Zoogdieren omhulsel bevat oplosmiddel-extraheerbare lipiden die chemische samenstelling kenmerkend is voor individuele soorten kan bieden. Dit document presenteert een routinemethode voor het scheiden brede lipideklassen Integumentair geïsoleerd uit weefsels met behulp van dunnelaagchromatografie en waarin de triacylglyceride profiel door matrix-geassisteerde laser desorptie / ionisatie time-of-flight massaspectrometrie.
De zoogdieren integument bevat talgklieren die een olieachtige stof afscheiden op het huidoppervlak. Talgproductie is onderdeel van het aangeboren immuunsysteem dat beschermend tegen pathogene microben. Abnormale talgproductie en chemische samenstelling ook een klinisch symptoom van bepaalde huidziekten. Talg bevat een complex mengsel van lipiden, zoals triacylglyceriden, die soortspecifiek. De brede chemische eigenschappen vertoond door diverse lipideklassen belemmeren de specifieke bepaling van talg samenstelling. Analysetechnieken voor lipiden vergen doorgaans chemische derivatiseringen dat arbeidsintensieve en stijging monstervoorbereiding kosten. Dit document beschrijft hoe om lipiden te extraheren uit zoogdieren integument, aparte brede lipideklassen door dunne-laag chromatografie, en het profiel van de inhoud triacylglyceride behulp van matrix-assisted laser desorptie / ionisatie time-of-flight massaspectrometrie. Deze robuuste methode maakt een directe bepalingvan de triacylglyceride profielen tussen soorten en individuen, en kan gemakkelijk worden toegepast op elke taxonomische groep van zoogdieren.
Zoogdieren integumentary weefsels onder de opperhuid, verhoornde structuren (bv. haar en nagels) en exocriene klieren. Talg type exocriene klieren zijn geassocieerd met haarfollikels, die collectief worden aangeduid als de talgklieruitvoergang 1. Talgklieren laat een olieachtige afscheiding op het huidoppervlak aangeduid als talg. Talg is grotendeels samengesteld uit glycerolipids (bijv. triacylglyceriden [TAG]), vrije vetzuren acyls (FFAs), sterol / wasesters, en squaleen. Talg de chemische samenstelling is soortspecifiek 2. Naast het feit dat een deel van het aangeboren immuunsysteem en het verstrekken van antimicrobiële functie 3, talglipiden beïnvloeden belangrijke fysiologische processen waaronder waterverlies door verdamping via de huid 4, cellulaire integriteit en genregulatie 5, en absorptie 6. Sebaceous lipidesamenstellingen kan ook dienen als ziektemarkers. Veranderde verhoudingen en hoeveelheden talg bweg lipide klassen zijn klinische symptomen van ziekten zoals acne vulgaris 7, 8 roos, seborrheic dermatitis 8, asteatosis 9, onder anderen 10. Epidermale en haar weefsels bevatten variabele profielen met sterolen en derivaten, markeringen, FFAs, ceramiden, fosfolipiden, en andere kleine lipide componenten. Omdat integumentary lipiden kunnen functioneren ziekteprocessen bepalen verschillen in chemische samenstellingen van TAGs tussen gezonde en zieke individuen bruikbaar zijn voor klinische diagnose van ziekte.
Lipiden worden in het algemeen gedefinieerd als zijnde niet in water oplosbare organische verbindingen met ofwel niet-polaire of apolaire-polaire substituenten 11. Lipide structuren kunnen lange koolwaterstofketens, geoxygeneerde alkanen (zoals wax esters, FFAs, alcoholen, ketonen en aldehyden), of complexe ringstructuren zoals cholesterol 12. Er zijn acht grote klassen van lipiden basis van de structuur (FFAs, glycerolipids [GL] glycerophospholipids [GP], sfingolipiden [SP], sterol lipiden [ST], prenol lipiden [PR] saccharolipids [SL] en polyketiden [PK]), die een groot aantal chemische eigenschappen vertonen afhankelijk klasse 13. Vanwege de grote variatie in de chemische eigenschappen van lipide klassen, wordt direct profilering zonder voorafgaande derivatisering van vetmoleculen gewenst. Een opkomende werkwijze lipide activiteit is dunnelaagchromatografie (TLC) gecombineerd met matrix-assisted laser desorptie / ionisatie time-of-flight massaspectrometrie (MALDI-TOF MS) 14.
MALDI-TOF MS wordt veelvuldig gebruikt in proteomics onderzoek om eiwitten te identificeren en koppelen aan specifieke aminozuursequenties vanwege de zeer nauwkeurige peptide ion mass "fingerprints" gegenereerd door trypsine-gedigereerde eiwitten 15. MALDI-TOF MS kan ook worden gebruikt om andere biomolecuul klassen, waaronder lipiden zoals TAG 16-18 profileren. MALDI vereist het gebruik van een matrix, typtisch een organische verbinding die aromatische en geconjugeerde dubbele binding structuren bevat. De matrix moleculen dienen voorzichtig overdracht van de energie van de laser om de analyten, bevorderen protonenoverdracht en produceren enkelvoudig geladen gasfase ionen 19-21. Ionen worden onderworpen aan een hoge spanning veld onder hoog vacuüm en versneld in een TOF massa-analysator wanneer ionen vervolgens gescheiden door verschillen in snelheden die evenredig is met hun massa-tot-lading verhoudingen. Zelfs zeer grote biomoleculen kunnen worden geïoniseerd met weinig fragmentatie, het produceren van enkelvoudig geladen moleculaire ion soorten vereenvoudigde spectrum analyse. De mogelijkheid om vetmoleculen direct analyseren zonder voorafgaande derivaatvorming heeft bevorderd klaar goedkeuring van MALDI-TOF MS in lipidomic onderzoek 18.
Dit document presenteert een routine methode te isoleren en analyseren Integumentair lipiden uit het haar, de talgafscheiding en plagiopatagium van de Oost-rode vleermuis (Lasiurus Borealis). Dit wordt gebruikt om interspecifieke variaties in bat Integumentair lipiden bepalen om het ziekteproces van Wit-Nose Syndrome (WNS) 22 toe te lichten. WNS is een schimmelziekte van knuppels en wordt veroorzaakt door de nieuw beschreven psychrofiele soorten Geomyces destructans 23-25. WNS heeft de dood van meer dan 5 miljoen Noord-Amerikaanse grot vleermuizen veroorzaakt en bedreigt het uitsterven van kwetsbare soorten vleermuizen, met potentiële economische effecten van miljarden dollars aan schade aan de agrarische industrie 26,27. Om de stappen in G. onderzoeken destructans infectie werden lipiden geëxtraheerd uit het haar en vleugel weefsels van Oost rode vleermuizen en gescheiden in brede lipideklassen door TLC aan de TAG fractie voor verdere analyse door MALDI-TOF MS isoleren. Tags bevatten korte acylketens en zijn gemakkelijk gedetecteerd door MALDI-TOF MS met weinig matrix interferentie.
Dit document presenteert een eenvoudige en robuuste methode voor het scheiden van brede lipideklassen geïsoleerd van zoogdieren omhulsel door preparatieve TLC en het bepalen van TAG profielen door MALDI-TOF MS, zonder tijdrovende derivatisering van de vetmoleculen. De kritische stappen in het produceren van kwaliteit spectra van TAG's met MALDI-TOF MS zijn onder andere: 1) Succesvolle extractie van de verbinding met minimale vervuiling of oxidatie, 2) Voldoende scheiding en isolatie door chromatografie, en 3) een hoge resolutie en nauwkeurigheid van massa door MALDI-TOF MS.
Deze paper toont de methode door het winnen en het scheiden van de neutrale lipide fractie uit de plagiopatagium van de Oost-rode vleermuis om TAG MS profielen te verkrijgen. Hoewel de huidige studie gebruikte een vleermuis species (Mammalia: Chiroptera) deze werkwijzen kunnen worden uitgebreid tot bedekkinglijk lipiden van elke zoogdiersoort bestuderen. Bat omhulsel wordt gekenmerkt door overwegend cholesterol, met lagere hoeveelheden TAG, FFAs, squaleen, en sterol / wasesters. Talg lipideverhoudingen in knuppels verschillen van mensen, dat squaleen aanwezig in lage bedragen (in plaats van tot 16% bij de mens), terwijl cholesterol komt in grotere verhoudingen (1 – 7% bij mensen maar 26-62% in knuppels) 22 , 31. Menselijke haren bevatten ongeveer 3% TAGs, terwijl verhoudingen tot 28% gevonden in Oost rood bat haar. De extractie van lipide monsters van knuppels is vergelijkbaar voor andere soorten. Terwijl in deze studie watten gedrenkt in oplosmiddel gebruikt talg verwijderen, kan men ook zwenken flesje of monsterbuis met oplosmiddel op het oppervlak van het omhulsel meerdere keren. Gespecialiseerde tape producten bieden ook alternatieve middelen om het oppervlak lipiden halen 32. Een belangrijk onderdeel van een goede lipide extractie is om verontreiniging van de huid olie te minimaliseren. Dit is eenvoudig te realiseren door het houden van een knijpfles met methanol en spuiten van al het glaswerk en bestek, vegen gebruiksvoorwerpen met een weefsel tussen alle monsters en het dragen van onderzoekshandschoenen. Oxidatie of polyonverzadigde acyls wordt voorkomen door de toevoeging van BHT en moet ongeacht de temperatuur monsters opgeslagen worden.
Biomolecuul analyse vereist meestal een chromatografische stap om afzonderlijke moleculen van belang tegen verontreinigingen. TLC wordt gebruikt in deze werkwijze, die instrumentatie eisen voor gas-of vloeistofchromatografie vermijdt en vereist minder technische ervaring robuuste en herhaalbare resultaten. Afhankelijk van de lipide klasse plaats kunnen vele mobiele fasen worden opgenomen. Bovendien kan het gebruik van HPTLC platen en scanning densitometrie worden gebruikt om kwantitatieve resultaten te bereiken. Hoewel variaties van TLC methoden zijn te talrijk om hier een aantal gangbare mobiele fasen gebruikt lipide TLC onder chloroform: methanol: water voor scheiding van fosfolipiden en glycolipiden of isooctaan: ethylether voor het scheiden van niet-polaire lipiden 28. In termen van het scheiden van tags uit andere lipide klassen, de H: E: Een zolvent systeem werkt consequent en levert vergelijkbare resultaten.
Een ander voordeel voor het gebruik van TLC is dat banden van belang snel kan worden geprofileerd met behulp van MALDI-TOF MS zonder voorafgaande derivatisering van de analyten. In deze studie wordt de silica uit de TLC-plaat en de analyt geëlueerd uit door sonicatie in een oplosmiddel en daaropvolgende centrifugatie aan het adsorptiemiddel en verdamping van het eluerende oplosmiddel te scheiden. Als alternatief matrix kan direct op analyt bands gescheiden op TLC-platen en vervolgens direct geanalyseerd met MALDI-TOF MS 33 toegepast. Succesvolle profilering door MALDI-TOF MS doet beroep op voldoende monstervoorbereiding en vaardigheid van de operator met tuning en kalibreren van het instrument. Het instrument moet dagelijks worden gekalibreerd met normen voor molecuulgewichtbereik geschikt is voor de moleculen van belang. De geschikte gevoeligheid en resolutie (bijv. ≥ 10.000) van de apparatuur moet worden confirmedagelijks d met ACTH.
De talgklieren lipide bestanddelen gevonden op het oppervlak van zoogdieren omhulsel kan een rol spelen in de kolonisatie door bacteriën / schimmels. Daarom is kennis van de chemische samenstelling tussen soorten en individuen kan aanwijzingen over processen van mens en dier ziekten. Intraspecifieke verschillen tussen zieke en gezonde mensen kunnen klinische verschijnselen vertegenwoordigen die helpen bij ziekte opsporing en diagnose. Bovendien, als specifieke verbindingen die microbiële groei remmen aanwezig zijn, kunnen deze worden geïdentificeerd voor gebruik in de behandeling van ziekten en preventie.
The authors have nothing to disclose.
Hulp werd geboden door Scott Treece, Katelyn Arter, Jeremy Ragsdell, Tony LaMark James, Amy Fischer, Hannah Blair, en Cheyenne Gerdes tijdens de ontwikkeling van laboratoriumtechnieken. Wij willen de Medina-Bolivar Laboratory (Luis H. Nopo-Olazabal; Arkansas Biosciences Institute) bedanken voor hulp bij TLC scanning densitometrie. MALDI-TOF MS gebruikt voor dit project werd verstrekt door de NSF EPSCoR, RII: Arkansas ASSET Initiatief P3 Center (EPS-0701890) in de Arkansas Biosciences Institute. De financiering werd verstrekt door een Amerikaanse Fisheries and Wildlife Service / Arkansas State Wildlife Grant, de Nationale Speleologische Society, en het Centrum voor Noord-Amerikaanse Bat Research and Conservation aan de Indiana State University.
Name of the reagent | Company | Catalogue number | Comments (optional) |
Butylated Hydroxytoluene | MP Biomedicals, LLC | 101162 | www.mpbio.com |
TLC Flexible Plates | Whatman | 4410-222 | www.whatman.com |
ACTH | Sigma-Aldrich Chem. Co. | A8346-5X1VL | www.sigmaaldrich.com |
Triolein | Sigma-Aldrich Chem. Co. | 44895-U | |
TLC Lipid Standard | TLC 18-1 | www.nu-chekprep.com | |
MALDI TAG Standard | Nu-Check Prep., Inc. | NIH Code 53B | |
MALDI TAG Standard | Sigma-Aldrich Chem. Co. | 17810-1AMP-S | |
Glass Vials with Teflon Cap | U.S. National Scientific Co. | B7800-2 | www.nationalscientific.com/ |
DHB | Sigma-Aldrich Chem. Co. | 50862-1G-F | |
CHCA | Sigma-Aldrich Chem. Co. | C8982-10X10 mg | |
Sebutape | CuDerm | S100 |