Giant vesicles containing highly packed micrometer-sized components are useful cell models. The water-in-oil emulsion centrifugation method is a simple, powerful tool for the preparation of giant vesicles with encapsulated materials.
La biologie constructive et l'approche synthétique de la biologie à la création de la vie artificielle impliquent l'ensemble de la base de matériaux biologiques ou non biologiques. Ces approches ont reçu une attention considérable dans la recherche sur la frontière entre la matière vivante et non vivante et ont été utilisées pour construire des cellules artificielles au cours des deux dernières décennies. En particulier, Giant Vésicules (GV) ont souvent été utilisées comme membranes cellulaires artificiels. Dans cet article, nous décrivons la préparation de microsphères encapsulant GV très emballés comme un modèle de cellules contenant des biomolécules hautement condensés. GV ont été préparées au moyen d'un procédé simple eau-dans-huile par centrifugation. En particulier, un homogénéisateur a été utilisé pour émulsionner une solution aqueuse contenant les substances à encapsuler et une huile contenant des phospholipides dissous et l'émulsion résultante a été soigneusement en couche sur la surface d'une autre solution aqueuse. Le système en couches a été ensuite centrifugé to générer les GVS. Cette puissante méthode a été utilisée pour encapsuler des matériaux allant de petites molécules à des microsphères.
L'approche constructive, ou synthétique, la biologie est une avenue fascinante pour explorer la frontière entre vie et matière inerte. Parce que la cellule est l'unité minimale requise pour la vie comme nous l'entendons actuellement il, plusieurs chercheurs ont tenté de construire des cellules artificielles de produits chimiques simples, bien comprises afin que les phénomènes qui se produisent dans de telles cellules artificielles peuvent être étudiées, avec l'objectif ultime de élucidant les origines de la vie et l' étude des fonctions fondamentales de cellules vivantes 1, 2, 3. En particulier, les vésicules 4, qui sont des microcompartiments sphériques constituées de molécules amphiphiles et peuvent encapsuler des molécules biologiques telles que les protéines 5, 6 et 7 de l' ADN, 8, 9,lass = "xref"> 10, ont souvent été utilisés comme modèles de membranes biologiques.
Les vésicules peuvent être classés comme faible (définie comme ayant un diamètre <100 nm), de grande taille (diamètre <1 um), ou géant (diamètre> 1 um). vésicules géantes (GVS) ont été largement étudiés car ils sont semblables à des cellules vivantes dans la taille, la forme et la structure. En raison de la taille du VG, des changements morphologiques dans les membranes GV peuvent être facilement observées en temps réel sous un microscope optique.
Plusieurs méthodes de préparation ont été rapportés GVs 11, y compris le procédé d'hydratation 12, 13, le procédé de congélation-décongélation 14, le procédé de électroformation 15, 16, et le procédé de dispositif fluidique 17, 18. Cependant les protéines, et d'autres encapsulant MACROMolecules de GVS à des concentrations élevées au moyen de ces méthodes est difficile. En particulier, il est extrêmement difficile pour encapsuler des matières biologiques en quantité suffisante (20-30% en volume) pour imiter l'environnement encombré l' intérieur des cellules 19, 20. Pour former instantanément GV, Weitz et ses collègues a établi une eau-dans-huile (w / o) Méthode émulsion de centrifugation 21, 22. Cette méthode présente cinq caractéristiques importantes. Premièrement, parce que les GV préparés par ce procédé ont une faible lamellarité 23, 24, leurs membranes sont si minces qu'ils peuvent être déformés facilement. GV membrane déformation induite par FtsZ (une protéine de division cellulaire bactérienne), la tubuline, et d' autres macromolécules a été étudié 25, 26, 27, 28, et nous avons observé polyhe déformation dron comme des membranes GV induites par encapsulation des microsphères 29, 30. Deuxièmement, les protéines membranaires peuvent être insérées dans la membrane vésiculaire par ce procédé, bien qu'avec difficulté 31. Par exemple, le groupe Yomo a utilisé cette méthode pour étudier la synthèse in vitro et l' activité de formation de pores de la protéine membranaire α-hémolysine 32. Troisièmement, il est possible de générer GVs asymétriques dans lesquels les constituants lipidiques des valves internes et externes sont différents 22. Par exemple, Whittenton et al. GV asymétriques générées avec des lipides cationiques dans le feuillet interne pour encapsuler des polynucleotides chargés négativement, et avec des lipides neutres sur le feuillet externe pour diminuer la toxicité et l' absorption cellulaire non spécifique 33. Quatrièmement, la fraction de la concentration et le volume de substances à l'intérieur des GV peut être relativement élevés = "xref"> 28, 34. En cinquième lieu , plusieurs types de matériaux peuvent être encapsulées 35. Par exemple, Nishimura et al. encapsulé un système de transcription-traduction in vitro dans VG et utilisé le système pour exprimer la protéine fluorescente verte (GFP) dans le GV 36. Ces cinq caractéristiques font émulsion w / o centrifugation une méthode indispensable pour générer GVs mimant les cellules.
Dans des travaux antérieurs, GV générés par centrifugation ont été recueillies au moyen d'une seringue munie d'une 16 G aiguille en acier inoxydable longue contenant une partie de la solution aqueuse finale 22. Dans les mains des techniciens inexpérimentés, cette méthode de collecte pourrait facilement entraîner la contamination du GV avec de l'huile. Dans cette étude, nous avons utilisé le w / o protocole émulsion de centrifugation développée par le groupe Yomo 23, 37,dans lequel GVs précipités sont recueillis par un trou ouvert au fond du tube de centrifugeuse dans lequel ils sont préparés. Nous avons préparé GV encapsulant 1,0 um microsphères, qui sont similaires en taille aux organites intracellulaires. L'utilisation de microsphères nous a permis d'estimer leur concentration en calculant leur fraction volumique. Mise en place d'une méthode pour la préparation de GV dans lequel les matériaux sont denses est une étape importante pour la création de cellules artificielles. Pour confirmer l'utilité de notre protocole pour différents types de matériaux intérieurs, nous avons aussi démontré que la GFP et soluble dans l'eau à petite molécule fluorescente (uranine) peuvent être encapsulés dans les GVS.
Les gravités spécifiques du milieu de dispersion aqueux interne et externe de la solution aqueuse doit être choisie avec soin. Pour l'émulsion w / o à précipiter dans la solution aqueuse externe au cours de la centrifugation, la densité du milieu aqueux de dispersion interne doit être supérieure à celle de la solution aqueuse externe. Nous avons essayé de préparer GV en utilisant des solutions internes et externes sans sucres, mais nous avons obtenu aucun GV dans ces conditions, parce que la solution aqueuse interne n'a pas eu assez de masse pour traverser l'interférence entre les deux phases. S'il y a une grande différence de pression osmotique entre les deux solutions, GV qui précipitent dans la solution aqueuse externe peut rétrécir ou rupture. Par conséquent, la pression osmotique à l'intérieur et à l'extérieur des GV doivent être égaux. Pour ce faire, nous avons utilisé le saccharose comme soluté dans la dispersion aqueuse interne et du glucose en tant que soluté dans la solution aqueuse externe; les deux sucres étaient présents à la même concentration. Les deux selss = "xref"> 22 et de sucre 23, 35, 38 ont été utilisées à de telles fins, mais le sucre est habituellement utilisé parce qu'il est moins toxique et plus soluble que le sel. Cependant, si trop de sucre est ajouté, les GV peuvent entrer en contact avec le fond du verre de couverture et de l'effondrement. Il existe plusieurs stratégies pour éviter ceci. Une stratégie consiste à réduire la différence de gravité spécifique entre les solutions aqueuses interne et externe de sorte que les GVs précipitent dans des conditions douces; Plus précisément, le surnageant de la dispersion GV précipité peut être échangée avec une solution identique à la solution aqueuse interne afin de réduire la possibilité de rupture vésiculaire par adhérence à la vitre de protection en raison de la flottabilité. Une autre stratégie consiste à revêtir préalablement les deux verres de couverture avec un mince film de lipide 29.
Une préparation appropriée et l'incubation de l'émulsionimportant. On a utilisé la paraffine liquide pour préparer la solution d'huile. Huile 26, 31, dodécane 21, 33 et squalane 33 minéraux, 39 sont également souvent utilisés comme huiles de solvant. Du fait que ces matériaux varient en masse volumique, la viscosité et la tension superficielle, des nombres différents de vésicules se forment même lorsque les mêmes conditions de centrifugation , on utilise 33. Pour obtenir des vésicules ayant les propriétés cibles, il est essentiel d'optimiser les densités et viscosités des solutions aqueuses interne et externe spécifiques ainsi que la préparation acceleration.For centrifuge de la phase huileuse, l'incubation doit avoir lieu à température élevée et dans un endroit sec environnement, comme un incubateur ou un déshydrateur. Dans cette étude, nous avons chauffé la paraffine liquide à 80 ° C pour dissoudre complètement le lipide molecules.In outre, l'émulsion devraitêtre préparé qu'en cas de besoin et doit être immédiatement soumis à une centrifugation, car il est instable juste après sa préparation et w / o gouttelettes fusionnent facilement les unes aux autres. L'émulsion peut être préparée en grandes quantités par sonication, tourbillonnement, ou les écoutes. Cependant, l'utilisation d'un homogénéisateur permet la préparation rapide de grandes quantités d'émulsion et de faciliter l'émulsification dans l'huile avec une viscosité élevée. Il est également important que l'émulsion soit stratifiée sur la solution aqueuse externe en douceur et rapidement, puis refroidi à 4 ° C. Pour raccourcir le temps entre l'émulsification et la centrifugation, le système de solution aqueuse d'huile externe peut être prérefroidi avant que l'émulsion est stratifiée sur elle, et l'ensemble du système peut ensuite être centrifugé immediately.If le trouble blanc apparaît plus rapidement ou plus lentement que d'habitude, la mécanique homogénéisateur doit être soigneusement rincé pour éliminer les détergents de nettoyage. En outre, avant émulsification, la solution d'huile, d'une solution aqueuse interne, et d'émulsifiant doit être returned à la température ambiante.
accélération centrifuge appropriée est également importante. Par centrifugation à 18.000 x g, nous avons été en mesure de préparer GV avec un seul matériau intérieur encapsulé à une concentration élevée. Lors de l'encapsulation de matériaux multiples est nécessaire, il est préférable de réduire l'accélération centrifuge. Par exemple, un système d'assemblage d'actine sept composés d' encapsulation a été réalisé avec une centrifugation à au moins 350 x g 35. Dans les cas dans lesquels la centrifugation est indésirable, GVs peut être obtenue en ajustant la concentration en sucre ou en précipitant l'émulsion sous l'influence de sa propre masse 38, 40, 41.
La méthode décrite ici présente deux limites importantes. L'une est que les molécules d'huile (de la paraffine, dans ce cas) peut être solubilisés dans la membrane GV, comme cela a été souligné par le Weitz groupe 21. Lors de l'insertion d'une protéine de membrane dans la membrane GV est souhaitée, les effets des molécules d'huile coexistantes sur la protéine doivent être considérées. L'autre limite est la variation de la fraction volumique. Dans cette étude, nous avons estimé que les fractions de volume de microsphères dans les GV variaient 4-30% en volume; les fractions de volume ne sont pas identiques à la fraction volumique de la solution aqueuse interne utilisée pour la préparation GV. Bien que nous étions capables d'encapsuler des microsphères dans des GV pour une fraction volumique suffisamment élevée pour que l'observation au microscope, cette méthode ne convient pas pour la préparation de VG avec une distribution de la fraction volumique uniforme. Il a été rapporté que la distribution des fractions de volume de microsphères change lors de la centrifugation 34.
Le procédé de centrifugation émulsion w / o est couramment utilisé pour la formation de GV contenant des matières encapsulées. Cependant, peu de rapports ont décrit la préparation des GV encapsulant matériaux micrométriques 34, 42. Récemment, des robots moléculaires contenant un dispositif d'ADN encapsulé ou un dispositif moléculaire ont été construits 43, 44. GV avec compartiments sont le premier choix pour ces types d'applications; Par conséquent, les techniques, comme la nôtre, qui pourraient être utilisées pour encapsuler des microsphères magnétiques et des microsphères avec diverses fonctionnalisation de surface peuvent être censés être utiles 44.
The authors have nothing to disclose.
Nous remercions Tomoko Yamaguchi pour dessiner l'image schéma de la figure 1. Cette étude a été soutenue par le projet Okazaki ORION de l'Institut Okazaki for Integrative Bioscience des theNational Instituts des Sciences naturelles (NINS); par le Projet Centre Astrobiology (pas AB281010.) de NINS; par un Grant-in-Aid pour la recherche scientifique sur les zones innovantes (de commande dynamique des systèmes biomoléculaires pour la création de fonctions intégrées) de la Société japonaise pour la promotion de la science (JSPS) (pas 25.102.008.); par un Grant-in-Aid pour jeunes scientifiques (B) (à KK, pas 15K17850.) à partir de JSPS; etpar un Grant-in-Aid pour la recherche Activité Start-Up (à YN,. 15H06653 pas) à partir de JSPS. Un soutien supplémentaire a été fourni par une subvention de l'Institut Noguchi, une subvention de la Fondation Kao des Arts et des Sciences, et une subvention de l'eau Kurita Fondation Environnement.
REAGENTS: | |||
1,2-Dioleoyl-sn-glycero-3-phosphocholine (DOPC) | Avanti Polar Lipids | 850375C | Vesicular membrane molecule |
Texas Red 1,2-dihexadecanoyl-sn-glycero-3-phosphoethanolamine, triethylammonium salt (Texas Red DHPE) | Thermo Fisher Scientific | T1395MP | |
Liquid paraffin | Wako Pure Chemical Industries | 128-04375 | Oil, Density (20℃) 0.86 -0.89 g/mL |
1 M Tris-HCl (pH 7.5) | Nippon Gene Co. | 318-90225 | Buffer solution |
D(+)-Glucose | Wako Pure Chemical Industries | 049-31165 | For outer water solution |
Sucrose | Wako Pure Chemical Industries | 196-00015 | For inner water solution |
Polybead carboxylate microspheres 1.0 µm | Polysciences | 08226-15 | Nonfluorescent, 2R = 1.0 µm |
Fluoresbrite YG carboxylate microspheres 1.0 µm | Polysciences | 15702-10 | Fluorescent, 2R = 1.0 µm |
Fluoresbrite YG carboxylate microspheres 0.10 µm | Polysciences | 16662-10 | Fluorescent, 2R = 0.10 µm |
Fluorescein sodium salt (uranine) | Sigma Aldrich Japan | F6377-100G | |
GFP standard (recombinant) | Vector Laboratories | MB-0752 | |
Name | Company | Catalog Number | Comments |
EQUIPMENT: | |||
Centrifuge 5427R | Eppendorf | 5409000233 | Centrifuge rotor: FA-45-48-11 |
Physcotron | Microtec Co. | NS-310EIII | Handy micro-homogenizer |
Generator shaft | Microtec Co. | NS-4 | Homogenizer attachment |
Frame-Seal incubation chambers for in situ PCR and hybridization | Bio-Rad Laboratories | SLF0201 | Hybridization chamber volume: 25 µL Chamber size: 9 × 9 × 0.3 mm |
Frame-Seal incubation chambers for in situ PCR and hybridization | Bio-Rad Laboratories | SLF0601 | Hybridization chamber volume: 65 µL Chamber size: 15 × 15 × 0.3 mm |
Microman E | Gilson | FD10006 | Pipette for viscous liquid. We measured liquid paraffin by using this. |
Inverted microscope | Olympus Co. | IX73 | |
Mirror unit | Olympus Co. | U-FBNA | Excitation filter: 470-495 nm Emission filter: 510-550 nm |
Mirror unit | Olympus Co. | U-FMCHE | Excitation filter: 565–585 nm Emission filter: 600-690 nm |