该协议描述了人类诱导多能干细胞的巨噬细胞的强健生成,以及其后续表征的方法。细胞表面标记表达、基因表达和功能测定用于评估这些iPSC衍生巨噬细胞的表型和功能。
巨噬细胞存在于大多数脊椎动物组织中,包括广泛分散和异构细胞群,具有不同的功能。他们是健康和疾病的关键参与者,在免疫防御和调解营养、维护和修复功能期间充当邻形细胞。虽然已经能够研究人类巨噬细胞功能所涉及的一些分子过程,但事实证明,将基因工程技术应用于原生人类巨噬细胞是很困难的。这大大阻碍了我们询问巨噬细胞生物学中复杂的遗传途径的能力,并为特定疾病状态生成模型的能力。因此,人类巨噬细胞的现成来源,能够适应庞大的遗传操纵技术库,因此,它将在这一领域提供一个宝贵的工具。我们提出了一个优化的协议,允许从人类诱导多能干细胞(iPSCs)在体外生成巨噬细胞。这些 iPSC 衍生的巨噬细胞 (iPSC-DM) 表示人类巨噬细胞表面标记,包括 CD45、25F9、CD163 和 CD169,我们的活细胞成像功能测定表明它们表现出强大的噬菌体活性。培养的iPSC-DM可以激活到不同的巨噬细胞状态,通过添加LPS和IFNg、IL4或IL10来显示改变的基因表达和噬菌体活性。因此,该系统提供了一个平台,以生成携带基因改变的人类巨噬细胞,模拟特定的人类疾病,并为药物筛选或细胞治疗细胞治疗细胞治疗细胞来源,以治疗这些疾病。
胚胎干细胞 (ESCs) 和诱导多能干细胞 (iPSCs) 代表一种自我更新的细胞源,可以分化以生成所有三个生殖层谱系的细胞。允许基因操纵人类多能干细胞(PSCs)的技术,如锌手指核酸酶、TALENS和CRISPR-Cas9,彻底改变了医学研究11、2、3、4。2,3,4当主要感兴趣的细胞难以扩展和/或体外维持时,或难以遗传操作时,人类PSCs的基因操纵是一个特别有吸引力的策略,例如巨噬细胞55、6、7、8、9。6,7,8,9由于人类 iPSC 可以从任何体细胞派生,它们规避了与 ESC 相关的道德限制,并提供提供个性化药物的策略。这包括患者特定的疾病建模、药物测试和自体细胞治疗,降低免疫排斥和感染的风险66,8,10,11。8,10,11
描述iPSC巨噬细胞生成的协议包括一个三步过程,包括:1) 胚胎体生成;2) 悬架中造血细胞的出现;3) 终端巨噬体成熟。
三维骨料的形成,称为胚胎体(EB),可启动iPSCs的分化。骨形态遗传蛋白(BMP4)、干细胞因子(SCF)和血管内皮生长因子(VEGF)被添加,以推动间质蛋白规格,并支持新兴的造血细胞77,8,9,11,12。8,9,11,12EBs内的不同细胞也启动内源信号通路(如Wnt和Activin)的激活。某些差异化协议不会经过 EB 形成阶段。在这些情况下,Wnt 和 Activin 信号调节器,如重组人类 Activin A 和/或 Chiron,以单层格式13、14、15,15添加到13,区分的 iPSC 中。在这里,我们专注于使用EB形成的协议。对于分化的第二步,EB 被镀在粘附表面上。这些附属细胞然后暴露于细胞因子,促进包括造血细胞和骨髓祖体的悬浮细胞的出现。在这些体外培养条件下,白细胞-3(IL3)可能支持造血干细胞-祖细胞形成和增殖16、17,以及骨髓前体16,增殖和分化18。巨噬细胞群落刺激因子(CSF1)支持骨髓细胞的产生及其分化对巨噬细胞19、20。19,在分化的第三阶段,这些悬浮细胞在CSF1的存在下培养,以支持终端巨噬细胞成熟。
人类iPSCs在体外分化为巨噬细胞,模仿了发育过程中巨噬细胞生产的早期波。组织驻留巨噬细胞在胚胎生成期间建立,与成年单细胞具有明显的发育谱系。几项研究表明,iPSC-DM具有比血液衍生的单核细胞更可与胎儿肝脏衍生巨噬细胞相媲美的基因特征,这表明iPSC-DM更类似于组织常驻巨噬细胞。iPSC-DM表示更高水平的基因编码,用于组织改造和血管生成中涉及的蛋白质的分泌,并表示低层次的基因编码,用于亲炎细胞因子分泌和抗原表达活动21,22。21,此外,iPSC-DM具有类似于组织-居民巨噬细胞的转录因子要求23,24。23,使用转录因子 RUNX1、SPI1 (PU.1) 和 MYB 的挖空 iPSC 细胞系,Buchrieser 等人表明,iPSC-DM 的生成与 SPI1 和 RUNX1 相关,但 MYB 独立。这表明,它们在转录上类似于在开发23期间第一波造物过程中产生的蛋黄囊衍生巨噬细胞。因此,人们普遍认为,iPSC-DM代表一个更合适的细胞模型来研究组织常驻巨噬细胞,如微胶质14、25,25和Kupffer细胞11,以及可能用于修复组织的疗法的更理想的细胞来源。例如,已经表明,从小鼠ESCs体外产生的巨噬细胞在CCl4诱导的肝损伤模型中有效改善纤维化。此外,这些ESC衍生的巨噬细胞比骨髓衍生巨噬细胞在小鼠使用脂质体凝血11来重新填充Mrupffer细胞室时更有效。
在这里,我们描述了用于维护、冷冻和解冻人类iPSCs以及将这些iPSCs分化为功能巨噬细胞的血清和送料器无量协议。该协议与范·威尔根堡等人12中描述的协议非常相似,其小改动包括:1) iPSC维护介质;2) ROCK抑制剂不在EB形成阶段使用;3) 机械方法,而不是酶方法,用于从 iPSC 殖民地生成统一的 EB;4) EB收获和电镀方法不同;5) 悬浮细胞每周收获2倍,而不是每周;和6) 收获的悬浮细胞在CSF1下培养,以进行9天而不是7天的巨噬体成熟。我们还描述了用于表征 iPSC 衍生的巨噬细胞表型和功能的协议,包括基因表达 (qRT-PCR)、细胞表面标记表达(流细胞学)和用于评估噬菌体和极化的功能测定的分析。
此处描述的 iPSC-DM 生成协议是可靠的,允许从相对少量的 iPSC 中产生大量同质细胞。在大约 1 x 106 iPSC的初始分化后,后续培养物可以每 4 天收获一次,长达 2-3 个月,在此期间至少产生 6.5 x 107大噬细胞。这些体外生成的人类巨噬细胞在形态上与原人类巨噬细胞相似,表达关键的巨噬细胞表面标记,并表现出噬菌体活性。巨噬细胞分化协议是可重复的,可应用于其他hiPSC和hESC细胞系,但巨噬细胞前体首次收获的精确时间以及可生成的细胞的绝对数量在iPSC系之间有所不同。
已经证明,巨噬细胞可以从经过基因操纵的iPSCs生成。例如,在组成CAG促进剂的控制下,由荧光报告器ZsGreen组成的转基因盒插入SFCi55 iPSC线的AAVS1位点,随后表明该iPSC线可以分化为ZsGreen表达巨噬细胞8。这些荧光巨噬细胞将来可用于跟踪疾病模型中治疗性巨噬细胞的迁移和稳定性。在另一项研究中,巨噬细胞来自一种通过基因操纵来表达他莫西芬诱导转录因子KLF1的iPSC线。在iPSC衍生的巨噬细胞中激活KLF1,导致巨噬细胞的产生,其表型可与红细胞岛9的巨噬细胞相媲美。可能,这种策略可用于基因编程 iPSC 衍生的巨噬细胞到与其他组织特异性巨噬细胞群相关的表型,如肝脏的 Kupffer 细胞或皮肤的兰格汉斯细胞。一旦确定了定义这些单元格类型的关键转录因子,就可以这样做。
在协议方面,必须指出,iPSC 起始种群的状况对于成功区分至关重要。人类iPSC培养物可以在几个通道上与岩溶异常亚群一起溢出,因此建议对受基因组质量控制的iPSC种群和大型批次主种群进行强力固化。在我们手中,这里描述的维护协议可以连续培养2个月,但在不同的细胞系和不同的实验室中,这种维护协议可以维持长达2个月的氯正常iPSC。如果遇到问题,建议在每个分化实验中使用一小瓶未分化的 iPSC。此外,未分化的iPSC的起始区域性不应超过80%。在 EB 电镀阶段,每口 6 井组织培养板的孔只能镀 10-15 个 EB,因此这些 EB 均匀分布整个孔中至关重要。在井中心,EB和/或结块数较多,对产生的巨噬细胞数量产生了负面影响。在补充介质和从EB培养物中收获类似单细胞的后代悬浮细胞时应小心谨慎,以避免干扰EB粘附到涂层培养板表面。每次收获时产生的造血悬浮细胞数量逐渐增加,分化第40-72天之间最佳生产(图2)。第68天后产量逐渐下降,板材在2.5个月后趋于排气,但精确时序可能因iPSC生产线而异。
我们协议的一个限制是,无法冷冻保存第2阶段结束时产生的造血悬浮细胞。依赖于WNT外源激活的协议报告冷冻保存后回收率为40%,但这些协议只报告一个细胞收获,因此产生的巨噬细胞的绝对数量是低30。此处描述的通过EB的形成诱导内源性信号的协议,可以每两周一次收获,从而产生高得多的总巨噬细胞产量。
总之,我们提出了用于生产功能性 iPSC 衍生巨噬细胞的详细协议。与单核细胞衍生巨噬细胞(MdM)的实验,利用iPSC衍生的巨噬细胞进行体外实验,研究健康与疾病中的巨噬细胞生物学具有许多优势。这些优点包括易于获得材料(例如,不需要捐赠者),可以产生大量巨噬细胞,而且产生转基因巨噬细胞是可行的,而且相对简单。此外,iPSC衍生的巨噬细胞可能是研究组织-居民巨噬细胞生物学的更好资源。
The authors have nothing to disclose.
我们感谢菲奥娜·罗西和克莱尔·克里尔在流动细胞测量方面给予的帮助,埃格汉·奥杜伊希尔和贝特朗·韦尔奈用显微镜。这项工作由CONACYT(M.L.-Y.)、威康信托(102610)和创新英国(L.M.F)、威康信托博士(A.M)、MRC精密医学学生(T.V)资助。L.C. 和 J.W.P. 得到了威康信托 (101067/Z/13/Z)、医学研究委员会 (MR/N022556/1) 和 COST 行动 BM1404 Mye-EUNITER (http://www.mye-euniter.eu) 的支持。
2-Mercaptoethanol (50 mM) | Invitrogen | 31350010 | |
Abtibody CD64-APC -CY7 | Biolegend | 305026 | Dilution factor: 1:100 |
Antibody 25F9-EFLUOR 660 | Ebioscience | 15599866 | Dilution factor: 1:20 |
Antibody CCR2-PE-Cy7 | Biolegend | 357212 | Dilution factor: 1:100 |
Antibody CCR5 PE | Biolegend | 313707 | Dilution factor: 1:100 |
Antibody CCR8 PE | Biolegend | 360603 | Dilution factor: 1:100 |
Antibody CD11b-PE | Biolegend | 301305 | Dilution factor: 1:50 |
Antibody CD14-APC | Ebioscience | 10669167 | Dilution factor: 1:20 |
Antibody CD163-PE-CY7 | BIolegend | 333614 | Dilution factor: 1:25 |
Antibody CD169-APC | Biolegend | 346007 | Dilution factor: 1:25 |
Antibody CD206-PE | Biolegend | 321106 | Dilution factor: 1:100 |
Antibody CD209-PE-CY7 | Biolegend | 3310114 | Dilution factor: 1:100 |
Antibody CD274-PE-CY7 | Biolegend | 329718 | Dilution factor: 1:100 |
Antibody CD43-PE | Ebioscience | 10854419 | Dilution factor: 1:100 |
Antibody CD45-APC | Ebioscience | 15577936 | Dilution factor: 1:20 |
Antibody CD86-APC | Biolegend | 305412 | Dilution factor: 1:100 |
Antibody CD93-PE | Ebioscience | 10804637 | Dilution factor: 1:100 |
Antibody CX3CR1-PE | Biolegend | 307650 | Dilution factor: 1:100 |
Antibody HLA-DR-BV650 | Biolegend | 307650 | Dilution factor: 1:100 |
Antiboy CD115-PE | Biolegend | 347308 | Dilution factor: 1:40 |
Cell Dissociation Buffer, enzyme free | Thermofisher | 13151014 | |
Cell Dissociation Buffer, enzyme-free, PBS | Gibco | 13151014 | |
CellCarrier-96 Ultra Microplates, tissue culture treated, black, 96-well | PerkinElmer | 6055302 | |
CellMask Deep Red Plasma Membrane Stain | Thermofisher | C10046 | Cryopreservation media |
Cryostor CS10 | Sigma | C2874 | |
CTS CELLstart Substrate | Invitrogen | A1014201 | Stem cell substrate |
DAPI | Merck | D9542-1MG | Final concentration 1 μg/mL |
DPBS, calcium, magnesium (500ml) | Thermofisher | 14040091 | |
FcR Blocking Reagent, human | MACS Miltenyi Biotec | 130-059-901 | |
FGF-Basic (AA 10-155) Recombinant Human Protein | Thermofisher | PHG0021 | |
GlutaMAX Supplement | Thermofisher | 35050061 | |
Human Recombinant IFNY | Thermofisher | 14-8319-80 | |
Human Serum Albuminum | Irvine Scientific | 9988 | |
Lipopolysaccharide (LPS) from E. Coli | Sigma | L2630 | |
NucBlue (Hoechst33342) | Thermofisher | R37605 | |
pHrodo Green Zymosan Bioparticles Conjugate for Phagocytosis | Thermofisher | P35365 | |
Porcine Skin Gelatin | Sigma | G9136 | |
Recombinant Human BMP4 Protein | R&D | 314-BP-010 | |
Recombinant Human IL10 | Preprotech | 200-10 | |
Recombinant Human IL3 | Preprotech | 200-03-10 | |
Recombinant Human IL4 | Preprotech | 200-04 | |
Recombinant Human MCSF (carrier-free) 100ug | Biolegend | 574806 | |
Recombinant Human VEGF Protein | R&D | 293-VE-010 | |
Rock Inhibitor Y-27632 | Merck | SCM075 | |
SCF (C-Kit Ligand) Recombinant Human Protein | Thermofisher | PHC2111 | |
StemPro hESC SFM | Thermofisher | A1000701 | |
StemPro EZPassage Disposable Stem Cell Passaging Tool | Thermofisher | 23181010 | |
Ultralow attachment plates: Cell culture multi-well plate, 6 well, cell star cell repellent surface | Greiner | 657970 | |
UltraPure 0.5 M EDTA, pH 8.0 | Invitrogen | 15575020 | |
X-Vivo 15 500 mL bottle | Lonza | BE02-060F |