada muestra de los 3 grupos (es decir, para células de bazo, LN y BM).NOTA: La puerta de población unicelular (paso 9.7) y la puerta cuádruple para el ciclo celular (paso 9.17) pueden tener diferentes coordenadas de compuerta en diferentes muestras, principalmente debido a las posibles ligeras diferencias de intensidad del colorante hoechst entre muestras (sección 6.2). Por esta razón, podría ser necesario modificar la puerta de población de una sola célula y las puertas cuádruples para el ciclo celular en cada muestra. Esto se hará de la siguiente manera: haga doble clic en el nombre del grupo y elimine la sincronización de las propiedades del grupo. Esta operación permite la modificación de las compuertas en una muestra sin modificar las mismas compuertas en todas las demás muestras del grupo. Después de la eliminación de la sincronización, modifique las puertas cuando sea necesario. Para visualizar los resultados obtenidos por este análisis, haga clic en Editor de diseño en la sección de la cinta del espacio de trabajo para abrirlo. Arrastre cada puerta de la estrategia de puerta en el panel de ejemplo al editor de diseño y coloque las gráficas de acuerdo con la secuencia de la estrategia de puerta. Si es necesario, cambie el tipo de gráfico haciendo doble clic en el gráfico correspondiente en el diseño y seleccionando el tipo apropiado en la ventana Definición de gráfico. Haga clic en el Grupo e itere por funciones en la cinta de diseño para visualizar los resultados obtenidos en cada órgano y comparar diferentes muestras.