Deze procedure wordt beschreven hoe u cytochroom c (cyt. C) in te kapselen silica (SiO 2) sol-gels, proces deze gels te bioaerogels te vormen en gebruiken deze bioaerogels om stikstofoxide (NO) snel te herkennen door middel van een gas-fase reactie. Dit type protocol kan helpen bij de toekomstige ontwikkeling van biosensoren of andere bioanalytische apparaten.
Toepassingen zoals sensoren, batterijen en brandstofcellen zijn verbeterd door het gebruik van zeer poreuze aerogel als functionele verbindingen worden ingekapseld in de aerogels. Echter, weinig rapporten over inkapselen eiwitten in sol-gels die worden verwerkt tot aerogels vormen bestaan. Een procedure voor het inkapselen van cytochroom c (cyt. C) siliciumoxide (SiO 2) sol-gels die supercritically worden verwerkt tot bioaerogels met gasfase-activiteit nitric oxide (NO) wordt gepresenteerd. Cyt. C toegevoegd aan een gemengde silicasol onder gecontroleerde eiwitconcentratie en buffersterkte omstandigheden. Het mengsel wordt vervolgens sol gegeleerd en de vloeistof vullen van de poriën gel wordt vervangen door een reeks oplosmiddel uitwisseling met vloeibaar kooldioxide. De kooldioxide wordt om zijn kritiek punt gebracht en afgeblazen droge aerogel met cyt vormen. C binnen ingekapseld. Deze bioaerogels kenmerken met UV-spectroscopie eend circulair dichroïsme spectroscopie en kan worden gebruikt om de aanwezigheid van de gasfase stikstofoxide detecteren. Het succes van deze procedure is gebaseerd op de regulering cyt. C concentratie en de bufferconcentratie en geen andere componenten zoals metaal nanodeeltjes vereisen. Het kan mogelijk zijn om andere eiwitten met een soortgelijke aanpak waardoor deze procedure belangrijke potentiële toekomstige ontwikkeling bioanalytische apparaat kapselen.
Cytochroom c (cyt. C) is een belangrijke elektronenoverdrachtsmiddel eiwit betrokken bij het lichaam cellulaire ademhaling reacties. Het is aangetoond dat betrokken is bij apoptose, een gecontroleerde vorm van celdood, en kunnen dergelijke kleine toxische moleculen zoals stikstofmonoxide en koolstofmonoxide 1-3 detecteren. Stikstofoxide (NO) speelt een rol in diverse fysiologische processen in het zenuwstelsel, cardiovasculaire en immuunsysteem. Terwijl cyt. C meestal vereist een waterige omgeving gebufferd tot pH-neutrale waarden structureel intact en actief te blijven, heeft onderzoek aangetoond dat cyt. C kan de structuur en functie in vaste materialen bekend als aerogels onder bepaalde voorwaarden 4-9 te behouden.
Aerogel is sterk poreuze materialen vaak gevormd door het synthetiseren sol-gel metaaloxiden (terwijl metaaloxide aerogel is zeer vaak hebben koolstof en andere vormen van aërogels gesynthetiseerd. Een voorbeeld is InP aerogels) 10 en drogen deze sol-gels zodanig dat de poreuze vaste matrix ongewijzigd gelaten 11-14. Alle poriën in vaste aërogels leiden tot veel beschikbare oppervlakte waardoor aerogels zeer nuttig voor toepassingen waarbij oppervlaktereacties belangrijk. Wanneer chemische of biochemische functionaliteit is gemonteerd binnen de aërogel nanoarchitecture, is aangetoond dat de fysische porositeit en verbeterde oppervlakte van de aerogels helpen sensoren en elektroden voor batterijen, brandstofcellen en supercondensator toepassingen 11,15-23 verbeteren . Om aerogels zodanig dat de poreuze vaste matrix ongewijzigd laat drogen, is het kenmerkend voor het oplosmiddel in de poriën achterblijft nadat sol-gel-synthese met superkritische vloeistofextractie verwijderen. Elke porie instorting die door oppervlaktespanningskrachten worden veroorzaakt als oplosmiddel verdampt uit de gel worden geminimaliseerd door in superkritisch drogen een vloeistof-lucht grensvlak niet vormen.
<p class="jove_content"> Er zijn veel meldingen van heem eiwitten zoals cyt. c wordt ingekapseld in sol-gels die nat zijn gehouden of die zijn ambiently 24-30 gedroogd. Verslagen van inkapselen biomoleculen in sol-gels die vervolgens supercritically gedroogd onder vorming aerogel is zeldzamer, omwille van de verwerking die schadelijk is voor de structuur van veel eiwitten zijn. Bij cyt. C, bepaalde voorwaarden maken het mogelijk om het vermogen van cyt. C te sporen en aan te gasfase stikstofoxide in aerogels behouden. Eenmaal gestabiliseerd in de aerogel, de hoogwaardige poriestructuur van de aërogel vergemakkelijkt de reactie tussen cyt. C en stikstofmonoxide 4,8,9. Cyt. C kan binnen aerogelen worden ingekapseld door eerst te associëren in meerdere lagen rond gouden of zilveren nanodeeltjes in oplossing 4-8. Deze meerlagige bovenbouw dienen om het eiwit in de aërogel matrix te beschermen. In de meest recente approach die we hebben ontwikkeld, wanneer de eiwitconcentratie en buffer sterkte worden gecontroleerd en andere synthetische omstandigheden cyt. c integriteit behoudt in de aerogels zelfs zonder metaal nanodeeltje initiële associatie 9.De synthese begint als vele aerogel syntheses beginnen door het mengen van silica sol-gel-voorlopers voor een bepaalde periode van tijd. Het is na een bepaalde mengtijd die cyt. C wordt toegevoegd als een gebufferde oplossing in het mengsel. Gelering plaatsvindt, een poreuze silica stevige structuur waarin de poriën zijn gevuld met water, methanol, resterende reagentia en bijproducten vormen. Deze vloeistof die de poriën vult gespoeld worden met verschillende oplosmiddelen door een reeks van oplosmiddel uitwisseling, de laatste uitwisseling met vloeibaar kooldioxide plaatsvinden binnen een kritisch punt drooginrichting bewaard bij lage temperatuur. Waardoor de gels boven de kritische temperatuur (31,1 ° C) kooldioxide vergemakkelijkt de vorming van alsupercritical vloeistof in het onder druk staande inrichting die kan worden ontlucht droog, sterk poreuze aerogels vormen. De relatief lage temperatuur vereist voor koolstofdioxide een superkritische vloeistof te vormen voordelig in vergelijking met andere oplosmiddelen omdat het eiwit onder een temperatuur waarbij het kan denatureren houdt.
De metaal nanodeeltjes-vrij benadering inkapselen cyt. C in aërogels is voordelig omdat het een eenvoudige procedure die kan leiden tot de ontwikkeling van een algemener toepasbaar protocol voor het inkapselen van andere eiwitten ook. Veel eiwitten geen interactie met metalen nanodeeltjes op dezelfde manier cyt. C doet en metaal nanodeeltjes synthese of eerst voegt extra tijd en kosten voor de procedure. De enkele rapporten over inkapselen eiwitten in aërogels maken de ontwikkeling van deze procedure een belangrijke stap om met een meer algemene procedure voor het inkapselen van andere eiwitten in aerogels die ik kan helpenn potentiële toekomstige bioanalytische apparaten.
Het protocol deel van dit manuscript beschrijft hoe silica sol-gels te synthetiseren, te kapselen cyt. C in deze sol-gels, drogen deze samengestelde sol-gels te aerogels te vormen, karakteriseren deze bioaerogels met UV-zichtbaar en circulair dichroïsme spectroscopie en opsporen van de aanwezigheid van gasfase stikstofoxide met deze bioaerogels. Cyt. C met succes ingekapseld in aërogels bij de eerste in 4,4-70 mM waterige oplossingen van fosfaatbuffer opgelost. Echter geoptimaliseerd eiwitstructuur in aërogels gebleken ontstaan wanneer inkapselen 40 mM fosfaatgebufferde oplossingen cyt. C produceren loaded aerogel cyt. C concentraties in het bereik van 5-15 uM 9. Daarom is het protocol hieronder is aerogels synthetiseren middels 40 mM fosfaatgebufferde oplossingen cyt. C waardoor een geladen cyt. C concentratie in het aerogels van 15 uM. </ P>
Zoals beschreven, heeft deze procedure consequent geproduceerd levensvatbare cyt. C ingekapseld aerogels. De concentratie van cyt. C binnen de aerogels kan variëren van 5 tot 15 uM en de bufferconcentratie van de oorspronkelijke cyt. C oplossing ingekapseld in de aerogels kunnen worden gevarieerd 4,4-70 mM fosfaat zonder ernstige nadelige effecten op de levensvatbaarheid eiwit. Echter, de piek centrum en de piek breedte van de karakteristieke cyt. C Soret piek in aerogel het dichtst bij wat ze zijn voor cyt. C in oplossing als cyt. C in aerogel is ingekapseld uit oplossingen van 40 mM buffer 9.
De synthese van de cyt. C SiO2 aerogelen wordt beïnvloed door de leeftijd van enkele van de start reagentia. Methanol, tetramethoxysilaan, en ammonium hydroxide oplossing zijn hygroscopisch en moet ieder naar twee maanden worden vervangen. De toegenomen water die opbouwt indeze reagentia tijd beïnvloedt de gel structuurkenmerken en de sol-naar-gel overgang tijd.
Bij het uitvoeren van superkritisch drogen, kan het kritische punt drooginrichting transfer boot maximaal achttien 0,5 cm dik, 1 cm diameter gels. Zoals in de sectie protocol moet een specifieke vullen en aftappen procedure gevolgd om kooldioxide te zetten in de sol-gels. Het is belangrijk op te merken dat aan het begin van het aftappen protocol, de drainerende mengsel van kooldioxide en aceton stroomt met zodanig hoge snelheid dat de afvoerslang bevriest stijf vocht condenseren ijs aan de buitenkant. Het mengsel aftappen out bevat een aantal water, omdat de aceton is niet watervrij en dit water kan soms bevriezen in een mate die de afvoerslang eigenlijk klompen. Er moet letten dergelijke klompen en een onderbreking van stroom te luisteren. De afvoerklep dient te worden gesloten voor een paar minuten, zodat de klomp zal smelten als een klomp wordt gedetecteerd. Inhet ergste geval, als de afvoer klep niet is gesloten, een klomp kan veroorzaken zo veel druk op te bouwen dat de afvoerslang met kracht knalt uit het apparaat. Na de eerste verversingsperiodes, zal de meerderheid van de aceton gespoelde uit de inrichting, en het optreden van nat ijs brokken zal drastisch afnemen. De ontlading zal geleidelijk lijken droog ijs als de drooglegging protocol gaat verder met het resterende bewijs van aceton aanwezigheid (zoals geur) steeds niet op te sporen door het einde van de drooglegging proces.
Na de kooldioxide in het apparaat is overgegaan van vloeistof superkritisch fluïdum en de ontluchting is begonnen, moet het afgeven van vloeistof met een lage snelheid over ten minste 45 min zoals aangegeven in de procedure 9. Een hogere afgiftesnelheid kan de levensvatbaarheid van cyt in de aerogelen verlagen. C (zie figuur 9) en de aerogels zelf kunnen zelfs splitsen als the vloeistof haast zich om te ontsnappen aan de gels. In het algemeen, zelfs als de aerogels intact na het openen van de deur inrichting blijven, is het belangrijk om zorgvuldig en voorzichtig behandelen alsof zij bros en kan gemakkelijk breken.
De besturing silica gels die naast de cyt uitgegoten. C SiO2 gels worden gebruikt na superkritisch drogen om te bepalen of de kooldioxide overdracht de gels geslaagd. Soms cyt. C SiO2 gels lijkt troebel en het is belangrijk om te bepalen of dit het gevolg is incomplete oplosmiddeloverdracht of het kan te maken hebben met de concentratie van de cyt. C of buffer ingekapseld in de gels. Als de silicagels zonder cyt. C lijken een homogeen, doorschijnend verschijning door het hebben, kan dit worden beschouwd als bewijs dat het oplosmiddel overdracht heeft plaatsgevonden, ook niet als de cyt. C SiO2 gels wat troebelheid hen. Troebelheid in de silicagelszonder cyt. c na drogen geeft aan dat sommige aceton in de gels bleef tijdens de ontluchting.
Zoals aangegeven in de sectie protocol, moeten belangrijke voorzorgsmaatregelen moeten worden genomen bij het werken met stikstofmonoxide (NO). NO detecteren met de aerogels, is het noodzakelijk om de cuvette afdichting goed en het gas dat via aerogels in een zuurkast uitlaat. Alternatief kan de gehele spectrofotometer worden verplaatst naar een zuurkast met de NO gascilinder als extra voorzorgsmaatregel beperken van de blootstelling aan NO gas. Bij contact met lucht NO zal aanstonds de zeer giftige stikstofdioxide, stikstoftetroxide of beide. NO kan ook reageren met water om warmte en bijtende dampen produceren. Daarom kan langdurige blootstelling aan NO leiden tot direct toxiciteit weefsel.
Bij gebruik van de cyt. C SiO2 aërogels de aanwezigheid van stikstofmonoxide, dan voeren de Soret band aanvankelijk ten ~ 408 nm en verschuiventot ~ 414 nm in aanwezigheid van stikstofoxide. Na het inschakelen terug naar stikstof, moet de Soret band terug te keren naar zijn gecentreerd op ~ 408 nm. Het kan ook mogelijk zijn om de cyt gebruiken. C SiO2 aërogels de aanwezigheid van andere liganden te detecteren zoals koolmonoxide 27.
Verschillende beschreven werkwijzen omvatten een extra stap van het combineren gouden of zilveren nanodeeltjes met cyt. C in oplossing vóór het mengen van de sol en supercritically drogen tot 4-8 aerogels vormen. Vergelijken van de UV-zichtbare spectroscopie van cyt. C ingekapseld in aërogels met metalen nanodeeltjes die van cyt. C ingekapseld in aërogels zonder metaalnanodeeltjes blijkt dat deze twee soorten inkapselingstechnieken produceren cyt. C gelijksoortige levensvatbaarheid binnen de aerogels (figuur 5) . De cyt. C ingekapseld met metalen nanodeeltjes iets stabieler dan cyt. C kapselend zonder metalen nanodeeltjes in de aerogels 9. De CD spectra van beide soorten cyt. C aerogel is ook vergelijkbaar, hoewel beide verschillen van het spectrum van cyt. C in buffer aangeeft sommige ontvouwen van cyt. C binnen de aerogels (Figuur 7). Eerdere verslagen over cyt. C ingekapseld in aërogels suggereren dat de circulair dichroïsme spectroscopie waarschijnlijk beoordeelt de buitenste laag van eiwitten, ontvouwde bij contact met silicagel, respectievelijk tot metaal nanodeeltje-kernhoudende meerlaags cyt. C structuren of los georganiseerde structuren vormen als er geen metalen nanodeeltjes aanwezig zijn in aerogels 4,9. De meerderheid van de cyt. C in beide typen zelforganiserende structuur binnen de aerogelen gevouwen blijft zoals gemeten met UV-spectroscopie wel. Het voordeel van de hierin beschreven zonder nanodeeltjes protocol is dat dure aankoop of tijdrovende synthese van metaalnanodeeltjes is niet noodzakelijk. Eiwitten vaak niet met succes ingekapseld in aerogels, en dus deze procedure is belangrijk omdat het kan leiden tot de ontwikkeling van een meer algemene methode voor het inkapselen van andere eiwitten in aërogels met potentiële betekenis voor toekomstige bioanalytische apparaten.
The authors have nothing to disclose.
Steun voor dit werk en / of publicatie werd verstrekt door de Science Institute van Fairfield University's College van Kunsten en Wetenschappen, Fairfield Universiteit Faculty Research Grant, een Cottrell College Science Award van de Research Corporation for Science Advancement, Fairfield University's College of Arts & Sciences en Fairfield University Scheikunde en Biochemie afdeling. Wij dankbaar erkennen Jean Marie Wallace voor veel nuttig inzicht en advies met betrekking tot deze algemene onderzoeksgebied. Daarnaast breiden we een heel speciale dank aan alle vroegere, huidige en toekomstige undergraduate onderzoekers van de Harper-Leatherman Research Lab.
Potassium phosphate, monobasic | Fisher Scientific | P285-500 | Certified ACS (also possible to use sodium phosphate monobasic) |
Potassium phosphate dibasic anhydrous | Fisher Scientific | P288-500 | Certified ACS (also possible to use sodium phosphate dibasic) |
Water | Millipore Direct-Q | 18 MΩ cm | |
pH meter and electrode | Denver Instrument | UB-10 | |
Cytochrome c from equine heart | Sigma Aldrich | C7752-100MG | ≥95% based on Mol. Wt. 12,384, used as received and stored at -20°C |
Glass scintillation vials | Wheaton | 03-341-25J | 20 mL, O.D. x height (with cap): 28 mm x 61 mm |
Disposable cuvette | Fisher Scientific | 14-955-126 | methacrylate, 10 mm x 10 mm x 45 mm |
Ultraviolet Visible Spectrophotometer | Shimadzu | UV-1800 | Uses UVProbe v 2.33 software |
Circular dichroism spectrometer (or spectropolarimeter) | JASCO | J-810 | |
Isotemp Laboratory Refrigerator | Fisher Scientific | ||
Polypropylene disposable beakers | Fisher Scientific | 01-291-10 | 50 mL |
Tetramethylorthosilicate (also known as tetramethoxysilane, TMOS) | Sigma Aldrich | 218472-500G | 98% purity |
Methanol | Fisher Scientific | A457-4 | GC Resolv grade |
Ammonium hydroxide solution | Sigma Aldrich | 221228-25ML-A | ACS reagent, 28.0-30.0% |
General purpose polypropylene scintillation vials | Sigma Aldrich | Z376825-1PAK | 16 mm x 57 mm, volume size 6.5 mL, slice off bottom with sharp knife or razor |
generic plastic wrap | various | ||
Parafilm M laboratory wrapping film | Fisher Scientific | S37440 | |
Plastic syringe plunger | various | use syringe plunger from 3 mL syringe | |
Ethyl alcohol | Acros | 61509-0040 | Absolute, 200 proof, 99.5% A.C.S. reagent |
Acetone | Fisher Scientific | A949-4 | HPLC grade |
Critical point drying apparatus | Quorum Technologies | E3000 Series | |
Circulator | Fisher Scientific | Isotemp 3016 | |
Carbon dioxide cylinder | Tech Air | siphon tube | |
Micrometer | Central Tool Company | ||
GRAMS/AI 8.0 software | Thermo Electron Corporation | ||
Nitrogen cylinder | Tech Air | Another inert gas could be substituted | |
10% nitric oxide/90% nitrogen cylinder | Airgas | ||
Tygon tubing | various | ||
T-switch valve | various | ||
syringe needles | various |