ジャーナル
/
生物工学
/
Da Voxels alla Conoscenza: Una guida pratica per la segmentazione del Complesso microscopia elettronica 3D-Data
JoVE Journal
生物工学
This content is Free Access.
JoVE Journal 生物工学
From Voxels to Knowledge: A Practical Guide to the Segmentation of Complex Electron Microscopy 3D-Data
Please note that all translations are automatically generated. Click here for the English version.

Da Voxels alla Conoscenza: Una guida pratica per la segmentazione del Complesso microscopia elettronica 3D-Data

24,186 Views

•

12:08 min

•

August 13, 2014

DOI:

10.3791/51673-v

DOI:
10.3791/51673-v

•

12:08 min
August 13, 2014

•

1 Views
, , , , , ,
1Life Sciences Division,Lawrence Berkeley National Laboratory, 2Joint Bioenergy Institute, Physical Biosciences Division,Lawrence Berkeley National Laboratory, 3National Energy Research Scientific Computing Center,Lawrence Berkeley National Laboratory

概要

Automatically generated

Il collo di bottiglia per cellulare microscopia elettronica 3D è estrazione di caratteristiche (segmentazione) in mappe di densità 3D altamente complessi. Abbiamo sviluppato una serie di criteri, che fornisce indicazioni su quale approccio di segmentazione (manuale, semi-automatico o automatico) è più adatto per diversi tipi di dati, fornendo così un punto di partenza per la segmentazione efficace.

Explore More Videos

3D Electron MicroscopyUltrastructural OrganizationSegmentationVisualizationQuantificationResin Embedded Stained Electron TomographyFocused Ion Beam- And Serial Block Face- Scanning Electron MicroscopyManual Model BuildingManual TracingSemi-automated ApproachesAutomated Custom-designed Segmentation AlgorithmsSurface RenderingQuantitative AnalysisTriage Scheme

Read Article

Cite this Article

Tsai, W., Hassan, A., Sarkar, P., Correa, J., Metlagel, Z., Jorgens, D. M., Auer, M. From Voxels to Knowledge: A Practical Guide to the Segmentation of Complex Electron Microscopy 3D-Data. J. Vis. Exp. (90), e51673, doi:10.3791/51673 (2014).

Download .ris file

Copy

Share Video

.

Copy