本协议描述了一种高效的方法, 用于提取和定量的咖啡因在细胞悬浮液中的表达水平和评价咖啡因合酶酶活性的实验过程。编码这种酶的基因。
咖啡因 (13, 7-trimethylxanthine) 是一种嘌呤生物碱, 目前流行饮料, 如咖啡和茶。这种次生代谢产物被认为是一种化学防御, 因为它具有抗菌活性, 被认为是一种天然杀虫剂。咖啡因也可以产生负面的化感作用, 防止周围植物的生长。此外, 世界各地的人们使用咖啡因的镇痛和刺激作用。由于对咖啡因技术应用的兴趣, 这种化合物的生物合成途径的研究已经发展。这些研究主要集中于了解调节咖啡因生物合成的生物化学和分子机制。体外组织培养已成为研究这种生物合成途径的有用系统。本文将介绍一步一步的协议, 以量化咖啡因和测量的转录水平的基因 (CCS1) 编码咖啡因合成酶 (CS) 的细胞悬浮液, 以及它的活动。
咖啡因是咖啡1属植物 biosynthesized 的次生代谢产物。这生物碱属于甲基黄嘌呤家庭并且被认为作为一个化工厂防御, 因为它可能采取行动反对病原体和草食动物的有害作用2,3。此外, 这种代谢物负责的刺激性能的咖啡饮料, 这是普遍消费全球4,5。由于其特性, 一些研究小组对咖啡因6,7的生物合成途径和分解代谢有兴趣。目前, 植物体外细胞/组织培养作为评价咖啡因积累的替代品, 在不同的生物和非生物学的战略8,9。
咖啡因的生物合成涉及 7-甲基黄嘌呤的水解释放从相应的核糖核苷, 其次是有序的n-methylations 在位置3和1。特定的s-甘基蛋氨酸 (SAM) 依赖 n-甲基 (NMT) 催化甲基化在位置 7, 而可可碱合酶 (TS) 和 CS 分别参与3和 1-methylations, 生产可可碱和咖啡因。对不同 NMTs 基因编码的研究, 使人们了解调节咖啡因生产的机制10,11。CS 具有n-甲基活性, 催化了咖啡因11生物合成途径的最后两个步骤。在咖啡树幼苗中, 光辐射可以增加 CS 的活性, 从而增加咖啡因的生物合成。最近, 我们发现, 在光照射下维持细胞悬浮液是评价产生非生物胁迫因子影响咖啡因生物合成途径的最佳条件.8。这些研究中获得的信息可能在代谢工程和系统生物学中的应用, 以最大限度地研究这种体外系统中的咖啡因生物合成途径。
鉴于获得合适的咖啡因生物合成模型的优点, 我们优化了咖啡因在细胞悬浮液中的提取条件. 还有可能制定一个有用的协议来研究酶活性, 以及评估咖啡咖啡因合酶 1 (CCS1) 编码这种酶的基因转录水平的方法学步骤。在此, 我们报告了一个协议, 以提取和量化的咖啡因在C.
我们在这里提出了评价咖啡因含量, CS 活动和转录水平的最佳条件在体外植物组织培养, 如细胞悬浮的C. 阿拉伯咖啡。以前的报告已经证实, 在光照射下维持细胞和在培养基中存在可可碱, 是提高咖啡因含量的合适参数, 从而可以评价咖啡因分离方法。采用反相高效液相色谱法 (RP)。目前, 很少有报道使用一种简单而快速的方法和经济优势来研究细胞悬浮液中的咖啡因生物合成。在这里, …
The authors have nothing to disclose.
我们实验室的工作由委员会 Ciencia y Tecnología (CONACyT 219893) 的赠款提供给 SMTHS。这项研究还得到了 CONACyT 和 Sistema 全国 Investigadores (4422) 授予 RJPK (37938 号) 的奖学金的支持。作者感谢 CIATEJ 在撰写本手稿时使用了它的安装。特别感谢 Víctor 博士的所有建议在分子生物学科和 Valentín 门多萨, 国际金融公司, UNAM 的设施在拍摄这篇文章。
Murashige & Skoog Basal salt mixture | PhytoTechnology Laboratories | M524 | Packge Size: 50 L Reagent (mg/L) Ammonium Nitrate (1650) Boric acid (6.2) Calcium chloride, anhydrous (322.2) Cobalt Chloride•H2O (0.025) Cupric Sulfate•5H2O (0.025) Na2EDTA•2H2O (37.26) Ferrous Sulfate•7H2O (27.8) Magnesium Sulfate, Anhydrous (180.7) Manganese Sulfate•H2O (16.9) Molybdic Acid (Sodium Salt)• 2H2O (0.25) Potassium Iodide (0.83) Potassium Nitrate (1900) Potassium Phosphate, Monobasic (170) Zinc Sulfate•7H2O (8.6) Supplemented with myo-inositol (100) thiamine (10) cysteine (25) sucrose (30000) 2,4-dichlorophenoxyacetic acid (3) 6-benzylamine purine (1) |
Caffeine | SIGMA | C0750-5G | STANDARD-5g |
Theobromine | SIGMA | T4500 | 20 g |
CAMAG TLC Scanner-4 | CAMAG | 27.62 | |
WinCATS Planar Chromatography Manager software | CAMAG | 1.4.10 | Software |
Isoamyl alcohol (24:1) | SIGMA | C-0549 | 500 mL |
Cyclohexane | JALMEX | C4375-13 | 1 L |
Acetone | J.T. BAKER | 900643 | 4 L |
Methanol | J.T. BAKER | 9093-03 | 4 L |
Chloroform | JALMEX | C-4425-15 | 3.5 L |
TLC silica gel 60 F254 | Merck | 1.05554.0001 | TLC plate |
β-mercaptoethanol | M6250 | SIGMA | 100 mL |
(+)-sodium L- ascorbate | A4034 | SIGMA | 100 g |
Trizma base | SIGMA | T6066 | 1 Kg |
Hydrochloric acid 36.5-38% | J.T. Baker | 9535-05 | 2.5 L |
Pierce BCA Protein Assay Kit | Thermo scientific | 232227 | Kit |
Methyl [3H]-S-adenosyl methionine | Perkin Elmer | NET155 | Specific activity of 15 Ci/mmol |
Liquid scintillation vials | SIGMA | Z253081 | |
Thermostatic bath/circulator | Cole Parmer | 60714 | |
Micro centrifugue tube | Eppendorf | Tube of 1.5 mL | |
Cryogenic vials | Heathrow Scientific | HS23202A | 2 mL |
Centrifuge 5804 | Eppendorf | 5804 000925 | |
Vortex | Thermolyne | LR 5947 | |
Porcelain mortar | Fisherbrand | FB961B | |
Filter paper | Whatman | Z274844 | Porosity medium |
Picofuge | Stratagene | 400550 | 2000 x g |
Analytical balance | AND | HR-120 | Model HR-120 |
Scintillation counter | Beckman Coulter | 6500 | |
Gel photodocumentation system | Bio-Rad | Chemic XRS | Model Chemic XRS |
Compact UV lamp | UVP | 95002112 | UVGL-25 |
Scienceware HDPE Buchner funnel | SIGMA | 2419907 | Type 37600 mixer |
TRIzol reagent | Thermo scientific | 15596-018 | 200 mL |
ReverdAid Reverse transcriptase | Thermo scientific | #EP0441 | 10000 U |
Oligo (dT)18 primer | Thermo scientific | #S0131 | 100 µM |
DNase I, RNase-free | Thermo scientific | #EN0525 | 1000 U |
Magnesium chloride | Thermo scientific | EN0525 | 1.25 mL |
Ethylenediaminetetraacetic acid | Thermo scientific | EN0525 | 1 mL |
dNTP mix | Thermo scientific | R0191 | R0191 |
SYBR Green qPCR Master Mix (2X) | Thermo scientific | K0251 | For 200 reactions of 25 µL |
PikoReal | Thermo scientific | 2.2 | Software |
Phenol, pH 8.0, equilibrated, Molecular Biology Grade, Ultrapure | USB | J75829 | 100 mL |
Isopropyl alcohol | Karal | 2040 | 1 L |
Ethyl alcohol | SIGMA | 64175 | 1 L |
Diethyl pyrocarbonate | SIGMA | D5758 | 100 mL |
Lab Rotator | LW Scientific | Mod. LW210 |