Aquí describimos un método para la toma de imágenes multifotonas de lapso de tiempo de alta resolución de células tumorales cerebrales antes y después de una intervención quirúrgica invasiva (por ejemplo, biopsia) dentro del mismo animal vivo. Este método permite estudiar el impacto de estos procedimientos quirúrgicos invasivos en el comportamiento migratorio, invasivo y proliferativo de las células tumorales a un nivel de células únicas.