Imaging molecolare con matrix-assisted laser desorbimento/ionizzazione-based imaging spettrometria di massa (MALDI-IMS) consente la mappatura simultanea di più analiti in campioni biologici. Qui, presentiamo un protocollo per la rilevazione e visualizzazione della proteina β amiloide sui tessuti di cervello del morbo di Alzheimer e campioni di angiopatia amiloide cerebrale usando MALDI-IMS.
La neuropatologia del morbo di Alzheimer (annuncio) è caratterizzata dall’accumulo e aggregazione dei peptidi β amiloide (Aβ) nelle piastre extracellulare del cervello. I peptidi Aβ, composti di 40 aminoacidi, sono generati da proteine del precursore dell’amiloide (APP) di β – e γ-secretasi. Aβ è depositato non solo nel parenchima cerebrale, ma anche in leptomeningeal e pareti cerebrali del vaso, noti come angiopatia amiloide cerebrale (CAA). Mentre una varietà di peptidi Aβ sono stati identificati, la dettagliata di produzione e distribuzione di singoli peptidi Aβ in tessuti patologici dell’annuncio e CAA non sono stati completamente risolti. Qui, sviluppiamo un protocollo matrix-assisted laser desorbimento/ionizzazione-based imaging della spettrometria di massa (MALDI-IMS) sui tessuti di cervello umano autopsia per ottenere la mappatura completa della proteina. Per questo scopo, esemplari umani corticali sono stati ottenuti da Brain Bank presso il Tokyo Metropolitan Institute of Gerontology. Cryosections congelati vengono tagliati e trasferito a ossido di indio-stagno (ITO)-rivestito di lastre di vetro. Gli spettri vengono acquisiti utilizzando il sistema MALDI con una risoluzione spaziale fino a 20 µm. Acido sinapico (SA) è uniformemente depositato sulla diapositiva utilizzando uno spruzzatore manuale o automatica. Con l’attuali vantaggi tecnici del MALDI-IMS, un set di dati tipico di varie specie Aβ entro le stesse sezioni di cervelli sottoposti ad autopsia umani possono essere ottenuto senza sonde specifiche. Inoltre, ad alta risoluzione (20 µm) formazione immagine di un cervello dell’annuncio e severa CAA campione mostra chiaramente che Aβ1-36 a Aβ1-41 sono stati depositati nei vasi leptomeningeal, mentre Aβ1-42 e Aβ1-43 sono stati depositati nel parenchima cerebrale come placca senile (SP). È possibile adottare MALDI-IMS come un approccio standard in combinazione con le osservazioni cliniche, genetiche e patologiche nella comprensione della patologia dell’annuncio, CAA, e altre malattie neurologiche basano sulla strategia attuale.
Al fine di rendere la diagnosi e per capire la patogenesi di malattie neurodegenerative, precisa identificazione molecolare di depositi patologici è essenziale1. Nel corso della D.C., Aβ è prodotto per rendere SPs nel parenchima cerebrale e depositati nei vasi molto prima malattia inizio2,3,4,5,6. Mentre Aβ1-42 è il peptide predominante in SP di cervelli dell’annuncio, altre varianti Aβ, quali N-terminale o C-terminale troncato o modificato Aβs, vengono identificati anche interessato AD cervelli7,8,9, 10. Un quadro completo delle specie di ampia gamma di Aβ in cervelli umani, soprattutto con l’annuncio e cerebrale angiopatia amiloide (CAA)11, aiuterà gli scienziati capire produzione di Aβ, metabolismo e deposizione.
Come l’approccio classico di neuropatologia, immunohistochemistry (IHC) è stato il metodo più conclusivo per determinare la posizione di Aβs nel cervello tessuti12,13,14,15. In generale, IHC non può distinguere molecole quando parecchi epitopi coesistono simultaneamente. Al contrario, un’analisi basati sulla spettrometria di massa proteomica emergenti è un valido approccio soprattutto per analizzare una varietà di specie Aβ nei tessuti del cervello, che non possono essere differenziati con anticorpi16,17. L’analisi basati sulla spettrometria di massa convenzionale di cervello lisati e campioni immuno-precipitato non riesce a rilevare peptidi Aβ secondari e perde informazioni sulla distribuzione di Aβ nel tessuto cerebrale.
Nelle opere precedenti, visualizzando i depositi Aβ in cervelli di topo ha avuto successo utilizzando un modello animale transgenico di annuncio, ad esempio APP23. Tuttavia, questo processo deve ancora avanzamenti tecnici per confrontare IMS e IHC rispetto ad alta risoluzione e sensibilità18,19,20. Neuropatologia annuncio dovrebbe essere studiato su cervelli umani, e abbiamo utilizzato tecnologia MALDI-IMS su tessuti di cervello umano autopsia per ottenere la proteina completa mappatura21. Per questo scopo, abbiamo sviluppato un protocollo per un tipo avanzato di spettrometria di massa che ha vantaggi nella sua rapidità, sensibilità e riproducibilità.
Qui abbiamo dimostrato un protocollo dettagliato e risultati della visualizzazione di Aβ e sue isoforme da diversi cervelli sottoposti ad autopsia con l’annuncio e CAA con MALDI-IMS. Il profilo di deposizione di Aβs drasticamente è stato cambiato da Aβ1-42 a sue variazioni di N – e C-terminale. Aβ1-41 è stato prima identificato e visualizzate in cervelli umani con il protocollo attuale e più ulteriormente è stata convalidata con IHC21. Considerando che la morfologia di Aβ depositato da IMS con un’analisi ad alta risoluzione (20 μm) dovrà essere in buon accordo con IHC, IMS e IHC ugualmente contribuire a distinguere i depositi Aβ dalla loro posizione e il contenuto di proteine, così come dalla loro morfologia. Come l’intero esperimento descritto qui è stato condotto nella corteccia occipitale, studiando la localizzazione di diverse specie di beta-amiloide in tutte le regioni del cervello sarà generalizzato con futuri esperimenti utilizzando il protocollo corrente.
Fasi critiche all’interno del protocollo sono passaggi di preparazione di tessuto per ottenere un efficace ionizzazione di aggregati proteici nei tessuti del cervello umano. Uno strato di matrice è necessaria per assorbire l’energia del laser ed indurre la ionizzazione degli analiti e desorbimento. In questo processo, una sezione intera del tessuto è rivestita in modo omogeneo con piccoli cristalli. Cocrystallization omogenea dell’analita con la matrice è cruciale per l’imaging ad alta sensibilità e priva di artefatti. Ciascuno dei tre spray metodi ha i suoi vantaggi. Verniciatura a spruzzo manuale è uno dei metodi più frequentemente usati. L’aerografo è conveniente; Tuttavia, esso richiede operazione abile. Come precisa e riproducibile tecnica sperimentale è essenziale, utilizzando uno spruzzatore ad ultrasuoni e/o uno spruzzatore automatico come descritto nei protocolli correnti è raccomandato. Per quanto riguarda un spruzzatore ad ultrasuoni, esso non sarà non essere influenzato dall’umidità e la temperatura della stanza in perché esso viene spruzzato in una camera. Nel frattempo, con uno spruzzatore automatico, risoluzione spaziale relativamente conservata con buona riproducibilità è ottenuta. In genere, la risoluzione spaziale ottenuta con l’aumento di tre metodi nell’ordine 1) aerografo, dispositivo 2) automatico e spruzzatore 3) ad ultrasuoni.
La cosa più importante, questo protocollo originalmente è stato generato per rilevare e visualizzare Aβs nei campioni di cervello umano sottoposto ad autopsia. La visualizzazione di Aβs con MALDI-IMS per topi APP23, che viene generata come un modello animale dell’annuncio basato sulla mutazione svedese-tipo di APP umana, è stata segnalata prima di altri utenti con un esistente metodo18,19. Tuttavia, l’ex protocollo applicato a APP23 non era sufficiente a visualizzare Aβ nella sua risoluzione laterale e la sensibilità. Opere precedenti discusso che alte concentrazioni di Aβ all’esterno del contorno di tessuto sono chiaramente artefatti in APP23 imaging con loro protocollo18,19. Ciò significa che il cosiddetto ‘blur’ tra real SPs e IMS immagini a causa della fase di estrazione di matrice era inevitabile con formazione immagine MALDI-tipo. Tuttavia, nel protocollo attuale, la sfocatura è sparito ed ogni spettro rappresentato ogni singolo SP nel parenchima del cervello.
Come mostrato qui, possiamo rintracciare Aβ1-41 per la prima volta in annuncio e cervelli di CAA con MALDI-IMS, nonché con IHC, con un anticorpo specifico dalla nostra generazione21. Secondo il modello di elaborazione di Aβ, Aβ1-38 deriva da Aβ1-45 via Aβ1-42, mentre Aβ1-41 deriva da Aβ1-45 di γ-secretasi graduale scissione27,28,29,30,31 . Ciò significa che l’attuale protocollo supporta questo modello. Per quanto riguarda le limitazioni di questa tecnica, dobbiamo considerare l’eterogeneità dei campioni dal cervello umano autopsia. La fase più critica, in un certo senso, è quello di valutare qualificato autopsia tessuto cerebrale con prova di etica. Con l’attuale protocollo su quei tessuti di cervello autopsia qualificato, MALDI-IMS individualmente può tenere traccia l’intera distribuzione delle molecole complesse avendo più modifiche, nonché a fattori sconosciuti che regolano la patogenesi dell’annuncio, che devono ancora essere definito. Inoltre, nella comprensione della patogenesi globale di vari neuropatologia in cervelli umani invecchiati, deve essere fattibile adottare MALDI-IMS come un approccio standard, in combinazione con le osservazioni cliniche, genetiche e patologiche nelle malattie neurologiche .
Un altro passo fondamentale di MALDI-IMS è il processo di data mining da set di dati ottenuti, che è sempre molto tempo. Estrazione manuale dei dati di ogni distribuzione di picco richiede agli utenti di fare clic su ogni immagine e cercare di distribuzioni che possono correlare alla morfologia del campione analizzato. Segmentazione automatica spaziale può essere utilizzato come il primo passo di data mining, fornendo una panoramica del set di dati e che consente la rapida identificazione di caratteristiche prominenti. In questo approccio, statisticamente sono determinate somiglianze tra spettri di una determinata regione e spettri simili sono raggruppati in un cluster. Tutti i pixel hanno colori diversi secondo la loro assegnazione di cluster (Figura 5). Nello studio presente annuncio/CAA, l’area di interesse è lo spazio delle deposizioni di Aβ nella placca parenchimatica e le strutture vascolari subaracnoidea e parenchimale. Le due cime distintive che sono stati ulteriormente convalidate con IHC erano i valori m/z da Aβ1-40 e Aβ1-4221. Così, è facile trovare colocalized m/z con Aβ1-40 e Aβ1-42, che era già Aβ troncato con annotazioni a N – e C-terminale, come pure i peptidi sconosciuti, per ulteriori analisi.
Weller e colleghi hanno riferito che Aβ si accumula nelle pareti del vaso, più nei dintorni di arterie che intorno vene21. Inoltre, è stato proposto che il fluido interstiziale (ISF) include Aβs escreto dal parenchima cerebrale per il linfonodo tramite un perivascolare drenaggio via22,23,24,25 ,26. Il protocollo corrente per generare una mappa di segmentazione basata su un set di dati di MALDI-IMS a una risoluzione di µm 20 supporta la possibile esistenza di vie di drenaggio perivascolare del cervello (Figura 5), che contribuiscono significativamente alla CAA in annuncio21 , 32. Inoltre, possiamo scoprire le proteine marker colocalized con placca e subaracnoidea vasculature calcolando la correlazione di ogni valori m/z. Nella comprensione della patogenesi globale di vari neuropatologia in cervelli umani invecchiati, deve essere fattibile adottare MALDI-IMS come un approccio potente in combinazione con dati IHC stabiliti di clinici, genetici e osservazioni patologiche in neurologiche malattie.
The authors have nothing to disclose.
Questo lavoro è stato in parte sostenuto dalla sovvenzione per la ricerca scientifica in settori innovativi (cervello proteina invecchiamento e demenza controllo 26117004; M.I. e T.M.). Questa ricerca era parzialmente supportata dal programma di ricerca strategico per le scienze del cervello dall’Agenzia giapponese per la ricerca medica e sviluppo (AMED). Tutti gli esperimenti sono stati condotti in conformità con le linee guida ARRIVE.
Cryostat | Leica Microsystems, Wetzlar, Germany | CM1950 | |
Indium tin oxide (ITO)-coated microscope glass slide | Bruker Daltonics | #237001 | |
Blade (disposable) | Leica Microsystems, Wetzlar, Germany | #117394 | |
O.C.T. Compound | Leica Microsystems, Wetzlar, Germany | FSC 22 Blue | |
Scanner | EPSON | GT-980 | |
Air-Brush | GSI Creos | PS274 | |
Compressor | MRHOBBY | Mr.Linear compressor L5 | |
Ultrasonic sprayer | Bruker Daltonics | ImagePrep | |
Automatic sprayer | HTX Technologies | TM Sprayer | |
Confocal-laser-scanning-microscope | Carl Zeiss Inc. | LSM 700 | |
Ultra high speed MALDI instrument | Bruker Daltonics | rapifleX MALDI Tissuetyper | |
MALDI control software | Bruker Daltonics | FlexControl 3.8 | |
Data analysis software | Bruker Daltonics | FlexImaging 5.0 | |
Molecular histology software | SCiLS, Bremen, Germany | SciLS Lab 2016a | |
Statistical software | SCiLS, Bremen, Germany | SciLS Lab 2016a | |
Sinapinic acid (SA) | Nacalai tesque | 30494-91 | |
Alpha-Cyano-4-hydroxyl-cinnamic acid (CHCA) | Wako | 037-19261 | |
Calibration standard | Bruker Daltonics | ||
Biotinylated anti-mouse IgG antibodies | Vector Laboratories, Inc., Burlingame, CA | ||
Biotinylated anti-rabbit IgG antibodies | Vector Laboratories, Inc., Burlingame, CA | ||
Avidin and biotinylated HRP complex. | Vector Laboratories, Inc., Burlingame, CA | Vectastain Elite ABC kit | |
3,3-diaminobenzidine (DAB) | Vector Laboratories, Inc., Burlingame, CA | Vectastain Elite ABC kit |