We present a protocol to identify protein moieties containing antigens for human and mouse IgM antibodies with specific kappa (Vκ) light chains. This protocol is not limited to IgM class antibodies but applies to all immunoglobulin isotypes that target their antigen with sufficiently high affinity during immunoprecipitations.
Antibodies of the IgM isotype are often neglected as potential therapeutics in human trials, animal models of human diseases as well as detecting agents in standard laboratory techniques. In contrast, several human IgMs demonstrated proof of efficacy in cancer models and models of CNS disorders including multiple sclerosis (MS) and amyotrophic lateral sclerosis (ALS). Reasons for their lack of consideration include difficulties to express, purify and stabilize IgM antibodies, challenge to identify (non-protein) antigens, low affinity binding and fundamental knowledge gaps in carbohydrate and lipid research.
This manuscript uses HIgM12 as an example to provide a detailed protocol to detect antigens by Western blotting, immunoprecipitations and immunocytochemistry. HIgM12 targets polysialic acid (PSA) attached to the neural cell adhesion molecule (NCAM). Early postnatal mouse brain tissue from wild type (WT) and NCAM knockout (KO) mice lacking the three major central nervous system (CNS) splice variants NCAM180, 140 and 120 was used to evaluate the importance of NCAM for binding to HIgM12. Further enzymatic digestion of CNS tissue and cultured CNS cells using endoneuraminidases led us to identify PSA as the specific binding epitope for HIgM12.
נוגדנים של אלוטיפ IgM להפגין פוטנציאל טיפולי רב לטיפול במחלות שונות, כולל סרטן והפרעות במערכת העצבים המרכזית 1-7. הקבוצה 'Vollmers זיהתה נוגדנים רבים בקרב חולי סרטן לשימוש פוטנציאל לשמש כסמנים ביולוגיים או רפוי פעיל-גידולים ספציפיים המסוגלים להרוג תאים ממאירים על ידי גרימת מסלולי אפופטוטיים 4,8,9. המעניין לשים לב שכל הנוגדנים המזוהים עם פוטנציאל טיפולי הם של אלוטיפ IgM ולהשתייך לקבוצה "נוגדנים עצמיים טבעיים" (חטיף).
בדומה לכך, הקבוצה של רודריגז מזוהה עכבר נוגדנים אנושיים המעודדים מיאלין מחדש בנגעי חוט שדרת demyelinated הכרוני במודלים של טרשת נפוצה (MS). זהה נוגדנים עם השפעות נוגדות סרטן, כל הנוגדנים לקידום מיאלין מחדש הם nabs ושל אלוטיפ IgM 1,6,7,10. אנטיגנים המדויק IgMs המזוהה ביותר עדיין undetermineד כולל נוגדן אנושי לקידום מיאלין מחדש rHIgM22, כרגע בשלב הראשון של הניסויים הקליניים של חולים בטרשת נפוצה 11. למרות מאמצים חוזרים ונשנים על ידי מומחים בתחום של מחקר שומנים פחמימות הן את ההגדרה האקדמית בשיתוף עם התעשייה 11, מנסה לזהות אנטיגן של rHIgM22 לא הוכתרו בהצלחה. הכישלון של טכניקות סטנדרטיות המשמשות לזיהוי אנטיגנים של נוגדני IgG לעבוד עם נוגדני IgM מזהה צורך קריטי כדי לחדד שיטות ספציפיות נוגדנים אלה כי היעד הסביר ביותר אנטיגנים פחמימות או שומנים.
ההתמקדות של כתב היד הזה היא נוגדן משובי אדם HIgM12 ואת הפרוצדורות המשמשות לזיהוי אנטיגן שלה. נוגדן HIgM12 זוהה מחולים עם macroglobulinemia של Waldenstrom, מגרה תולדה neurite במבחנה 12-14 וממקד חומצה polysialic (PSA) מחוברת מולקולת הידבקות התא העצבי (PSA-NCAM) 15,16. HIgM12 ומאריכה את תוחלת חיים במודל של עכברים של ALS 17 ומשפרת תוצאה תפקודית בנגיף encephalomyelitis בעכברים של Theiler (TMEV) עכברי -infected. באופן ספציפי, HIgM12 מגרה פעילות מוטורית אופקית ואנכית ספונטנית demyelinated כרוני מספרי עכברים ועליות של אקסונים בחוט השדרה בקוטר קטן ובינוני שמונה שבועות לאחר מנה אחת, נמוכה של intraperitoneal מוזרקת נוגדן 18.
מולקולת הידבקות תא העצבית (NCAM) היא גליקופרוטאין של אימונוגלובולינים (איג) הביעו superfamily על פני התא של הנוירונים, גליה, שרירי שלד, תאי הרג טבעי 19-25. השלושה isoforms NCAM הגדול כינת NCAM180, NCAM140, ו NCAM120, הם וריאנטים אחוי חלופה של תמליל עיקרי להשתנות רק בתחום ציטופלסמית שלהם. בתוך מערכת העצבים המרכזית, NCAM היא מולקולת polysialylated הגדולות (> 95%) עם ארוך, homopolymers חומצה sialic טעונים שלילית. PolysialicCID עם n> 10 נקרא PSA אבל מבני oligomeric קצרים קיימים כי הם גם ביולוגיים רלוונטיים. חלבונים polysialylated אחרים הביעו במערכת העצבים המרכזית הם SynCAM1 26, Neuropilin-2 (מפד"ל-2) 27,28 ו למקטע ערוץ נתרן 25 (לסקירה ראה 29).
השיטות שתוארו כאן ניתן לזהות אנטיגן עבור אימונוגלובולינים האדם והעכבר המכיל ספציפי קאפה (Vκ) שרשראות אור (VκI, VκIII או VκIV שרשראות אור עבור נוגדנים אנושיים ורשתות אור VκI נוגדנים העכבר) אינו מותנה של אלוטיפ של נוגדן (למשל, IgG, IgM , IgA, IGD או IgE). מגבלה זו מבוססת על שימוש של agarose L חלבון עבור immunoprecipitations עם נוגדנים של אלוטיפ IgM. אסטרטגיות חלופיות יכולות לכלול לקטינים מחייב מנוז ונוגדנים אנטי-IgM IgG משני קשור קוולנטית agarose חרוזים, אשר עשוי להרחיב את תחולת בשיטה זו כדי נוגדנים יותר IgM including אלה עם למבדה (λ) שרשראות אור (ראה דיון). יחסי חלק מרשתות אור בסרום IgM Vκ לעומת שרשראות אור λ IgM נגזר אנשים בריאים הם 1.5: 1 30.
בהתבסס על המתודולוגיה chromatographic משמשת כאן כדי להפריד, להעשיר אימונולוגית לזהות מולקולות מסוימות 31, כל אנטיגנים נדרשים לכלול לפחות תחום חלבון קטן אחד. את epitope מחייב הספציפי של הנוגדן יכול להיות בתוך או מחוץ לתחום החלבון (לדוגמא, ב גליקופרוטאינים, ליפופרוטאינים). צעדים ביוכימיים ראשוני המשמש לזיהוי אנטיגן ספציפי עבור HIgM12, בהתאמה כדי לצמצם את רשימת המועמדים הפוטנציאליים, הם הצעדים החשובים ביותר בשיטה זו. סוג תא הכנות ספציפיות אפיונים מבוססי תאי מורפולוגיה מתוארות ביחס ותאי גלייה אבל מתודולוגיה זו ניתן להסיק על להכיל סוגי תאים אחרים בתוך או מחוץ למערכת העצבים המרכזית.
ישן דחוףצריך לפתח טכניקות חדשות או שונות ישימות עבור המספר הולך וגדל של נוגדני IgM עם פוטנציאל טיפולי להפרעות אנושיות שונות במיוחד באותם מקרים (רוב אנטיגנים IgM) שבו הנוגדן המכוון הם מבני פחמימות או שומנים.
נוגדנים עצמיים IgM טבעיים אדם פונים מועמדי immunotherapies ו הוכיחו פוטנציאל טיפולי לטיפול במחלות שונות, כולל סרטן והפרעות במערכת עצבים מרכזיים 1-7. לתועלתו, נוגדנים אלה לא לעורר תגובה חיסונית אשר הדור של נוגדנים מנטרלים מפחית את המינון טיפולי האפקטיבי משמעותי ויעילות. חשוב לציין, כל הנוגדנים עם פוטנציאל טיפולי היו של אלוטיפ IgM ושייכים הרפרטואר NAB 3-5,8,9,37,40,42-45. משוכה גדולה עבור היישום הקליני הפוטנציאל של נוגדני IgM היא זיהוי של אנטיגנים שלהם, אשר לא ידועים במקרים רבים. טכניקות סטנדרטיות מועסקות נוגדני IgG הן בדרך כלל לא ישים לזהות אנטיגן של IgM.
פרוטוקול זה מתאר את זיהוי של PSA-NCAM כמו אנטיגן עבור HIgM12 נוגדני IgM אדם רגנרטיבית, יעיל במודלים של בעלי חייםשל MS ו- ALS 15-18. המתודולוגיה בשימוש ישימה בעיקר לכל נוגדנים אנושיים עם שרשראות אור Vκ ספציפיים VκI, VκIII ו VκIV ונוגדנים העכבר עם שרשראות אור VκI, ללא קשר אלוטיפ של נוגדן.
השלב הקריטי ביותר בפרוטוקול זה הוא השימוש נוגדני IgM ביישומי כרומטוגרפיה זיקה. באופן ספציפי יותר, נוגדנים מוצלחים נדרשים לפעול כסוכנים הנפתח ב immunoprecipitations לבודד או להעשיר אנטיגן מתוך lysates רקמות או תרבית תאים המורכב. שברי אנטיגן מועשרים ניתן להשוות immunoprecipitations מ נוגדנים לשלוט אלוטיפ ובהמשך נתחו להבדלים ידי ספקטרומטריית מסה. אחת דרישה הכרחית או הגבלה של שלב זה היא הנוכחות של שרשרת אור מארח הנכון נוגדן Vκ (אדם, העכבר) כדי לאפשר נוגדן מחייב agarose חלבון L. שימוש חלבון mannan מחייב בהכרח agarose (גם Calleד מנוז מחייב לקטינים) במקום agarose חלבון L היא אלטרנטיבה פוטנציאל immunoprecipitate IgMs ללא שרשראות אור ספציפי Vκ. עם זאת, כאמור על ידי ארנולד et al. 35, נוגדנים IgM הנכנס אנטיגן לא להיקשר לחלבון mannan מחייב, כמו glycan היעד נראה הופכים נגישים פעם IgM הכפיף אותו אנטיגן שלה. בהתבסס על ממצאים אלו mannan מחייב חלבון לא ניתן להשתמש כמטריצה מחייב immunoprecipitate טעון אנטיגן IgM מולקולות 35. חלופות אפשריות אחרות עשויות להיות שימוש נוגדנים אנטי-IgM agarose הנכנס משני IgG 46,47 או שימוש חרוזים מגנטיים המופעל משטח 48. נוגדני IgG מכוונים נגד IgMs יכולים להיות crosslinked כימי agarose A או agarose G על מנת לצמצם את היקף נוגדן eluted יחד עם האנטיגן של עניין. השוואה נכונה בין גרסאות שונות של immunoprecipitation IgM ביחס אנטיגנים זיהו בהצלחה iזה קשה כי רוב immunoprecipitations בוצע כדי לבודד או לרוקן IgMs ללא ריבית נוספת אנטיגנים שלהם. בנוסף, immunoprecipitations באמצעות IgMs שמש בעיקר כדי לאשר אנטיגן כבר ידוע או צפוי יחיד עם חשיפת נוגדנים לאנטיגנים מטוהרים 49. חסרון של IgGs מצמיד agarose מכוון נגד אדם IgMs הוא תשואה נמוכה מאוד (10 – 15%) של מולקולות immunoprecipitated בסרום IgM כשמשווה את החומר המוצא 50. לעומת זאת, חרוזים מגנטיים המופעל משטח יושמו בהצלחה לנוגדנים של isotypes השונה כולל IgM כדי immunoprecipitate סיבים הקשורים scrapie 48. שיטה זו אינה מצטמצמת אך קאפה ספציפי (Vκ) או למבדה (λ) שרשרות או שורה מסוימת ועשויה להרחיב בצורה ניכרת את הספקטרום של נוגדני IgM המשמשים immunoprecipitations.
צעד חשוב נוסף בפרוטוקול הוא היכולת של הנוגדן לתפקד בתור detecting נוגדן (נוגדן ראשוני) ב כתמים מערביים או פלטפורמות סריקה אחרות. נוגדנים מוצלחים חייבים למקד אנטיגן שלהם עם זיקה גבוהה מספיק כדי לאפשר אנטיגן מחייב בנוכחות דטרגנטים שאינם יונים או אולי יוניים. נוגדני זיקה גבוהים נפוצים בקרב נוגדני IgG-maturated זיקה, אבל פחות נפוצים בקרב נוגדנים של אלוטיפ IgM, שהיא אחת הסיבות מדוע יש יחסית מעט נוגדני IgM זמינים מסחרי כמו גילוי סוכנים במסגרות ביוכימיים. זיקה גבוהה המחייבת של נוגדנים מהווה דרישה immunoprecipitations של אנטיגנים מולקולרי עבור מערבי סופג. הפחתת ריכוזי חומר ניקוי או ההעדר המוחלט של דטרגנטים מאגרי IP או מאגר תמוגה מאפשרת אנטיגן מיקוד ידי נוגדנים נמוך זיקה באמצעות תחום Fab שלה. לעומת זאת, היכולת של הנוגדן למקד agarose חלבון L באמצעות חלק Fc שלו אינה מושפעת באופן משמעותי בקרב שולטת אלוטיפ על פני טווח של concen חומר ניקוי השונהtrations. עם זאת, ריכוז חומר ניקוי נמוך במאגר תמוגה חיץ IP מונע הפרעת קרום תא ובידוד של מולקולות ספציפיות. באופן דומה, ריכוז חומר ניקוי נמוך מאגרי כביסת כתם מערביים (למשל, PBS-T) מאפשר אנטיגן מחייב של נוגדנים בעלת זיקה נמוכה אך בעת ובעונה האחת מגדיל את הלא ספציפי מחייב ולכן הוא לא אופציה.
הנוכחות של ליבת חלבון אנטיגן היא דרישה נוספת עבור שיטה זו. חלבונים עם שינויי posttranslational (למשל, גליקופרוטאינים, ליפופרוטאינים) וחלבונים ללא שינוי, אך לא שומנים בלעדיים או פחמימות, ניתנים לזיהוי ב כתמים מערביים. זה לא ניתן immunoprecipitate שומנים (למשל, ספינגוליפיד) מ lysates רקמות או תאים בנוכחות או בהיעדר דטרגנטים. מאפייני physicochemical של דטרגנטים ושומנים דומים מכדי לאפשר אינטראקציות שומנים-נוגדן סלקטיבי, בעוד באותו הזמן דטרגנטים חיוניים לשבשממברנות כדי לאפשר בידוד סלקטיבי של מולקולות ספציפיות. למיטב ידיעתנו, immunoprecipitations המורכב אך ורק של פחמימות, בהעדר גרעין חלבון, לא דווח בעבר. זה הופך רלוונטי במיוחד בגלל נוגדנים IgM לעתים קרובות למקד פחמימות glycolipids, אשר אינן צמודות בהכרח ליחידת חלבון. טכניקות chromatographic אחרות נדרשות לזיהוי ההפרדה אימונולוגית של שומנים ופחמימות בהיעדר גרעין חלבון. לדוגמא, כרומטוגרפיה בשכבה דקה (TLC) של שומנים הסלולר עם זיהוי נוגדן עוקב על צלחת TLC (החיסונית TLC) ניתן ליישם 51,52.
נוגדנים נגד ה- PSA אחרים תוארו במחקרים קודמים ותוצאות לעומת HIgM12 וכן IgM אנטי PSA הזמין המסחרי (שיבוט 2-2B). הנוגדן הנפוץ ביותר בתחום ה- PSA הוא נוגדן IgG (שיבוט 735) זמין עכבר monoclonal או ארנב polyclonal נוגדן 53. נוגדן אנטי PSA IgG זה מזהה PSA על SynCAM ו NCAM על תאים מסוגים שונים במערכת העצבים המרכזית כולל תאים microglial 41. בניגוד הנוגדן IgG אנטי PSA, נוגדנים IgM האדם HIgM12, HIgM42 ואת IgM העכבר אנטי PSA (שיבוט 2-2B) אינם מסוגלים למקד PSA על SynCAM (אבל על NCAM) בשעה שלבי הלידה העוברית המוקדמת שונים בעכברים ואילו SynCAM הלא polysialylated ניתן לזהות בקלות 15. הנוגדנים IgM בהם נעשה שימוש הם גם לא מסוגל לזהות PSA על תאים microglial (איורים 3 + 4). הסבר אפשרי ההבדלים שנצפו בין isotypes נוגדנים עשוי להיות רמות נמוכות PSA-SynCAM לעומת רמות של PSA-NCAM בשילוב עם זיקה פוטנציאלית נמוכה יותר מחייב של נוגדנים IgM לעומת IgG אנטי-PSA. כדי לבחון השערה זו, ביצענו immunoprecipitations בחיות NCAM KO בשלב העוברי E17 עם כמויות עצומות של ההווה SynCAM והשתמשו HIgM12 בתור "סוכן הנפתח" <sup> 15. בשנת להמלטה WT E17 שולטת HIgM12 immunoprecipitated PSA-NCAM במידה שהראו בעוצמות דומות של "הוריד" PSA-NCAM לעומת שרשרת IgMs כבד כפי שזוהו על ידי צפיפות ב כתם המערבי לאחר מכן באמצעות אנטיגנים eluted. תוצאה זו הציעה לפחות זיקה מספקת של HIgM12 כדי PSA היעד שלה. בניגוד להמלטה WT שולט HIgM12 לא לזהות PSA המצורפת SynCAM בחיות KO NCAM. תוצאות זהות התקבלו immunoprecipitations באמצעות IgM HIgM42 אנטי PSA האדם. HIgM12 ו HIgM42, כמו גם את העכבר אנטי PSA IgM (שיבוט 2-2B) לא הצליחו למקד PSA על SynCAM ב כתמים המערבי מחיות WT ו NCAM KO בשלבים התפתחותיים עובריים לאחר הלידה. בהתחשב בכמות הנמוכה של HIgM12 נדרשה (0.1 מיקרוגרם / מיליליטר) כדי לזהות PSA מצורפת NCAM דווקא כתמים מערביים באמצעות כמויות קטנות של רקמת מערכת עצבים המרכזית (CNS 0.1 מיקרוגרם רקמה לכל טוב) 15 זה נראה סביר כי זיקות נמוכות לבד הםאחראי חוסר מוחלט של זיהוי PSA-SynCAM ידי HIgM12 בשלוש שיטות שונות.
אנו מסיקים כי ישנם הבדלים משמעותיים בין נוגדנים נגד ה- PSA IgM ואת נוגדן IgG אנטי PSA המפורסם התדיר (שיבוט 735). לא ברור מדוע זמינים מסחרי נוגדנים נגד ה- PSA IgM לא היו רגילים בתדירות גבוהה יותר בעבר לאשר את תוצאות שהושגו עם antiPSA IgG נוגדנים 735. זה מעניין במיוחד משום HIgM12 כבר הוכיח יעיל במודלי מחלה שונים. בעוד נוגדנים נגד ה- PSA IgM אחרים עשויים להיות השפעות טיפוליות דומות עדיין לא ברור האם נוגדן IgG אנטי PSA (שיבוט 735) יש תוצאה טיפולית דומה במודלים של טרשת הנפוצה ALS.
בקיצור, השיטות שתוארו כאן שימשו בעיקר כדי לזהות את האנטיגן של HIgM12 נוגדן אנושי משובי לתמוך בניסויים קליניים פוטנציאל MS ואולי מחלות ניווניות אחרות. זיהוי של נמלהigens נוגדנים בעלי פעילות ביולוגית הוא צעד חיוני כדי להבין את מנגנון הפעולה שלהם. זה הופך רלוונטי במיוחד בהקשר של נוגדנים חד שבטיים רבים בימים אלה נבדקים על בטיחות ויעילות בניסויים בבני אדם. בעוד מספר נוגדנים IgM נבדק קלינית עד כה הוא קטן, השיפורים האחרונים בטכנולוגיה hybridoma יחד עם מספר גדל והולך של מחקרים המדגיש את הפוטנציאל הטיפולי של הכיתה נוגדן זה 1-10,37,40,42-45 קורא מפיתוח מוצרים חדשים וחדשניים או שיטות שונות ישים לזהות אנטיגנים IgM הלא חלבון.
The authors have nothing to disclose.
עבודה זו נתמכה על ידי מענקים מהמוסד הלאומי לבריאות (R01 GM092993, R01 NS048357 ו R21 NS073684), הקרן הלאומית למדע (פרס קריירה), פרס שותפות מינסוטה לביוטכנולוגיה והרפואי Genomics, האגודה לטרשת הלאומית המרובה (CA1060A) , ואת המרכז המרפא מאיו למדע קליני Translational (CCaTS). המחברים מודים תמיכה מן אפלבאום, הילטון, פיטרסון ומקרנות סנפורד, הירח ומרילין פארק קרן מנהלות ומשפחת McNeilus.
DMEM | Fisher Scientific | MT-10-013-CVRF | HIGH GLUCOSE, with glutamine, with sodium pyruvate, 500 ml |
DMEM/F-12, HEPES | Life Technologies | 11330-032 | 500 ml, L-glutamine, sodium pyruvate, high glucose |
Penicillin-Streptomycin | Life Technologies | 15140-122 | 10,000 U/mL, 100 ml |
N-2 Supplement (100X) | Life Technologies | 17502-048 | 5 ml |
B-27 Supplement (50X) | Life Technologies | 17504-044 | serum free, 10 ml |
Fetal Bovine Serum – Optima | Atlanta Biologicals | S12450 | 500 ml |
STERILE WATER FOR IRRIGATION | Baxter Healthcare | #2F7114 | USP-1000 ml, 12/CA |
Poly-D-lysine hydrobromide | Sigma | P7886-50MG | D-Lys-(D-Lys)n-D-Lys · xHBr, Molecular Weight 30,000-70,000 g/mol, 50 mg |
bovine serum albumin fraction V | Sigma | A-3294-100G | heat shock fraction, protease free, pH 7, purity 98%, 100 g |
D-(+)-Glucose | Sigma | G5767-500G | C6H12O6, Molecular Weight: 180.16 g/mol, ACS reagent, 500 g |
Trypsin from bovine pancreas | Sigma | T9935-100mg | essentially salt-free, lyophilized powder, =9,000 BAEE units/mg protein, |
Deoxyribonuclease I from bovine pancreas | Sigma | D5025-150KU | Type IV, lyophilized powder, =2,000 Kunitz units/mg protein |
Recombinant Rat FGF basic Protein | R&D systems | 3339-FB-025 | BSA as a carrier protein, 25 ug, lyophilized, >95%, 16.2 kDa |
Recombinant Rat PDGF-AA Protein | R&D systems | 1055-AA-50 | carrier free, 50 ug, lypphilized, >97%, E.coli-derived, 12.5 kDa |
Neurobasal-A | Life Technologies | 10888-022 | 500 ml, No Glutamine, No Aspartic Acid, No Glutamic Acid |
Paraformaldehyde | Sigma | P6148-1KG | crystalline, 1 kg, reagent grade, Molecular Weight 30.03 g/mol (as monomer) |
Tris[hydroxymethyl]aminomethane (Tris bas | Biorad | #1610719 | 1 kg, 99.8% pure, powder |
Sodium Dodecyl Sulfate (SDS) | Biorad | #1610302 | 1 kg, powder |
Glycine | Fisher Scientific | BP-381-5 | C2H5NO2, Molecular weight: 75.07 g/mol, White crystalline Powder, 5 kg |
Sodium chloride | Sigma | S7653-5KG | NaCl, Molecular Weight: 58.44 g/mol, 5 kg |
Sodium phosphate monobasic | Sigma | S0751-500G | NaH2PO4, Molecular Weight: 119.98 g/mol, 500 g |
Phosphate-buffered Solution 1X (PBS) | Cellgro | MT-21-040-CV | Without Calcium and Magnesium, 6 x 500 ml |
Falcon 60mm TC-Treated Cell Culture Dish | Corning Life Sciences | #353002 | 60 mm Cell Culture Dish, TC-treated polystyrene, 20/pack, sterile |
Falcon 60 mm x 15 mm Petri dish | Corning Life Sciences | #351007 | Not TC-Treated Bacteriological Petri Dish, 20/Pack |
6 well cell culture plates | Corning Costar | CLS3516 | 6 well, flat bottom (Individually wrapped), gamma-irradiated, growth area 9.5 c |
75cm² tissue culture flask | Corning Life Sciences | 430720U | 75cm² U-Shaped Canted Neck Cell Culture Flask with Plug Seal Cap |
Pierce™ Protein L Plus Agarose | ThermoFisher Scientific | #20520 | 2 ml, crosslinked 6% beaded agarose (CL-6B), binding capacity: 10 to 20 mg IgG |
4-20% Mini-PROTEAN TGX Precast Gel | Biorad | 456-1094 | 10-well, 50 µl, for use with Mini-PROTEAN electrophoresis cells |
Immobilon-P Membrane | Millipore | IPVH00010 | PVDF, 0.45 µm, 26.5 cm x 3.75 m roll |
Anti-Polysialic Acid-NCAM Antibody, clone | Millipore | MAB5324 | 50 microliters, Host: mouse, monoclonal IgM |
XT sample buffer (Western blot) | Biorad | #1610791 | 10 ml, 4 x premixed protein sample buffer |
2-mercaptoethanol | Biorad | #1610710 | 25 ml, 98 % pure, 14.2 M |
Endoneuraminidase-N (Endo-N) | ABC Scientific | ABC0020 | 50 microliters, 200 µg/ml, 3500 U/mg |
25 mm glass coverslips | Fisher Scientific | 12-545-102 | Circles No. 1; Thickness: 0.13 to 0.17mm; Size: 25mm |
HEPES buffer solution | ThermoFisher Scientific | 15630-080 | 100 ml, 1M |
Hanks' Balanced Salt Solution 1X (HBSS) | Cellgro | MT-21-022-CV | 500 ml, without Calcium, Magnesium, Phenol Red |
Papain | Worthington Biochemical Cooperation | LS003119 | lyophilized powder, 100 mg |
Magnesiumsulfate | Sigma | M-2643-500G | powder, 500 g |
L-Glutamine | Gibco | #25030-081 | 100 ml, 200 mM |