人类诱导的多能干细胞 (hiPSC) 衍生的肠道有机体为体外肠道疾病的模型模型提供了令人兴奋的机会。我们展示了高 Psc 分化为肠道有机体 (Iho), 这些 Iho 的刺激与细胞因子, 以及微注射伤寒沙门氏菌到 iho 腔, 使研究上皮入侵的研究通过此病 原 体。
肠道 “有机体” (iHO) 系统, 其中代表人类肠道上皮衬里的三维结构可以从人类诱导的多能干细胞 (Hipsc) 产生并保持在培养中, 提供了一个令人兴奋的机会, 以促进对肠道感染的上皮反应的模拟。在体内, 肠道上皮细胞 (Iec) 在调节肠道稳态方面发挥着关键作用, 并可能直接抑制病原体, 尽管这种情况发生的机制尚未得到充分阐明。细胞因子白细胞介素-22 (IL-22) 已被证明在维持和防御肠道上皮屏障, 包括诱导释放抗菌肽和趋化因子以应对感染的作用。
我们描述了健康控制高 Psc 通过在其培养基中添加特定的细胞因子组合, 然后将其嵌入到基底膜基质肠道培养系统中, 从而将其分化为 Iho。一旦嵌入, Iho 在培养基中生长, 辅以 Noggin、R-spondin-1、表皮生长因子 (EGF)、CHR99021、prostaglandin E2 和 y27632 一水。每周通道通过手动破坏 iHO 超微结构导致形成发芽的 Iho, 其中一些显示出一个隐式绒毛结构。所有 Iho 都表现出由杯状细胞、肠内分泌细胞、胰腺细胞和极化肠细胞组成的分化上皮, 可通过免疫染色的方法对每个细胞子集的特定标记、透射电子显微镜进行确认(TEM) 和定量 PCR (qPCR)。为了模拟感染, 将肠炎沙门氏菌 SL1344 微注射到 iho 的腔内, 在37°c 下孵育 90分钟, 并进行改良的庆大辛保护试验, 以确定细胞内的水平. 细菌入侵。一些 Iho 也在感染前使用重组人 IL-22 (rhIL-22) 进行预处理, 以确定这种细胞因子是否能预防沙门氏菌感染.
近年来, 通过开发 “有机体” 模型, 可以从不同的祖细胞中产生肠道上皮的三维表达, 从而加强了对宿主-病原体相互作用的研究。”初级” 有机生物可以直接从肠道活检中采集的肠道干细胞中产生。此外, 肠有机会从高 Psc 中生成。许多组织也是如此, 其中胃1、肝脏2、胰腺3、4、大脑5、6、肺7和前列腺8类有机体被许多研究人员用来建模疾病。有机系统有许多令人兴奋的应用, 包括模型癌症9和药物筛选10, 但在这里我们重点讨论使用 iho 作为感染模型, 使用s 。伤寒的肠系膜.伤寒) 作为一种模范病原体, 并以 IL-22 为治疗方法进行预处理。
在这项研究中, 用于生成 iHO 的 Hipsc 是 “Kof2” Ipsc, 由一个健康的个人产生, 可从人类诱导的多能干细胞倡议联盟 (HipSci; www.hipsci.org) 中获得, 这是一个开放获取的参考小组, 该小组的特征第11行.使用高 Psc 作为有机体的祖细胞的一个优点是, 现在有大量的健康供体 iPSC 线可用, 这意味着结果可以在一些不同遗传背景的细胞系中得到验证。此外, 如果研究人员希望研究特定疾病相关的单核苷酸多态性 (SNPs), 则可以使用 CRISPR/Cas9 在健康的细胞系中进行突变, 从而产生突变系并保留同源基因控制线进行比较12。根据我们的经验, hpsc 衍生的肠道有机体比主要的肠道有机体体积更大, 培养也更稳定, 从而使技术上更具挑战性的微注射, 并有可能使更多样化的病原体更多样化。研究。Iho 可以被低温保存, 我们已经传播了长达一年的 iHO 培养物, 以生产用于实验的材料。
在体内, Iec 在调节肠道稳态方面发挥着关键作用, 并可能直接抑制病原体, 尽管人们对这种情况发生的机制并不十分了解。细胞因子 IL-22 是已知的一个作用, 以维持肠道上皮屏障 13, 并参与诱导和分泌抗菌肽和趋化因子, 以应对感染 14.它是由激活 T 细胞 (特别是, Th17 细胞) 以及自然杀手 (NK) 细胞产生的, 并与由 IL-22R1 和 IL-10R2 亚基15组成的异二化受体结合。IL-22 受体在 IECs 上基本表达, 这意味着在 iHO 模型中, 只需将其添加到培养基16即可对有机体进行预处理.有机体系统的一个缺点是, 它缺乏相关的免疫反应通常由其他免疫细胞类型提供;然而, 模型正在出现, 试图与肠道淋巴细胞共培养有机体, 以更好地代表这17,18.
使用微注射系统是模拟 iHO 模型中感染的关键, 因为这样可以将病原体直接传递到上皮的顶端表面, 就像体内感染的情况一样。在注射到 iHO 中的细菌溶液中加入苯酚红, 标志着被感染的物质, 从而避免了重复注射相同的 iHO。作为感染模型的容器的有机体正在使用中, 病原体如幽门螺杆菌、19种诺如病毒、20例罗塔病毒、 21种生产滋海药的大肠杆菌22,隐孢子虫23和寨卡病毒24已被证明在这些系统中存活和复制。这项技术可应用于更广泛的病原体, 特别是难以培养的生物, 如原生动物或人类受限病原体, 以便获得关于人类上皮对感染反应的直接信息。
该协议概述了 Hipsc 与 Iho 的区别及其作为模拟肠道感染模型的效用。下面, 我们概述了协议中的关键步骤以及我们所做的任何修改或改进。
与以前出版的作品25相比, 该协议简化了 Hipsc 的差异化过程.以前使用的方法要求将 hiPSC 从其他 hiPSC 培养系统 (例如, 依赖弱的 Hapsc 培养系统) 转移到化学定义的介质—-聚乙烯醇 (CDM-PVA)。这种转移到 CDM-PVA 通常需要2-3周的时间, 需要每天喂养 Hpsc。该议定书也不总是有效的, 一些区分失败;因此, 我们使用相同的生长因子进行分化试验, 但从在干细胞培养基 (而不是 CDM-PVA) 中生长的 Hpsc 开始, 并在分化天0-3 用干细胞培养基取代 CDM-PVA。这对于迄今试验的5条独立的 hiPSC 生产线来说是成功的, 使差异化过程变得更快、更高效。这也允许在分化之前对高 Psc 进行无周培养, 从而使 hiPSC 培养具有更大的灵活性。这种方法生产的 iHO 线已经表型的肠道上皮标记, 正如我们之前所描述的 Hepsc 线 Klof Klof, Yemz1 和 Lise116,似乎表型无法区分从使用前一个生产的 iho协议。
播种后, Iho 需要至少1个月的常规传代, 每4-7天进行一次分裂, 以促进成熟。请注意, 根据所使用的 iPSC 线路和初始培养的密度, iHO 的开发会有一些变化。在前几个通道中, 会有明显的污染细胞, 而这些细胞不是 Iho。这些最终会死亡, 留下一个干净的球形文化, 大约4周后, 萌发 Iho。此外, 引擎盖内成像系统可用于选择和通过所需的形态学 Iho。随着 Iho 的成熟, 它们将需要每6-7天拆分一次, 这取决于生长速度和密度。如果发生以下任何一种情况, Iho 应该在这一点之前被分割: Iho 的腔开始充满死细胞, 基底膜基质开始解体, Iho 开始从基底膜基质中生长出来, 或者培养太多 密集和媒体开始变黄非常快。
一旦 iHO 培养建立, 如果在任何时候 Iho 的外观改变或不同 (例如, 培养物仍然是球形的, 而不是发芽), 通过免疫组织化学和 qPCR 的表型细胞标记应该是重复以确保 Iho 中细胞类型 (如杯状细胞、Paneth 细胞) 的分化保持不变。如果 Iho 不再区分, 则应丢弃 iho 并对其进行重新区分或较早的 Iho 通道应解冻和重组。如果 Iho 停止区分, 潜在的原因是文化的年龄 (如果超过 6个月), 生长因子的活动 (确保这些都按照制造商的指示重组, 并冻结在小的脂肪, 以避免多个冻融周期), 过于频繁或暴力通道 (一般情况下, 通过应只发生每周一次, 如果 Iho 手动离解过于激烈的定期, 他们将停止完全区分)。
我们通过 RNA 测序确定, IL-22 在感染前18小时刺激可刺激抗菌基因和那些参与屏障防御表型的基因。在使用新的 iHsO 进行涉及白细胞介素-22 预调量的检测之前 (如果系统用于此类检测, 则使用替代细胞因子), 最好检查已知由细胞因子增强的基因的活性 (在 IL-22 的情况下), 我们使用 duox2 和lcn2) 后, 通过 qpcr 刺激 iho, 以确保受体的表达和完整的信号。在首次使用 IL-22 之前, 我们还进行了免疫组织化学, 以确定 IL-22 受体在 Iho 上的 LI-22 受体, 以确定 IL-22 受体的表达是基础的, 这意味着只需在 iHO 培养中添加 Il-22 即可实现预调。中。然而, 如果受体是顶部表达, 这个协议可能必须适应提供脂质顶部。
微注射系统的陷阱通常与注射所需针头的细腻有关。在这里, 我们使用市售的钻头, 带有6μm 流明。有可能从玻璃毛细血管26中拔出注射针, 尽管这可能不太均匀, 导致针尖泄漏或注入 iho 的体积不一致。重要的是要确保注射已经发生在 iHO 腔, 这是使用苯酚红色作为染料的原因之一;Iho 将明显地扩大和持有红色接种器, 使确定注射了哪些 Iho。偶尔针头会堵塞 iHO 墙上的碎片;如果是这种情况, 请从 iHO 内部取出针尖, 然后按微注射系统上的清洁按钮。这将产生一个短暂的较高的气压, 这应该可以清除堵塞。这也会导致细菌接种物在板上出现一些泄漏;因此, 如果发生这种情况, 应在所有板材上重复清洁操作, 以确保每个板材的细菌接种平等。Hispc 衍生 Iho 的一个大优点是它们的尺寸。来自小鼠的肠道有机体和原代人的有机体要小得多 (分别测量约100μm 和 100-300μm, 27, 而对 hipscc 衍生的 iho 为250-1500 微米), 这意味着大量注射有机体的速度会变慢。这使得在高 pscc 衍生的 Iho 中进行了更大规模的注射实验。还可以通过在感染后采集 Iho 并手动将其分离到 DPBS 中, 释放其腔内内容来研究 Iho 的腔内内容。对于微注射, 我们建议使用高浓度的细菌。我们发现, 浓度较低不足以从构成 Iho 的 IHOs 中产生反应。此外, 很难随后使用显微镜定位内化细菌。可能需要针对不同的细菌菌株进行优化。
总之, hiPSC-derived 衍生的 Iho 提供了一个很有希望的模型, 直接剖析上皮反应对肠道感染, 无论是通过研究细胞内的侵袭计数, 成像, 测量细胞因子水平在 iHO 上清液, 或收获 RNA研究接触病原体后的转录变化。它们在未来的效用将更加明显, 以建立人类受限病原体的感染模型, 并通过研究与疾病有关的具体基因突变, 利用利用这一技术进行个性化研究的可能性和药物反应。
The authors have nothing to disclose.
这项工作得到了威康信托、盖茨基金会和剑桥生物医学研究中心的资助。E. a. l. 是由 Wellcome 信托基金支持的临床博士生。
2-Mercaptoethanol | Sigma-Aldrich | M6250-10ML | |
5 mm glass bottom injection dishes | MatTek corporation | P50G-0-14-F | |
Advanced DMEM/F12 | Gibco | 12634010 | |
Alexa fluor 647 phalloidin | Life Technologies | A22287 | Use at 1:1000 concentration |
B27 serum-free supplement | Life Technologies | 17504044 | Stock concentration 50x, final concentration 1x |
BMP-4 recombinant human protein | R&D | PHC9534 | Stock concentration 10 μg/mL, final concentration 10 ng/mL |
Cell recovery solution (cell lifting solution) | BD | 354253 | |
CHIR99021 | Abcam | ab120890-5mg | Stock concentration 3 mM, final concentration 3 µM |
Collagenase, type IV powder | Life Technologies | 17104019 | Reconstitute at 0.1% |
Corning cryogenic vials | Corning | 430487 | |
Costar TC treated 24 well culture plates | Corning | CLS3527 | |
DAPI dilactate | Sigma-Aldrich | D9564-10MG | Use at 10 nM concentration |
Dulbecco’s PBS (No MgCl2 or CaCl2) | Life Technologies | 14190-144 | |
Dulbecco’s PBS (with MgCl2 and CaCl2) | Sigma-Aldrich | D8662-100ML | |
Epidermal growth factor | R&D | 236-EG-200 | Stock concentration 100 μg/mL, final concentration 100 ng/mL |
Eppendorf TransferMan NK2 (microinjection system) | Eppendorf | 920000011 | |
Eppendorf Femtojet express (microinjection system) | Eppendorf | 5248 000.017 | |
Essential 8 Flex medium kit (stem cell culture medium) | Life Technologies | A2858501 | |
EVOS XL imaging system (in-hood imaging system) | |||
Gentamicin | Sigma-Aldrich | G1272-10ML | Stock concentration 10 mg/mL, final concentration 0.1 mg/mL |
Goat anti-Salmonella, CSA-1 | Insight Biotechnology | 02-91-99 | Use at 1:20 concentration |
HEPES 1 M | Life Technologies | 15630056 | |
KnockOut Serum Replacement (setrum replacment) | Gibco | 10828010 | |
GlutaMAX supplement (glutamine supplement | ThermoFisher | ||
L-glutamine | Life Technologies | A2916801 | Stock concentration 200 mM, final concentration 2 mM |
LY294002 | Promega UK | V1201 | Stock concentration 50 mM, final concentration 10μM |
Matrigel, GFR, phenol free (basement membrane matrix) | Corning | 356231 | |
MEM non-essential amino acids solution (100x) | Gibco | 11140035 | |
N2 serum-free supplement | Life Technologies | 17502048 | Stock concentration 100x, final concentration 1x |
Penicillin-streptomycin | Life Technologies | 15140163 | Stock concentration 10,000 U/mL, final concentration 100 U/mL |
Phenol red | Sigma-Aldrich | P0290-100ML | |
Piezo Drill Tip Mouse ICSI, 25° tip angle, 6 µm inner diameter | Eppendorf | 5195000087 | |
Prostaglandin E2 | Sigma | P0409-1MG | Stock concentration 2.5 mM, final concentration 2.5 mM |
Recombinant human FGF basic | R&D | 233-FB-025 | Stock concentration 100 μg/mL, final concentration 100 ng/mL |
Recombinant human IL-22 | R&D | 6057-NG-100 | Stock concentration 100 μg/mL, final concentration 100 ng/mL |
Recombinant human Noggin | R&D | 6057-NG-100 | Stock concentration 100 μg/mL, final concentration 100 ng/mL |
Recombinant human R-spondin1 | R&D | 4645-RS-025 | Stock concentration 25 mg/mL, final concentration 500 ng/mL |
Recombinant human/mouse/rat Activin A | R&D | 338-AC-050 | Stock concentration 100 μg/mL, final concentration 100 ng/mL |
Recovery cell culture freezing medium (cell freezing medium) | Gibco | 12648010 | |
Retinoic acid | Sigma-Aldrich | R2625-50MG | Stock concentration 3μM, final concentration 3mM |
RPMI 1640 media with Glutamax supplement (RPMI Medium with L-glutamine supplement) | Life Technologies | 61870010 | |
Triton X-100 (cell lysis buffer) | Sigma-Aldrich | RES9690T-A101X | Use at 1% concentration |
Versene (EDTA solution) | Life Technologies | 15040066 | |
Vitronectin XF | Stemcell Technologies | 7180 | |
Y-27632 dihydrochloride monohydrate | Sigma-Aldrich | Y0503-1MG | Stock concentration 3 mM, final concentration 10 mM |