Peixe-zebra (Danio rerio) estão se tornando vertebrado modelo animal utilizado para colonização microbiana e patogénese. Este protocolo descreve o uso do protozoário Paramecium caudatum como um veículo para a infecção de origem alimentar em larvas de peixe-zebra. P. caudatum prontamente internaliza as bactérias e obter retomadas por larval zebrafish através de comportamento predando natural.
Devido a sua transparência, rastreabilidade genética e facilidade de manutenção, peixe-zebra (Danio rerio) tornaram-se um modelo de vertebrados utilizado para doenças infecciosas. Zebrafish larval naturalmente predar os unicelulares protozoários Paramecium caudatum. Este protocolo descreve o uso de p. caudatum como um veículo para a infecção de origem alimentar em zebrafish larval. P. caudatum internalizar uma vasta gama de bactérias e células bacterianas permanecem viáveis durante várias horas. Zebrafish então predar p. caudatum, a carga bacteriana é lançada no foregut após digestão do veículo paramécio e as bactérias colonizam o trato intestinal. O protocolo inclui uma descrição detalhada da manutenção de paramécios, carregando com bactérias, determinação da degradação bacteriana e dose, assim como a infecção de zebrafish, alimentando com protozoários. A vantagem deste método de infecção de origem alimentar é que estreitamente imita o modo de infecção observada na doença humana, leva à colonização mais robusta em relação aos protocolos de imersão e permite o estudo de uma ampla gama de patógenos. Infecção de origem alimentar no zebrafish modelo pode ser usada para investigar a expressão de gene bacteriano dentro do hospedeiro, interações patógeno-hospedeiro e características de patogenicidade, incluindo a morbilidade, a localização, a difusão e a carga bacteriana.
Compartilhamento de zebrafish morfologicamente e funcionalmente conservada características com mamíferos, incluindo linhagens granulocíticos (por exemplo, os neutrófilos), monócitos/macrófagos-células, receptores Toll-like, citocinas pró-inflamatórias e peptídeos antimicrobianos1 . O trato intestinal no zebrafish é totalmente desenvolvido em 6 dias pós fertilização (dpf) e mostra a conservação morfológica e funcional com o trato gastrointestinal dos mamíferos, tais como Regulamento transcriptional conservado em células epiteliais intestinais 2. isso faz com que um excelente modelo para a colonização microbiana intestinal e patogênese zebrafish. Uma ampla gama de bactérias entéricas tem sido estudada no modelo zebrafish, incluindo enterohemorrhagic Escherichia coli3, Vibrio cholerae4,5, Salmonella enterica6, o zebrafish microbiota7,8e o papel dos probióticos na imunidade intestinal9. Uma vantagem distinta do zebrafish modelo é que ele é colonizado por muitos micróbios sem interromper a microbiota endógena, que permite a investigação de comportamento microbiano no contexto de populações microbianas mistas3, 6. atualmente, a maioria dos modelos de zebrafish de colonização gastrointestinal e doença dependem da administração de micróbios por imersão de banho, onde o zebrafish são incubadas em uma suspensão bacteriana para uma quantidade específica de tempo10. No entanto, isso torna difícil determinar a dose exata de bactérias administradas e leva à colonização limitada com alguns micróbios, particularmente com bactérias não-patogênicas. Alternativamente, uma suspensão bacteriana é administrada a pescar através de de gavagem oral11, mas isso é tecnicamente desafiador e limitado a larvas mais velhas e adultos.
Este protocolo descreve o uso do unicelulares protozoários Paramecium caudatum como um veículo para entrega de origem alimentar de micróbios para o trato gastrointestinal de larvas de peixe-zebra. Paramécios são fácil e barato para manter e são capazes de alimentando-se de uma grande variedade de micróbios, incluindo algas, fungos e bactérias, que eles interiorizar através de um sulco oral ciliadas12,13,14. Uma vez internalizados, bactérias realizam-se em vacúolos, que eventualmente acidificar e conteúdo são degradados ao longo de um período de tempo de várias horas15. Zebrafish larval capturar protozoários como presas naturais logo após a eclosão, cerca dpf de 3 – 4, dependendo da temperatura de16e levá-los com alta eficiência. O processo de captura de presas leva em média 1.2 s da detecção de capturar17e paramécios capturados são digeridos rapidamente no zebrafish foregut, tal que interiorizado bactérias viáveis são liberadas para o trato intestinal3. Como resultado, os paramécios podem ser usados como um método rápido e fácil para entregar uma dose alta e consistente de bactérias no trato gastrointestinal de zebrafish. As bactérias entregues também podem ser transformadas para expressar uma proteína fluorescente, tais como mCherry, conforme descrito aqui, ou, no caso de bactérias geneticamente intratáveis, podem ser pre-manchadas com uma tintura fluorescente para permitir a visualização dentro do trato gastrointestinal.
Este protocolo descreve a entrega de origem alimentar de enteropatogênica Escherichia coli (enterohemorrhagic Escherichia coli [EHEC] e aderente invasiva Escherichia coli [AIEC]) e o SSP de Salmonella enterica Typhimurium. Tanto a patogenicidade de e. coli e S. typhimurium são transmitidas através da rota fecal-oral18,19e podem ser adquirida através de contaminados alimentos como carne, legumes e laticínios. Usando p. caudatum como um veículo, e. coli e S. typhimurium colonizam com sucesso as larvas de zebrafish dentro de 30 a 60 min de incubação co com o veículo paramécio. A carga bacteriana alcançada é robusta o suficiente para visualizar a colonização e determinar a carga por chapeamento do tecido homogenates.
O protocolo básico descrito aqui foi otimizado para a patogenicidade de e. colie foi adaptado com sucesso para outras espécies bacterianas, incluindo a Salmonella typhi e Vibrio cholerae. Para algumas espécies que não a colonizar o intestino de zebrafish após imersão de banho, incluindo algumas estirpes de typhi Salmonella e alguns anaeróbios, infecção de origem alimentar conforme descrito aqui pode ser usada para estabelecer com sucesso a colonização. Em comparação com microgavage, que também é usado para estabelecer elevados encargos bacterianos no trato intestinal larval, infecção de origem alimentar é tecnicamente menos desafiador e requer equipamentos menos especializados. No entanto, os parâmetros críticos devem ser otimizados para as espécies bacterianas e as tensões para ser usado. Tais fatores incluem a densidade bacteriana e paramécio para a etapa de co-cultura de bactérias-paramécio: se bacteriana números dentro paramécios são baixos, isto pode ser melhorado, aumentando a densidade bacteriana na etapa de co-cultura. Algumas espécies bacterianas podem causar danos ao host paramécio, e isto deve ser avaliado por microscopia.
Outro fator importante neste protocolo é a captura de presas por zebrafish. A taxa predando conforme descrito aqui é baseada no pressuposto de que cada captura de presas strike resultados na ingestão de um paramécio. Altas densidades de paramécios por peixes são usadas no protocolo para garantir altas taxas rapinando. No entanto, a captura de presas é dependente da densidade de protozoários no sistema, e em culturas muito diluído paramécio, predando taxas podem ser tão baixas quanto 13 – 15 paramécios por hora21,22. Uma limitação é que taxas de captura de presas também são fortemente dependentes em condições de iluminação e no escuro, as taxas de captura são 80% mais baixos do que em condições de luz21 e isso devem ter em conta quando a criação de experiências. Se os tempos de exposição a presa precisa ser expandida para otimizar a colonização, consideração deve ser dada à exposição secundária a bactéria através de fezes. Nas condições descritas acima – 2 h de exposição de rapina – esta exposição é negligenciável, desde que o tempo de passagem do intestino de bactérias é mais de 1h e a concentração de bactérias no veículo é muito maior do que nas fezes. No entanto, se o tempo de exposição de rapina é significativamente maior, isto pode tornar-se um fator significativo.
Controlos adequados devem ser incluídos no presente protocolo, incluindo a colonização do zebrafish seguindo alimentação com paramécios contendo não-patogênicas de Escherichia coli MG1655. Se várias estirpes bacterianas são comparadas pela sua capacidade de colonizar o zebrafish host, é importante testar se seus Half-Life dentro paramécios é comparável. Mutações bacterianas, incluindo aqueles comprometer a integridade da parede celular ou sensoriamento de ácido, podem comprometer a estabilidade bacteriana dentro de paramécios. Em tais casos, zebrafish alimentação tem que ser ajustado para dar conta das diferenças na dosagem.
O protocolo descrito aqui pode ser usado para investigar a colonização bacteriana e suas consequências, incluindo por imagem colonização bacteriana de zebrafish como descrito acima, bem como determinando CFU por zebrafish de tecido homogeneizado3, ou investigando a mortalidade e a morbidade associada a infecção. Idealmente, para visualização de bactérias, cepas bacterianas expressando proteínas fluorescentes, tais como mCherry ou proteína fluorescente vermelha (RFP) devem ser usadas. Isto permitirá a visualização do crescimento das populações bacterianas. Se a estirpe bacteriana não é geneticamente tractable ou o uso da expressão da proteína fluorescente é impedido por outras razões, bactérias podem ser coradas com um corante fluorescente, como FM 4-64FX, antes da cultura co com protozoários. Ao usar o protocolo descrito aqui, não diminui o brilho da tintura co-cultura com protozoários e bactérias coradas são claramente visíveis no intestino zebrafish. No entanto, a tintura será diluída ao longo do tempo deve ocorrer de significativa proliferação bacteriana dentro do host de zebrafish. Em ambos os casos, vermelho fluorescente bactérias são preferíveis sobre bactérias fluorescentes-verde, desde autofluorescência de tecido pode ser mais elevada no verde do que no canal vermelho.
Verificou-se que o presente protocolo pode ser adaptado para aeróbios e microaerofílicas espécies bacterianas. Pode ser possível adaptá-lo para a alimentação de esporos e espécies de fungos, embora isto continua a ser testada experimentalmente.
The authors have nothing to disclose.
Gostaríamos de agradecer os membros do grupo Krachler para leitura crítica e comentários sobre o manuscrito. Este trabalho foi financiado por um prêmio de UT sistemas STAR e o BBSRC NIH (R01AI132354).
Paramecium caudatum, live | Carolina | 131554 | no not store growing cultures below room temperature |
0.4% Trypan Blue Solution | Sigma | T8154-20ML | liquid, sterile-filtered, suitable for cell culture; prepared in 0.81% sodium chloride and 0.06% potassium phosphate, dibasic |
Dimethyl sulfoxide (DMSO) | Sigma | 276855-100ML | store in a solvent safety cabinet |
Escherichia coli, MG1655 | ATCC | ATCC 700926 | can be replaced by any other non-pathogenic E. coli strain |
FM 4-64FX stain | Thermo Fisher | F34653 | aliquot and store frozen |
Formaldehyde | Sigma | F8775-4X25ML | |
LB Broth | Sigma | L3397-1KG | |
Phosphate buffered saline tablets | Thermo Fisher | 18912014 | |
Tetracycline | Sigma | 87128-25G | toxic, irritant |
Tricaine (Ethyl 3-aminobenzoate methanesulfonate) | Sigma | E10521-10G | |
Triton X-100 | Sigma | X100-100ML | |
Trypan Blue Solution, 0.4% | Sigma | 93595-50ML | |
UltraPure Low Melting Point Agarose | Thermo Fisher | 16520050 | |
hemocytometer or cell counter | any | ||
stereomicroscope | any | ||
table-top centrifuge | |||
microwave | |||
rotator wheel | |||
heated shaking incubator | |||
aquatics facilities | |||
breeding tanks |