Wir beschreiben eine Methode zur Trennung von Organellen Dichte in lebenden<em> Drosophila</em> Embryonen. Die Embryonen werden in Agar eingebettet und zentrifugiert. Diese Technik liefert reproduzierbare Trennung von wichtigen Organellen entlang der anterior-posterior Embryo-Achse. Diese Methode erleichtert die Kolokalisation Experimente und liefert Organelle Fraktionen für die biochemische Analytik und Transplantation Experimente.