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预测与基因调控元件的验证激活过程中维甲酸诱导胚胎干细胞分化
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発生生物学
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JoVE Journal 発生生物学
Prediction and Validation of Gene Regulatory Elements Activated During Retinoic Acid Induced Embryonic Stem Cell Differentiation
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预测与基因调控元件的验证激活过程中维甲酸诱导胚胎干细胞分化

DOI:
10.3791/53978-v

•

09:07 min

•

June 21, 2016

•

, , ,
1Sanford-Burnham-Prebys Medical Discovery Institute at Lake Nona, 2生化学・分子生物学科,Research Center for Molecular Medicine, Medical and Health Science Center, University of Debrecen, 3MTA-DE “Lendulet” Immunogenomics Research Group,University of Debrecen

章

  • 00:05標題
  • 00:45Enhancer Selection Based on ChIP-seq Analysis
  • 01:27Transfection of Embryonic Stem Cells
  • 03:21β-Galactosidase and Luciferase Assays
  • 05:19Characterization of Enhancer RNA and Measurement of eRNA Transcription
  • 06:34Results: Retinoic Acid Induced Enhancer Activation in Embryonic Stem Cells
  • 08:13Conclusion

概要

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In this work we provide an experimental workflow of how active enhancers can be identified and experimentally validated.

タグ

Gene Regulatory ElementsEnhancersRetinoic AcidEmbryonic Stem Cell DifferentiationReporter Plasmid ConstructTransfectionTranscription Regulation

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