Moleculaire beeldvorming met laser matrix-bijgewoonde desorptie/ionisatie gebaseerde imaging massaspectrometrie (MALDI-IMS) kan de gelijktijdige koppeling van meerdere analyten in biologische monsters. Hier presenteren we een protocol voor de detectie en de visualisatie van amyloïde β eiwit op weefsels van de hersenen van Alzheimer en Cerebrale amyloïde angiopathie monsters met behulp van MALDI-IMS.
Het neuropathologie de ziekte van Alzheimer (AD) wordt gekenmerkt door de accumulatie en de aggregatie van amyloïde β (Aβ) peptiden in extracellulaire plaques van de hersenen. De Aβ peptiden, samengesteld uit 40 aminozuren, worden gegenereerd uit amyloïde precursor-eiwit (APP) door de β – en γ-secretases. Aβ wordt gestort, niet alleen in cerebrale parenchym, maar ook in leptomeningeale en cerebrale wanden, bekend als Cerebrale amyloïde angiopathie (CAA). Terwijl een aantal Aβ peptiden werden geïdentificeerd, de gedetailleerde productie en distributie van individuele Aβ peptiden in pathologische weefsels van AD en CAA niet volledig zijn opgelost. Hier ontwikkelen wij een protocol van laser matrix-bijgewoonde desorptie/ionisatie gebaseerde imaging massaspectrometrie (MALDI-IMS) op menselijke autopsie hersenen weefsels te verkrijgen van uitgebreide eiwit toewijzing. Voor dit doel, werden menselijke corticale specimens verkregen van de Bank van de hersenen bij de Tokyo Metropolitan Instituut voor gerontologie. Bevroren cryosecties zijn gesneden en overgedragen aan indium-tin-oxide (ITO)-gecoat glas dia’s. Spectra worden verkregen met behulp van de MALDI-systeem met een ruimtelijke resolutie tot 20 µm. Sinapinic zuur (SA) is gelijkmatig afgezet op de dia met behulp van een automatische of een handmatige sproeier. Met de huidige technische voordelen van MALDI-IMS, kan een typische gegevensset soorten verschillende Aβ binnen dezelfde baanvakken van menselijke autopsie hersenen worden verkregen zonder specifieke sondes. Bovendien, met een hoge resolutie (20 µm) beeldvorming van een AD-hersenen en ernstige CAA voorbeeld toont duidelijk aan dat Aβ1-36 tot en met Aβ1-41 werden gestort van leptomeningeale schepen, terwijl Aβ1-42 en Aβ1-43 werden afgezet in cerebrale parenchym als seniele plaque (SP). Het is haalbaar te nemen MALDI-IMS als een standaardaanpak in combinatie met de klinische genetische en pathologische opmerkingen in het begrip van de pathologie van AD, CAA, en andere neurologische aandoeningen gebaseerd op de huidige strategie.
Om de diagnose te kunnen en te krijgen in de pathogenese van neurodegeneratieve aandoeningen, is exacte moleculaire identificatie van pathologische deposito’s essentieel1. In de loop van AD, Aβ is geproduceerd zodat SPs in de cerebrale parenchym en gedeponeerd in schepen lang voordat de ziekte begin2,3,4,5,6. Terwijl Aβ1-42 de overheersende peptide in de SP van AD hersenen is, andere Aβ varianten, zoals N-terminal of C-terminal afgekapt of Aβs bewerkt, worden ook geïdentificeerd in getroffen AD hersenen7,8,9, 10. Een volledig beeld van de brede waaier van Aβ soorten in de menselijke hersenen, met name met AD en Cerebrale amyloïde angiopathie (CAA)11, zal helpen wetenschappers begrijpen Aβ productie, metabolisme en depositie.
Als de klassieke benadering van Neuropathologie, is immunohistochemistry (IHC) geweest de meest overtuigende methode om te bepalen van de locatie van Aβs in de hersenen weefsels12,13,14,15. In het algemeen, IHC kan geen onderscheid maken tussen moleculen als verschillende epitopen gelijktijdig naast elkaar bestaan. Daarentegen is een opkomende massa spectrometrie gebaseerde Proteoom-analyse een waardevolle benadering vooral voor het analyseren van een aantal Aβ soorten in de weefsels van de hersenen, die niet kunnen worden gedifferentieerd met antilichamen16,17. De conventionele massa spectrometrie gebaseerde analyse van hersenen lysates en immuno-neergeslagen monsters herkent kleine Aβ peptiden en verliest van informatie van de distributie van Aβ in het hersenweefsel.
In eerdere werken, is visualiseren Aβ deposito’s in muis hersenen succesvol geweest met behulp van een transgene diermodel van AD, zoals APP23. Dit proces moet echter nog steeds technische vooruitgang IMS en IHC vergelijken met betrekking tot de resolutie en gevoeligheid18,19,20. AD Neuropathologie moet worden onderzocht op menselijke hersenen, en we gewend MALDI-IMS technologie op menselijke autopsie hersenen weefsels uitgebreide eiwit toewijzing21te verkrijgen. Voor dit doel ontwikkelden we een protocol voor een geavanceerde soort massaspectrometrie dat voordelen in snelheid, gevoeligheid, en reproduceerbaarheid heeft.
Hier wij een gedetailleerd protocol en de resultaten van de visualisatie van Aβ en haar isoforms blijkt uit verschillende autopsied hersenen met AD en CAA met MALDI-IMS. Het profiel van de afzetting van Aβs werd het drastisch veranderd van Aβ1-42 naar de N – en C-terminaal variaties. Aβ1-41 werd voor het eerst geïdentificeerd en gevisualiseerd in menselijke hersenen met het huidige protocol en verder werd gevalideerd met IHC21. Gezien het feit dat de morfologie van gedeponeerde Aβ door IMS met een hoge resolutie analyse (20 μm) moet in goede overeenkomst met IHC, IMS en IHC even dragen bij aan onderscheidende Aβ deposito’s door hun locatie en eiwitgehalten, alsmede door hun morfologie. Als het hele experiment hier beschreven werd uitgevoerd in de occipital cortex, zal het bestuderen van de lokalisatie van de verschillende soorten van amyloid-bèta in alle regio’s van de hersenen worden veralgemeend met toekomstige experimenten met behulp van het huidige protocol.
Kritische stappen binnen het protocol zijn weefsel voorbereiding stappen voor het verkrijgen van een effectieve behandeling door ionisering van geaggregeerde eiwitten in het menselijk brein weefsels. Een matrix-laag moet de energie van de laser absorberen en veroorzaken desorptie en ionisatie van analyten. In dit proces, is een hele weefselsectie homogeen bedekt met kleine kristallen. Homogene cocrystallization van de analyt met de matrix is cruciaal voor hoge gevoeligheid en artefact-vrije imaging. Elk van de drie spray methoden heeft zijn eigen voordelen. Handmatige spray coating is een van de meest gebruikte methoden. Een airbrush is handig; Nochtans, vereist het bekwame bediening. Nauwkeurige en reproduceerbare experimentele techniek is essentieel, wordt met een ultrasone sproeier en/of een automatische sproeier zoals beschreven in de huidige protocollen aanbevolen. Met betrekking tot een ultrasone sproeier, zal het niet worden beïnvloed door de vochtigheid en de temperatuur van de kamer omdat het is gespoten in een kamer. Ondertussen, met een automatische sproeier, relatief bewaarde ruimtelijke resolutie met goede reproduceerbaarheid wordt verkregen. In het algemeen, de ruimtelijke resolutie verkregen met de verhoging van de drie methoden in de volgorde 1) airbrush, 2) automatisch apparaat, en 3) ultrasone sproeier.
Dit protocol was bovenal oorspronkelijk zijn gegenereerd voor het opsporen en visualiseren van Aβs in autopsie hersenen monsters. De visualisatie van Aβs met MALDI-IMS voor APP23 muizen, die wordt gegenereerd als een dierlijk model van AD op basis van de Zweeds-type mutatie van menselijke APP, heeft eerder door anderen is gerapporteerd met een bestaande methode18,19. Het voormalige protocol toegepast op APP23 was echter niet voldoende om te visualiseren Aβ in zijn laterale resolutie en gevoeligheid. Eerdere werken besproken dat hoge Aβ concentraties buiten de grens van het weefsel zijn duidelijk artefacten in APP23 imaging met hun protocol18,19. Dat betekent dat de zogenaamde ‘vervagen’ tussen echte SPs en IMS beelden als gevolg van de matrix extractie stap was onvermijdelijk met MALDI-achtige beeldvorming. Echter, in het huidige protocol, de vervaging verdwenen en elke spectrum vertegenwoordigd elke één SP in de hersenen parenchym.
Zoals u hier ziet, wij voor de eerste keer in AD Aβ1-41 kunt traceren en CAA hersenen met MALDI-IMS, alsook met IHC, met een specifiek antilichaam door onze eigen generatie21. Volgens de Aβ verwerkingsmodel, Aβ1-38 is afgeleid van Aβ1-45 via Aβ1-42, terwijl Aβ1-41 is afgeleid van Aβ1-45 door γ-secretase stapsgewijze decollete27,28,29,30,31 . Dit betekent dat het huidige protocol dit model ondersteunt. Wat betreft de beperkingen van deze techniek, moeten we de heterogeniteit van de monsters van de autopsie van de menselijke hersenen. De meest kritische stap, in zekere zin is te beoordelen van gekwalificeerde autopsie hersenweefsel met ethische bewijs. Met het huidige protocol betreffende deze gekwalificeerde autopsie hersenen weefsels, kunt MALDI-IMS afzonderlijk bijhouden de hele distributie van de complexe moleculen hebben meerdere wijzigingen, evenals onbekende factor(en) regulering van de pathogenese van AD, die nog moeten worden gedefinieerd. Bovendien inzicht in de algehele pathogenese van verschillende Neuropathologie in leeftijd menselijke hersenen, moet het haalbaar te nemen MALDI-IMS als een standaard aanpak, in combinatie met de klinische genetische en pathologische opmerkingen in neurologische aandoeningen .
Een andere belangrijke stap van MALDI-IMS is het proces van de mijnbouw gegevens uit de verkregen data set, is altijd tijdrovend. Handmatige datamining van elke piek-distributie vereist de gebruikers doorklikken naar elke afbeelding en kijk voor distributies die aan de morfologie van het geanalyseerde monster correleren kunnen. Automatische ruimtelijke segmentatie kan worden gebruikt als de eerste stap voor data mining, een overzicht van de gegevensset te verstrekken en waardoor de snelle detectie van opvallende kenmerken. In deze benadering gelijkenissen tussen spectra van een bepaald gebied zijn statistisch bepaald en gelijkaardige spectra zijn gegroepeerd in één cluster. Alle pixels zijn kleurgecodeerde volgens hun cluster toewijzing (Figuur 5). In de huidige AD/CAA studie is het gebied van belang de ruimte van Aβ afzettingen in de parenchymal plaque en de subarachnoïdale en parenchymal vasculaire structuren. De twee opvallende pieken die werden verder gevalideerd met IHC waren de m/z-waarden uit de Aβ1-40 en Aβ1-4221. Het is dus gemakkelijk te vinden colocalized m/z met Aβ1-40 en Aβ1-42, die al geannoteerde aan de N – en C-terminaal afgeknotte Aβ, evenals onbekende peptides, voor verdere analyse was.
Weller en collega’s hebben gemeld dat Aβ in wanden, meer rond slagaders accumuleert dan rond veins21. Bovendien, er is voorgesteld dat de interstitiële vloeistof (ISF) van de cerebrale parenchym uitgescheiden naar de lymfeklier via een gerelateerde drainage traject22,23,24,25 Aβs bevat ,26. Het huidige protocol voor het genereren van een kaart van de segmentatie op basis van een MALDI-IMS-gegevensverzameling met een 20 µm resolutie ondersteunt het mogelijke bestaan van gerelateerde drainage trajecten van de hersenen (Figuur 5), die aanzienlijk tot de CAA in AD21 bijdragen , 32. Voorts wij marker eiwitten colocalized met plaque en subarachnoïdale therapieën door de berekening van de correlatie van elke m/z-waarden kunt ontdekken. Inzicht in de algehele pathogenese van verschillende Neuropathologie in leeftijd menselijke hersenen, moet het haalbaar te nemen MALDI-IMS als een krachtige aanpak in combinatie met gevestigde IHC gegevens van klinische, genetische, en pathologische observaties in neurologische ziekten.
The authors have nothing to disclose.
Dit werk werd gedeeltelijk ondersteund door de Grant-in-Aid voor wetenschappelijkonderzoek op innovatieve gebieden (hersenen eiwitten veroudering en dementie controle 26117004; mi en T.M.). Dit onderzoek werd gedeeltelijk ondersteund door het strategische onderzoeksprogramma voor hersenen Wetenschappen van het Japan Agency voor medisch onderzoek en ontwikkeling (AMED). Alle experimenten werden uitgevoerd in overeenstemming met de richtsnoeren voor het aankomen.
Cryostat | Leica Microsystems, Wetzlar, Germany | CM1950 | |
Indium tin oxide (ITO)-coated microscope glass slide | Bruker Daltonics | #237001 | |
Blade (disposable) | Leica Microsystems, Wetzlar, Germany | #117394 | |
O.C.T. Compound | Leica Microsystems, Wetzlar, Germany | FSC 22 Blue | |
Scanner | EPSON | GT-980 | |
Air-Brush | GSI Creos | PS274 | |
Compressor | MRHOBBY | Mr.Linear compressor L5 | |
Ultrasonic sprayer | Bruker Daltonics | ImagePrep | |
Automatic sprayer | HTX Technologies | TM Sprayer | |
Confocal-laser-scanning-microscope | Carl Zeiss Inc. | LSM 700 | |
Ultra high speed MALDI instrument | Bruker Daltonics | rapifleX MALDI Tissuetyper | |
MALDI control software | Bruker Daltonics | FlexControl 3.8 | |
Data analysis software | Bruker Daltonics | FlexImaging 5.0 | |
Molecular histology software | SCiLS, Bremen, Germany | SciLS Lab 2016a | |
Statistical software | SCiLS, Bremen, Germany | SciLS Lab 2016a | |
Sinapinic acid (SA) | Nacalai tesque | 30494-91 | |
Alpha-Cyano-4-hydroxyl-cinnamic acid (CHCA) | Wako | 037-19261 | |
Calibration standard | Bruker Daltonics | ||
Biotinylated anti-mouse IgG antibodies | Vector Laboratories, Inc., Burlingame, CA | ||
Biotinylated anti-rabbit IgG antibodies | Vector Laboratories, Inc., Burlingame, CA | ||
Avidin and biotinylated HRP complex. | Vector Laboratories, Inc., Burlingame, CA | Vectastain Elite ABC kit | |
3,3-diaminobenzidine (DAB) | Vector Laboratories, Inc., Burlingame, CA | Vectastain Elite ABC kit |