هنا ، نصف طريقة لتوليد الورم الأرومي الدبقي (GBM) العضوي من عينات المرضى الأولية أو مزارع الخلايا المشتقة من المريض والحفاظ عليها حتى النضج. تحتوي هذه المواد العضوية GBM على مجموعات خلايا متنوعة ظاهريا وتعيد إنشاء بيئات دقيقة للورم خارج الجسم الحي.
الورم الأرومي الدبقي (GBM) هو سرطان الدماغ الخبيث الأولي الأكثر شيوعا مع تشخيص ضعيف للغاية. يمكن للتنوع الخلوي والجزيئي داخل الرحم ، بالإضافة إلى التفاعلات المعقدة بين البيئات الدقيقة للورم ، أن يجعل العثور على علاجات فعالة تحديا. ويمكن للطرق التقليدية للاستزراع الالتصاق أو المجال أن تخفي مثل هذه التعقيدات، في حين أن الاستزراع العضوي ثلاثي الأبعاد يمكن أن يلخص التدرجات البيئية الدقيقة الإقليمية. المواد العضوية هي طريقة لثقافة GBM ثلاثية الأبعاد تحاكي بشكل أفضل بنية ورم المريض ، وتحتوي على مجموعات خلايا متنوعة ظاهريا ، ويمكن استخدامها في التجارب متوسطة الإنتاجية. على الرغم من أن الثقافة العضوية ثلاثية الأبعاد أكثر شاقة واستهلاكا للوقت مقارنة بالثقافة التقليدية ، إلا أنها توفر فوائد فريدة ويمكن أن تعمل على سد الفجوة بين الأنظمة الحالية في المختبر وفي الجسم الحي . أثبتت المواد العضوية نفسها كأدوات لا تقدر بثمن في ترسانة علماء الأحياء السرطانية لفهم سلوك الورم وآليات المقاومة بشكل أفضل ، وتستمر تطبيقاتها في النمو. هنا ، يتم توفير تفاصيل حول طرق توليد وصيانة المواد العضوية GBM. كما يتم وصف تعليمات حول كيفية إجراء تضمين وتقسيم العينات العضوية باستخدام كل من تقنيات تضمين المجمدة والبارافين ، بالإضافة إلى توصيات للكيمياء النسيجية المناعية وبروتوكولات التألق المناعي على الأقسام العضوية ، وقياس الجدوى الكلية للخلايا العضوية.
الورم الأرومي الدبقي (GBM) هو ورم الدماغ الأولي الأكثر شيوعا مع تشخيص قاتم لمدة 15 شهرا تقريبا من التشخيص1. العلاجات التي تكون فعالة في الدراسات قبل السريرية يمكن أن تكون في كثير من الأحيان ضعيفة الفعالية في المرضى 2,3. تعزى الاستجابة السريرية الضعيفة إلى العديد من العوامل ، بما في ذلك عدم تجانس البيئة الدقيقة ل GBM والتفاعلات المعقدة داخل الرحم. قد يكون من الصعب إعادة إنشائها في بيئة المختبر باستخدام طرق الالتصاق التقليدية أو زراعة المجال4. وجود مجموعة فرعية من الخلايا الجذعية السرطانية ذاتية التجديد (CSCs) داخل GBM قد يساهم أيضا في هذا التعقيد 5,6. تعتبر CSCs حاسمة لانتشار الورم والحفاظ على نمو الورم من خلال تعزيز تولد الأوعية الدموية النشط ، وغزو السرطان ، ومقاومة العلاجات بما في ذلك الإشعاع7،8،9. لا يتم توزيع CSCs بشكل موحد في جميع أنحاء الأورام ولكن يتم إثراؤها داخل بيئات دقيقة محددة ، بما في ذلك المناطق المحيطة بالأوعية الدموية والمناطق المعجانة ، والتي توفر كل منها تنظيما جزيئيا متميزا لحالاتها الخلوية10،11،12،13،14. CSCs ليست متلقين سلبيين لإشارات البيئة الدقيقة ولكن بدلا من ذلك تمتلك القدرة على إعادة تشكيل بيئاتها الدقيقةالخاصة بها 7،15،16. يمكن للبيئة الدقيقة ل CSC تعزيز الحفاظ على حالة الخلايا الجذعية استجابة لضغوط مثل ندرة المغذيات ودرجة الحموضة ونقص الأكسجة17،18،19،20 ، مما يشير إلى أهمية هذه الظروف في نظام نموذجي. لذلك فإن تلخيص البيئة الدقيقة الخلوية المتنوعة داخل الأورام أمر بالغ الأهمية لفهم المقاومة العلاجية وتحديد العلاجات الجديدة.
زادت شعبية الثقافة ثلاثية الأبعاد في السنوات الأخيرة21,22. تم استخدام المواد العضوية في أنواع أخرى من السرطان ، والهدف الأساسي من الحفاظ على الخلايا كعضويات هو السماح بنمو مجموعات الخلايا غير المتجانسة (التي قد يكون الكثير منها عادة متفوقا في ثقافة المجال الأكثر تجانسا) والتنوع المكاني ، الذي ينظر إليه على أنه بيئات دقيقة إقليمية للورم ذات خصوصية وراثية4،23،24،25،26 . هناك العديد من الطرق للزراعة ثلاثية الأبعاد للخلايا السرطانية ، والتي لكل منها مزايا وعيوب27،28،29. لا يقصد من الثقافة العضوية أن تكون بديلا عن الثقافة التقليدية الملتزمة أو الكروية. من الأفضل استخدامه كتقنية مكملة للطرق ثنائية الأبعاد عندما تكون هناك أسئلة محددة يكون فيها التفاعل بين البيئة الدقيقة للخلية واستجابات الخلايا السرطانية أمرا بالغ الأهمية.
توضح هذه المقالة طرقا موثوقة وقابلة للتكرار لإنشاء عضويات GBM من عينات المرضى الأولية أو الثقافات المشتقة من المريض. نحن نعالج هدفين مختلفين للثقافة العضوية ثلاثية الأبعاد: (1) إنشاء عضويات من أنسجة المريض الأولية ، مع أقصى قدر من إمكانات التطعيم بغض النظر عن التوحيد ، أو (2) زراعة عضويات موحدة للاستخدام التجريبي الكمي. عند إنشاء عينة أولية كمواد عضوية ، ليس من الضروري تصفية الخلايا المفردة أو عد الخلايا ، لأن الحفاظ على الحد الأقصى لأعداد الخلايا وأنواعها لإنشاء الثقافة الأولية هو أولوية. ومع ذلك ، عند زراعة المواد العضوية للتجارب المقارنة ، هناك حاجة إلى الترشيح أحادي الخلية وعد الخلايا لضمان أن تكون المواد العضوية المكررة قابلة للمقارنة من أجل الاتساق التجريبي. يوضح هذا البروتوكول بالتفصيل كيفية إنشاء مزارع عضوية وإنشاء عضويات موحدة ، بالإضافة إلى طرق محسنة لتضمين المواد العضوية والحفاظ عليها وتجارب زراعة الخلايا القياسية ، بما في ذلك الكيمياء النسيجية المناعية ، والتألق المناعي ، وتقييم الجدوى الكلية للخلية في المواد العضوية GBM.
GBM organoids هي طريقة استزراع مكملة للمجالات التقليدية التي تتضمن عدم تجانس خلوي وبيئي دقيقأكبر 4,22,30. على الرغم من أن الثقافة العضوية تتطلب المزيد من الوقت والموارد الكثيفة الاستخدام ، إلا أنها يمكن أن توفر نظرة ثاقبة قيمة على السلوك داخل الأخلاق وآليات مقاومة الأدوية.
يتم دفع GBM من قبل عدد سكان CSCs 5,31 ، وقد تم تطوير هذه الأساليب للسماح بالنمو المستمر والتجديد الذاتي لسكان CSC هؤلاء. من المعروف أن عامل نمو البشرة (EGF) وعامل نمو الخلايا الليفية (FGF) يعززان صيانة الخلايا الجذعية ونموها ويوفران إشارات مستقبلات التيروزين كيناز النشطة (RTK). يعتمد تكوين مجموعات خلوية غير متجانسة وبيئات دقيقة متميزة للورم داخل أورام GBM على دعم سلوكيات CSC. اختيار lrECM يحاكي بيئة الدماغ الغنية باللامينين ويدعم الخلايا في الثقافة العضوية للتنظيم الذاتي والهجرة عن طريق الغزو. على الرغم من أن بعض المجموعات قد أنشأت ثقافة عضوية دون استخدام وسائط lrECM أو EGF / FGF المخصبة24,28 ، والتي قد توفر طريقة أكثر كفاءة من حيث الوقت لطريقة الاستزراع هذه واختيار أقوى للإشارات السرطانية المنشأ لدفع النمو ، فقد تم اختيار هذه الطرق لتحسين بيئة الخلايا الجذعية المؤيدة لتحديد أفضل عدم التجانس الخلوي للعضويات. تم تصنيع كل من المواد العضوية الدماغية و GBM العضوية باستخدام lrECM في الأدبيات السابقة21،32،33. على الرغم من أننا أنشأنا بيانات تتعلق بمجموعات الأورام الموجودة داخل المواد العضوية والتباين المكاني ، إلا أنه لا يعرف سوى القليل عن المجموعات السكانية غير السرطانية داخل المواد العضوية ومدة بقائها على قيد الحياة من عينات المرضى الأصلية. قد توفر بعض بقع المدينة العالمية للخدمات الإنسانية (مثل CD45) هذه البيانات ، ويمكن أن تكون نقطة بحث مثيرة للاهتمام في المستقبل مع المواد العضوية.
معرفة الاستخدام المقصود للثقافة العضوية مهم لاختيار الطرق المناسبة. إن إنشاء عضويات من العينات الأولية مقابل زراعة عضويات موحدة لتجارب محددة لها إجراءات مختلفة قليلا. إن تقدير كيفية نضج المواد العضوية وملئها بصريا في سقالة lrECM أمر مهم للتمكن من تخصيص الوقت والموارد المناسبة للثقافة العضوية. سوف تتوسع المناطق المتناثرة من الخلايا في المواد العضوية ببطء وتنمو لملء lrECM ، والتي يمكن أن تستغرق في أي مكان من 2-8 أسابيع ، اعتمادا على سلوك العينة. معدل النمو هذا جوهري إلى حد ما لكل عينة. يتم الحفاظ عليها عبر دفعات مختلفة من المواد العضوية وتتفق إلى حد ما مع المعدل النسبي لنمو الكرة. يمكن الحفاظ على المواد العضوية لأكثر من 1 سنة والاحتفاظ بقدرات تكوين الورم على xenograft في الفئران. ومع ذلك ، يوصى بزراعتها لغرض متميز يتمثل في عدم إهدار موارد المختبر (المواد والوقت على حد سواء)4. تم اختبار النمو العضوي في أحجام وتنسيقات آبار متعددة ، ويظهر أن لوحة 10 سم هي الإعداد المثالي للحفاظ على الجدوى المثلى للخلية ، تليها لوحة من 6 آبار مع ثلاثة عضويات لكل بئر34. تستهلك المواد العضوية المزيد من الوسائط مقارنة بنظيراتها من الثقافة ثنائية الأبعاد ، ولا يؤدي استخدام تنسيق بئر أصغر إلى الصيانة المناسبة. على سبيل المثال ، لا يحتوي بئر واحد من لوحة تنسيق 96 بئرا على مساحة كافية أو حجم وسائط بالنسبة لحجم العضو العضوي للحفاظ على نمو العضوي.
كما تنشأ المواد العضوية ، فإن الملاحظة أمر مهم لزيادة النجاح. في البداية ، سوف تستهلك المواد العضوية الوسائط ببطء ، ولكن عندما تصبح أكثر كثافة وأكثر نضجا ، فإنها ستستهلك الوسائط بسرعة أكبر. يمكن أن تساعد إضافة الفينول الأحمر إلى الوسائط في العمل كمؤشر على استهلاك الوسائط. عندما تكون الوسائط صفراء أكثر، قد يدفعنا ذلك إلى تعديل نمط التغذية، سواء كان ذلك لتبادل حجم أكبر من الوسائط، أو زيادة إجمالي كمية الوسائط في اللوحة، أو تقسيم المواد العضوية بين لوحات زراعة الخلايا المتعددة لمواكبة نموها، أو حتى ضبط الجدول الزمني للتجارب.
من نواح كثيرة ، تعد المواد العضوية طريقة غير فعالة لإجراء أبحاث السرطان. فهي تنطوي على نطاقات زمنية طويلة ، وهي مكلفة وكثيفة الموارد مقارنة بثقافة المجال GBM. ومع ذلك ، بالمقارنة مع xenografts المشتقة من المريض ، وهي طريقة بديلة لإعادة خلق التنوع الخلوي والبيئي الجزئي ، فهي أكثر وضوحا وأقل تكلفة ويمكن التحكم فيها. اختيار أفضل وقت لاستخدام المواد العضوية مهم للباحثين في مجال السرطان. وليس المقصود منها أن تحل محل المجال التقليدي أو الثقافة الملتزمة بها وليس أن تحل محل نماذج xenograft. يمكن للعضويات ، عند تطبيقها على السؤال العلمي الصحيح ، الجمع بين فوائد هذين النظامين وقد تسمح لنا بمراقبة بيولوجيا الخلايا السرطانية التي كانت ستبقى مخفية لولا ذلك. بدأ المجتمع العلمي للتو في فهم فرص التعلم التي توفرها المواد العضوية ، ولكن من الواضح أنها ستكون أداة لا تقدر بثمن في المستقبل لفهم البيولوجيا المعقدة ل GBM.
The authors have nothing to disclose.
نود أن نشكر الدكتور جاستن لاثيا على نصائحه القيمة ودعمه المستمر. كما نشكر كاترينا فايف وليزا والاس ومايا كامهي على دعمهم الفني الممتاز.
3,3-Diaminobenzidine (DAB) tablets | MP Biomedicals | 08980681 | 3,3-Diaminobenzidine (DAB) tablets |
96-well PCR plates | ThermoFisher Scientific | 96-well PCR plates | |
Accutase | ThermoFisher Scientific | SCR005 | Cell detachment solution |
Antibiotic-antimycotic | ThermoFisher Scientific | 15240062 | Antibiotic-antimycotic |
B-27 supplement minus vitamin A | ThermoFisher Scientific | 12587001 | B-27 supplement minus vitamin A (50x) |
GelCode Blue Stain Reagent | ThermoFisher Scientific | 24590 | Bluing reagent |
Cell strainer (70 µm) | CellTreat Scientific | 229483 | Cell strainer (70 µm) |
CellTiter-Glo 3D | Promega | G9681 | Luminescent cell viability assay |
Clarifier 2 | ThermoFisher Scientific | 7301 | Nuclear hematoxylin clarifying reagent |
Clear-Rite 3 | ThermoFisher Scientific | 6901 | xylene substitute |
Epredia Gill 2 Hematoxylin | ThermoFisher Scientific | 72504 | Hematoxylin |
Glutamine in 0.85% NaCl | ThermoFisher Scientific | 35050061 | Glutamine in 0.85% NaCl (200 mM) |
Matrigel | ThermoFisher Scientific | 354234 | Laminin-enriched extracellular matrix |
Mini PAP pen | ThermoFisher Scientific | 008877 | Hydrophobic barrier pen |
Mounting medium | ThermoFisher Scientific | 22-050-102 | Mounting medium |
Neurobasal media minus phenol red | ThermoFisher Scientific | 12349015 | Neurobasal media minus phenol red (500 mL) |
Normal donkey serum (NDS) | Jackson ImmunoResearch | 017-000-121 | Normal donkey serum (NDS) |
Paraformaldehyde 4% in PBS | ThermoFisher Scientific | AAJ19943K2 | Paraformaldehyde 4% in PBS |
Phenol red | Sigma | P0290 | Phenol red (0.5%) |
ProLong Gold Antifade Mountant with DAPI | ThermoFisher Scientific | P10144 | Liquid curing mountant |
Recombinant human EGF protein | R&D systems | 236-EG-01M | Recombinant human EGF protein (250 µg/mL) |
Recombinant human FGF basic | R&D systems | 4144-TC-01 | Recombinant human FGF basic (250 µg/mL) |
SignalStain Antibody Diluent | Cell Signaling | 8112 | Antibody diluent |
SignalStain Boost IHC Detection Reagent | Cell Signaling | 8114 | Immunohistochemistry detection reagent |
SignalStain Citrate Unmasking Solution | Cell Signaling | 14746 | Citrate unmasking solution |
Single edge razor blade | Uline | H-595B | Single edge razor blade |
Sodium pyruvate | ThermoFisher Scientific | 11360070 | Sodium pyruvate (100 mM) |
Tissue-Tek Cryomolds | VWR | 25608-916 | Disposable cryomolds |
Tissue-Tek O.C.T. Compound | VWR | 25608-930 | Optimal cutting temperature compound |
Trypan Blue Stain | ThermoFisher Scientific | T10282 | Cell impermeant stain (0.4%) |
Xylene | ThermoFisher Scientific | X3P-1GAL | Xylene |