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Modelado de un sitio activo enzimático utilizando software gratuito de visualización molecular
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生化学
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JoVE Journal 生化学
Modeling an Enzyme Active Site using Molecular Visualization Freeware
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Modelado de un sitio activo enzimático utilizando software gratuito de visualización molecular

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•

14:37 min

•

December 25, 2021

DOI:

10.3791/63170-v

DOI:
10.3791/63170-v

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14:37 min
December 25, 2021

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1The University of Texas at Austin, 2Mount Mary University, 3College of St. Benedict/St. John’s University, 4Wabash College

概要

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Una habilidad clave en el modelado biomolecular es mostrar y anotar sitios activos en proteínas. Esta técnica se demuestra utilizando cuatro programas gratuitos populares para la visualización macromolecular: iCn3D, Jmol, PyMOL y UCSF ChimeraX.

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Molecular VisualizationEnzyme Active SiteGlucokinasePDBID 3FGULigandsSubstrate AnalogCatalytic ComplexBinding InteractionsUCSF ChimeraXMolecular ModelingBiological MacromoleculesVisualization Software

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Procko, K., Bakheet, S., Beckham, J. T., Franzen, M. A., Jakubowski, H., Novak, W. R. P. Modeling an Enzyme Active Site using Molecular Visualization Freeware. J. Vis. Exp. (178), e63170, doi:10.3791/63170 (2021).

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