Cette étude présente une méthode d’analyse de la morphologie des mitochondries basée sur l’immunomarquage et l’analyse d’images dans le tissu cérébral de souris in situ. Il décrit également comment cela permet de détecter les changements dans la morphologie mitochondriale induits par l’agrégation des protéines dans les modèles de la maladie de Parkinson.
Les mitochondries jouent un rôle central dans le métabolisme énergétique des cellules, et leur fonction est particulièrement importante pour les neurones en raison de leur forte demande énergétique. Par conséquent, le dysfonctionnement mitochondrial est une caractéristique pathologique de divers troubles neurologiques, y compris la maladie de Parkinson. La forme et l’organisation du réseau mitochondrial sont très plastiques, ce qui permet à la cellule de répondre aux signaux et aux besoins environnementaux, et la structure des mitochondries est également étroitement liée à leur santé. Ici, nous présentons un protocole pour étudier la morphologie mitochondriale in situ basé sur l’immunomarquage de la protéine mitochondriale VDAC1 et l’analyse d’images ultérieure. Cet outil pourrait être particulièrement utile pour l’étude des maladies neurodégénératives car il peut détecter des différences subtiles dans le nombre et la forme des mitochondries induites par des agrégats de α-synucléine, une protéine sujette à l’agrégation fortement impliquée dans la pathologie de la maladie de Parkinson. Cette méthode permet de rapporter que les neurones dopaminergiques de la substantia nigra pars compacta hébergeant des lésions pS129 présentent une fragmentation mitochondriale (comme le suggère leur rapport d’aspect réduit, AR) par rapport à leurs neurones voisins sains dans un modèle de Parkinson à injection intracrânienne fibrillaire préformé.
Le système nerveux central a une demande intense d’ATP : les neurones utilisent l’ATP pour soutenir les gradients ioniques, la synthèse des neurotransmetteurs, la mobilisation, la libération et le recyclage des vésicules synaptiques, et pour permettre la traduction et la dégradation locales des protéines. Plus de 95 % de l’ATP utilisé par le cerveau est produit par les mitochondries1. Il n’est donc pas surprenant que le dysfonctionnement mitochondrial soit particulièrement nocif pour les neurones. En fait, les déficiences de la fonction mitochondriale jouent un rôle important dans plusieurs maladies neurologiques, y compris les maladies neurodégénératives, telles que la maladie de Parkinson (MP) et la maladie d’Alzheimer (MA)2,3.
De multiples gènes sont sans équivoque liés à des protéines codant pour la qui sont pertinentes pour la fonction mitochondriale et l’homéostasie, telles que Parkin 4,5,6, PTEN-induced kinase 1 (PINK1)7,8 et DJ-19. D’autres preuves d’un rôle du dysfonctionnement mitochondrial dans la MP sont que les traitements avec des inhibiteurs du complexe I de la chaîne de transport d’électrons mitochondriale (tels que la roténone et le MPTP) récapitulent plusieurs aspects de la MP in vitro et in vivo10. Cependant, il est important de préciser que de nombreux processus pathologiques peuvent entraîner une perte neuronale dans la MP, ainsi que des déficits mitochondriaux : le stress oxydatif, l’altération de l’homéostasie calcique, l’échec de l’ubiquitine-protéasome et des systèmes autophagie-lysosomal, et l’agrégation des protéines sont parmi les plus étudiés (examinés en 11,12,13 et).
Les mitochondries sont de forme hétérogène : en plus des unités individuelles, on les trouve généralement sous forme de réseaux réticulaires et tubulaires étendus. La structure et l’emplacement cellulaire des mitochondries sont essentiels à leur fonction14 ; En fait, les réseaux mitochondriaux sont extrêmement dynamiques, subissant de fréquents processus de fission, de fusion et de mitophagie afin de répondre aux besoins des cellules et de répondre aux signaux environnementaux15,16. De plus, la morphologie des mitochondries est intimement liée à leur état de santé. Par exemple, dans l’atrophie optique humaine, les mutations génétiques qui réduisent l’activité mitochondriale conduisent à des mitochondries anormales, minces et hyperfusionnées17. D’autre part, une variété de maladies humaines présentent une morphologie mitochondriale aberrante, y compris la fragmentation mitochondriale ou la fusion mitochondriale excessive, qui ont des effets néfastes sur la fonction mitochondriale (examiné dans18). Dans le contexte de la MP, nous avons déjà montré avec d’autres que la forme anormale des mitochondries est corrélée à un dysfonctionnement en réponse aux agrégats de α-synucléine19. Bien que la morphologie mitochondriale ait été largement étudiée in vitro dans le contexte de la MP et d’autres maladies 20,21,22, il n’existe pas de protocoles pour l’évaluation de la morphologie mitochondriale à partir de coupes in vivo. Cela rend l’étude in vivo des mitochondries dans le contexte de maladies telles que la MP fortement dépendante des animaux transgéniques23 ou de l’évaluation d’extraits de mésencéphale qui ne peuvent pas fournir de résolution cellulaire.
Ici, un protocole est présenté pour étudier la morphologie mitochondriale in situ comme indicateur de leur état fonctionnel et de leur santé, basé sur l’immunomarquage de la protéine mitochondriale VDAC124 suivi d’une analyse d’images dans des coupes de tissus enrobés de paraffine. Nous montrons également les résultats de ce protocole dans des modèles de MP in vitro et in vivo : cellules de neuroblastome surexprimant la SNCA (Synucléine Alpha) et tissu cérébral de souris soumises à une injection intracrânienne de fibrilles préformées de α-synucléine (PFF). La co-immunocoloration avec un anticorps contre la α-synucléine (dans les cellules) ou la phosphoSer129-α-synucléine pS129 (dans le cerveau de souris) nous a permis d’identifier des cellules présentant une pathologie protéique agrégée (fibrilles de α-synucléine et de α-synucléine surexprimées, respectivement) dans les échantillons, tandis que les cellules négatives servaient de contrôle non pathologique dans les mêmes échantillons. Grâce à cette analyse et aux données décrites ici, un rapport d’aspect réduit a été observé, indiquant la fragmentation des mitochondries dans les cellules surexprimant le SNCA ou présentant des lésions pS129.
Dans l’ensemble, cette étude montre que l’immunomarquage combiné à l’analyse d’images est une méthode fiable pour analyser la morphologie mitochondriale. En effet, il permet de quantifier le nombre de mitochondries ainsi que certains paramètres morphologiques tels que l’aspect ratio en culture cellulaire et en tissu. Le nombre de mitochondries est directement lié à l’état fonctionnel des mécanismes de fission et de fusion des échantillons, tandis que la valeur AR repose sur l’allongement de l’organite. Cette méthode peut être particulièrement utile pour l’évaluation rapide des anomalies mitochondriales dans des modèles de MP dans lesquels l’altération de la morphologie, de la dynamique et des fonctions mitochondriales est un mécanisme pathologique bien connu28,29. α-synucléine joue également un rôle important dans la MP : en effet, la α-synucléine est l’un des composants des corps de Lewy, les agrégats fibrillaires cytoplasmiques utilisés pour le diagnostic post-mortem des patients atteints de la MP30. De plus, des mutations du gène SNCA ont été trouvées chez des patients atteints de MP familière et sporadique (examiné dans31). Il a été largement démontré que la phosphorylation de la α-synucléine au niveau de Ser129 marque une pathologie de type Lewy-Body, qui émerge après une agression par PFF et provoque divers effets toxiques32,26.
En utilisant l’outil présenté ici, nous avons pu détecter une réduction du nombre mitochondrial et des valeurs AR en présence de α-synucléine surexprimée et agrégée (cellules présentant une coloration à la α-synucléine et neurones portant des lésions positives à la phosphoSer129α-synucléine, respectivement) par rapport aux cellules dépourvues de telles lésions (cellules α-synucléine et phosphoS129α-synucléine négative). Ces résultats concordent avec les rapports précédents montrant comment les interactions directes α-synucléine-mitochondries produisent des effets toxiques sur la fonction mitochondriale et l’homéostasie dans26,33 34. En effet, il a été rapporté que les souris présentant des mutations de la α-synucléine présentent une augmentation des dommages à l’ADN mitochondrial35 et de la mitophagie 36,37. De plus, il a été décrit que l’augmentation des niveaux de α-synucléine favorise la fission/fragmentation mitochondriale, induit des espèces réactives de l’oxygène dans les mitochondries et dérègle l’expression des protéines mitochondriales dans les lignées cellulaires et les modèles murins surexprimant la α-synucléine 26,38,39.
Il est important de souligner que cet outil dépend fortement des anticorps utilisés pour l’étude ; Une évaluation morphologique minutieuse de la coloration des anticorps utilisée est impérative pour détecter le compartiment subcellulaire approprié. Comme cette technique est basée sur des coupes de 5 μm et nécessite donc des plans focaux uniques pour l’analyse des structures mitochondriales, l’absence d’un phénotype n’exclut pas l’existence d’un phénotype, car il est possible que des différences subtiles dans la morphologie mitochondriale ne soient pas détectées par cette méthode.
Bien que ce travail et d’autres aient déjà utilisé des approches similaires pour évaluer la morphologie mitochondriale in vivo40, il est nécessaire de mettre un protocole détaillé à la disposition de la communauté des chercheurs pour cette évaluation. L’importance de cette étude est qu’il est possible d’appliquer cette méthode à divers modèles de maladies in vivo pour évaluer les anomalies morphologiques mitochondriales et identifier les pathologies potentielles, ce qui pourrait éventuellement faciliter le criblage de composés phares pour le traitement de ces troubles. Bien que cette analyse soit actuellement limitée aux tissus inclus dans la paraffine, l’avantage de la méthode est qu’elle peut être appliquée à n’importe quel modèle de maladie après le prélèvement de tissus en phase terminale, ce qui en fait un outil très polyvalent.
The authors have nothing to disclose.
Nous tenons à remercier les bailleurs de fonds de cette étude, en particulier Ikerbasque, le ministère espagnol de la Science et de l’Innovation, la Fondation Michael J Fox, IBRO et le Centre basque Achucarro pour les neurosciences.
32 G Hamilton syringe | Hamilton | 7632-01 | |
4',6-diamidino-2-fenilindol, dihidrocloruro (DAPI) | Invitrogen | D1306 | |
4/0 USP 45 cm suture | SSa90 pga | 32345n-36u | |
Alexa fluor 488/594-Donkey anti-Mouse | Invitrogen | A21202; A21203 | green/red dye-Donkey anti-Mouse |
Alexa fluor 594/647-Donkey anti-Rabbit | Invitrogen | A21207 A31573 | red/far red dye-Donkey anti-Rabbit |
AlexaFluor 488-Donkey anti-Chicken | Jackson ImmunoResearch | 703-545-155 | green dye-Donkey anti-Chicken |
Anti-PSer129 α-synuclein EP1536Y (Rabbit) antibody | Abcam | ab51253 | |
Anti-TOM 20 (Mouse) antibody | Santa Cruz | sc-17764 | |
Anti-Tyrosine Hydroxylase (Chicken) antibody | Abcam | ab76442 | |
Anti-VDAC1 (Mouse) antibody | Santa Cruz | sc-390996 | |
Anti-α-synuclein antibody MJFR1 (Rabbit) | Abcam | ab138501 | |
Citrate buffer 100X stock: 120mM citrate buffer, 5% Tween in water (pH 6) | Home-made | ||
Disposable base mold for tissue embedding | Fisher | 22-363-553 | Plastic embedding boxes |
D-MEM F12 | Gibco | A321331020 | |
EVOS M7000 Imaging System | ThermoFisher Scientific | High-content automated fluorescence microscope | |
Fetal Bovine Serum | Gibco | 10270106 | |
Flat optical bottom 96 well plates | Greiner | 675090 | |
FluorSave Reagent | Millipore | 345789-20ML | Mounting reagent |
Glutamine 200 mM | Gibco | 25030-024 | |
ImmEdge Hydrophobic Barrier Pen | Vector Laboratories | H-4000 | PAP-pen |
Lipofectamine and Plus Reagent | Invitrogen | 11668-019; 11514-015 | Transfection reagent and transfection adjuvant |
Matrigel | Corning | 354230 | Coating matrix |
Microtome | ThermoFisher Scientific | ||
Normal Donkey Serum | Gibco | PCN5000 | |
Opti-MEM | Gibco | 31985070 | Transfection medium |
PCDNA4 plasmid (backbone) | Addgene | 41036 | |
Penicillin/Streptomycin solution | Gibco | 15140-122 | |
SH-SY5Y cells/well | ATCC | HTB-11 | |
Xylene substitute | Labbox | 22L36504 | |
Zeiss Axio Imager Apotome 2 | Carl Zeiss | Structured illumination fluorescence imaging system | |
α-synuclein peptide | rpeptide | S-1010-2 |