في هذه المقالة, نعرض كيفية استخدام نظام تسجيل النقاط السبع لقياس التغييرات التي تطرأ باستمرار على مورفولوجيا الخلايا العصبية الدوبامين في C. elegans. ويهدف هذا النظام لتحليلات المقايسات التنكس العصبي الدوبامين باستخدام النماذج الوراثية والكيميائية والعمرية من الاضطرابات العصبية.
وتشارك فقدان الخلايا العصبية الدوبامين في علم أمراض مرض باركنسون (PD), اضطراب العصبية السائدة للغاية التي تؤثر على أكثر من 10 مليون شخص في جميع أنحاء العالم. نظرا لأن العديد من التفاصيل حول مسببات PD لا تزال غير معروفة ، فإن الدراسات التي تحقق في المساهمين الوراثيين والبيئيين في PD ضرورية لاكتشاف طرق الوقاية والإدارة والعلاج. قد يكون التوصيف السليم لفقدان الخلايا العصبية الدوبامين ذات صلة ليس فقط بأبحاث PD ، ولكن بالاضطرابات العصبية الأخرى المنتشرة بشكل متزايد.
هناك نماذج وراثية وكيميائية راسخة من التنكس العصبي الدوبامين في نظام نموذج Elegans Caenorhabditis ، مع سهولة تصور البيولوجيا العصبية المدعومة بشفافية النيماتود والهندسة العصبية الثابتة. على وجه الخصوص، يمكن تصور التغيرات المورفولوجية العصبية الدوبامينية ل C. elegans باستخدام سلالات مع المراسلين الفلوريين مدفوعين بمضوانات خاصة بالخلايا مثل جين ناقل الدوبامين dat-1، والذي يتم التعبير عنه حصريا في الخلايا العصبية الثمانية الدوبامين.
مع قدرات هذا النظام النموذجي والتكنولوجيا المناسبة، وقد درست العديد من المختبرات التنكس العصبي الدوبامين. ومع ذلك ، هناك القليل من الاتساق في الطريقة التي يتم بها تحليل البيانات ويستخدم الكثير من الأدبيات الحالية تحليلات التهديف الثنائية التي تلتقط وجود الانحطاط ولكن ليس التفاصيل الكاملة لتطور فقدان الخلايا العصبية. هنا، نقدم نظام تسجيل عالمي لتقييم التغيرات المورفولوجية والانحطاط في التشعبات العصبية السيفالية C. elegans. يسمح هذا المقياس ذو السبع نقاط بالتحليل عبر مجموعة كاملة من مورفولوجيا التغصن ، بدءا من الخلايا العصبية الصحية لإكمال فقدان التغصن ، والنظر في التفاصيل المورفولوجية بما في ذلك مكامن الخلل ، والمتفرعة ، والبليبس ، والفواصل. مع هذا النظام التهديف، يمكن للباحثين تحديد التغيرات الدقيقة المرتبطة بالعمر، فضلا عن التغيرات الناجمة عن المواد الكيميائية أكثر دراماتيكية. وأخيرا، نحن نقدم مجموعة من الصور الممارسة مع التعليق التي يمكن استخدامها لتدريب ومعايرة وتقييم اتساق التهديف من الباحثين جديدة لهذه الطريقة. وينبغي أن يحسن ذلك الاتساق داخل المختبر وفيما بينهما، وزيادة الصرامة والقابلية للاستنساخ.
مرض باركنسون (PD) هو مرض تنكسي عصبي شائع بشكل متزايد يصيب ما يصل إلى 10 ملايين شخص في جميع أنحاء العالم1. الذكور وكبار السن من الأفراد هم أكثر عرضة لتطوير PD; متوسط عمر بداية المرض هو 60 عاما ، ويرتفع معدل الإصابة PD من 0.3٪ في عموم السكان إلى 3٪ في الأفراد الذين تزيد أعمارهم عن 80 عاما من العمر1،2. على الرغم من أن تفاصيل علم الأمراض PD غير مفهومة تماما ، إلا أن هذا الاضطراب التدريجي ينطوي على فقدان الخلايا العصبية الدوبامين في منطقة نيغرا تحتستانتيا في الدماغ المتوسط. آليات المفترضة من هذه الخسارة العصبية تنطوي على خلل الميتوكوندريا, الإجهاد التأكسدي, والتهاب2. ولا تزال أسباب المرض وعوامل الخطر التي يسببها قيد البحث، ولكنها تنطوي على مزيج من العوامل البيئية والوراثية1. على سبيل المثال، وجدت الدراسات روابط إيجابية بين استخدام المبيدات الحشرية مدى الحياة وPD، فضلا عن الحساسية الوراثية لPD الأسرة1،3.
نظام نموذج C. elegans, وضعت أصلا جزئيا لأبحاث البيولوجيا العصبية4, هو مناسبة تماما لتقييم فقدان الخلايا العصبية الدوبامين في الجسم الحي. ناس وزملاؤه رائدة في استخدام C. elegans لdوبامينججيك العصبي5,ومنذ ذلك الحين اعتمدت العديد من المجموعات الدودة كنموذج ناجح لPD والخلل الدوبامين6, 7,8,9,10,11,12,13,14,15,17 ،18،19،20. C. elegans هي نماذج الأمراض العصبية جيدة لكثير من نفس الأسباب التي هي مثل هذا الكائن نموذج شعبية لمجالات أخرى من علم الأحياء; شفافيتها يسمح لدراسة في الجسم الحي من العمليات الخلوية، والتلاعب الجيني في الديدان سريعة نسبيا وسهلة، لديهم جيل قصير من الوقت من حوالي ثلاثة أيام، وأنها سهلة للحفاظ على21. معظم نماذج دودة PD تندرج في واحدة من ثلاث فئات: النماذج القائمة على العمر، والنماذج الكيميائية، والنماذج الوراثية. القدرة على مزامنة مجموعة من الديدان يسمح لدراسة التنكس العصبي المرتبط بالعمر لنموذج العمر القائم على الأمراض العصبية المرتبطة بالشيخوخة، مثل PD22. وقد تم إنشاء التعرض الكيميائية التي تسبب عيوب الخلايا العصبية مثل PD باستخدام مجموعة متنوعة من المواد الكيميائية بما في ذلك 6-هيدروكسيدوبامين (6-OHDA)، rotenone، و 1-ميثيل-4-فينيل-1،2،3،6-رباعي هيدرودروبيريدين (MPTP)22. كما تستخدم الديدان بنجاح كنماذج وراثية من PD; سلالات مع اختيار الجينات العصبية بالضربة القاضية يمكن نموذج مختلف الأمراض العصبية1،4. وقد تم فحص مجموعات متعددة باستخدام C. elegansمجموعات متعددة من العوامل الوراثية والبيئية، أو “التفاعلات الجينية البيئية”، والتي من المرجح أن تلعب دورا رئيسيا في PD 2 و17و23و24 و 25و26و 27و28. وأخيرا, وقد لوحظ أيضا التنكس العصبي الدوبامين المرتبطة بالعمر29,30. إذا كان استخدام سلالة معدلة وراثيا العصبية المناسبة في التصوير الفلوري، يمكن استخدام أي من هذه النماذج دودة PD لدراسة التنكس العصبي الدوبامين.
تحديد التغيرات في مورفولوجيا الخلايا العصبية هو عنصر حاسم في البحوث العصبية التنكسية. في C. elegans، تم استخدام العديد من سلالات المراسل الفلوري لتصور التغيرات المورفولوجية وفقدان الخلايا العصبية. سلالات مناسبة للتصوير العصبي ميزة بروتين الفلورسنت المرتبطة المروجين الخلايا الخاصة. بالنسبة لمقايسات التنكس العصبي الدوبامين، استخدم مختبرنا سلالة BY200[vtIs1 ( dat-1p::GFP، rol-6)] التي تحتوي على علامة بروتين فلوري أخضر (GFP) في جين dat-1، والتي يتم التعبير عنها في الخلايا العصبية الدوبامينية. لاحظ أن النمط الظاهري الأسطوانة BY200 لديه نسبة وبين منخفضة جدا ونادرا ما يلاحظ. وتشمل السلالات الشائعة الأخرى المستخدمة لهذا النوع من التصوير BY250 [dat-1p::GFP]، BY273 [baEx18 [دات-1p::GFP+دات-1p::WT α-syn]] وBZ555 [egIs1 [dat-1p::GFP]] والعديد من المختبرات الأخرى المتاحة من مركز علم الوراثة Caenorhabditis (CGC) أو بناء على طلب من مختبرات محددة1،21،22،29 . هذه السلالات تسمح عادة لتصور جميع الفئات الثلاث من الخلايا العصبية الدوبامين: السيفال (CEP), ديريد الأمامية (ADE), والخلايا العصبية postdeirid (PDE). C. elegans لا يعبر بطبيعة الحال عن بروتين ألفا سينوكلين، ولكن تم تصميم سلالات مثل BY273 للتعبير عن ذلك. ومع ذلك، نلاحظ أن نظام التهديف الذي نقدمه تم تطويره باستخدام BY200، والذي لا يعبر عن ألفا سينوكلين، وسيحتاج إلى التحقق من صحته مع تلك السلالة (أو أي سلالة جديدة أخرى) قبل الاستخدام. الخلايا العصبية الدوبامين إضافية موجودة في الذكور ولكن نادرا ما تعتبر لأن الذكور يشكلون عادة <1٪ من السكان C. elegans. هنا، ونحن نركز على الخلايا العصبية الدوبامين CEP الأربعة الموجودة في منطقة الرأس من C. elegans. هذه المجموعة من الخلايا العصبية يقع بسهولة تحت المجهر الفلورسنت، موجود في كل من الديدان hermaphrodite والذكور، لا تتداخل عادة مع مجالات أخرى من الفلورسينس السيارات، ويتم الإبلاغ عنها عادة في دراسات دودة. وتجدر الإشارة إلى أن هذه الخلايا العصبية ليست myelinated, الخلايا العصبية الظهرية CEP (CEPD) تتعرض مباشرة لسائل الجسم الزائف حيث كما الخلايا العصبية البطنية CEP ليست كذلك. عادة ما تعرض مجموعة صحية من dendrites CEP كخطوط مستقيمة نسبيا وغير منقطعة. قد تظهر التشعبات المتحللة أي مزيج من المخالفات وعلامات الضرر ، بما في ذلك النقاط الواضحة التي تسمى blebs على طول خط التشعب والفواصل في خط التشعب. ويمكن رؤية أمثلة من الخلايا العصبية CEP في مستويات متفاوتة من الانحطاط في الشكل 1.
على الرغم من أن الدوبامين العصبي يجري دراستها من قبل عدد متزايد من مختبرات C. elegans, كان هناك اختلاف كبير في الأساليب التحليلية لتحديد تلف الخلايا العصبية الدوبامين29,31,32,33,34. وقد ذكرت العديد من الدراسات المنشورة على وجود أو غياب سوما CEP مع نظام تسجيل ثنائي من الخلايا العصبية نوع التنكسية مقابل نموذجية أو البرية31,32. يمكن أن تحدد طرق التسجيل هذه بعض الضغوطات التي تحفز التنكس العصبي ولكنها لا تستطيع تحديد تفاصيل تطور تلف الخلايا العصبية الأكثر دقة ، أو اكتشاف الاختلافات بسهولة بين التنكس العصبي على النحو الناجم عن المواد الكيميائية الفريدة أو المتغيرات الأخرى. بالإضافة إلى ذلك، قد لا تكون أنظمة التسجيل التي تركز على أجسام الخلايا حساسة لمستويات أقل حدة من الضرر أو تلف الخلايا العصبية التي تؤثر على جزء فقط من الخلية، مثل التندريت. وبما أن التشعب يبدو أن لديه أكبر مجموعة من التغيرات المورفولوجية التي يمكن اكتشافها باستمرار استجابة للضغوطات الكيميائية، فقد اخترناها كأساس لتحليلنا. يتم تعديل نظام التهديف الذي نقدمه هنا من مقاييس متعددة النقاط تستند إلى دندريت والتي تم استخدامها سابقا في مختبرنا29،33. ويوسع هذا النظام نطاقي النقاط الخمس والست إلى مقياس من سبع نقاط لمراعاة التغيرات المورفولوجية المتصلة بالعمر، مثل ارتفاع الأعداد المتوقعة من مكامن الخلل في التشعبات البالغة الأكبر سنا، والتمييز بين الضرر الشديد وفقدان التشعب الكامل. الغرض من إدخال هذا النظام التهديف هو توفير القدرة على التقاط صورة شاملة للتجدد العصبي على جميع مستويات تلف الخلايا العصبية وتوفير نظام عالمي لدعم الاتساق عبر البحوث C. elegan الدوبامين العصبي. لأن التهديف هو ذاتي بطبيعته ، فمن الأهمية بمكان لتحقيق أقصى قدر من الاتساق بين تسجيل الأفراد ، وتعمية الهداف إلى هوية الصور باستخدام التعمية اليدوية أو برنامج التعمية التلقائي35. لتحسين الاتساق، نقدم سلسلة من الصور التدريبية ونستخدم قدرات الفيديو الخاصة ب JoVE لإظهار نظام التسجيل الخاص بنا بالتفصيل. نوصي باستخدام نظام يسمح بتسجيل النقاط الأعمى الآلي ويسمح للهادف بتحديد مدى اتساقه في التسجيل عن طريق إعادة تسجيل مجموعة فرعية من الصور. وهذا أمر مهم بشكل خاص عند الجمع بين أو مقارنة البيانات من علماء متعددين، أو تدريب العلماء الجدد على التسجيل.
يوضح هذا البروتوكول كيفية استخدام مقياس النقاط السبع الذي تم تطويره في مختبرنا لتحديد مستويات التغيير المورفولوجي للخلايا العصبية الدوبامينية والانحطاط في C. elegans. أنشأنا وتقاسمنا هذا النطاق كأداة لتوحيد تحليل عمل التنكس العصبي الدوبامين في الديدان. إدراكا لأهمية دراسة المسارات المشاركة في الأمراض العصبية العصبية المنتشرة للغاية، العديد من المحققين الاستفادة من ملاءمة نموذج C. elegans لتصور البيولوجيا العصبية لدراسة التنكس العصبي29،31،32،33. ومع ذلك ، لم يكن هناك حتى الآن جهد للحد من الاختلاف الكبير في كيفية قياس تلف الخلايا العصبية عبر أبحاث التنكس العصبي في الديدان. ولذلك فإن نظام التسجيل المعروض هنا يهدف إلى تعزيز الاتساق في التحليلات والسماح بالمقارنة بين الدراسات.
يمكن استخدام نظام التسجيل لدينا لتحليل البيانات المستمدة من تجارب C. elegans التي تستخدم المراسلين الفلوريين الخاصين بالخلايا التي تسمح بتصور الخلايا العصبية الدوبامين – على وجه التحديد dendrites CEP. على وجه التحديد ، سلالات الموسومة في الجين دات – 1 لتصور GFP من الخلايا العصبية الدوبامين متوافقة مع هذا البروتوكول التهديف ، على الرغم من وجود العديد من النماذج الأخرى ذات الصلة المعدلة وراثيا من PD. ومن الممكن أن يكون نظام التسجيل هذا مفيدا أيضا في تلك النماذج؛ ومع ذلك، يجب التحقق من صحة هذا قبل استخدامها. على وجه الخصوص، فمن الممكن (ولكن لم يتم اختبارها على حد علمنا) سلالات مع mCherry قد لا تكون مناسبة تماما لهذا البروتوكول كما قد يكون تجميع mCherry لا يمكن تمييزها عن blebs أو يؤدي إلى إجهاد الخلية. بدلا من تقديم تعليق على جميع النماذج المحددة من PD والاضطرابات العصبية التنكسية ذات الصلة، ونحن نركز على تسجيل بيانات التنكس العصبي نفسه. بالإضافة إلى ذلك، يركز هذا البروتوكول فقط على مورفولوجيا الخلايا العصبية ولا يأخذ في الاعتبار مستويات الفلورية من سوما. يمكن إجراء فحوصات التنكس العصبي جنبا إلى جنب مع المقايسات السلوكية ذات الصلة بالأمراض العصبية، مثل الحركة والعمر وتجارب المدى الصحي. يمكن أيضا تأكيد مستويات الانحطاط في النماذج الكيميائية والعمرية والجينية الثابتة ل PD وتفصيلها باستخدام نظام التسجيل هذا. يمكن أن يضيف قياس النماذج والمساهمين والمسارات المرتبطة ب PD والأمراض العصبية الأخرى إلى المعرفة العلمية حول هذه الاضطرابات ويشير إلى كيفية إدارة العدد المتزايد من الأفراد المصابين. وجود نتائج مماثلة تنكس الأعصاب عبر الأدب هو المفتاح في دعم هذا الهدف.
لتفسير النتائج المستمدة من نظام التهديف هذا، نقترح النظر في كل dendrite سجل ن = 1، لأن الخلايا العصبية المختلفة داخل الدودة نفسها غالبا ما تستجيب بشكل مختلف للعلاج. قد يكون الدافع وراء ذلك هو حقيقة أن الخلايا العصبية CEPD فقط هي التي تتعرض مباشرة لسائل الجسم الزائف. على هذا النحو ، وهذا يسمح لانتشار درجة من المجموعات التجريبية ليتم عرضها كنسب من العدد الإجمالي للdendrites سجل في كل مجموعة. هذه الطريقة، المستخدمة للنتائج التمثيلية المبينة هنا، تسمح بإجراء مقارنة سهلة بين مجموعات العلاج، وحسابات الاستجابات التفاضلية داخل الدودة نفسها، ويتم تحليلها بسهولة مع اختبار Chi-squared تكملها تصحيح Bonferroni لمقارنات متعددة. ويمكن الاطلاع على نموذج مثال لتسجيل عشرات الخلايا العصبية وحساب النسب المئوية في الملف التكميلي 2. لقد نظرنا في طريقتين بديلتين لتحليل البيانات وتحديد العيوب في كل منهما. الخيار الأول هو في المتوسط عشرات من الخلايا العصبية CEP الأربعة لكل دودة. وهذا بارامتريز البيانات; ومع ذلك، فإنه يفترض علاقة خطية مع زيادة درجة ويفقد المعلومات حول أي اختلافات في الاستجابة للعلاج داخل الدودة نفسها. الخيار الثاني هو تلخيص عشرات جميع الخلايا العصبية CEP الأربعة لكل دودة ، والتي تقوم أيضا ببارامتريز البيانات. هذا لا يزال يفترض وجود علاقة خطية بين عشرات، ومع ذلك فإنه يفسر أكثر قابلية للاختلافات داخل كل دودة من متوسط الدرجات عن طريق توسيع المعلمات من عشرات ممكن. ومع ذلك يقرر الباحثون الفردية لعرض بياناتهم، وينبغي النظر في النتائج جنبا إلى جنب مع المتغيرات التجريبية مثل سلالة وعمر دودة؛ على سبيل المثال، الديدان القديمة لديها مستوى خط أساس أعلى المتوقع من الانحطاط.
كما يتم تفسير هذه النتائج النتيجة التنكس العصبي، وينبغي للباحثين أيضا أن تكون على بينة من بعض المحاذير والقيود المفروضة على طريقة التهديف. أولا، بعض المتطلبات التكنولوجية ضرورية لالتقاط الصور المناسبة للتسجيل. يجب أن يدعم مجهر التصوير قنوات الفلورسينس وإعدادات التكبير والتعرض التي تسمح بتصور واضح للتشعبات CEP. وكما لوحظ في البروتوكول، يمكن تخفيض المتطلبات التكنولوجية عن طريق تعديلات البروتوكول مثل تسجيل الصور الحية من خلال المجال المجهري بدلا من التقاط الصور التي سيتم أرشفتها وتسجيلها في وقت لاحق. ثانيا، إن طرق التحليل الإحصائي المحتملة لهذه البيانات محدودة لأن البيانات غير بارامترية. ويفترض أن مقياس الدرجات تقدمي، ولكن لا يمكن اعتباره رقميا لأن هناك خيارات نقاط منفصلة، كما أن زيادات النقاط لا تتناسب بالضرورة مع بعضها البعض فيما يتعلق بالوظيفة البيولوجية. ولهذه الأسباب، فإن اختبارات الاستقلال التربيعية هي الأنسب لهذا النوع من البيانات، مما يعني أن التحليل الإحصائي يعتمد على المراقب لتحديد اتجاه أي أهمية إحصائية. وتجدر الإشارة إلى أن الاختبار التربيعي أيضا يحلل فقط للاختلافات في توزيع النقاط وغير قادر على تقديم أدلة على الاختلافات في فئات تسجيل محددة. وأخيرا، لم تدرس بعد الأهمية الوظيفية للتغيرات المورفولوجية التي حددها نظام التسجيل هذا.
الاتجاهات المستقبلية التي دفعها تطوير هذا النظام التهديف تنطوي على تحديد القواعد البيولوجية والارتباطات مع عشرات الخلايا العصبية الفردية. دراسة الأهمية الوظيفية (مثل الإشارات العصبية، سلوك دودة) من جميع النقاط على مقياس التهديف سوف تعلم كيفية ترجمة النتائج بشكل أفضل إلى استنتاجات تنطبق على فهم أسباب وعواقب الأمراض العصبية وتطوير خيارات الوقاية والعلاج. يجب أن تهدف الأبحاث المستقبلية حول التنكس العصبي في الديدان إلى اكتشاف الاتصالات بالمورفولوجيا الأخرى ، مثل شكل الدودة وحجمها. بالإضافة إلى ذلك ، يمكن دعم أبحاث التجديد العصبي من خلال دراسة سلالات المراسل الآخر C. elegans لقياس نقاط النهاية مثل الجيوجيات الحيوية ، وإنتاج أنواع الأكسجين التفاعلية ، ومورفولوجيا الميتوكوندريا.
The authors have nothing to disclose.
نود أن نعترف إيان ت. رايد، للمساهمات في تطوير مقياس التهديف ودعمه أثناء إنشاء هذه المخطوطة. وقد تم دعم هذا العمل من قبل المعاهد الوطنية للصحة (T32ES021432 المدعومة KSM، وP42ES010356 إلى JNM).
96-well plate | VWR | 29442-056 | For imaging in wells |
Blinder | Solibyte Solutions LLC | Free software that blinds between and within uploaded sets of image files | |
BY200 [vtIs1 (dat-1p::GFP, rol-6)] | Aschner Lab | C. elegans strain suitable for dopaminergic neuron fluorescent imaging. May be subsituted by other strains with a fluorescent reporter driven by cell-specific promotors Available upon request from the Meyer lab |
|
complete K-medium | 51 mM sodium chloride, 32 mM potassium chloride, 3 mM calcium chloride, 3 mM magnesium sulfate, 13 mM cholesterol | ||
Coverslips 22x22mm, No.1 glass | VWR VistaVision | 48366-067 | For imaging on slides |
dimethyl sulfoxide (DMSO) | Sigma-Aldrich | 472301 | Solvent for rotenone exposures |
ImageJ | National Institutes of Health (NIH) | ImageJ 1.5e or newer. Rasband, W.S., ImageJ, U. S. National Institutes of Health, Bethesda, Maryland, USA, https:// imagej.nih.gov/ij/, 1997-2016. | Sotware for image manipulation |
Keyence BZ-X All-in-one Fluoresence Microscope | Keyence | Used for fluorescent dopaminergic neuron image capture. May be substituted by other microscopes stuitable for fluorescent, high-resolution imaging | |
Microscope Slides 3×1" | VWR VistaVision | 16004-420 | For imaging on slides |
Rotenone | Sigma-Aldrich | R8875 | Electron transport chain complex I inhibitor |
Sodium Azide (NaN_3) | Sigma-Aldrich | S2002 | Paralytic |
Sodium Hydroxide | Sigma-Aldrich | S2770 | For bleach lysis |
Sodium Hypochlorite | VWR | RC7495.5-32 | For bleach lysis |
Tetramisole (Levamisole) Hydrochloride (HCl) | Sigma-Aldrich | L9756 | Paralytic |