Recently available video recording and spatiotemporal mapping (STmap) techniques make it possible to visualize and quantify both propagating and mixing patterns of intestinal motility. The goal of this protocol is to explain the generation and analysis of STmaps using the GastroIntestinal Motility Monitoring (GIMM) system.
Несколько подходы были использованы для записи и оценить моторику желудочно включая: записи изменений в мышечной напряженности, внутриполостной давлением, и мембранного потенциала. Все эти подходы в зависимости от измерения активности в одной или нескольких точках вдоль кишки одновременно, которые затем интерпретируются, чтобы обеспечить ощущение общей схеме моторики. В последнее время развитие видеозаписи и пространственно-временной отображение (STmap) методов позволили наблюдать и анализировать сложные узоры в бывших естественных условиях целых сегментов толстой кишки и кишечника. После регистрации и оцифровывается, видеозаписи могут быть преобразованы в STmaps, в котором диаметр просвета преобразуется в градации серого или [карты диаметр называется (Dmaps)] цвет. STmaps может предоставить данные о направлении моторики (т.е., стационарный, перистальтические, противоперистальтический), скорости, продолжительности, частоты и силы шаблонов сократительной подвижности. Преимущества этого подхода включают в себя: analysiс взаимодействия или одновременного развития различных форм подвижности в различных регионах в том же сегменте, визуализация подвижности шаблон меняется с течением времени, и анализ того, как деятельность в деятельности влияет одного региона в другой регион. Видеозаписи могут быть воспроизведены с различными сроками и параметров анализа, так что отдельные STmaps и узоры моторики могут быть проанализированы более подробно. Этот протокол специально детализирует последствия внутрипросветных живота жидкости и внутрипросветных стимулов, которые влияют на формирование моторики. Использование агонистов рецепторов просвета и антагонистов обеспечивает механистическую информацию о том, как определенные шаблоны инициируются и как один шаблон может быть превращено в другое рисунком. Техника ограничивается возможностью только измерить подвижность, который вызывает изменения в просвете диаметре, без предоставления данных об изменениях внутрипросветных давления или напряжения мышц, и по генерации артефактов на основе экспериментальной установки; хотя, analysiS методы могут объяснить эти вопросы. По сравнению с предыдущими методами видеозапись и STmap подход обеспечивает более полное представление о желудочно-кишечного.
Различные методы записи и анализа моторику кишечника были разработаны в течение последних 150 лет 1. Они варьировались от начального в естественных условиях наблюдения и описания Уильям Бомонт и Вальтера пушки на более поздних методов измерения и интерпретации мультисайтовой записи мышечного напряжения, внутриполостной давлением, и / или мембранного потенциала (т.е. соединительных потенциалы) 2 – 6. Эти последние подходы обеспечивают снимок общей схеме моторики, но ограничены по количеству сайтов записи и действия интерполяции данных в областях между ними сайтов записи.
Недавнее развитие видеозаписи и пространственно-временной отображение (STmap) методов позволили наблюдать и анализировать сложные узоры подвижности в бывших естественных условиях целых сегментов толстой кишки и кишечника. Первоначальные подходы, впервые описанные для Интескишечные сегменты в конце 1990-х, 7,8 зависели от следователя разработанное программное обеспечение для анализа видеозаписи, несколько групп уже созданы или изменены программное обеспечение для этой цели 2,8 – 12. В то время как многие группы генерируется свои программные пакеты или плагины, все они анализируют диаметры сегмента ткани и конвертировать эти разные диаметры в оттенках серого представления. Коммерчески доступный записи и системный анализ называется системой мониторинга желудочно-кишечного тракта (GIMM) обеспечивает ключ подхода, который позволяет для анализа как пропульсивной моторики через определения фекального скорости осадок в свинки дистальной толстой кишки 13, а также анализ движителей и смешивания моделей подвижности с стимул жидкости в неповрежденных сегментах кишечника 4,5,14 – 19. Этот последний подход зависит от генерации и анализа STmaps и описан в этой статье. Цель этого метода является увеличение тон возможность качественно и количественно анализируют различные шаблоны подвижности в кишечнике. В то время как другие группы использовали STmap для анализа подвижности через свое собственное программное обеспечение, это первое описание, как использовать GIMM анализировать образцы моторики генерацией STmaps. В настоящей работе, мы предоставляем подробные шаг за шагом инструкции о: подготовке кишечника тканей для записи видео, правильной настройке параметров записи видео в максимально способности обнаруживать изменения в диаметре ткани, создание STmaps, а также Интерпретация и анализ STmaps с использованием системы GIMM и программное обеспечение ImageJ.
Способ, описанный здесь, является специфическим для анализа просвета перфузии жидкости или полутвердые вещества, содержащие соединения, которые влияют на кишечную перистальтику узоры. Способ анализа кала движения гранул описано в работе мужского пола и его коллеги 13. Общий метод, описанный здесь может бытьприменены к другим трубчатых гладкомышечных органов, таких как: тонкой кишки, кровеносных сосудов, мочеиспускательного канала, мочеточников и др Хотя этот метод сам по себе не обеспечивает данные по изменению давления или напряжения мышц, она может быть в сочетании с использованием давления преобразователи, датчики силы или электрофизиологические измерения, чтобы обеспечить более полное представление о моделях моторики, как некоторые другие группы показали 2,15,20,21.
Моторику кишечника был просмотрен и описаны с различных точек зрения, основанных на природе параметров записывается. Запись видео и пространственно-временной отображение доказал ценный инструмент, который позволяет анализ общего движения и / или приведения в движение в течение длительного сегментов кишки, а также анализ деятельности в определенных точках вдоль сегмента. Подход к видеозаписи и пространственно-временной отображения может быть в два раза и отражает области рассмотрены и природы просвета содержимого. В кишечных сегментов, где просвета содержание больше жидкости, а в проксимальном отделе толстой кишки, где содержание больше полутвердый, активность индуцируется внутрипросветного введения жидкости болюсным вливанием или. Пространственно-временные карты, изготовленные из этих видеозаписей предназначены для представления движения всей сегмента, как описано выше. В противоположность этому, в середине-дистального отдела толстой кишки Если содержимое более прочной, активность инициируется посредством введения фекальной Pelleт (с эпоксидным покрытием природный или искусственный гранул гранул) и пространственно-временные карты разработаны с учетом движения гранул через толстую кишку, как показано в статье JOVE Гофмана и др., 13. Таким образом, настройка эксперимента и анализа являются критическими и зависят от типа стимула и области изучается. Таким образом, критические шаги для генерации и анализа пространственно-временных карт жидкости, вызванной моторики кишечника: 1) собственно удаление брыжейки от рассеченной ткани; 2) собственно калибровки изображения перед записью; 3) собственно удаление артефактов во время генерации и анализа STmap; 4) собственно установки системы анализа; и 5) набирает ловкость катетеризировать и шовные сегменты, не повреждая их.
Хотя использование STmaps диаметром просвета улучшили способность визуализации и анализа полных моделей подвижности по области кишечника, методика лучше всего использовать в сочетании сфункциональные измерения давления или сокращение мышц 2,15,20. Например, в то время как некоторые мышечные сокращения могут изменить просвета диаметр чуть-чуть и будет видна на некоторых STmaps (например, миогенные ряби), они могут на самом деле не вызывает никаких толчок или смешивание содержимого кишечника 25. Это не может быть известно без муфты этой методики других функциональных измерений. Кроме того, природа многих тканевых препаратов в этом типе системы (т.е. замкнутой системе просвета или постоянной просвета перфузии с помощью насосной системы) приводит к артефактам в пределах STmaps. Таким образом, пользователь должен быть в курсе, как их удельный подготовка органов и эксперимент может привести к появлению артефактов в данных и способы, чтобы избежать или исключить эти артефакты в анализе данных (например, брыжейки, вызванных вертикальные линии или темно-пикселизации из-за неспособности ткани к выталкивать жидкость из системы в закрытом подготовки просвета). Есть несколько методов для просвета перфузии втакта кишечного сегмента, кроме закрытой системе. Одним из способов является использование вместо открытую систему, которая поддерживает постоянную внутрипросветного / противодавление за счет использования повышенных трубки и / или односторонний клапан на конце анального препарата 8-10,30. Это позволяет жидкости, чтобы выйти из подготовки во пропульсивной схватки.
Как система настроена в основном для обнаружения изменений в просвете диаметре, эти сокращения или модели моторики, которые не имеют очень большое значение просвета диаметр зачастую трудно визуализировать с помощью этого протокола. Так как изменения в пиксельных шейдеров в пределах STmap основаны на изменении просвета диаметра, структуры моторики, которые не вызывают значительных изменений в диаметре не будет визуализировать также в этом методе, если сильные схватки также присутствуют в пределах одной записи. Как описано для визуализации и анализа сокращения пульсации типа (рисунок 3), установив линии анализа в видео записи ближе тО ткань стена может устранить эту проблему. Этот метод уменьшает максимальный диаметр отображается в STmap, так схватки, что только минимально изменять диаметр ткани могут быть визуализированы. Еще один вариант решения этой проблемы меняется продолжительность видео сегменте анализируемого, чтобы исключить сокращения которые значительно влияют просвета диаметр, так что меньшие сокращения более легко визуализировать. Это приводит к потенциальной проблемы подвижности, что минимально изменяет диаметр просвета ищет похожа на отдельном STmap, где сокращения значительные изменения просвета диаметр. Это потому, что определение белых пикселей на карте на основе наименьшего диаметра в данном видео. Если там не так много различия в диаметре в видео (немного или нет сокращения круговая мышца) очень маленьких сокращений, которые не изменяют диаметр подготовки значительно может выглядеть примерно перистальтических сокращений из другого видео. Поэтому, важно рассмотреть фигуруЛегенда в правом верхнем углу карты. Если разница между максимальным и минимальным диаметрами мала, важно, чтобы сравнить STmap на видео оно было подготовлено с, чтобы определить действительность изменения оттенка пикселей, как представлено в STmap. Таким образом, экспертиза баре масштаба в сочетании с реальной записи имеет решающее значение для правильной интерпретации карты.
Видеозапись и пространственно-временное отображение кишечных и толстой сегментов были применены к различным видам, включая данио 26, мыши 25,27 – 30, крысы 7,9,30 – 33, морской свинки 5,6,8,13 – 19, 24,30,32,34,35, щеткохвоста 12,36, кролик 2,30,37,38, курица 39, свинья 40,41 и 42 человек. Наиболее широко изученные виды является морская свинка. Это не удивительно, потому что свинки энтеральной нервной системы часа наиболее полно характеризуется и исторически она была животное наиболее изученным в пробирке в связи с пропульсивной моторики кишечника 43. Пространственно-временная отображение в основном была применена к трубчатым сегментов кишки от мелких животных; Однако исследования, проведенные в кроликов и свиней с использованием модифицированных систем продемонстрировать применение этой методологии к более крупных животных. В случае кролика, подход идентичен мелких животных исключением того, что более крупные сегменты и ванночках были использованы 30. Подход, используемый в свинью было использовать выводили петли кишечника с наркозом свиньи, а не погружения сегмента расчлененный ткани в ванне для органов. Кроме того, STmaps были получены с помощью кросс-корреляции, а не методом просвечивания, используемой в большинстве исследований 40. Изолированный, vascularly перфузии подготовка петля для записи видео и пространственно-временной отображения применяется также для мелких видов, таких как крысы <sup> 33. Недавнее исследование Kuizenga др. это первое использование STmaps видео записывается моторики закономерности в бывших естественных сегментов кишечника человека 42; хотя, STmapping подходы были применены к анализу манометрических (давление) записей в людях в естественных условиях 3,44. Записанные узоры моторики в ткани человека аналогичны тем, которые уже записаны в моделях на животных с использованием методов и аналогичные проверки расширение этого подхода к тканей человека. Стоит отметить, что данное исследование в сочетании STmaps получены из видеозаписей с измерением мышц записанного силовых преобразователей. Измерение внутрипросветного давления по волоконно-оптическому манометрическим катетер, введенный в Экс Vivo сегменте также преобразуется в STmap, показывающий универсальность STmap визуализировать более изменений в просвета. Этот комбинированный подход корреляции напряжение мышц, внутрипросветный давление и движение стенки позволяетдля более углубленного функционального анализа STmaps генерируемых из видео записи.
Исследования STmaps, полученных от движений стенки и изменения в просвета (также называемый Dmaps) позволили подробные описания шаблонов моторики, такие как прямоточных перистальтических волн и локализованных сегментных сокращений. В то время как эти модели были определены ранее экспериментальных методов, нынешний подход позволяет более изысканный определение локализованных движений, таких как сократительных рябь и новых анти-перистальтических сокращений 9,24,25,30,31,42. Строительство STmaps и анализа изменений в подвижности рисунком были применены на ключевые вопросы в желудочно-кишечном моторики кишечника и толстой кишки. К ним относятся: дифференциация нейрогенных и миогенных сокращений и определение роли интерстициальных клеток Кахаля 6,9,11,12,16,24,26,27,29 – 31,33,37 – 40,42, понимая комплексвзаимодействия между круговыми и продольными мышечными слоями 2,7,8,11,12,32,39,40, исследующие эффекты внутрипросветных питательных веществ 10,18,19, штаммы микроорганизмов 34 и вязкости 12,36 на различных форм подвижности, и понимание роли различных эндогенных нейрогуморальных агентов и экзогенных фармакологических агентов 2,4 – 7,9,10,13 – 17,28,35,40 в поколение и модификация подвижности. Будущее этой техники включает в себя соединения его с другими измерениями в том числе давления, электрофизиологии и натяжения / сократительной. Недавние исследования часто включают один или более из этих измерений в сочетании с видеозаписью и пространственно-временной отображения, чтобы обеспечить дополнительные детали корреляционные 2,42. Кроме того, система может быть использована для измерения подвижности в других трубчатых и не трубчатых органов. Например, были предприняты попытки при измерении с помощью двигательной функции желудкатакая система, но техника и программное обеспечение нуждаются в уточнении для более точной количественной моторику таким не-трубчатый орган 45. Существует никаких сомнений, что использование пространственно-временных методов картографирования отдельности и в сочетании с более традиционными методами анализа приведет к более углубленного и всестороннего понимания желудочно-кишечного в будущем.
The authors have nothing to disclose.
ДМК была поддержана гранта IRACDA от NIGMS (K12GM093857) на Университета Содружества Вирджинии. Эта работа была поддержана NIDDKD гранта DK34153 Джона Р. Гридер.
Sodium Chloride (NaCl) | Fisher | BP358 | For Krebs buffer. |
Potassium Chloride (KCl) | Fisher | BP366 | For Krebs buffer. |
Potassium Phosphate (KH2PO4) | Fisher | P285 | For Krebs buffer. |
Magnesium Sulfate (MgSO4) | Sigma | M2643 | For Krebs buffer. |
Calcium Chloride (CaCl2) | Sigma | C7902 | For Krebs buffer. |
Sodium Bicarbonate (NaHCO3) | Fisher | BP328 | For Krebs buffer. |
Glucose | Sigma | G7021 | For Krebs buffer. |
Carboxygen (95%O2/5%CO2) | |||
Dissecting pins | |||
Dissecting trays/dishes | |||
Dunkin Hartley Guinea Pigs | Charles River | Strain 051 | |
ImageJ | http://imagej.nih.gov/ij/ | Freely available online. | |
GastroIntestinal Motility Monitor (GIMM) | Catamount Inc., St. Albans, Vermont | Includes parts listed below. | |
Peristaltic Pumps | Included with GIMM. | ||
Bath Cameras | Included with GIMM. | ||
Bath TransIllumination Backlights | Included with GIMM. | ||
Organ Baths | Included with GIMM. | ||
Backlight Intensity Controls | Included with GIMM. | ||
GIMM Processor ImageJ Plugin | Included with GIMM. | ||
Polyethylene Tubing | Included with GIMM. | ||
Tubing Connectors | Included with GIMM. | ||
Masterflex tubing for Peristaltic Pumps | Included with GIMM. | ||
Heating Bath/Water Circulator | Included with GIMM. |