このコンテンツを視聴するには、JoVE 購読が必要です。 サインイン又は無料トライアルを申し込む。
RIBO-seq in Bacteria: een Sample Collection and Library Preparation Protocol voor NGS Sequencing
章
- 00:00Introduciton
- 00:54Cell Harvesting and Lysis
- 04:13MNase Digestion and Size Selection of Samples for RIBO-seq
- 06:17rRNA Depletion and Alkaline Fragmentation of Samples for RNA-seq
- 07:07Library Preparation and Size Selection of cDNA Libraries
- 08:49Results: Quality of cDNA Libraries and Reads
- 11:31Conclusion
Hier beschrijven we de stadia van monsterverzameling en voorbereiding voor RIBO-seq bij bacteriën. Sequencing van de bibliotheken die volgens deze richtlijnen zijn opgesteld, resulteert in voldoende gegevens voor een uitgebreide bio-informatische analyse. Het protocol dat we presenteren is eenvoudig, maakt gebruik van standaard laboratoriumapparatuur en duurt zeven dagen van lysis tot het verkrijgen van bibliotheken.
