Здесь мы представляем протокол для обогащения, изоляции, идентификации и характеристики белков, модифицированных SUMO in vivo как из клеток гепатомы человека, так и опухолей печени, полученных из моделей мыши гепатоцеллюлярной карциномы с помощью SUMO-связывающих сущностей (SUBEs).