تم العثور على بروتينات Upf التي تقوم بالتحلل المتوسط بلا معنى (NMD) في جميع الكائنات حقيقية النواة ، بما في ذلك البشر. كل بروتين له دور فردي ، لكن يجب أن يعملوا بالتعاون. يفك حلزون RNA. نظرًا لأن Upf1 يمكنه فك أي RNA ، فإن Upf2 و Upf3 مطلوبان لمساعدة Upf1 على التمييز بين الهراء و mRNAs العادي.
عادةً ، يرتبط Upf3 بمركب موصل الإكسون (EJC) في مواقع لصق mRNA. إذا قام الريبوسوم بترجمة mRNA بالكامل ، فسيتم إزاحة Upf3 و EJC أثناء الترجمة. ومع ذلك ، إذا كان هناك كودون توقف سابق لأوانه ، فإن Upf3 يظل مرتبطًا بـ EJC ويمثل mRNA متحولة للتدهور.
قد تحدث تسلسلات الكودون غير المنطقية بشكل طبيعي في المناطق الداخلية من الرنا المرسال. ومع ذلك ، يمكن للطفرة أيضًا أن تنتج كودونًا غير منطقي ضمن تسلسل الجينات. تسمى هذه الطفرات الطفرات غير المنطقية. كما هو الحال في مسار NMD ، تؤدي هذه الطفرات أيضًا إلى الإنهاء المبكر للترجمة. عادة ما يكون عديد الببتيد غير المكتمل المركب غير نشط. يمكن استعادة الوظيفة الطبيعية للجين إذا قامت طفرة ثانية بتصحيح كودون الإنهاء لتسلسل ترميز الأحماض الأمينية ، أو قمع تأثيرات كود الإنهاء. تسمى هذه الطفرات المعدلة بمثبطات غير المنطقي. أكثر أنواع مثبطات غير المنطقي شيوعًا هي الطفرات في جينات الحمض النووي الريبي (tRNA) التي تنتج (tRNAs) متخصصة والتي تسمى الحمض الريبي النووي النقال الكابح. يمكن أن ترتبط هذه بكودون الإنهاء المبكر وتدخل حمض أميني في هذا الموضع.
