比较方法来表征景观的宿主 - 病原体蛋白 - 蛋白相互作用

越来越多的数据收集产生的蛋白质 – 蛋白质相互作用图谱打开的角度来进一步了解病原体的感染。随着全球病原体感染的认识开始出现，它提供了访问连接时，病原体蛋白诱导人类蛋白质组¹范围内的扰动。因此，它提供了一种方式来理解，病原体如何操纵宿主细胞的机械。特别是，一些病毒宿主相互作用网络的映射显示，病毒蛋白的优先目标主机蛋白高度蜂窝网络中的连接（集线器），或中央许多在一个网络中的路径（瓶颈蛋白^）2-4。这些互动让病毒操纵重要的蜂窝流程，这是有助于复制并产生感染性子代。最近进行相关病毒与目标提取信息相对比较相互作用映射发病机制^4。此外，研究宿主病原体相互作用景观一直延伸到许多病原体^5。针对性的细胞因子识别提供洞察战略病原体感染细胞，并允许潜在的致病性标志物的检测。

酵母双杂交系统是目前最流行的方法来识别二进制交互作用，因为遗传筛查是一种高效，敏感的蛋白质 – 蛋白质相互作用的高通量映射工具。这里提出的方法，进一步提高个别Y2H放映通过评估多种病原体的蛋白质应变变种，从而提供比较概述病原宿主蛋白 – 蛋白相互作用。此外，酵母双杂交筛选的一个主要限制在于较高的假阴性率，因为它恢复约20％的总相互作用^6。这意味着，只有一个子集的病理检测的相互作用一族变种可能逃脱检测与他人。因此，从所有双杂交放映个别合作伙伴，新兴的互动与研究菌株齐全的进一步挑战，提供比较相互作用数据库。因为它表明，结合不同的方法强烈地增加了鲁棒性的蛋白-蛋白相互作用的数据集^7，此验证在哺乳动物细胞中进行了新开发的蛋白质片段互补法称为HT-GPCA ^8。此细胞为基础的系统允许，Gaussia颤通过互补性分裂的蛋白质的相互作用的检测荧光素酶和已被设计为具有高通量的格式兼容。基于其发光技术及其背景噪音低，与其他基于荧光检测相比，HT-GPCA显示了惊人的高灵敏度。

总体而言，这种做法构成了一个高效工具来生成一个全面的映射宿主 – 病原体interplays的，它代表一个全球性的理解宿主细胞劫持的第一步。