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RIBO-seq in Bakterien: ein Probensammlungs- und Bibliotheksvorbereitungsprotokoll für die NGS-Sequenzierung
章
- 00:00Introduciton
- 00:54Cell Harvesting and Lysis
- 04:13MNase Digestion and Size Selection of Samples for RIBO-seq
- 06:17rRNA Depletion and Alkaline Fragmentation of Samples for RNA-seq
- 07:07Library Preparation and Size Selection of cDNA Libraries
- 08:49Results: Quality of cDNA Libraries and Reads
- 11:31Conclusion
Hier beschreiben wir die Phasen der Probenentnahme und Vorbereitung für RIBO-seq in Bakterien. Die Sequenzierung der nach diesen Richtlinien erstellten Bibliotheken liefert ausreichende Daten für eine umfassende bioinformatische Analyse. Das Protokoll, das wir präsentieren, ist einfach, verwendet Standard-Laborgeräte und dauert sieben Tage von der Lyse bis zur Beschaffung von Bibliotheken.
