היסטונים הם חלבונים המסייעים לארגן DNA בגרעין אאוקריוטי על ידי משמש “פיגומים” שסביבם ניתן לעטוף DNA, ויוצרים קומפלקס הנקרא “כרומטין”. חלבונים אלה יכולים להשתנות באמצעות תוספת של קבוצות כימיות, ושינויים אלה משפיעים על ביטוי הגנים. חוקרים משתמשים בטכניקה הנקראת אימונופרציפיטציה של כרומטין (ChIP) כדי להבין טוב יותר אילו אזורי DNA מקשרים עם שינויים ספציפיים בהיסטון או חלבונים רגולטוריים אחרים. נוגדנים משמשים כדי לבודד את חלבון העניין, ואת ה- DNA הכבול מופק לניתוח.
כאן, JoVE מציג את העקרונות מאחורי ChIP, דן שינויים ספציפיים histone ואת הקשר שלהם ביטוי גנים וארגון DNA. לאחר מכן אנו בודקים כיצד לבצע פרוטוקול ChIP, ולחקור את הדרכים שבהן מדענים משתמשים כעת בטכניקה זו.
手順
אימונופרציפיטציה של כרומטין, או “ChIP”, היא טכניקה המשמשת חוקרים להערכת אינטראקציות חלבון-DNA. גורמי חלבון ממלאים תפקידים חשובים בוויסות הגנים; לא רק שהם מארגנים דנ”א בכרומוזומים, אלא גם נקשרים לרצפי דנ”א ספציפיים – הנקראים אתרי רגולציה – כדי להפעיל או להדחיק ביטוי. במהלך ChIP, הכרומטין – המורכב …