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JUMPn: Una aplicación optimizada para la agrupación de coexpresión de proteínas y el análisis de redes en proteómica
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JUMPn: A Streamlined Application for Protein Co-Expression Clustering and Network Analysis in Proteomics
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JUMPn: Una aplicación optimizada para la agrupación de coexpresión de proteínas y el análisis de redes en proteómica

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07:28 min

•

October 19, 2021

DOI:

10.3791/62796-v

DOI:
10.3791/62796-v

•

07:28 min
October 19, 2021

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14 Views
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1Departments of Structural Biology and Developmental Neurobiology,St. Jude Children’s Research Hospital, 2Center for Proteomics and Metabolomics,St. Jude Children’s Research Hospital, 3Department of Computational Biology,St. Jude Children’s Research Hospital

概要

Automatically generated

Presentamos una herramienta de biología de sistemas JUMPn para realizar y visualizar análisis de red para datos proteómicos cuantitativos, con un protocolo detallado que incluye preprocesamiento de datos, agrupación de coexpresión, enriquecimiento de vías y análisis de red de interacción proteína-proteína.

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Vanderwall, D., Suresh, P., Fu, Y., Cho, J., Shaw, T. I., Mishra, A., High, A. A., Peng, J., Li, Y. JUMPn: A Streamlined Application for Protein Co-Expression Clustering and Network Analysis in Proteomics. J. Vis. Exp. (176), e62796, doi:10.3791/62796 (2021).

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