This protocol describes the visualization of biofilm development following exposure to host-factors using a slide chamber model. This model allows for direct visualization of biofilm development as well as analysis of biofilm parameters using computer software programs.
Biofilms bestaan uit groepen van bacteriën ingekapseld in een zelf-uitgescheiden matrix. Zij spelen een belangrijke rol bij industriële vervuiling en in de ontwikkeling en persistentie van vele gezondheid gerelateerde infecties. Een van de meest goed beschreven en bestudeerd biofilms in menselijke ziekte voorkomt bij chronische longinfectie van cystische fibrose. Bij het bestuderen biofilms in het kader van de gastheer, een groot aantal factoren biofilm vorming en ontwikkeling beïnvloeden. Om te bepalen hoe gastheerfactoren biofilm vorming en ontwikkeling kunnen beïnvloeden gebruikten we een statische chambered dekglaasje methode biofilms groeien in aanwezigheid van gastheer afkomstig factoren in de vorm van sputum supernatanten. Bacteriën worden gezaaid in kamers en blootgesteld aan sputum filtraten. Na 48 uur groei worden biofilms gekleurd met een commerciële kit biofilm levensvatbaarheid vóór confocale microscopie en analyse. Volgende beeld acquisitie, kan biofilm eigenschappen worden beoordeeld met behulp van verschillende software platforms.Deze methode stelt ons in staat om de belangrijkste eigenschappen van de biofilm groei te visualiseren in aanwezigheid van verschillende stoffen, waaronder antibiotica.
Bacteriële biofilms zijn groepen micro-organismen die zijn bevestigd aan elkaar en ingekapseld in een zelf-uitgescheiden matrix. 1,2 klassiek, zij vertegenwoordigen bacteriën fysiek verbonden aan een abiotische of biotische oppervlak gevormd onder omstandigheden van flow. Biofilms zijn ook aangetoond dat ze groeien in statische toestand (zonder stroom) en distaal van oppervlakken, zoals bij de lucht-water grensvlak thermische zwembaden of pellicles gevormd in reageerbuizen. Deze biofilms zijn lang erkend in de omgeving en die een groot nadeel voor industriële processen zoals deze zich kunnen vormen in water reservoirs of leidingen, waardoor biofouling, corrosie en verstopping. 3,4
Biofilms zijn ook kritisch in de gezondheidszorg, zoals ze zijn getoond worden bij kathetergerelateerde infecties, longinfecties bij cystische fibrose patiënten, alsmede in talrijke andere infecties. 5,6 Een van de kenmerken van biofilm infecties is het degevouwen gevoeligheid van bacteriën tegen antibiotica en verminderde klaring van het aangeboren immuunsysteem. 7-9 De meest bestudeerde, klinisch relevante scenario's van biofilm-gebaseerde infectie optreedt bij patiënten met cystic fibrosis (CF), die chronisch besmet zijn met Pseudomonas aeruginosa biofilms. P. aeruginosa kan bij instelling van chronische infectie die het zeer moeilijk te behandelen een aantal wijzigingen ondergaan. 10,11 Biofilms kunnen differentieel activeren aangeboren immuniteit en rijden ontsteking. 12-14 Al deze infecties leiden tot verhoogde morbiditeit en mortaliteit bij CF-patiënten, is het cruciaal om factoren die invloed hebben biofilm ontwikkeling in dit verband verstaan.
Een recente studie suggereert dat gastheer-factoren zijn cruciaal bij de vorming van biofilm P. aeruginosa aggregaten. 15 Deze biofilms bijdragen tot verminderde gevoeligheid voor antibiotica en gastheer afweermechanismen. de presentie van gastheer afkomstig factoren, zoals neutrofiel elastase, alsook uitgescheiden producten van micro-organismen in de CF longen, het potentieel sterk moduleren vorming en ontwikkeling biofilm. 16 Daarnaast biofilms interactie met de gastheer voor expressie van een groot cascades en een ontstekingsproces. Terwijl hoge doorvoer werkwijzen, zoals de standaard kristalviolet assay kan enige informatie met betrekking tot de biofilm werkwijze, visualisatie van de biofilm in reactie op deze factoren zorgen voor meer gedetailleerde informatie.
In dit manuscript beschrijven we een werkwijze voor het gebruik van factoren uit het sputum van patiënten met CF biofilmvorming in vitro bestuderen. Deze methode zorgt voor een snelle visualisatie van biofilms blootgesteld aan sputum met gastheer factoren met behulp van een commercieel biofilm levensvatbaarheid kit. Deze techniek kan worden gebruikt om visueel veranderingen die optreden tijdens biofilmgroei te identificeren in de aanwezigheid van exogenoons producten, en vertegenwoordigt een verbeterde werkwijze voor de veranderingen in biofilm ontwikkeling onder verschillende omstandigheden te analyseren.
De hierin beschreven werkwijzen maken voor visualisatie van bacteriële biofilms gekweekt in de aanwezigheid van exogeen producten. Niet verrassend, de productie van de exoproducts van belang bij gebruik van dit type systeem. Bijvoorbeeld, dithiothreitol (DTT), wordt vaak gebruikt op menselijke sputum monsters om vloeibaar monsters. Echter, het effect van DTT alleen biofilm ontwikkeling en levensvatbaarheid verlagen (gegevens niet getoond). Aldus juiste controles voor alle omstandigheden noodzakelijk. Verder is de toevo…
The authors have nothing to disclose.
TB erkent een research fellowship van Cystic Fibrosis Canada.
Lab-Tek II Chambered coverglass, #1.5 borosilicate, 8-well | Thermo Sicher Scientific | 155409 | |
Filmtracer Live/Dead Biofilm Viabilty Kit | Thermo Fisher Scientific | L10316 | |
Blood agar plates | Thermo Fisher Scientific | R10215 | Confirming viability via CFU counts or selecting colonies for innoculation |
COMSTAT | Availble software online | COMSTAT is software to analyze biofilm images. Available www.comstat.dk | |
Millers LB Broth | Thermo Fisher Scientific | 12780-052 | Standard media for overnight gowth/biofilm growth |
Millex-GV Syringe Filters | Millipore | SLGV013SL | Filtering of sputum supernants |
Phosphate Buffered Saline (Dulbecco A) | Oxoid | BR0014G | Washing of biofilm chambers after media removal |
Zeiss AxioVert 200M | Carl Zeiss | ||
Hamamatsu C9100-13 EM-CCD | QS Technologies Inc. | ||
Spectral Borealis | Qs Technologies Inc. | ||
Perkin Elmer Volocity | QS Technologies Inc. | Instructions for this software can be found at: http://cellularimaging.perkinelmer.com/pdfs/manuals/VolocityuserGuide.pdf |