Gerichte cross-linking massaspectrometrie creëert quaternaire eiwitstructuurmodellen met behulp van massaspectrometriegegevens die zijn verkregen met behulp van maximaal drie verschillende acquisitieprotocollen. Wanneer de resultaten worden uitgevoerd als een vereenvoudigde workflow op de Cheetah-MS-webserver, worden ze gerapporteerd in een Jupyter Notebook. Hier demonstreren we de technische aspecten van hoe de Jupyter Notebook kan worden uitgebreid voor een meer diepgaande analyse.
Khakzad, H., Vermeul, S., Malmström, L. Quaternary Structure Modeling Through Chemical Cross-Linking Mass Spectrometry: Extending TX-MS Jupyter Reports. J. Vis. Exp. (176), e60311, doi:10.3791/60311 (2021).