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RIBO-seq in Bacteria: un protocollo di raccolta dei campioni e preparazione della biblioteca per il sequenziamento NGS
章
- 00:00Introduciton
- 00:54Cell Harvesting and Lysis
- 04:13MNase Digestion and Size Selection of Samples for RIBO-seq
- 06:17rRNA Depletion and Alkaline Fragmentation of Samples for RNA-seq
- 07:07Library Preparation and Size Selection of cDNA Libraries
- 08:49Results: Quality of cDNA Libraries and Reads
- 11:31Conclusion
Qui descriviamo le fasi di raccolta e preparazione dei campioni per RIBO-seq nei batteri. Il sequenziamento delle biblioteche elaborate secondo queste linee guida si traduce in dati sufficienti per un'analisi bioinformatica completa. Il protocollo che presentiamo è semplice, utilizza attrezzature di laboratorio standard e richiede sette giorni dalla lisi all'ottenimento delle biblioteche.
