インフルエンザAウイルス(IAV)感染は、宿主およびウイルスタンパク質を切断するカスパーゼを活性化し、次に、プロウイルスおよび抗ウイルス機能を有する。阻害剤、RNA干渉、部位特異的突然変異誘発、およびウェスタンブロッティングおよびRT-qPCR技術を採用することにより、宿主コルタクチンおよびヒストンデアセチラーゼを切断する感染哺乳類細胞におけるカスパーゼが同定された。
システインプロテアーゼのファミリーであるカスパーゼは、微生物感染を含むさまざまな刺激に応答してプログラムされた細胞死を調整します。当初はアポトーシスによって起こると説明されていましたが、プログラムされた細胞死は、パイロトーシス、アポトーシス、ネクロプトーシスの3つの相互接続された経路を含むことが現在知られており、一緒になって1つのプロセスであるパントーシスとして造られています。インフルエンスAウイルス(IAV)感染は、さまざまなカスパーゼの活性化を誘導することにより哺乳類細胞のパンノプトーシスを誘導し、さまざまな宿主およびウイルスタンパク質を切断し、宿主の自然抗ウイルス応答の活性化や拮抗宿主タンパク質の分解などのプロセスを引き起こします。これに関して、宿主コルタクチンのカスパーゼ3媒介切断、ヒストンデアセチラーゼ4(HDAC4)、およびヒストンデアセチラーゼ6(HDAC6)が、IAV感染に応答して動物およびヒト上皮細胞の両方で発見されている。これを実証するために、阻害剤、RNA干渉、および部位特異的突然変異誘発法を使用し、続いて、コルタクチン、HDAC4、およびHDAC6ポリペプチドの切断または切断に対する耐性および回収をウェスタンブロッティングによって測定しました。これらの方法は、RT-qPCRと組み合わせて、IAVまたは他のヒトおよび動物ウイルスの感染中にカスパーゼ媒介切断を受けている宿主およびウイルスタンパク質を同定するための単純でありながら効果的な戦略を形成します。本議定書は、この戦略の代表的な結果を詳述し、それをより効果的にする方法についても議論する。
インフルエンザAウイルス(IAV)は、 オルトミクソウイルス科 のプロトタイプメンバーであり、世界的な流行と予測不可能なパンデミックを引き起こすことが知られています。IAVは、一般に「インフルエンザ」として知られているヒト呼吸器疾患、インフルエンザを引き起こします。インフルエンザは、宿主の炎症誘発性および抗炎症性の自然免疫応答の誘導とヒト気道の上皮細胞の死をもたらす急性疾患です。どちらのプロセスも、プログラムされた細胞死と呼ばれる現象によって支配されています1。プログラムされた細胞死のシグナル伝達は、さまざまな病原体認識受容体が宿主細胞に入ってくるウイルス粒子を感知するとすぐに誘導されます。これは、感染した細胞の死のプログラミングと、パイロトーシス、アポトーシス、ネクロプトーシスと呼ばれる3つの相互接続された経路による隣接する健康な細胞へのシグナル伝達につながります-最近、1つのプロセスとして造られました、 PANoptosis1。
PANoptosisは、誘導から実行までの多くの宿主およびウイルスタンパク質のタンパク質分解プロセスを含みます。このようなタンパク質のプロセシングは、主にカスパーゼ1,2と呼ばれるシステインプロテアーゼのファミリーによって主導されています。最大18個のカスパーゼ(カスパーゼ1からカスパーゼ18まで)が知られています3。ほとんどのカスパーゼはプロカスパーゼとして発現され、ウイルス感染のような刺激に応答して自己触媒または他のカスパーゼ4のいずれかによって独自のタンパク質分解処理を受けることによって活性化される。IAV感染細胞のPANoptosisは宿主防御機構であると考えられていましたが、IAVは、その複製を促進するためにそれを回避および悪用する方法を進化させました1,2,5,6。それらの1つは、本質的に抗ウイルス性であるか、IAVライフサイクルのステップの1つを妨害するカスパーゼ媒介性の切断または分解を介して宿主因子に拮抗することです。この目的のために、宿主因子であるコルタクチン、HDAC4、およびHDAC6は、IAV感染上皮細胞においてカスパーゼ媒介切断または分解を受けることが発見されている7、8、9。HDAC4およびHDAC6は抗IAV因子8,10であり、コルタクチンは感染の後期段階、潜在的にウイルスの集合および出芽中にIAV複製を妨害する11。
さらに、さまざまなカスパーゼも活性化され、それが次に複数のタンパク質を切断して、IAV感染中の宿主炎症反応を活性化します1,2。さらに、核タンパク質(NP)、IAV 12,13,14のイオンチャネルM2タンパク質、および他のウイルス3,15,16の様々なタンパク質も、感染中にカスパーゼ媒介切断を受け、ウイルスの病因に影響を与える。したがって、ウイルス病因の分子基盤を理解するために、IAVおよび他のウイルス感染中の宿主およびウイルスタンパク質のカスパーゼ媒介切断または分解を研究することが継続的に必要とされています。本明細書では、(1)カスパーゼによるそのようなタンパク質の切断または分解を評価し、(2)それらのカスパーゼを同定し、および(3)切断部位を特定するための方法が提示される。
ウイルスは宿主の要因と経路をその利益に合わせて調整することが確立されています。次に、宿主細胞はさまざまな戦略を採用することによってそれに抵抗します。それらの戦略の1つは、宿主細胞がウイルス感染に対する抗ウイルス戦略として使用するパンノプトーシスです。しかし、IAVのようなウイルスは、パンノプトーシスに対抗し、それを有利に利用するために独自の戦略を進化させ…
The authors have nothing to disclose.
A549 cells | ATCC | CRM-CCL-185 | Human, epithelial, lung |
Ammonium chloride | Sigma-Aldrich | A9434 | |
Caspase 3 Inhibitor | Sigma-Aldrich | 264156-M | Also known as 'InSolution Caspase-3 Inhibitor II – Calbiochem' |
cOmplete, Mini Protease Inhibitor Cocktail | Roche | 11836153001 | |
Goat anti-NP antibody | Gift from Richard Webby (St Jude Children’s Research Hospital, Memphis, USA) to MH | ||
Lipofectamine 2000 Transfection Reagent | ThermoFisher Scientific | 31985062 | |
Lipofectamine RNAiMAX Transfection Reagent | ThermoFisher Scientific | 13778150 | |
MDCK cells | ATCC | CCL-34 | Dog, epithelial, kidney |
MG132 | Sigma-Aldrich | M7449 | |
Minimum Essential Medium (MEM) | ThermoFisher Scientific | 11095080 | Add L-glutamine, antibiotics or other supplements as required |
MISSION siRNA Universal Negative Control #1 | Sigma-Aldrich | SIC001 | |
Odyssey Fc imager with Image Studio Lite software 5.2 | LI-COR | Odyssey Fc has been replaced with Odyssey XF and Image Studio Lite software has been replaced with Empiria Studio software. | |
Pierce BCA Protein Assay Kit | ThermoFisher Scientific | 23225 | |
Plasmid expressing human cortactin-GFP fusion | Addgene | 50728 | Gift from Kenneth Yamada to Addgene |
Pre-designed small interferring RNA (siRNA) to caspase 3 | Sigma-Aldrich | NM_004346 | siRNA ID: SASI_Hs01_00139105 |
Pre-designed small interferring RNA to caspase 6 | Sigma-Aldrich | NM_001226 | siRNA ID: SASI_Hs01_00019062 |
Pre-designed small interferring RNA to caspase 7 | Sigma-Aldrich | NM_001227 | siRNA ID: SASI_Hs01_00128361 |
Pre-designed SYBR Green RT-qPCR Primer pairs | Sigma-Aldrich | KSPQ12012 | Primer Pair IDs: H_CASP3_1; H_CASP6_1; H_CASP7_1 |
Protran Premium nitrocellulose membrane | Cytiva (Fomerly GE Healthcare) | 10600003 | |
Rabbit anti-actin antibody | Abcam | ab8227 | |
Rabbit anti-cortactin antibody | Cell Signaling | 3502 | |
Rabbit anti-GFP antibody | Takara | 632592 | |
SeeBlue Pre-stained Protein Standard | ThermoFisher Scientific | LC5625 | |
Transfection medium, Opti-MEM | ThermoFisher Scientific | 11668019 | |
Tris-HCl, NaCl, SDS, Sodium Deoxycholate, Triton X-100 | Merck | ||
Trypsin, TPCK-Treated | Sigma-Aldrich | 4370285 |