CARIP-Seq and ChIP-Seq: Methods to Identify Chromatin-Associated RNAs and Protein-DNA Interactions in Embryonic Stem Cells

Benjamin L. Kidder

doi:10.3791/57481

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CARIP-Seq y ChIP-Seq: métodos para identificar cromatina asociada RNAs y las interacciones DNA proteína en las células madre embrionarias

JoVE Journal
発生生物学

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CARIP-Seq and ChIP-Seq: Methods to Identify Chromatin-Associated RNAs and Protein-DNA Interactions in Embryonic Stem Cells

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CARIP-Seq y ChIP-Seq: métodos para identificar cromatina asociada RNAs y las interacciones DNA proteína en las células madre embrionarias

DOI:

10.3791/57481-v

•

11:13 min

•

May 25, 2018

•

Benjamin L. Kidder²

¹Department of Oncology,Wayne State University医学部, ²Karmanos Cancer Institute,Wayne State University医学部

章

00:04標題
01:02Crosslinking of Embryonic Stem Cells for ChIP and CARIP
02:29Chromatin Sonication for ChIP and CARIP
03:48ChIP and CARIP Process
07:12Double-stranded cDNA Synthesis for CARIP-Seq
08:53Use of ChIP-Seq and CARIP-Seq to Study Global Protein-DNA Interactions and Chromatin-Associated RNAs in Embryonic Stem Cells
10:43Conclusion

概要

自動翻訳

Aquí, describimos los métodos para realizar ChIP-Seq y mapas de CARIP-Seq, incluyendo preparación de biblioteca para secuenciación de próxima generación, generar global epigenómica y RNA asociada a la cromatina en células madre embrionarias.

CARIP-Seq ChIP-Seq Chromatin-associated RNAs Protein-DNA Interactions Embryonic Stem Cells エピジェネティクス Transcription Factors Epigenetic Regulators Histone Modifications Chromatin Immunoprecipitation Sonication Formaldehyde Cross-linking Glycine Phosphate Buffered Saline Trypsinization MEF Medium Fetal Bovine Serum Sonication Buffer Sodium Dodecyl Sulfate

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