Summary

Споро адсорбция как Nonrecombinant отображения системы для ферментов и антигены

Published: March 19, 2019
doi:

Summary

Этот протокол ориентирована на использование бактериальных спор как «живой» nanobiotechnological инструмент адсорбировать гетерологичных молекулы с различными биологической деятельности. Также приведены методы для измерения эффективности адсорбции.

Abstract

Бактериальная спора является ячейкой метаболически покоя, сформирован целый ряд защитных слоев, окружающих обезвоженной цитоплазмы. Это своеобразная структура делает споро чрезвычайно стабильные и устойчивые и предложил использование спор в качестве платформы для отображения гетерологичных молекул. До настоящего времени различные антигены и ферментов выставлялись на спор Bacillus subtilis и несколько других видов, первоначально рекомбинантных подход и, затем, простой и эффективный метод nonrecombinant. Nonrecombinant отображения система основана на прямой адсорбции гетерологичных молекул на поверхности споро, избегая строительство рекомбинантных штаммов и выпуска генетически модифицированных бактерий в окружающей среде. Адсорбированных молекул стабилизировалась и охраняются взаимодействия с спор, который ограничивает быстрой деградации антигены и потеря активности ферментов в неблагоприятных условиях. После использования, споро адсорбированные ферменты можно легко собраны с минимальным снижением активности и повторно использовать для дополнительных реакции раундов. В этом документе показано, как адсорбировать молекулы модель для очищенного спор B. subtilis, как оценивать эффективность адсорбции и как собрать используемые споры утилизировать их для новых реакций.

Introduction

Системы отображения направлены на представление биологически активных молекул на поверхности микроорганизмов и поиск приложений в различных областях, от промышленных до медицинских и экологических биотехнологий. В дополнение к бактериофаги1,2 и клетки различных грамотрицательных и – положительных видов3,4,5,6,7, также были бактериальных спор предложенный как систем отображения двух подходов8,9.

Из-за его своеобразная структура, а именно обезвоженной цитоплазмы, в окружении ряда защитных слоев10, споро обеспечивает несколько преимуществ перед8,на основе ФАГ – и клетки систем отображения9. Первое преимущество приходит от экстремальных надежности и стабильности спор на условиях, которые бы пагубным для всех других клеток10,11. Spore отображается антигены и ферментов являются стабильными, после длительного хранения при комнатной температуре12 и защищены от деградации при низких значениях рН и температура13. Второе преимущество спор является безопасность многих видов спорообразующих. B. subtilis, б. clausii, б. coagulansи несколько других видов используются во всем мире как пробиотики и были на рынке для человека или животных использования для десятилетий14,15. Эта запись исключительных безопасности является очевидное общее требование для поверхности дисплея системы и имеет особое значение, когда система предназначена для использования человеческого или животного16. Третий важным преимуществом системы на основе spore отображения является, что она не имеет ограничений на размер молекулы, которая подвергается. В системах на базе фага, большой гетерологичных белка может повлиять на структуру капсида, в то время как в системах на базе ячейки, это может повлиять на структуру мембраны или может лимит/повредить мембраны транслокации шаг17. Защитные слои, окружающих споро состоят из более чем 70 различных белков10 и являются достаточно гибкими для того, чтобы принять большие инородные белки без каких-либо очевидной структурных дефектов или функциональными нарушениями8. Кроме того с обеих систем отображения на основе spore, мембраны транслокации белка гетерологичных не требуется8,9. Действительно гетерологичных белки либо производятся в цитоплазме клеток матери и собрал на спор, который формируется в том же цитоплазме или адсорбируется на зрелых споро8,9.

Споро отображения изначально был получен путем генетической системы инженера споро поверхности18. Эта генетическая система была основана на я) строительство гена слияние между кодирование гена для ползучих пальто белок (используется в качестве носителя) и кодирование гена белка будет отображаться – наличие сигналов транскрипционный анализ и трансляционная эндогенных Джин будет контролировать выражение fusion и ii) интеграция химерных гена в хромосоме B. subtilis предоставлять генетической стабильности. Этот рекомбинантных подход, с помощью различных белков споро поверхности как перевозчиков и направленный на различных потенциальных приложений, начиная от слизистой вакцины глюкозоизомеразы, биосенсор, биовосстановления, были отображены различные антигены и ферментов или Биоаналитические инструмент8,13.

Совсем недавно другой подход споро дисплей был развитых19. Эта вторая система nonrecombinant и опирается на спонтанное и крайне жесткой адсорбции молекул на поверхности споро9. Антигены19,20 и ферменты13,21 эффективной отображаться и показали, что этот метод является значительно более эффективным, чем рекомбинантных. Такой nonrecombinant подход позволяет отображать белков в родной форме20 и может также использоваться с газобетона, смерть споры19. Молекулярный механизм адсорбции полностью еще не выяснены. Отрицательный заряд и гидрофобность спора были предложены как соответствующие свойства для адсорбции13,19,22. Недавно было показано, что модель белка, белка красный autofluorescent (mRFP) коралловых Discosoma, когда адсорбированные споро, смог проникнуть через поверхностные слои локализации в внутренний слой23. Если доказана верно для других белков, внутренней локализации гетерологичных белков может объяснить их повышение стабильности при адсорбированные споры23.

В недавнем исследовании двух ферментов, катализирующих два последовательных шагов по пути деградации xylan независимо были выставлены на спор B. subtilis и, когда инкубировали вместе, были в состоянии выполнять шаги как деградация21. Споры, собранные после реакции были все еще активен и способен продолжать xylan деградации при добавлении свежий субстрат21. Даже если потеря около 15% конечного продукта наблюдался в второй реакции21, многократного использования адсорбированных ферментов для одного, а нескольких шаг, реакций является дополнительное важное преимущество системы отображения споро.

24 Пан et al. сообщили дополнительные подход для отображения гетерологичных белков на поверхности споро: гетерологичных белков (эндоглюканаза белок и бета галактозидазы, один) производится в ячейке мать во время заспорение были спонтанно заключенная в формирование пальто споро, без необходимости перевозчика. Эта система отображения дополнительных spore является сочетание двух подходов, изложенных до настоящего времени. Действительно, это рекомбинантных, поскольку гетерологичных белки были инженерии выражаться в ячейке мать во время заспорение, в то время как их сборку в пальто было спонтанным и, следовательно, nonrecombinant24. Однако эффективность отображения этого дополнительного подхода остается быть проверены и по сравнению с другими двумя подходами, используя же гетерологичных белков.

Настоящий Протокол исключает споро производственные процессы и очистки, которые были описаны подробно в другом месте24. Она включает в себя адсорбции реакции, оценки эффективности адсорбции точка промокательной и Люминесцентная микроскопия, и рециркуляции адсорбированных ферментов для дополнительных реакции раундов.

Protocol

1. адсорбция реакция Проинкубируйте 2, 5 и 10 мкг mRFP с 2 х 109 B. subtilis одичал тип очищенный спор в 200 мкл привязки буфера, цитрат натрия 50 мм, pH 4.0 (16,7 мм натрия цитрат дигидрат; лимонная кислота 33,3 мм) за 1 ч при 25 ° C на качалки шейкер (рис. 1) . Центрифуга привязки …

Representative Results

Успешное адсорбции может оцениваться Западный blotting. После реакции смесь фракционированный центрифугированием и промывают, и фракция гранул (рис. 1) используется для извлечения белков поверхности. Экстракт фракционированный электрофореза геля полиак?…

Discussion

Этот спор адсорбции протокол является очень простым и понятным. Реакция является строго зависит от pH буфера реакции и эффективность адсорбции является оптимальным в кислой рН (рН 5,0 или ниже). На нейтральном pH эффективность адсорбции низка, и в щелочной рН, адсорбция может не произойти. ?…

Disclosures

The authors have nothing to disclose.

Acknowledgements

Эта работа была поддержана «Finanziamento di Ricerca ди Ateneo» к L. Baccigalupi, название проекта «SP-LAY: бактериальные споры как живой платформы для отображения белков».

Materials

0.1% Poly-L-lysine solution Sigma P8920
0.45 µm Nitrocellulose Blotting Membrane Sartorius M_Blotting_Membranes
100× objective UPlanF1  Olympus microscope equipment
Bacillus subtilis strain NCIB3610 Bacillus Genetic Stock Center 3A1
BD ACCURI C6 PLUS BD flow cytometer
BX51 Olympus Fluorescent microscope
Clarity Biorad 1705060
DP70 digital camera a Olympus microscope equipment
Goat anti-Rabbit IgG (H+L) Cross-Adsorbed Secondary Antibody, FITC Thermo fisher F-2754
Goat Anti-Rabbit IgG H&L (HRP)  Abcam ab6721
Monoclonal Anti-polyHistidine−Peroxidase antibody Sigma A7058-1VL used to detect adsorbed proteins presenting a 6xhistidine-tag at C- or N- terminal 
SecureSlip glass coverslip Sigma S1815-1PAK
Superwhite Uncharged Microscope Slides VWR 75836-190
U-CA Magnification Changer  Olympus microscope equipment

References

  1. Felici, F., et al. Peptide and protein display on the surface of filamentous bacteriophage. Biotechnology Annual Review. 1, 149-183 (1995).
  2. Cortese, R., et al. Identification of biologically active peptides using random libraries displayed on phage. Current Opinion in Biotechnology. 6, 73-80 (1995).
  3. Sousa, C., Cebolla, A., de Lorenzo, V. Enhanced metalloadsorption of bacterial cells displaying poly-His peptides. Nature Biotechnology. 14, 1017-1020 (1996).
  4. Richins, R., Kaneva, I., Mulchandani, A., Chen, W. Biodegradation of organophosphorus pesticides by surface-expressed organophosphorus hydrolase. Nature Biotechnology. 15, 984-987 (1997).
  5. Wu, J. Y., et al. Expression of immunogenic epitopes of hepatitis B surface antigen with hybrid flagellin proteins by a vaccine strain of Salmonella. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 86, 4726-4730 (1989).
  6. Newton, S. M., Jacob, C. O., Stocker, B. A. Immune response to cholera toxin epitope inserted in Salmonella flagellin. Science. 244, 70-72 (1989).
  7. Fischetti, V. A., Medaglini, D., Pozzi, G. Gram-positive commensal bacteria for mucosal vaccine delivery. Current Opinion in Biotechnology. 7, 659-666 (1996).
  8. Isticato, R., Ricca, E. Spore surface display. Microbiology Spectrum. 2 (5), (2014).
  9. Ricca, E., et al. Mucosal vaccine delivery by non-recombinant spores of Bacillus subtilis. Microbial Cell Factories. 13, 115 (2014).
  10. McKenney, P. T., Driks, A., Eichenberger, P. The Bacillus subtilis assembly and functions of the multilayered coat. Nature Reviews Microbiology. 11, 33-44 (2013).
  11. Knecht, L. D., Pasini, P., Daunert, S. Bacterial spores as platforms for bioanalytical and biomedical applications. Analytical and Bioanalytical Chemistry. 400, 977-989 (2011).
  12. Isticato, R., Cangiano, G., De Felice, M., Ricca, E., Ricca, E., Henriques, A. O., Cutting, S. M. Display of molecules on the spore surface. Bacterial Spore Formers: Probiotics and Emerging Applications. , 193-200 (2004).
  13. Sirec, T., et al. Adsorption of β-galactosidase of Alicyclobacillus acidocaldaricus wild type and mutant spores of Bacillus subtilis. Microbial Cell Factories. 11, 100 (2012).
  14. Cutting, S. M. Bacillus probiotics. Food Microbiology. 28, 214-220 (2011).
  15. Baccigalupi, L., Ricca, E., Ghelardi, E., Venema, K., Do Carmo, A. P. Non-LAB Probiotics: Spore Formers. Probiotics and Prebiotics: Current Research and Future Trends. , 93-103 (2014).
  16. Cutting, S. M., Hong, H. A., Baccigalupi, L., Ricca, E. Oral Vaccine Delivery by Recombinant Spore Probiotics. International Reviews of Immunology. 28, 487-505 (2009).
  17. Lee, S. Y., Choi, J. H., Xu, Z. Microbial cell-surface display. Trends in Biotechnology. 21, 45-52 (2003).
  18. Isticato, R., et al. Surface display of recombinant proteins on Bacillus subtilis spores. Journal of Bacteriology. 183, 6294-6301 (2001).
  19. Huang, J. M., et al. Mucosal delivery of antigens using adsorption to bacterial spores. Vaccine. 28, 1021-1030 (2010).
  20. Isticato, R., et al. Non-recombinant display of the B subunit of the heat labile toxin of Escherichia coli wild type and mutant spores of Bacillus subtilis. Microbial Cell Factories. 12, 98 (2013).
  21. Mattossovich, R., et al. Conversion of xylan by recyclable spores of Bacillus subtilis thermophilic enzymes. Microbial Cell Factories. 16, 218 (2017).
  22. Pesce, G., et al. Surface charge and hydrodynamic coefficient measurements of Bacillus subtilis by optical tweezers. Colloids and Surfaces B: Biointerfaces. 116, 568-575 (2014).
  23. Donadio, G., et al. Localization of a red fluorescence protein adsorbed on wild type and mutant spores of Bacillus subtilis. Microbial Cell Factories. 15, 153 (2016).
  24. Pan, J. G., Choi, S. K., Jung, H. C., Kim, E. J. Display of native proteins on Bacillus subtilis spores. FEMS Microbiology Letters. 358, 209-217 (2014).
  25. Cutting, S., Vander Horn, P. B., Harwood, C., Cutting, S. Genetic analysis. Molecular Biological Methods for Bacillus. , (1990).
  26. Lanzilli, M., et al. Display of the peroxiredoxin Bcp1 of Sulfolobus solfataricus probiotic spores of Bacillus megaterium. New Biotechnology. 46, 38 (2018).

Play Video

Cite This Article
Isticato, R., Ricca, E., Baccigalupi, L. Spore Adsorption as a Nonrecombinant Display System for Enzymes and Antigens. J. Vis. Exp. (145), e59102, doi:10.3791/59102 (2019).

View Video