ジャーナル
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De voxels à la connaissance: Un guide pratique de la segmentation du complexe microscopie électronique 3D-données
JoVE Journal
生物工学
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JoVE Journal 生物工学
From Voxels to Knowledge: A Practical Guide to the Segmentation of Complex Electron Microscopy 3D-Data

De voxels à la connaissance: Un guide pratique de la segmentation du complexe microscopie électronique 3D-données

DOI:

12:08 min

August 13, 2014

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  • 00:05標題
  • 02:04Manual Abstracted Model Generation
  • 04:47Manual Tracing of Features of Interest
  • 08:10Automated Density-based Segmentation
  • 09:15Custom-tailored Automated Segmentation
  • 09:41Results: Application of Four Segmentation Approaches to Example Data Sets
  • 11:29Conclusion

概要

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Le goulot d'étranglement pour la microscopie électronique 3D cellulaire est l'extraction de caractéristiques (segmentation) dans des cartes très complexes de densité 3D. Nous avons développé un ensemble de critères, qui fournit des précisions sur l'approche de segmentation (manuel, semi-automatique ou automatique) est le mieux adapté pour différents types de données, fournissant ainsi un point de départ pour la segmentation efficace.

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